Procedimiento para seleccionar clonotipos raros.

Un procedimiento para seleccionar uno o más clonotipos específicos del paciente correlacionados con una neoplasia linfoide para controlar una enfermedad residual mínima de la misma,

comprendiendo el procedimiento las etapas de:

(a) amplificar moléculas de ácido nucleico de linfocitos T y/o linfocitos B de una muestra obtenida de un paciente, comprendiendo las moléculas de ácido nucleico secuencias de ADN recombinadas de genes del receptor de linfocitos T o genes de inmunoglobulina;

(b) secuenciar las moléculas amplificadas de ácido nucleico para formar un perfil de clonotipo;

(c) comparar clonotipos del perfil de clonotipo con los clonotipos de una base de datos de clonotipos, en el que la base de datos de clonotipos comprende clonotipos de perfiles de clonotipos de al menos 104 clonotipos de al menos 10 individuos distintos del paciente, para determinar una presencia, ausencia y/o nivel en la base de datos de clonotipos de cada clonotipo del perfil de clonotipo, en el que la etapa de comparación incluye contar un clonotipo como presente en la base de datos de clonotipos si un clonotipo en la base de datos de clonotipos es miembro del mismo clan que el clonotipo del perfil de clonotipo, y un clonotipo se considera miembro del mismo clan si

(i) el clonotipo de la base de datos de clonotipos es al menos noventa por ciento idéntico al clonotipo del perfil de clonotipo;

(ii) el clonotipo de la base de datos de clonotipos y el clonotipo del perfil de clonotipo comprenden secuencias recombinadas de la cadena pesada de inmunoglobulina y están relacionadas por un reemplazo de VH;

(iii) el clonotipo de la base de datos de clonotipos y el clonotipo del perfil de clonotipo tienen una región V y una región J mutadas idénticamente pero tienen una región NDN diferente;

(iv) el clonotipo de la base de datos de clonotipos y el clonotipo del perfil de clonotipo comprenden cada uno secuencias recombinadas de la cadena pesada de inmunoglobulina y están relacionados por hipermutación; o

(v) si los clonotipos han sufrido una o más inserciones y/o deleciones de 1-10 bases; y

(d) seleccionar uno o más clonotipos específicos del paciente para controlar la enfermedad residual mínima, cada uno de los cuales se correlaciona con la neoplasia linfoide y cada uno de ellos está:

i) ausente de la base de datos de clonotipos; o

ii) a un nivel en la base de datos de clonotipos por debajo de una frecuencia predeterminada.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2014/017416.

Solicitante: Adaptive Biotechnologies Corporation.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 1551 Eastlake Avenue East, Suite 200 Seattle, Washington 98102 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: FAHAM,MALEK, MOORHEAD,MARTIN, PEPIN,FRANCOIS.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/6809
  • C12Q1/6858
  • C12Q1/6869

PDF original: ES-2748204_T3.pdf

 

Patentes similares o relacionadas:

Detección prenatal no invasiva, del 27 de Mayo de 2020, de Oxford University Innovation Limited: Un procedimiento de detección prenatal para un trastorno recesivo y/o un trastorno causado por una mutación puntual, que comprende: (a) amplificar una […]

Sistema de detección de la reacción en cadena de la polimerasa, del 22 de Abril de 2020, de LGC Genomics Limited: Un método para la detección de un producto de extensión de cebador, comprendiendo el método las etapas de: a) proporcionar uno o más grupos de oligonucleótidos […]

Conjunto de sondas para analizar una muestra de ADN y método para usar el mismo, del 19 de Febrero de 2020, de Vanadis Diagnostics: Sistema de sonda para analizar una muestra de ácido nucleico, que comprende: (a) un conjunto de oligonucleótidos identificadores de secuencia B; […]

Método para proveer fragmentos de ADN derivados de una muestra archivada, del 29 de Enero de 2020, de EPIGENOMICS AG: Un método para amplificar el ADN tratado con bisulfito derivado de una muestra archivada por reacción en cadena de polimerasa, que comprende amplificar el […]

Métodos y materiales para evaluar el desequilibrio alélico, del 18 de Diciembre de 2019, de MYRIAD GENETICS, INC: Un método in vitro para detectar el estado de pérdida de heterocigosidad (LOH) en una pluralidad de loci genómicos de SNP en una muestra de tejido embebida en parafina, […]

Captura, detección y cuantificación de ARN pequeño, del 7 de Agosto de 2019, de LIFE TECHNOLOGIES CORPORATION: Un método para detectar un ARN pequeño maduro, comprendiendo el método: proporcionar una muestra que comprende una molécula de ARN pequeño que comprende aproximadamente […]

Método para la cuantificación relativa de cambios en la metilación del ADN, usando reacciones combinadas de nucleasa, ligamiento, y polimerasa, del 24 de Julio de 2019, de CORNELL UNIVERSITY (100.0%): Un método para identificar, en una muestra que se ha obtenido, una o más moléculas de ácido nucleico diana que se diferencian de otras moléculas de ácido […]

Detección simultánea altamente multiplexada de ácidos nucleicos que codifican heterodímeros de receptores inmunes adaptativos emparejados de muchas muestras, del 25 de Marzo de 2020, de Adaptive Biotechnologies Corp: Un método para asignar un par de polipéptidos primero y segundo que forman un receptor de linfocitos T (TCR) o un heterodímero de inmunoglobulina (Ig) a […]

Utilizamos cookies para mejorar nuestros servicios y mostrarle publicidad relevante. Si continua navegando, consideramos que acepta su uso. Puede obtener más información aquí. .