Evaluación de la inmunocompetencia por la diversidad de los receptores de inmunidad adaptativa y caracterización de la clonalidad.

Un método para predecir una respuesta de un sujeto de prueba a una inmunoterapia,

que comprende:

(a) obtener información de secuencias de ácido nucleico de una o más muestras de tumor sólido obtenidas del sujeto de prueba, en donde las una o más muestras de tumores sólidos comprenden ácidos nucleicos de células linfoides del sujeto de prueba, y en donde la información de secuencia de ácido nucleico comprende secuencias para una pluralidad de secuencias de ácido nucleico reordenadas únicas, codificando cada una un polipéptido receptor relacionado con la inmunidad adaptativa (AIR);

(b) cuantificar una puntuación de diversidad de secuencia de AIR para las una o más muestras de tumor sólido basándose en el número total de secuencias de ADN reordenadas únicas en las una o más muestras de tumor sólido, en donde la puntuación de diversidad de secuencia de AIR se cuantifica utilizando la información de secuencia de ácido nucleico;

(c) cuantificar una puntuación de distribución de la secuencia de AIR para las una o más muestras de tumor sólido calculando la frecuencia de aparición de una pluralidad de secuencias de ADN reordenadas únicas en las una o más muestras de tumor sólido, en donde la puntuación de distribución de la secuencia de AIR se cuantifica utilizando la información de secuencia de ácido nucleico;

(d) determinar una puntuación de calificación del sujeto de prueba para el sujeto de prueba en base a la puntuación de diversidad de secuencia de AIR y dicha puntuación de distribución de secuencia de AIR; y

(e) predecir una respuesta del sujeto de prueba a la inmunoterapia en base a la puntuación de calificación del sujeto, en donde una puntuación de calificación del sujeto de prueba caracterizada por una baja puntuación de diversidad de secuencia y una baja puntuación de distribución de secuencia AIR es indicativa de una elevada clonalidad de TCR y es predictiva de una respuesta positiva a dicha inmunoterapia.

Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E17199432.

Solicitante: Adaptive Biotechnologies Corporation.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 1551 Eastlake Avenue East, Suite 200 Seattle, Washington 98102 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: ROBINS,HARLAN, RUBINSTEIN,JULIE, EMERSON,RYAN, YUAN,JIANDA.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2749118_T3.pdf

 

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