Profármacos de nucleósidos modificados en 2'' y 3'' para el tratamiento de infecciones de Flaviviridae.

Un compuesto de la fórmula (IX):**Fórmula**

o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo,

en donde:

R1 y R2 son independientemente H; fosfato; alquilo de cadena lineal, ramificada o cíclica; acilo; CO-alquilo; CO-arilo;

CO-alcoxialquilo; CO-ariloxialquilo; arilo CO-sustituido; éster de sulfonato; bencilo, en donde el grupo fenilo está opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes; alquilsulfonilo; arilsulfonilo; aralquilsulfonilo; un lípido; un aminoácido; un hidrato de carbono; un péptido; o un colesterol;

X es O;

la Base* es una base de purina o pirimidina;

R12 es C(Y3)3;

Y3 es H; y

R13 es flúor.

Profïrmacos de nucleïsidos modificados en 2' y 3' para el tratamiento de infecciones de Flaviviridae Esta invenciïn pertenece al ïrea de la quïmica farmacïutica, y es en particular, un nucleïsido de pirimidina 2´ramificado o un nucleïsido de purina 2´-ramificado como se define en las reivindicaciones. La invenciïn es tambiïn una composiciïn farmacïutica que comprende el nucleïsido, y el nucleïsido para usar en un mïtodo para el tratamiento de una infecciïn de Flaviviridae, tal como una infecciïn por el virus de la hepatitis C.

Virus de flaviviridae La familia de virus Flaviviridae comprende al menos tres gïneros distintos: los pestivirus, que causan enfermedades en gatos y cerdos; flavivirus, que son la causa primaria de enfermedades tal como la fiebre del dengue y la fiebre amarilla; y hepacivirus, cuyo ïnico miembro es el VHC. El gïnero flavivirus incluye mïs de 68 miembros separados en grupos sobre la base de la relaciïn serolïgica (Calisher et al., J. Gen. Virol, 1993, 70, 37-43) . Los sïntomas clïnicos varian e incluyen fiebre, encefalitis y fiebre hemorrïgica (Fields Virology, editores: Fields, B. N., Knipe, D. M., y Howley, P. M., Lippincott-Raven Publishers, Filadelfia, Pensilvania, 1996, capïtulo 31, 931-959) . Los Flavivirus de preocupaciïn global que estïn asociados con enfermedades humanas incluyen el virus de la fiebre hemorrïgica del dengue (FHD) , el virus de la fiebre amarilla, el sïndrome de shock y el virus de la encefalitis japonesa (Halstead, S. B., Rev. Infect. Dis., 1984, 6, 251-264; Halstead, S. B., Science, 239:476-481, 1988; Monath, T. P., New Eng. J. Med., 1988, 319, 641-643) .

El gïnero pestivirus incluye el virus de la diarrea vïrico bovina (VDVB) , el virus de la fiebre del cerdo clïsica (VFCC, tambiïn llamada virus del cïlera del cerdo) y el virus de la enfermedad de la frontera (VEF) de las ovejas (Moennig,

V. et al. Adv. Vir. Res. 1992, 41, 53-98) . Las infecciones por pestivirus del ganado (ganado, cerdos y ovejas) causan pïrdidas econïmicas significativas a nivel mundial. BVDV causa la enfermedad de la mucosa en el ganado y es de importancia econïmica significativa para la industria del ganado (Meyers, G. y Thiel, H. J., Advances in Virus Research, 1996, 47, 53-118; Moennig V., et al, Adv. Vir. Res. 1992, 41, 53-98) . Los pestivirus humanos no han sido tan extensivamente caracterizados como los pestivirus animales. Sin embargo, sondeos serolïgicos indican la exposiciïn considerable de pestivirus en humanos.

Los pestivirus y hepacivirus son grupos de virus muy interrelacionados dentro de la familia de los Flaviviridae. Otros virus muy interrelacionados en esta familia incluyen los virus GB tipo A, agentes tipo virus GB tipo A, virusGB tipo B y virus GB tipo C (tambien llamados virus G de la hepatitis, HGV) . El grupo de los hepacivirus (virus de la hepatitis C; (VHC) consiste en un nïmero de virus estrechamente relacionado pero genotïpicamente distingibles que infectan a los seres humanos. Hay aproximadamente 6 genotipos VHC y mïs de 50 subtipos. Debido a las similitudes entre pestivirus y hepacivirus, combinado con la poca habilidad de los hepacivirus para crecer eficientemente en los cultivos celulares, el virus de la diarrea vïrica bovina (VDVB) se usa a menudo como un sustituto para estudiar el virus de VHC.

La organizaciïn genïtica de los pestivirus y hepacivirus es muy semejante. Estos virus de ARN trenzados positivos poseen un marco de lectura grande abierto ïnico (ORF) que codifica todas las proteïnas vïricas necesarias para la replicaciïn vïrica. Estas proteïnas son expresadas como una poliproteïnas que es co- y post-translacionalmente procesada por proteinasas codificadas tanto por cïlulas como por virus para producir las proteïnas vïricas maduras. Las proteïnas vïricas responsables de la replicaciïn del genoma ARN vïrico estïn localizadas dentro de aproximadamente el terminal carboxi. Dos tercios del ORF son las llamadas proteïnas no estructurales (NS) . La organizaciïn genïtica y el procesamiento de la poliproteïna de la porciïn proteica no estructural del ORF para los pestivirus y los hepacivirus es muy semejante. Para ambos, pestivirus y hepacivirus, las proteïnas maduras no estructurales (NS) , en orden secuencial a partir del terminal amino de la regiïn de codificaciïn de la proteïna no estructural al terminal carboxi del ORF, consisten en p7, NS2, NS3, NS4A, NS4B, NS5A, y NS5B.

Las proteinas NS de los pestivirus y hepacivirus comparten los dominios de secuencia que son caracteristicos de las funciones de la proteïna especïfica. Por ejemplo, las proteïnas NS3 de los virus en ambos grupos poseen motivos de secuencia de aminoïcidos caracterïsticos de las serinoproteinasas y de las helicasas (Gorbalenya et al. (1988) Nature 333:22; Bazan y Fletterick (1989) Virology 171:637-639; Gorbalenya et al. (1989) Nucleic Acid Res. 17.38893897) . Del mismo modo, las proteïnas NS5B de pestivirus y hepacivirus tienen los motivos caracterïsticos de ARN polimerasas dirigidas por ARN (Koonin, E.V. y Dolja, V.V. (1993) Crit. Rev. Biochem. Molec. Biol. 28:375-430) .

Los roles y funciones actuales de las proteïnas NS de pestivirus y hepacivirus en el ciclo de la vida de los virus son directamente anïlogos. En ambos casos, la serina proteinasa NS3 es responsable de todo el procesamiento proteolïtico de precursores de poliproteïna corriente abajo de su posiciïn en el ORF (Wiskerchen y Collett (1991) Virology 184:341-350; Bartenschlager et al. (1993) J. Virol. 67:3835-3844; Eckart et al. (1993) Biochem. Biophys. Res. Comm. 192:399-406; Grakoui et al. (1993) J. Virol. 67:2832-2843; Grakoui et al. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:10583-10587; Hijikata et al. (1993) J. Virol. 67:4665-4675; Tome et al. (1993) J. Virol. 67:4017-4026) . La proteïna NS4A, en ambos casos, actïa como un cofactor con la serina proteasa NS3 (Bartenschlager et al. (1994) J. Virol. 68:5045-5055; Failla et al. (1994) J. Virol. 68: 3753-3760; Lin et al. (1994) 68:8147-8157; Xu et al. (1997) J. Virol. 71:5312-5322) . La proteïna NS3 de ambos virus tambiïn funciona como una helicasa (Kim et al. (1995) Biochem. Biophys. Res. Comm. 215: 160-166; Jin y Peterson (1995) Arch. Biochem. Biophys., 323:47-53; Warrener y Collett (1995) J. Virol. 69:1720-1726) . Finalmente, las proteinas NS5B de pestivirus y hepacivirus tienen la actividad predicha de ARN polimerasas dirigida por ARN. (Behrens et al. (1996) EMBO J. 15:12-22; Lchmann et al. (1997) J. Virol. 71:8416-8428; Yuan et al. (1997) Biochem. Biophys. Res. Comm. 232:231-235; Hagedorn, documento de patente internacional PCT WO 97/12033; Zhong et al. (1998) J. Virol. 72.9365-9369) .

Virus de la Hepatitis C

El virus de la hepatitis C (VHC) es la causa principal de la enfermedad crïnica del hïgado en todo el mundo. (Boyer,

N. et al. J. Hepatol. 32:98-112, 2000) . El VHC causa una infecciïn vïrica de crecimiento lento y es la mayor causa de cirrosis y de carcinoma hepatocelular (Di Besceglie, A. M. y Bacon, B. R., Scientific American, Octubre: 80-85, (1999) ; Boyer, N. et al. J. Hepatol. 32:98-112, 2000) . Un estimado de 170 millones de personas estïn infectadas con VHC en todo el mundo. (Boyer, N. et al. J. Hepatol. 32:98-112, 2000) . La cirrosis causada por la infecciïn de hepatitis C crïnica es responsable de 8.000-12.000 muertes por aïo en los Estados Unidos, y la infecciïn por VHC es la principal indicaciïn para el transplante de hïgado.

Se sabe que VHC causa al menos el 80% de la hepatitis posttransfusiïn y una sustancial proporciïn de hepatitis aguda esporïdica. La evidencia preliminar tambiïn implica a VHC en muchos casos de hepatitis "idiopïtica" crïnica, cirrosis "criptogïnica", y probablemente, el carcinoma hepatocelular no relacionado con otros virus de hepatitis, tal como el virus de la hepatitis B (VHB) . Una pequeïa proporciïn de personas sanas parecen ser portadores crïnicos de VHC, variando con la geografïa y otros factores epidemiolïgicos.Los nïmeros pueden superar sustancialmente los de VHB, aunque la informaciïn es aïn preliminar; cuïntas de estas personas tienen una enfermedad hepïtica crïnica subclïnica no estï claro. (The Merck Manual, capïtulo 69, pïgina. 901, 16ava ediciïn, (1992) ) .

El VHC es un virus de sobre que contiene un genoma de ARN de sentido positivo de una sola hebra de aproximadamente 9, 4 kb.El genoma vïrico consiste de una regiïn 5´ no traducida (UTR) , un largo marco de lectura abierto que codifica un precursor de poliproteïna de aproximadamente 3011 aminoïcidos, y un 3' UTR corto. El 5' UTR es la parte mïs altamente conservada del genoma de VHC y es importante para la iniciaciïn y el control de la traducciïn de la poliproteïna. La traducciïn del genoma de VHC se inicia por un mecanismo de tapa independiente... [Seguir leyendo]

1. Un compuesto de la fïrmula (IX) :

o una sal farmacïuticamente aceptable del mismo, en donde:

R1 y R2 son independientemente H; fosfato; alquilo de cadena lineal, ramificada o cïclica; acilo; CO-alquilo; CO-arilo; CO-alcoxialquilo; CO-ariloxialquilo; arilo CO-sustituido; ïster de sulfonato; bencilo, en donde el grupo fenilo estï opcionalmente sustituido con uno o mïs sustituyentes; alquilsulfonilo; arilsulfonilo; aralquilsulfonilo; un lïpido; un aminoïcido; un hidrato de carbono; un pïptido; o un colesterol;

X es O;

la Base* es una base de purina o pirimidina;

R12 es C (Y3) 3;

Y3 es H; y

R13 es flïor.

2. El compuesto de la reivindicaciïn 1, en donde R1 y R2 son H.

3. El compuesto de la reivindicaciïn 1, en donde:

R1 es H; fosfato; alquilo de cadena lineal, ramificada o cïclica; acilo; CO-alquilo; CO-arilo; CO-alcoxialquilo; CO-ariloxialquilo; arilo CO-sustituido; ïster de sulfonato; bencilo, en donde el grupo fenilo estï opcionalmente sustituido con uno o mïs sustituyentes; alquilsulfonilo; arilsulfonilo; aralquilsulfonilo; un lïpido; un aminoïcido; un hidrato de carbono; un pïptido; o un colesterol; y

R2 es fosfato; alquilo de cadena lineal, ramificada o cïclica; acilo; CO-alquilo; CO-arilo; CO-alcoxialquilo; CO-ariloxialquilo; arilo CO-sustituido; ïster de sulfonato; bencilo, en donde el grupo fenilo estï opcionalmente sustituido con uno o mïs sustituyentes; alquilsulfonilo; arilsulfonilo; aralquilsulfonilo; un lïpido; un aminoïcido; un hidrato de carbono; un pïptido; o un colesterol.

4. El compuesto de la reivindicaciïn 1, en donde:

R1 es H; fosfato; alquilo de cadena lineal, ramificada o cïclica; acilo; CO-alquilo; CO-arilo; CO-alcoxialquilo; CO-ariloxialquilo; arilo CO-sustituido; ïster de sulfonato; bencilo, en donde el grupo fenilo estï opcionalmente sustituido con uno o mïs sustituyentes; alquilsulfonilo; arilsulfonilo; aralquilsulfonilo; un lïpido; un aminoïcido; un hidrato de carbono; un pïptido; o un colesterol;

R2 es acilo; y

Base* es timina, uracilo, guanina, citosina, adenina, hipoxantina, 5-fluorouracilo, o 5-fluorocitosina.

5. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-4, en donde Base* es citosina, uracilo, guanina, adenina, o timina.

6. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-5, o una sal farmacïuticamente aceptable del mismo, para uso en un mïtodo para el tratamiento de un anfitriïn infectado con un virus Flaviviridae.

7. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 6, en donde el virus es el de la hepatitis C.

8. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 6,

en donde el mïtodo comprende la administraciïn del compuesto o la sal farmacïuticamente aceptable del mismo en combinaciïn o alternancia con un segundo agente antivïrico; o en donde el mïtodo comprende la administraciïn del compuesto o la sal farmacïuticamente aceptable del mismo en 40 combinaciïn con un segundo o mïs agentes antivïricos.

9. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 8, en donde el segundo agente antivïrico se selecciona del grupo que consiste en un interferon, una ribavirina, una interleucina, un inhibidor de proteasa NS3, un inhibidor de proteasa de cisteïna, una fenantrenoquinona, un derivado de tiazolidina, una tiazolidina, una benzanilida, una fenantrenoquinona, un inhibidor de helicasa, un inhibidor de polimerasa, un anïlogo de nucleïtido, una gliotoxina, una cerulenina, un oligodesoxinucleïtido de fosforotioato antisentido, un inhibidor de la traducciïn dependiente de IRES, y una ribozima.

10. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 9, en donde el segundo agente antivïrico es un interferïn.

11. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 10, en donde el segundo agente antivïrico se selecciona del grupo que consiste en interferïn alfa 2a pegilado, interferïn alfacon-1, interferïn natural, albuferïn, interferïn beta1a, interferïn omega, interferïn alfa, interferïn gamma, interferïn tau, interferïn delta e interferïn gamma-1b.

12. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 6, en donde el compuesto o la sal farmacïuticamente aceptable del mismo estï en la forma de una dosificaciïn unitaria.

13. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 12, en donde la dosificaciïn unitaria contiene de 50 a 1000 mg o de 0, 1 a 50 mg del compuesto.

14. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 12, en donde la dosificaciïn unitaria es un comprimido o cïpsula.

15. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 6, en donde el anfitriïn es un ser humano.

16. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 6, en donde el compuesto o la sal farmacïuticamente aceptable del mismo estï en forma sustancialmente pura.

17. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 6, en donde el compuesto o la sal farmacïuticamente aceptable del mismo es al menos 90% en peso del isïmero º-D.

18. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 6, en donde el compuesto o la sal farmacïuticamente aceptable del mismo es al menos 95% en peso del isïmero º-D.

19. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 6, en donde el compuesto estï en la forma de una sal farmacïuticamente aceptable seleccionada del grupo que consiste en tosilato, metanosulfonato, acetato, citrato, malonato, tartrato, succinato, benzoato, ascorbato, a-cetoglutarato, a-glicerofosfato, formiato, fumarato, propionato, glicolato, lactato, piruvato, oxalato, maleato, salicilato, sulfato, nitrato, bicarbonato, sales de carbonato , bromhidrato, clorhidrato, di-clorhidrato, y sal de ïcido fosfïrico.

20. El compuesto para uso de la reivindicaciïn 19, en donde la sal farmacïuticamente aceptable es una sal de clorhidrato.

21. Una composiciïn farmacïutica que comprende una cantidad eficaz para tratar una infecciïn por Flaviviridae de un compuesto, o una sal farmacïuticamente aceptable del mismo, de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5 en un vehïculo farmacïuticamente aceptable.

22. La composiciïn farmacïutica de la reivindicaciïn 21, en donde el vehïculo es adecuado para la administraciïn oral.

23. La composiciïn farmacïutica de la reivindicaciïn 21, que comprende una cantidad eficaz del compuesto o de una sal farmacïuticamente aceptable del mismo para tratar a un anfitriïn infectado con el virus del Nilo Occidental, fiebre amarilla, el virus del dengue o VDVB.

24. La composiciïn de la reivindicaciïn 21, en donde el virus Flaviviridae es el de la hepatitis C.

25. La composiciïn farmacïutica de la reivindicaciïn 21, en donde el compuesto o la sal farmacïuticamente aceptable del mismo, estï en la forma de una dosificaciïn unitaria.

26. La composiciïn de la reivindicaciïn 25, en donde la dosis unitaria contiene de 0, 1 a 50 mg o de 50 a 1000 mg del compuesto o de la sal farmacïuticamente aceptable del mismo.

27. La composiciïn de la reivindicaciïn 25, en donde dicha dosificaciïn unitaria es un comprimido o cïpsula.

28. La composiciïn famacïutica de la reivindicaciïn 21.

que ademïs comprende un segundo agente antivïrico; o que ademïs comprende un segundo o mïs agentes antivïricos.

29. La composiciïn farmacïutica de la reivindicaciïn 28, en donde el segundo agente antivïrico se selecciona del grupo que consiste en un interferïn, una ribavirina, una interleucina, un inhibidor de proteasa NS3, un inhibidor de proteasa de cisteina, una fenantrenoquinona, un derivado de tiazolidina, una tiazolidina, una benzanilida, una fenantrenoquinona, un inhibidor de helicasa, un inhibidor de polimerasa, un anïlogo de nucleïtido, una gliotoxina, una cerulenina, un oligodesoxinucleïtido de fosforotioato antisentido, un inhibidor de la traducciïn dependiente de IRES, y una ribozina.

30. La composiciïn farmacïutica de la reivindicaciïn 29, en donde el segundo agente antivïrico es un interferïn.

31. La composiciïn farmacïutica de la reivindicaciïn 30, en donde el segundo agente antivïrico se selecciona del grupo que consiste en interferïn alfa 2a pegilado, interferïn alfacon-1, interferïn natural, albuferïn, interferïn beta-1a, interferïn omega, interferïn alfa, interferïn gamma, interferïn tau, interferïn delta e interferïn gamma-1b.

32. La composiciïn farmacïutica de la reivindicaciïn 21, en donde el compuesto o la sal farmacïuticamente aceptable del mismo, estï en forma sustancialmente pura.

33. La composiciïn farmacïutica de la reivindicaciïn 21, en donde el compuesto o la sal farmacïuticamente aceptable del mismo, es al menos 90% en peso del isïmero º-D.

34. La composiciïn farmacïutica de la reivindicaciïn 21, en donde el compuesto o la sal farmacïuticamente aceptable del mismo, es al menos 95% en peso del isïmero º-D.

35. La composiciïn farmacïutica de la reivindicaciïn 21, que ademïs comprende un vehïculo farmacïuticamente aceptable adecuado para administraciïn oral, parenteral, por inhalaciïn o intravenosa.

36. La composiciïn farmacïutica de la reivindicaciïn 21, en donde la sal farmacïuticamente aceptable se selecciona del grupo que consiste en un tosilato, metanosulfonato, acetato, citrato, malonato, tartrato, succinato, benzoato, ascorbato, a-cetoglutarato, a-glicerofosfato, formiato, fumarato, propionato, glicolato, lactato, piruvato, oxalato, maleato, salicilato, sulfato, nitrato, bicarbonato, sales de carbonato , bromhidrato, clorhidrato, diclorhidrato, y sal de ïcido fosfïrico.

37. La composiciïn farmacïutica de la reivindicaciïn 36, en donde la sal farmacïuticamente aceptable es una sal de clorhidrato.

Figura 1: Estructura quïmica de nucleïsidos ilustrativos Ribavirina

Figura 2 Figura 3 Figura 4