10 patentes, modelos y diseños de Adaptive Biotechnologies Corporation

Perfilado de la inmunidad adaptativa y métodos para la generación de anticuerpos monoclonales.

(01/05/2019) Un método para generar un anticuerpo monoclonal, que comprende las etapas de: a) crear una biblioteca de secuencias de ADNc de anticuerpo diana, comprendiendo la creación las etapas de: i) transcribir de forma inversa el ARNm a ADNc, en donde el ARNm se ha aislado de linfocitos aislados procedentes de un sujeto hospedador que se ha inmunizado con un antígeno; ii) amplificar las secuencias de ADNc del anticuerpo diana; y iii) secuenciar las secuencias de ADNc del anticuerpo diana, en donde las secuencias de ADNc del anticuerpo diana amplificadas se secuencian mediante secuenciación masiva paralela; y b) analizar la frecuencia de las secuencias de ADNc del anticuerpo diana secuenciadas, que comprende: i) comparar las frecuencias relativas de las secuencias de ADNc del…

Análisis biomolecular a gran escala con marcadores de secuencia.

(15/04/2019) Un método de determinación de un perfil de clonotipo de ácidos nucleicos recombinados que codifican una pluralidad de cadenas de receptor inmunitario en una muestra, comprendiendo el método las etapas de: (a) unir marcadores de secuencia a moléculas de ácido nucleico recombinadas de genes de receptores de linfocitos T o genes de inmunoglobulina a partir de una muestra de un individuo que comprende linfocitos T y/o linfocitos B y/o ADN sin células para formar conjugados de marcador-ácido nucleico, en donde al menos un ácido nucleico recombinado o copias del mismo tienen distintos marcadores de secuencia unidos; (b) amplificar los conjugados de marcador-ácido nucleico; (c) secuenciar una muestra de los conjugados de marcador-ácido nucleico para proporcionar lecturas de secuencias teniendo…

Método para medir y calibrar el sesgo de amplificación en reacciones de PCR multiplexadas.

(23/01/2019) Un método para determinar el potencial de amplificación de ácido nucleico no uniforme entre los miembros de un conjunto de cebadores oligonucleotídicos que es capaz de amplificar moléculas de ácido nucleico reordenadas que codifican uno o más receptores inmunitarios adaptativos en una muestra biológica que comprende moléculas de ácido nucleico reordenadas de células linfoides de sujeto mamífero, comprendiendo el método: (a) amplificar una composición que comprende una pluralidad de oligonucleótidos molde utilizando el conjunto de cebadores oligonucleotídicos en una reacción de PCR múltiple para obtener una pluralidad de oligonucleótidos molde amplificados, en donde…

Diagnóstico de tumores malignos linfoides y detección de enfermedad residual mínima.

(24/09/2018) Un método para detectar enfermedad residual mínima para un tumor maligno hematológico linfoide en un sujeto después de la terapia, comprendiendo el método (a) amplificación de ADN extraído de una primera muestra en una reacción en cadena de polimerasa múltiple (PCR) utilizando cebadores del segmentos V y J para producir una multiplicidad de moléculas de ADN reordenado amplificado que comprenden cada una una región que codifica CDR3 de TCR, en donde la primera muestra se ha obtenido del sujeto antes de la terapia y comprende una pluralidad de células hematopoyéticas linfoides, (b) secuenciación de alto rendimiento de dicha multiplicidad de moléculas de ADN reordenado amplificado…

Evaluación de la inmunocompetencia por la diversidad de los receptores de inmunidad adaptativa y caracterización de la clonalidad.

(06/12/2017) Un método para predecir una respuesta inmunológica de un sujeto de prueba a una inmunoterapia, que comprende: amplificar secuencias de ácido nucleico de una o más muestras de tumor sólido que comprenden células linfoides, en donde las muestras se obtienen del sujeto de prueba en uno o más puntos temporales antes y después del tratamiento con dicha inmunoterapia, y en donde las secuencias de ácido nucleico se amplifican en un ensayo de PCR múltiplex que utiliza una pluralidad de cebadores oligonucleotídicos del segmento V del receptor relacionado con la inmunidad adaptativa (AIR) y una pluralidad de cebadores oligonucleotídicos del segmento J de AIR o uno o más cebadores oligonucleotídicos del segmento C de AIR; …

Clonotipos de receptores de células T compartidos entre pacientes con espondilitis anquilosante.

Secciones de la CIP Química y metalurgia Necesidades corrientes de la vida

(11/01/2017). Inventor/es: FAHAM,MALEK, CARLTON,VICTORIA, MOORHEAD,MARTIN, ZHENG,JIANBIAO, ASBURY,THOMAS. Clasificación: C12N15/12, A61K39/395, C12Q1/68, C07K16/18.

Un método para determinar un estado de la enfermedad de un paciente que sufre, o es sospechoso de sufrir, espondilitis anquilosante, donde el método comprende las etapas de: (a) amplificar moléculas de ácido nucleico de las células T de una muestra obtenida del paciente, teniendo las moléculas de ácido nucleico secuencias de ADN recombinadas de genes de los receptores de las células T; (b) secuenciar las moléculas amplificadas de ácido nucleico para formar un perfil de clonotipos; (c) determinar a partir del perfil de clonotipos una presencia, una ausencia y/o un nivel de clonotipos codificantes de segmentos de un receptor de las células T al menos un setenta por ciento idéntico a un segmento en el grupo consistente en LCASSLEASGSSYNEQFFGPGTRLTV (SEC. Nº ID. 1) y VYFCASSDSSGSTDTQYFGPGTRLTV (SEC. Nº ID. 2); y (d) correlacionar la presencia, ausencia y/o nivel de dichos clonotipos con un estado de espondilitis anquilosante en el paciente.

PDF original: ES-2619713_T3.pdf

Monitorización de estados de salud y enfermedad usando perfiles de clonotipos.

Sección de la CIP Física

(10/08/2016). Inventor/es: FAHAM,MALEK, WILLIS,THOMAS. Clasificación: G01N33/48.

Un método para detectar la recurrencia de un neoplasma linfoide en un paciente con clonotipos de cáncer definidos que comprende las etapas de: (a) determinar un perfil de secuencias de ADN recombinadas en células T y/o células B que comprende las etapas de: (i) amplificar moléculas de ácido nucleico de células T y/o células B de una muestra obtenida del paciente; (ii) aislar espacialmente moléculas individuales del ácido nucleico amplificado; y (iii) secuenciar las moléculas individuales del ácido nucleico por secuenciación de nueva generación para formar el perfil de secuencias de ADN recombinadas; (b) evaluar el perfil de secuencias de ADN recombinadas para determinar los niveles de los clonotipos de cáncer definidos y los clones que evolucionan a partir de éstos; y (c) usar los niveles para detectar la recurrencia del neoplasma linfoide.

PDF original: ES-2593614_T3.pdf

Determinación de cadenas de receptor inmunitario emparejadas a partir de la frecuencia de subunidades coincidentes.

(06/07/2016) Un método de determinación de cadenas de receptor inmunitario emparejadas en una muestra, comprendiendo el método las etapas de: (a) dividir una muestra que contiene linfocitos que expresan parejas de cadenas de receptor inmunitario en una pluralidad de subconjuntos; (b) determinar las secuencias de nucleótidos de una primera cadena de cada pareja de cadenas de receptor inmunitario de linfocitos que tienen dichas parejas en una porción de la pluralidad de subconjuntos; (c) determinar las secuencias de nucleótidos de una segunda cadena de cada pareja de cadenas de receptor inmunitario de linfocitos que tienen dichas parejas de la misma porción de la pluralidad de subconjuntos; (d) identificar como cadenas de receptor inmunitario emparejadas las parejas de primeras cadenas y segundas cadenas (i) que, para cada subconjunto…

Composiciones y método para medir y calibrar el sesgo de la amplificación en reacciones de PCR multiplexadas.

(20/04/2016) Una composición para la normalización de la eficacia de la amplificación de un conjunto de cebadores oligonucleótidos para amplificar secuencias de ácidos nucleicos reordenadas que codifican uno o más receptores del sistema inmunitario adaptativo en una muestra biológica obtenida de células linfoides de un sujeto mamífero, comprendiendo cada receptor del sistema inmunitario adaptativo una región variable y una región de unión, comprendiendo la composición: una pluralidad de oligonucleótidos molde sintéticos, teniendo cada oligonucleótido molde sintético una concentración conocida antes de la amplificación y una secuencia de oligonucleótido de una fórmula general: 5'-U1-B1-V-B2-R-B3-J-B4-U2-3' (I) en donde: (a) V es una secuencia de oligonucleótido…

Perfilado de la inmunidad adaptativa y métodos para la generación de anticuerpos monoclonales.

(30/03/2016) Un método para generar anticuerpos monoclonales, que comprende las etapas de: a) crear una biblioteca de secuencias de ADNc, comprendiendo la creación las etapas de: (i) aislar el ARNm de linfocitos aislados procedentes de un sujeto hospedador que se ha inmunizado con un antígeno; (ii) transcribir de manera inversa el ARNm a ADNc; (iii) amplificar las secuencias de ADNc del anticuerpo diana; y (iv) secuenciar las secuencias de ADNc del anticuerpo diana; y b) analizar la frecuencia de las secuencias de ADNc del anticuerpo diana, que comprende: (i) comparar las frecuencias relativas de las secuencias de ADNc del anticuerpo diana antes y después de la exposición al antígeno, donde las secuencias de ADNc…

 

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