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Métodos y soportes sólidos para la preparación de muestras utilizando transposomas.

(08/02/2019) Un método para preparar una biblioteca inmovilizada de fragmentos de ADN marcados que comprende: (a) proporcionar un soporte sólido que tiene una pluralidad de complejos de transposoma inmovilizados en el mismo, en donde cada complejo de transposoma comprende: una transposasa unida de manera no covalente a un primer polinucleótido de un ácido nucleico bicatenario que comprende el primer y un segundo polinucleótido, en donde dicho primer polinucleótido está inmovilizado en dicho soporte sólido, y en donde dicho primer polinucleótido comprende (i) una parte 3' que comprende una secuencia terminal de transposón y (ii) un primer marcador que comprende un primer dominio de marcador; …

Nucleótidos etiquetados.

Secciones de la CIP Química y metalurgia Física

(26/12/2018). Inventor/es: LIU,XIAOHAI, MILTON,JOHN, RUEDIGER,SILKE. Clasificación: C07H21/00, C12Q1/68, G01N33/53, C07H19/20, C07H19/10, C07H19/06, C07H19/16.

Un nucleósido o nucleótido que tiene una base unida a una etiqueta detectable a través de un conector disociable, caracterizado porque el conector disociable contiene un residuo seleccionado del grupo que consiste en:**Fórmula** en el que X se selecciona del grupo que consiste en O, S, NH y NQ, en el que Q es un grupo alquilo C1-10 sustituido o no sustituido, Y se selecciona del grupo que consiste en O, S, NH y N(alilo), T es hidrógeno o un grupo alquilo C1-10 sustituido o no sustituido y * indica donde el el residuo está conectado al resto del nucleótido o nucleósido, y en donde el nucleósido o nucleótido comprende un residuo ribosa o desoxirribosa con un grupo protector alilo o azidometilo unido al átomo de oxígeno 2' o 3'.

PDF original: ES-2694651_T3.pdf

Compuestos de polimetina y su uso como marcadores fluorescentes.

Secciones de la CIP Física Química y metalurgia

(28/11/2018). Inventor/es: ROMANOV,NIKOLAI NIKOLAEVICH. Clasificación: G01N33/533, C07D209/08, C09B23/02.

Un compuesto de fórmula (IVd) (IV) o formas mesoméricas del mismo: **(Ver fórmula)** en la que mCat+ o mAn- es un contraión orgánico o inorgánico cargado positivamente/negativamente y m es un entero 0-3; n es un entero 1-5; y q es un entero desde 1-6.

PDF original: ES-2702662_T3.pdf

Nucleósidos o nucleótidos modificados.

(09/10/2018) Molécula de nucleótido o nucleósido modificada que comprende una base de purina o pirimidina y un resto de azúcar de ribosa o desoxirribosa que tiene un grupo protector de 3'-hidroxi retirable que forma una estructura -OC( R)2N3 unida covalentemente al átomo de carbono 3', en donde: R se selecciona entre el grupo que consiste en hidrógeno, -C(R1)m(R2)n, -C(≥O)OR3, -C(≥O)NR4R5, - C(R6)2O(CH2)pNR7R8 y -C(R9)2O-Ph-C(≥O)NR10R11; cada R1 y R2 se selecciona independientemente entre hidrógeno, o halógeno; R3 se selecciona entre hidrógeno o alquilo opcionalmente sustituido; cada R4 y R5 se selecciona independientemente entre hidrógeno,…

Nucleótidos marcados.

Sección de la CIP Química y metalurgia

(28/06/2017). Inventor/es: LIU,XIAOHAI, BARNES,COLIN, BALASUBRAMANIAN,SHANKAR, SWERDLOW,HAROLD. Clasificación: C07H21/00, C12Q1/68, C07H19/20, C07H19/10, C07H19/06, C07H19/16.

Un método para detectar la extensión de un cebador hibridado a un polinucleótido objetivo, que comprende: (a) proporcionar al menos un nucleótido que comprende un marcador fluorescente unido mediante un enlazador a la base de nucleótido, y un grupo protector Unido al oxígeno 2' o 3' del azúcar nucleótido, en donde el enlazador puede ser escindido por exposición a radicales, metales, agentes reductores o agentes oxidantes; (b) extender el cebador hibridado con el nucleótido solamente si la base de nucleótidos es complementaria a la base en la posición correspondiente del polinucleótido objetivo; y (c) detectar la presencia del marcador en el cebador extendido; detectando así la extensión del cebador.

PDF original: ES-2642963_T3.pdf

Nucleótidos marcados.

Secciones de la CIP Química y metalurgia Física

(01/02/2017). Inventor/es: LIU,XIAOHAI, BARNES,COLIN, BALASUBRAMANIAN,SHANKAR, SWERDLOW,HAROLD. Clasificación: C07H21/00, C12N15/09, C12Q1/68, G01N33/53, G01N33/533, C07H21/04, G01N33/566, C07H19/20, C07H19/10, C07H19/06, C07H19/16.

Una molécula de nucleótido o nucleósido, que tiene una base que se une a un marcador detectable a través de un enlazador escindible, en donde la molécula tiene una porción de azúcar ribosa o desoxirribosa que comprende un grupo protector unido a través del átomo de oxígeno 2' o 3' y el enlazador escindible y el grupo protector son escindibles bajo condiciones idénticas y en donde el enlazador puede ser escindido por exposición a radicales, metales, agentes reductores o agentes oxidantes.

PDF original: ES-2620131_T3.pdf

Nucleótidos etiquetados.

Secciones de la CIP Química y metalurgia Física

(26/10/2016). Inventor/es: LIU,XIAOHAI, MILTON,JOHN, RUEDIGER,SILKE. Clasificación: C07H21/00, C12Q1/68, G01N33/53, C07H19/20, C07H19/10, C07H19/06, C07H19/16.

Un nucleósido o nucleótido que tiene una base unida a una etiqueta detectable por medio de un conector disociable, caracterizado porque el conector disociable comprende un grupo alilo o azido y el conector es disociable por contacto con fosfinas hidrosolubles o catalizadores hidrosolubles de metal de transición, a base de fosfina.

PDF original: ES-2604951_T3.pdf

Secuenciado pirofosforolítico usando nanoporos.

Sección de la CIP Química y metalurgia

(13/04/2016). Inventor/es: MEULEMAN,WOUTER. Clasificación: C12Q1/68.

Un método para determinar la secuencia de un ácido nucleico diana, que comprende (a) proporcionar un ácido nucleico diana bicatenario; (b) poner en contacto el ácido nucleico diana con una polimerasa en condiciones de eliminar sucesivamente nucleótidos de la primera de las dos cadenas por pirofosforólisis, produciendo secuencialmente de este modo trifosfatos de nucleótido que tienen una variedad de diferentes restos de bases; y (c) distinguir los diferentes restos de bases para los trifosfatos de nucleótidos producidos sucesivamente, determinando de ese modo la secuencia del ácido nucleico diana; en donde la distinción de los diferentes restos de bases para los trifosfatos de nucleótidos producidos sucesivamente comprende pasar los trifosfatos de nucleótidos a través de un nanoporo.

PDF original: ES-2660671_T3.pdf

Nucleótidos modificados para secuenciación de polinucleótidos.

Sección de la CIP Química y metalurgia

(06/04/2016). Inventor/es: SMITH, MARK, LIU,XIAOHAI, MILTON,JOHN, BARNES,COLIN, WU,XIAOLIN, BRENNAN,JOSEPH, RUEDIGER,SILKE. Clasificación: C07H21/00, C12Q1/68, C07H19/20, C07H19/10, C07H19/06, C07H19/16.

Una molécula de nucleótido trifosfato modificada que comprende una base de purina o pirimidina y una unidad estructural de azúcar desoxirribosa que tiene un grupo 3'-azidometilo.

PDF original: ES-2664803_T3.pdf

Método de secuenciación de ácido nucleico.

(15/03/2016) Un método de secuenciación de una molécula de ácido nucleico que comprende: a. utilizar una primera colonia para proporcionar una pluralidad de moléculas de ácido nucleico monocatenario que tienen la misma secuencia y que hibridan con cebadores de una manera que permite la extensión de cebadores; b. utilizar una segunda colonia para proporcionar una pluralidad de moléculas de ácido nucleico monocatenario que tienen la misma secuencia y que hibridan con cebadores de una manera que permite la extensión de cebadores; c. proporcionar a cada colonia una polimerasa de ácido nucleico y un nucleótido marcado…

Métodos mejorados de secuenciación de ácidos nucleicos.

Sección de la CIP Química y metalurgia

(02/03/2016). Inventor/es: GORMLEY,NIALL ANTHONY, FRASER,LOUISE, KOKKO-GONZALES,PAULA. Clasificación: C12Q1/68.

Un método de etiquetar dúplex de ácido nucleico que comprende las etapas de: (a) suministrar una transposasa y una composición de transposón; (b) suministrar uno o más dúplex de ácido nucleico y movilizado sobre un soporte; (c) poner en contacto la transposasa y la composición de transposón con los uno o más dúplex de ácido nucleico bajo condiciones en donde los uno o más dúplex de ácido nucleico y la composición de transposón sufren una reacción de transposición para producir uno o más dúplex de ácido nucleico etiquetados, en donde la composición de transposón comprende una molécula de ácido nucleico de doble cadena que comprende una cadena transferida y una cadena no transferida.

PDF original: ES-2565809_T3.pdf

Compuestos rodamina y su uso como marcadores fluorescentes.

(13/01/2016) Un compuesto de la fórmula (I) y mesómeros del mismo:**Fórmula** En el que M+/- es un contraión común, k es un entero desde 0 hasta 6, q es un entero desde 1 hasta 6, R1 es H o un grupo alquilo, arilo o alquilo sustituido o arilo sustituido, R2 es H, grupo alquilo o alquilo sustituido, halógeno, carboxi, carboxamida, grupo hidroxi- o alcoxi, o R2 junto con R1 o R5 es una cadena de carbonos o heterosustituida que forma un anillo, R3 es H, grupo alquilo o alquilo sustituido, halógeno, carboxi, carboxamida, grupo hidroxi- o alcoxi o R3 junto con R4 o R6 es una cadena de carbonos o heterosustituida que forma un anillo, …

Compuestos de polimetina y su uso como marcadores fluorescentes.

Secciones de la CIP Química y metalurgia Física

(13/01/2016). Inventor/es: LIU,XIAOHAI, ROMANOV,NIKOLAI NIKOLAEVICH. Clasificación: C07D209/08, G01N33/00, C09B23/02.

Un compuesto de la fórmula (I) o formas mesoméricas del mismo:**Fórmula** en la que mCat+ o mAn- es un contraión cargado positiva/negativamente inorgánico u orgánico y m es un entero de 0 a 3; cada uno de Ra1 y Ra2 es independientemente H, SO3-, sulfonamida, halógeno, o un anillo adicional fusionado a un átomo de carbono adyacente; Rb es alquilo o alquilo sustituido con un grupo carboxi o un sulfónico o derivados del mismo; cada uno de Rc1 y Rc2 es independientemente alquilo o alquilo sustituido; y cualquiera de Rb o uno de Rc1 o Rc2 contiene un grupo funcional de enlace para adhesión adicional o se une a una molécula adicional.

PDF original: ES-2620423_T3.pdf

Nucleótidos modificados para secuenciación de polinucleótidos.

(10/11/2015) Un método para convertir un compuesto de fórmula R-O-alilo a un compuesto correspondiente en el cual el grupo alilo es eliminado y reemplazado por hidrógeno, comprendiendo dicho método la etapa de hacer reaccionar un compuesto de fórmula R-O-alilo en solución acuosa con un metal de transición y una fosfina soluble en agua, en donde R es una molécula de nucleósido, nucleótido o polinucleótido de fórmula PN-O-alilo, en donde PN es dicho nucleósido o nucleótido o es un nucleótido con terminal 3' de dicho polinucleótido.

Método de preparación de bibliotecas de polinucleótidos molde.

(11/12/2013) Un método para generar una biblioteca de moléculas polinucleotídicas molde que tienen secuencias comunes en sus extremos 5' y secuencias comunes en sus extremos 3', comprendiendo el método: ligar polinucleótidos adaptadores con apareamiento erróneo idénticos en ambos extremos de cada uno de uno o más dúplex de polinucleótido diana para formar una o más construcciones adaptador-diana, en el que cada adaptador con apareamiento erróneo se forma a partir de dos cadenas polinucleotídicas hibridadas que forman un complejo biomolecular que comprende al menos una región bicatenaria y una región no apareada, y realizar una reacción de extensión con cebador inicial…

Procedimiento para la secuenciación de un molde polinucleotídico.

(27/09/2013) Un procedimiento para la secuenciación por pares de una primera y segunda regiones de un polinucleótido dedoble hebra diana, en el que dichas primera y segunda regiones están en el mismo polinucleótido de doble hebradiana, comprendiendo el procedimiento: (a) proporcionar un soporte sólido que tiene inmovilizado sobre él una pluralidad de polinucleótidos molde dedoble hebra formados cada uno a partir de una primera y segunda hebras molde complementarias unidas alsoporte sólido en sus extremos 5' y múltiples copias de uno o más cebadores inmovilizados en el extremo 5'capaces de hibridar con el extremo 3' de la primera hebra del molde; (b) eliminar selectivamente las segundas hebras del molde de la pluralidad de polinucleótidos molde de doblehebra para permitir la hibridación de las primeras hebras molde con cebadores…

Nucleótidos modificados para la secuenciación de polinucleótidos.

(13/06/2013) Una molécula de nucleótido modificada que comprende una base purina o pirimidina y una porción de azúcarribosa o deoxiribosa con un grupo de bloqueo 3'-OH removible covalentemente unido a ella, tal que el átomo decarbono 3' tiene unido un grupo de la estructura-O-Zen donde Z es cualquiera de -C(R')2-N(R")2'C(R')2-N(H)R", y -C(R')2-N3,en donde cada R" es, o es parte de un grupo protector removible; cada R' es independientemente un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo, alquilo sustituido, arilalquilo, alquenilo,alquinilo, arilo, heteroarilo, heterocíclico, acilo, ciano, alcoxi, ariloxi, heteroariloxi o amido, o un marcadordetectable unido a través de un grupo de enlace; o (R')2 representa un grupo alquilideno de la fórmula ≥C(R''')2en donde cada R''' puede ser igual o diferente y se selecciona del grupo que…

Preparación de plantillas para la secuenciación de ácidos nucleicos.

(21/03/2013) Un procedimiento para generar una plantilla para una reacción de secuenciación de ácidos nucleicos quecomprende, (i) proporcionar al menos una molécula de ácido nucleico bicatenario unida a un soporte sólido por el extremo5', en la que la molécula de ácido nucleico bicatenario comprende una región diana a ser secuenciada ysecuencias no diana que flanquean a la región diana, (ii) escindir una hebra de la molécula de ácido nucleico bicatenario, en un sitio abásico, en el que el sitio parala escisión está ubicado en la secuencia no objetivo, y (iii) someter la hebra escindida a unas condiciones desnaturalizantes para eliminar la porción de la hebraescindida…

NUCLEOTIDOS MARCADOS.

Secciones de la CIP Química y metalurgia Física

(30/09/2009). Ver ilustración. Inventor/es: MILTON,JOHN SOLEXA LIMITED, RUEDIGER,SILKE SOLEXA LIMITED, LIU,XIAOHAI SOLEXA LIMITED. Clasificación: C07H21/00, C12Q1/68, G01N33/53, C07H19/20, C07H19/10, C07H19/23, C07H19/06, C07H19/16.

Un nucleótido o nucleósido que tiene una base unida a un marcador detectable por un enlazador escindible, caracterizado por que el enlazador escindible contiene un resto seleccionado del grupo que comprende: en el que X se selecciona del grupo que comprende O, S, NH y NQ donde Q es un grupo alquilo C1-10 sustituido o no sustituido, Y se selecciona del grupo que comprende O, S, NH y N(alilo), T es hidrógeno o un grupo alquilo C1-10 sustituido o no sustituido y * indica dónde se conecta el resto a la parte restante del nucleótido o nucleósido.

 

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