Evaluación de la inmunocompetencia por la diversidad de los receptores de inmunidad adaptativa y caracterización de la clonalidad.

Un método para predecir una respuesta inmunológica de un sujeto de prueba a una inmunoterapia,

que comprende:

amplificar secuencias de ácido nucleico de una o más muestras de tumor sólido que comprenden células linfoides, en donde las muestras se obtienen del sujeto de prueba en uno o más puntos temporales antes y después del tratamiento con dicha inmunoterapia, y en donde las secuencias de ácido nucleico se amplifican en un ensayo de PCR múltiplex que utiliza una pluralidad de cebadores oligonucleotídicos del segmento V del receptor relacionado con la inmunidad adaptativa (AIR) y una pluralidad de cebadores oligonucleotídicos del segmento J de AIR o uno o más cebadores oligonucleotídicos del segmento C de AIR;

obtener información de secuencia de ácido nucleico a partir de las secuencias de ácido nucleico amplificadas, en donde dicha información de secuencia de ácido nucleico comprende secuencias para una pluralidad de secuencias de ácido nucleico reordenadas únicas, codificando cada una un polipéptido receptor relacionado con la inmunidad adaptativa (AIR);

cuantificar una puntuación de diversidad de secuencia de AIR para dichas una o más muestras de tumor sólido basándose en el número total de secuencias de ADN reordenadas únicas en dichas una o más muestras de tumor sólido, en donde dicha puntuación de diversidad de secuencia de AIR se cuantifica utilizando dicha información de secuencia de ácido nucleico;

cuantificar una puntuación de distribución de la secuencia de AIR para dichas una o más muestras de tumor sólido calculando la frecuencia de aparición de una pluralidad de secuencias de ADN reordenadas únicas en dichas una o más muestras de tumor sólido, en donde dicha puntuación de distribución de la secuencia de AIR se cuantifica utilizando dicha información de secuencia de ácido nucleico;

determinar una puntuación de calificación del sujeto de prueba para dichas una o más muestras de tumor sólido en base a dicha puntuación de diversidad de secuencia de AIR y dicha puntuación de distribución de secuencia de AIR;

comparar dicha puntuación de calificación del sujeto de prueba con una puntuación de calificación del sujeto de control obtenida a partir de una muestra de un sujeto de control con una respuesta conocida a dicha inmunot predecir una respuesta inmunológica para dicho sujeto de prueba a dicha inmunoterapia en base a dicha comparación.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2013/062925.

Solicitante: Adaptive Biotechnologies Corporation.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 1551 Eastlake Avenue East, Suite 200 Seattle, Washington 98102 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: ROBINS,HARLAN, RUBINSTEIN,JULIE, EMERSON,RYAN, YUAN,JIANDA.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2660027_T3.pdf

 

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