Transposición conservadora de contigüidad.

Un método para preparar una genoteca de fragmentos de ADN codificados con códigos de barras de un ácido nucleico diana que comprende:



a. poner en contacto un ácido nucleico diana con una pluralidad de complejos de transposomas, cada complejo de transposomas comprende:

transposones y transposasas, en donde los transposones comprenden cadenas transferidas y cadenas no transferidas, en donde al menos uno de los transposones del complejo de transposomas comprende una secuencia de adaptadores capaz de hibridar a una secuencia de captura complementaria;

b. fragmentar el ácido nucleico diana en una pluralidad de fragmentos e insertar una pluralidad de cadenas transferidas en el extremo 5' de al menos una cadena de fragmentos mientras se mantiene la contigüidad del ácido nucleico diana;

c. poner en contacto la pluralidad de fragmentos del ácido nucleico diana con una pluralidad de soportes sólidos, cada uno de los soportes sólidos en la pluralidad comprende una pluralidad de oligonucleótidos inmovilizados, cada uno de los oligonucleótidos comprende una secuencia de captura complementaria y una primera secuencia de códigos de barras, y

en donde la primera secuencia de códigos de barras de cada soporte sólido en la pluralidad de los soportes sólidos difiere de la primera secuencia de códigos de barras de otros soportes sólidos en la pluralidad de soportes sólidos;

d. transferir la información de la secuencia de códigos de barras a los fragmentos del ácido nucleico diana,

produciendo así una genoteca de fragmentos bicatenarios,

en donde al menos una cadena está marcada en el extremo 5' con el primer código de barras, en donde al menos dos fragmentos del mismo ácido nucleico diana reciben información idéntica de códigos de barras.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2015/056040.

Solicitante: ILLUMINA CAMBRIDGE LIMITED.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 5200 Illumina Way San Diego, CA 92122 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: ZHANG,FAN, BETLEY,JASON RICHARD, GORMLEY,NIALL ANTHONY, GORYSHIN,IGOR, MEULEMAN,WOUTER, HE,MOLLY, IOANNOU,AVGOUSTA, GUNDERSON,KEVIN L, STEEMERS,FRANK J, WEIR,JACQUELINE, JENKINS,GARETH, JACKSON,ROSAMOND, MORRELL,NATALIE, POKHOLOK,DMITRY K, NORBERG,STEVEN J, KIA,AMIRALI, PANTOJA,RIGO.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12N15/10 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN (biocidas, productos que repelen o atraen a los animales nocivos, o reguladores del crecimiento de los vegetales, que contienen microorganismos virus, hongos microscópicos, enzimas, productos de fermentación o sustancias obtenidas por o extraídas de microorganismos o sustancias animales A01N 63/00; preparaciones de uso médico A61K; fertilizantes C05F ); PROPAGACION,CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Procedimientos para el aislamiento, la preparación o la purificación de ADN o ARN (preparación química de ADN o ARN C07H 21/00; preparación de polinucleótidos no estructurales a partir de microorganismos o con la ayuda de enzimas C12P 19/34).

PDF original: ES-2745814_T3.pdf

 

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