Secuenciación inmune de alto rendimiento.

Un método para identificar un anticuerpo útil en métodos diagnósticos o terapéuticos,

que comprende:

(a) acoplar las secuencias de polinucleótidos de la región variable de la cadena pesada (VH) y de la región variable de la cadena liviana (VL) de una sola célula de una pluralidad de células de una muestra biológica de un sujeto humano en un primer punto en el tiempo para formar secuencias acopladas, en donde el sujeto humano tiene una enfermedad o trastorno o se le ha administrado un agente para estimular un desafío inmunitario;

(b) realizar una secuenciación de alto rendimiento de polinucleótidos amplificados a partir de las secuencias acopladas;

(c) reagrupar las lecturas de secuenciación de acuerdo con al menos su segmento V y usar del segmento J para formar clones VDJ y determinar la frecuencia de clonación de los clones VDJ;

(d) comparar la frecuencia de clones de un clon de VDJ con (i) la frecuencia de clones de clones de VDJ de una muestra biológica del sujeto humano en un segundo punto en el tiempo, o (ii) la frecuencia de clones de clones de VDJ de una muestra biológica de un negativo sujeto de control humano sin la enfermedad o trastorno o un sujeto humano al que no se ha administrado el agente para estimular un desafío inmunitario; y

(e) identificar un anticuerpo útil en métodos de diagnóstico o terapéuticos con base en (d).

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2011/055801.

Solicitante: PRESIDENT AND FELLOWS OF HARVARD COLLEGE.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 17 QUINCY STREET CAMBRIDGE ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: CHURCH, GEORGE M., BACHELET,Ido, VIGNEAULT,FRANCOIS, LASERSON,URI.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07K16/00 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales.
  • C07K16/06 C07K […] › C07K 16/00 Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales. › del suero.
  • C12N15/10 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Procedimientos para el aislamiento, la preparación o la purificación de ADN o ARN (preparación química de ADN o ARN C07H 21/00; preparación de polinucleótidos no estructurales a partir de microorganismos o con la ayuda de enzimas C12P 19/34).
  • C12Q1/6874 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › implicando matrices de ácidos nucleicos, p. ej. secuenciación por hibridación [SBH].
  • C12Q1/6883 C12Q 1/00 […] › para enfermedades causadas por alteraciones del material genético.

PDF original: ES-2730951_T3.pdf

 

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