CIP-2021 : C12Q 1/6874 : implicando matrices de ácidos nucleicos, p. ej. secuenciación por hibridación [SBH].
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Notas[t] desde C01 hasta C14: QUIMICA
C QUIMICA; METALURGIA.
C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.
C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS.
C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones.
C12Q 1/6874 · · · implicando matrices de ácidos nucleicos, p. ej. secuenciación por hibridación [SBH].
CIP2021: Invenciones publicadas en esta sección.
Métodos para detectar la presencia de subunidades de polímeros usando quimioluminiscencia.
(27/05/2020) Un método para detectar la incorporación de nucleótidos en polinucleótidos que incluye:
a) proporcionar un sustrato; y un primer polinucleótido acoplado al sustrato;
b) hibridar un segundo polinucleótido con el primer polinucleótido;
c) poner en contacto el segundo polinucleótido con una polimerasa y una pluralidad de nucleótidos, un primer subconjunto de los cuales incluye un primer resto, un segundo subconjunto de los cuales incluye un segundo resto, un tercer subconjunto de los cuales incluye un tercer resto y un cuarto subconjunto de los cuales incluye un cuarto resto o ningún resto;
d) añadir un nucleótido de la pluralidad de nucleótidos al segundo polinucleótido en base a una secuencia del primer polinucleótido;
e)…
Métodos y matrices para producir y secuenciar agrupaciones monoclonales de ácido nucleico.
(22/04/2020). Solicitante/s: ILLUMINA CAMBRIDGE LIMITED. Inventor/es: RIGATTI,ROBERTO, ROGERT BACIGALUPO,MARIA CANDELARIA, BOUTELL,JONATHAN MARK, GUNDERSON,KEVIN L, MAISINGER,KLAUS, BOYANOV,BOYAN, BAI,JINGWEI, KELLINGER,MATTHEW WILLIAM, BEIERLE,JOHN M.
Una micromatriz que comprende:
a) un sustrato que comprende al menos un pocillo, una superficie que rodea el pocillo y una superficie interna del pocillo;
b) una primera capa que cubre al menos parcialmente la superficie interna del pocillo y que comprende al menos un primer par de cebadores de captura; y
c) una segunda capa que cubre la primera capa y la superficie que rodea el pocillo, en donde el primer par de cebadores de captura en la primera capa está presente y es funcional en un ensayo de exclusión cinética (KEA) después de que se haya proporcionado la segunda capa.
PDF original: ES-2802405_T3.pdf
Métodos y materiales para evaluar el desequilibrio alélico.
(18/12/2019). Solicitante/s: MYRIAD GENETICS, INC. Inventor/es: GUTIN,ALEXANDER, LANCHBURY,JERRY, TIMMS,KIRSTEN.
Un método in vitro para detectar el estado de pérdida de heterocigosidad (LOH) en una pluralidad de loci genómicos de SNP en una muestra de tejido embebida en parafina, fijada en formalina de un paciente, que comprende:
enriquecer una muestra de ADN genómico en moléculas de ADN cada una que comprende un locus de SNP de interés;
secuenciar dichas moléculas de ADN para determinar el genotipo en cada locus de SNP;
determinar para cada locus de SNP homocigoto si es homocigoto debido a LOH.
PDF original: ES-2768344_T3.pdf
Secuenciación inmune de alto rendimiento.
(13/11/2019) Un método para identificar un anticuerpo útil en métodos diagnósticos o terapéuticos, que comprende:
(a) acoplar las secuencias de polinucleótidos de la región variable de la cadena pesada (VH) y de la región variable de la cadena liviana (VL) de una sola célula de una pluralidad de células de una muestra biológica de un sujeto humano en un primer punto en el tiempo para formar secuencias acopladas, en donde el sujeto humano tiene una enfermedad o trastorno o se le ha administrado un agente para estimular un desafío inmunitario;
(b) realizar una secuenciación de alto rendimiento de polinucleótidos amplificados a…
Vacunas contra el cáncer personalizadas y terapias celulares inmunitarias adoptivas.
(06/11/2019) Método de fabricación de una línea celular de linfocitos T citotóxicos (CTL) específicos de cáncer para su uso en el tratamiento de un paciente con cáncer, en el que dicho método comprende
- identificar antígenos de cáncer a partir de ácido nucleico obtenido de células cancerosas del paciente con cáncer usando las etapas de
a) obtener una pluralidad de secuencias mutantes a partir del ácido nucleico de células cancerosas de un paciente con cáncer, codificando dichas secuencias mutantes para la totalidad o una parte de un gen expresado y en el que las secuencias mutantes tienen, cada una, un aminoácido de posición mutante que sustituye a un aminoácido de posición silvestre ubicado en la misma…
Dispositivo microfluídico.
(09/10/2019) Un dispositivo microfluídico que comprende:
un sustrato transparente para formar imágenes y que tiene una pluralidad de canales celulares separados y definidos espacialmente que tienen una dimensión para alojar células en monocapa;
un primer extremo respectivo de dicha pluralidad de canales celulares separados y definidos espacialmente que está en conexión fluida con un canal de entrada de flujo ; y
un segundo extremo respectivo de dicha pluralidad de canales celulares separados y definidos espacialmente que está en conexión fluida con un primer extremo de un primer canal de lavado respectivo que presenta un segundo extremo en conexión fluida con un canal de salida de flujo , donde dicho canal de salida de flujo está en conexión fluida…
Métodos y composiciones para la secuenciación de ácidos nucleicos.
(14/08/2019) Un método para determinar secuencias de polinucleótidos que comprende
(a) realizar una reacción de secuenciación que comprende ciclos repetidos de:
(i) incorporar conjugados de nucleótidos en una pluralidad de polinucleótidos para producir polinucleótidos extendidos,
(ii) detectar una primera colección de señales desde los polinucleótidos extendidos, en la que la primera colección de señales comprende señales de un marcador unido a un primer y segundo tipo de los conjugados de nucleótido,
(iii) añadir un marcador a un tercer que se incorporan en los polinucleótidos extendidos, produciendo así polinucleótidos modificados; y
(iv) detectar una segunda colección de señales desde los polinucleótidos modificados, en la que la segunda colección de señales comprende…
Métodos para detectar variantes de secuencia raras.
(04/04/2019). Solicitante/s: AccuraGen Holdings Limited. Inventor/es: LIN,SHENGRONG, SUN,ZHAOHUI, ZHAO,GRACE QIZHI, TANG,PAUL LING-FUNG.
Un metodo para identificar una variante de secuencia en una muestra de acido nucleico que comprende una pluralidad de polinucleotidos libres de celulas, teniendo cada polinucleotido libre de celulas de la pluralidad un extremo 5' y un extremo 3', comprendiendo el metodo:
(a) circularizar polinucleotidos libres de celulas individuales de dicha pluralidad para formar una pluralidad de polinucleotidos circulares, cada uno de los cuales tiene una union entre el extremo 5' y el extremo 3';
(b) amplificar los polinucleotidos circulares de (a);
(c) secuenciar los polinucleotidos amplificados para producir una pluralidad de lecturas de secuenciacion;
(d) identificar diferencias de secuencia entre lecturas de secuenciacion y una secuencia de referencia; y
(e) identificar una diferencia de secuencia como la variante de la secuencia solamente cuando la diferencia de secuencia se produce en al menos dos polinucleotidos circulares que tienen uniones diferentes.
PDF original: ES-2707744_T3.pdf
Sistema para secuenciación por síntesis ortogonal.
(20/02/2019) Un sistema para secuenciar moldes de ácidos nucleicos, que comprende:
(a) una matriz de sitios, en el que cada sitio incluye un primer molde de ácido nucleico y un segundo molde de ácido nucleico,
en el que el primer molde de ácido nucleico tiene una secuencia que es diferente de la secuencia del segundo molde de ácido nucleico;
(b) un primer cebador unido al primer molde;
(c) una primera especie de polimerasa adecuada para extender el primer cebador unido al primer molde;
(d) un primer conjunto de análogos de nucleótidos adecuados para producir un primer producto de extensión de cebador que se extiende desde el primer cebador, en el que el primer producto…
Procedimiento de alto rendimiento de cribado de una población para la obtención de elementos que comprendan mutaciones en una secuencia objetivo, utilizando un análisis de secuencia sin alineación.
(09/01/2019) Procedimiento de identificación de los miembros de una población que comprenda una o más mutaciones en una o más secuencias objetivo, donde cada uno de dichos miembros de dicha población es distinto, incluyendo dicho procedimiento las siguientes etapas:
(a) Agrupamiento del ADN genómico aislado procedente de cada uno de los miembros de la población en una o más dimensiones;
(b) Amplificación de la secuencia o secuencias objetivo en el ADN genómico agrupado;
(c) Secuenciación de los productos amplificados para obtener lecturas de secuencias correspondientes a los productos amplificados;
(d) Identificación de las mutaciones en función del análisis de k-meros de las lecturas de secuencia de (c); donde dicho análisis de k-meros comprende
(i) La descomposición de dichas lecturas de secuencias en k-meros de la secuencia…