KCNB: una proteína del canal de potasio.

Un procedimiento de detección de células cancerosas en una muestra biológica de mamífero,

comprendiendo el procedimiento la etapa de detectar la presencia de una molécula de ácido nucleico del KCNB que tiene una identidad de secuencia de ácidos nucleicos mayor de un 90 % a lo largo de su longitud con respecto a la secuencia de ácidos nucleicos establecida en la SEQ ID NO: 2, en el que un incremento de 1, 5 veces o más del ácido nucleico del KCNB detectado en comparación con el valor normal indica la presencia de células cancerosas.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2001/006801.

Solicitante: AMGEN INC..

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: ONE AMGEN CENTER DRIVE THOUSAND OAKS, CA 91320-1799 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: POWERS, SCOTT, MU,David.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • A61K31/7088 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA.A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE.A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › A61K 31/00 Preparaciones medicinales que contienen ingredientes orgánicos activos. › Compuestos que tienen al menos tres nucleósidos o nucleótidos.
  • A61K38/00 A61K […] › Preparaciones medicinales que contienen péptidos (péptidos que contienen ciclos beta-lactama A61K 31/00; dipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina 2,5-dionas, A61K 31/00; péptidos basados en la ergolina A61K 31/48; que contienen compuestos macromoleculares que tienen unidades aminoácido repartidas estadísticamente A61K 31/74; preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos A61K 39/00; preparaciones medicinales caracterizadas por los ingredientes no activos, p. ej. péptidos como soportes de fármacos, A61K 47/00).
  • A61K39/395 A61K […] › A61K 39/00 Preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos (materiales para ensayos inmunológicos G01N 33/53). › Anticuerpos (aglutininas A61K 38/36 ); Inmunoglobulinas; Inmunosuero, p. ej. suero antilinfocitario.
  • A61K45/00 A61K […] › Preparaciones medicinales que contienen ingredientes activos no previstos en los grupos A61K 31/00 - A61K 41/00.
  • A61P35/00 A61 […] › A61P ACTIVIDAD TERAPEUTICA ESPECIFICA DE COMPUESTOS QUIMICOS O DE PREPARACIONES MEDICINALES.Agentes antineoplásicos.
  • C07K14/47 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de mamíferos.
  • C07K14/705 C07K 14/00 […] › Receptores; Antígenos celulares de superficie; Determinantes celulares de superficie.
  • C07K16/18 C07K […] › C07K 16/00 Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales. › contra materiales animales o humanos.
  • C07K16/28 C07K 16/00 […] › contra receptores, antígenos celulares de superficie o determinantes celulares de superficie.
  • C12N1/15 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 1/00 Microorganismos, p.ej. protozoos; Composiciones que los contienen (preparaciones de uso médico que contienen material de protozoos, bacterias o virus A61K 35/66, de algas A61K 36/02, de hongos A61K 36/06; preparación de composiciones de uso médico que contienen antígenos o anticuerpos bacterianos, p. ej. vacunas bacterianas, A61K 39/00 ); Procesos de cultivo o conservación de microorganismos, o de composiciones que los contienen; Procesos de preparación o aislamiento de una composición que contiene un microorganismo; Sus medios de cultivo. › modificados por la introducción de material genético extraño.
  • C12N1/19 C12N 1/00 […] › modificados por la introducción de material genético extraño.
  • C12N1/21 C12N 1/00 […] › modificados por la introducción de material genético extraño.
  • C12N15/09 C12N […] › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Tecnología del ADN recombinante.
  • C12N15/12 C12N 15/00 […] › Genes que codifican proteínas animales.
  • C12N15/63 C12N 15/00 […] › Introducción de material genético extraño utilizando vectores; Vectores; Utilización de huéspedes para ello; Regulación de la expresión.
  • C12N5/10 C12N […] › C12N 5/00 Células no diferenciadas humanas, animales o vegetales, p. ej. líneas celulares; Tejidos; Su cultivo o conservación; Medios de cultivo para este fin (reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00). › Células modificadas por introducción de material genético extraño, p. ej. células transformadas por virus.
  • C12P21/02 C12 […] › C12P PROCESOS DE FERMENTACION O PROCESOS QUE UTILIZAN ENZIMAS PARA LA SINTESIS DE UN COMPUESTO QUIMICO DADO O DE UNA COMPOSICION DADA, O PARA LA SEPARACION DE ISOMEROS OPTICOS A PARTIR DE UNA MEZCLA RACEMICA.C12P 21/00 Preparación de péptidos o de proteínas (proteína monocelular C12N 1/00). › que tienen una secuencia conocida de varios aminoácidos, p. ej. glutation.
  • C12P21/08 C12P 21/00 […] › Anticuerpos monoclonales.
  • C12Q1/02 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen microorganismos vivos.
  • C12Q1/68 C12Q 1/00 […] › en los que intervienen ácidos nucleicos.
  • G01N21/17 FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 21/00 Investigación o análisis de los materiales por la utilización de medios ópticos, es decir, utilizando rayos infrarrojos, visibles o ultravioletas (G01N 3/00 - G01N 19/00 tienen prioridad). › Sistemas en los que la luz incidente es modificada con arreglo a las propiedades del material examinado (en los que el material examinado es ópticamente excitado para producir un cambio de la longitud de onda de la luz incidente G01N 21/63).
  • G01N33/53 G01N […] › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Ensayos inmunológicos; Ensayos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas; Materiales a este efecto.
  • G01N33/566 G01N 33/00 […] › utilizando un soporte específico o proteínas receptoras como reactivos para la formación de uniones por ligando.
  • G01N33/574 G01N 33/00 […] › para el cáncer.
  • G01N33/68 G01N 33/00 […] › en los que intervienen proteínas, péptidos o aminoácidos.

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KCNB: una proteína del canal de potasio.

Fragmento de la descripción:

KCNB: una proteína del canal de potasio.

Antecedentes de la invención

Los canales de iones de potasio (canales de K+) son proteínas transmembrana ubicuas que son los determinantes principales del potencial de membrana, es decir, la diferencia de voltaje que está presente a través de las membranas plasmáticas de casi todas las células animales. En células excitables, los canales de K+ definen la frecuencia y duración de potenciales de acción, y desempeñan una función fundamental en la integración neuronal, la contracción muscular y la secreción hormonal. En células no excitables, los canales de K+ son fundamentales para el mantenimiento de los potenciales de membrana y la regulación del volumen celular. Por tanto, estos canales son dianas importantes para el desarrollo de moduladores que se pueden usar para regular la electrofisiología celular fundamental, en particular para su uso en aplicaciones terapéuticas.

En un primer aspecto de la presente invención, se proporciona un procedimiento de detección de células cancerosas en una muestra biológica de mamífero, comprendiendo el procedimiento la etapa de detectar de la presencia de una molécula de ácido nucleico del KCNB que tiene una identidad de secuencia de ácidos nucleicos mayor de un 90 % a lo largo de su longitud con respecto a la secuencia de ácidos nucleicos establecida en la SEC. ID NO: 2, en la que un incremento de 1, 5 veces o más del ácido nucleico del KCNB detectado cuando se compara con el normal indica la presencia de células cancerosas.

En otro aspecto de la presente invención se proporciona un procedimiento de detección de células cancerosas en una muestra biológica de mamífero, comprendiendo el procedimiento la etapa de detectar la presencia de una molécula de ácido nucleico del KCNB que comprende al menos 50 nucleótidos contiguos del ácido nucleico que tiene la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 2 a 5, en la que un incremento de 1, 5 veces o más del ácido nucleico del KCNB detectado cuando se compara con el normal indica la presencia de células cancerosas.

En otro aspecto de la presente invención, se proporciona un procedimiento de detección de células cancerosas en una muestra biológica de mamífero, comprendiendo el procedimiento las etapas de:

detectar una sobreexpresión de un polipéptido del KCNB que tiene una secuencia de aminoácidos que es idéntica en un 90 % a lo largo de su longitud con respecto a la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 1 en la muestra, en la que un incremento de 1, 5 veces o más del polipéptido del KCNB detectado cuando se compara con el normal indica la presencia de células cancerosas.

En otro aspecto de la presente invención, se proporciona un procedimiento de detección de células cancerosas en una muestra biológica de mamífero, comprendiendo el procedimiento las etapas de:

detectar una sobreexpresión de un polipéptido del KCNB que tiene al menos 50 péptidos contiguos de la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 1 en la muestra, en la que un incremento de 1, 5 veces o más del polipéptido del KCNB detectado cuando se compara con el normal indica la presencia de células cancerosas.

Además, en otro aspecto de la presente invención se proporciona el uso de un anticuerpo que se une específicamente a un polipéptido del KCNB que comprende una identidad de secuencia de aminoácidos mayor de un 90 % a lo largo de su longitud con respecto a la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 1 para detectar células cancerosas en una muestra biológica de mamífero.

En otro aspecto de la presente invención, se proporciona el uso de un anticuerpo que se une específicamente a un polipéptido del KCNB que comprende al menos 50 péptidos contiguos de la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 1 para detectar células cancerosas en una muestra biológica de mamífero.

La presente divulgación proporciona ácidos nucleicos aislados que codifican una proteína del canal de K+, KCNB (canal de potasio expresado en la mama) . Las secuencias dadas a conocer en el presente documento se pueden usar para cualquiera de una serie de objetivos, incluyendo para la detección específica de células que expresan el KCNB, para la identificación de moléculas que se asocian con y/o modulan la actividad del KCNB, o, y de acuerdo con la invención, para el diagnóstico de cualquiera de una serie de afecciones asociadas con la actividad del canal de K+ o la expresión, por ejemplo, cáncer. El ácido nucleico y el receptor novedoso que lo codifica se denominan en el presente documento, entre otros, KCNB.

En un aspecto, la presente divulgación proporciona un ácido nucleico aislado que codifica un polipéptido que comprende al menos una identidad de secuencia de aminoácidos de un 70 %, a menudo una identidad de secuencia mayor de un 90 % o de un 95 %, con respecto a la SEQ ID NO: 1. En una realización, el ácido nucleico codifica un polipéptido que se une específicamente a los anticuerpos policlonales generados contra una secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 1. En otra realización, el ácido nucleico codifica un polipéptido que tiene una actividad de canal de potasio. En otra realización, el ácido nucleico codifica una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 1.

En otras realizaciones, el ácido nucleico comprende una secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO: 2 o SEQ ID NO: 5 o se puede amplificar por cebadores que se hibridan específicamente bajo condiciones restrictivas a un ácido nucleico que tiene una secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO: 2 o SEQ ID NO: 5.

En otro aspecto, la divulgación proporciona un ácido nucleico aislado que se hibrida específicamente bajo condiciones de hibridación restrictivas a un ácido nucleico que tiene una secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO: 1.

En otro aspecto, la divulgación proporciona un ácido nucleico aislado que codifica un polipéptido que comprende una identidad de aminoácidos de al menos un 70 %, a menudo una identidad de secuencia mayor de un 90 % o de un 95 %, con respecto a un polipéptido que tiene una secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 1, en la que el ácido nucleico se hibrida de forma selectiva bajo condiciones de hibridación moderadamente restrictivas a una secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO: 1.

En otra realización, la divulgación proporciona un polipéptido aislado que comprende una identidad de secuencia de aminoácidos de al menos un 70 %, a menudo una identidad de secuencia mayor de un 90 % o de un 95 %, con respecto a una secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 1. En una realización, el polipéptido se une específicamente a los anticuerpos policlonales generados contra la SEQ ID NO: 1. En otra realización, el polipéptido tiene una actividad de canal de potasio. En una realización adicional, el polipéptido tiene una secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 1.

En otro aspecto, la divulgación proporciona un anticuerpo que se une selectivamente a un polipéptido que comprende una identidad de aminoácidos de al menos un 70 %, a menudo una identidad de secuencia mayor de un 90 % o de un 95 %, con respecto a una secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 1.

En otro aspecto, la divulgación proporciona un vector de expresión que comprende un ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende una identidad de secuencia de aminoácidos de al menos un 70 %, a menudo una identidad de secuencia mayor de un 90 % o de un 95 %, con respecto a la SEQ ID NO: 1. En otro aspecto, la invención proporciona una célula huésped transfectada con el vector.

La presente divulgación también proporciona un procedimiento de identificación de un compuesto que modula la actividad del canal de potasio, comprendiendo el procedimiento: (i) poner en contacto el compuesto con un polipéptido que comprende una identidad de secuencia de aminoácidos de al menos un 70 %, a menudo una identidad de secuencia mayor de un 90 % o de un 95 %, con respecto a la SEQ ID NO: 1; y ii) determinar el efecto funcional del compuesto sobre el polipéptido. En una realización, el polipéptido está unido a una fase sólida, por ejemplo, unido covalentemente a una fase sólida.

En una realización, el efecto funcional se determina midiendo los cambios en el flujo de iones. En otra realización, el efecto funcional se determina midiendo la unión del compuesto al polipéptido. En otra realización, el polipéptido es recombinante. En algunas realizaciones, el polipéptido... [Seguir leyendo]

 


Reivindicaciones:

1. Un procedimiento de detección de células cancerosas en una muestra biológica de mamífero, comprendiendo el procedimiento la etapa de detectar la presencia de una molécula de ácido nucleico del KCNB que tiene una identidad de secuencia de ácidos nucleicos mayor de un 90 % a lo largo de su longitud con respecto a la secuencia de ácidos nucleicos establecida en la SEQ ID NO: 2, en el que un incremento de 1, 5 veces o más del ácido nucleico del KCNB detectado en comparación con el valor normal indica la presencia de células cancerosas.

2. Un procedimiento de detección de células cancerosas en una muestra biológica de mamífero, comprendiendo el procedimiento la etapa de detectar la presencia de una molécula de ácido nucleico del KCNB que comprende al menos 50 nucleótidos contiguos del ácido nucleico que tiene la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 2 ó 5, en el que un incremento de 1, 5 veces o más del ácido nucleico del KCNB detectado en comparación con el valor normal indica la presencia de células cancerosas.

3. El procedimiento de la reivindicación 1 ó 2, en el que el ácido nucleico del KCNB que se detecta comprende la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 2.

4. El procedimiento de la reivindicación 2, en el que el ácido nucleico del KCNB que se detecta comprende la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 5.

5. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que la molécula de ácido nucleico se pone en contacto con una sonda que se hibrida selectivamente al ácido nucleico del KCNB bajo condiciones en las que la sonda se hibrida selectivamente a la molécula de ácido nucleico para formar un complejo de hibridación estable, y detectar el complejo de hibridación.

6. El procedimiento de la reivindicación 5, en el que la etapa de puesta en contacto comprende además la etapa de amplificación del ácido nucleico del KCNB en una reacción de amplificación.

7. El procedimiento de la reivindicación 6, en el que la reacción de amplificación es una reacción en cadena de la polimerasa.

8. Un procedimiento de detección de células cancerosas en una muestra biológica de mamífero, comprendiendo el procedimiento las etapas de:

detectar una sobreexpresión de un polipéptido del KCNB que tiene una secuencia de aminoácidos que es idéntica en un 90 % a lo largo de su longitud con respecto a la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEQ ID NO: 1 en la muestra, en la que un incremento de 1, 5 veces o más del polipéptido del KCNB detectado cuando se compara con el normal indica la presencia de células cancerosas.

9. Un procedimiento de detección de células cancerosas en una muestra biológica de mamífero, comprendiendo el procedimiento las etapas de:

detectar una sobreexpresión de un polipéptido del KCNB que tiene al menos 50 péptidos contiguos de la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEQ ID NO: 1 en la muestra, en la que un incremento de 1, 5 veces o más del polipéptido del KCNB detectado cuando se compara con el normal indica la presencia de células cancerosas.

10. El procedimiento de la reivindicación 8 ó 9, en el que el polipéptido del KCNB que se detecta comprende la secuencia establecida en la SEQ ID NO: 1.

11. El procedimiento de la reivindicación 8, 9 ó 10, en el que el polipéptido del KCNB se detecta usando un anticuerpo que se une específicamente al polipéptido.

12. El procedimiento de la reivindicación 11, en el que se marca el anticuerpo.

13. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que la muestra es una muestra biológica humana.

14. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que las células cancerosas se seleccionan del grupo que consiste en células de cáncer de mama, células de cáncer de pulmón, células de cáncer de colon y células de cáncer de próstata.

15. El procedimiento de la reivindicación 14, en el que las células cancerosas son células de cáncer de mama.

16. El procedimiento de la reivindicación 14, en el que las células cancerosas son células de cáncer de pulmón.

17. El uso de un anticuerpo que se une específicamente a un polipéptido del KCNB que comprende una identidad de secuencia de aminoácidos mayor de un 90 % a lo largo de su longitud con respecto a la secuencia de

aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 1 para detectar células cancerosas en una muestra biológica de mamífero.

18. El uso de un anticuerpo que se une específicamente a un polipéptido del KCNB que comprende al menos 50

péptidos contiguos de la secuencia de aminoácidos establecida en la SEQ ID NO: 1 para detectar células 5 cancerosas en una muestra biológica de mamífero.

19. El uso de la reivindicación 17, en el que se marca el anticuerpo.

20. El uso de una cualquiera de las reivindicaciones 17 ó 18, en el que la muestra es una muestra biológica humana.

21. El uso de una cualquiera de las reivindicaciones 17 a 20, en el que las células cancerosas se seleccionan del

grupo que consiste en células de cáncer de mama, células de cáncer de pulmón, células de cáncer de colon y 10 células de cáncer de próstata.

22. El uso de la reivindicación 21, en el que las células cancerosas son células de cáncer de mama.

23. El uso de la reivindicación 21, en el que las células cancerosas son células de cáncer de pulmón.

Figura 1

Figura 2

Figura 3

Figura 4


 

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