19 inventos, patentes y modelos de VAN EIJK,MICHAEL,JOSEPHUS,THERESIA

(30/01/2019) Método para identificar el origen de muestra de ADN de muestra ligado a un adaptador y/o amplificado comprendiendo las etapas de: a) proporcionar un primer y un segundo identificador de secuencias de nucleótidos, donde cada identificador de secuencia de nucleótidos es una secuencia de nucleótidos de al menos un nucleótido; b) proporcionar adaptadores y/o cebadores de amplificación, donde al menos un primer adaptador o cebador de amplificación comprende el primer identificador de secuencia de nucleótidos y un segundo adaptador o cebador de amplificación comprende el segundo identificador de secuencia de nucleótidos, y donde opcionalmente se proporcionan otros adaptadores o cebadores de amplificación que comprenden otro identificador de secuencias de nucleótidos; c) proporcionar una pluralidad de ADNs…

(19/01/2016) Procedimiento para la determinación de una secuencia de nucleótidos diana en una muestra que comprende las etapas de: (a) proporcionar para cada secuencia de nucleótidos diana (T) una primera sonda (P1) y una segunda sonda (P2), en el que la primera sonda comprende una primera sección específica de diana (TS1) y una primera sección etiqueta (TAG1) que es no complementaria a la secuencia de nucleótidos diana y que comprende opcionalmente una primera secuencia de unión a cebador (PBS1), en el que la primera sección etiqueta comprende una primera secuencia de reconocimiento (RE1) para una primera endonucleasa de restricción; en el que la segunda sonda comprende una segunda sección específica de diana (TS2) y una segunda sección etiqueta (TAG2) que es no complementaria…

(06/01/2016) Método para identificar la presencia o ausencia de fragmentos de restricción en una muestra, que comprende las etapas de: (a) proporcionar dos o más muestras de ácidos nucleicos; (b) digerir cada muestra de ácido nucleico con al menos una endonucleasa de restricción para obtener un conjunto de fragmentos de restricción; (c) proporcionar adaptadores sintéticos bicatenarios que comprenden - una sección identificadora específica de la muestra, - al menos un extremo que se puede ligar al extremo romo o que sobresale de un fragmento de restricción; (d) ligar los adaptadores sintéticos bicatenarios a los fragmentos de restricción en el conjunto, para proporcionar un conjunto de fragmentos de restricción ligados al adaptador; (e) determinar la secuencia de al menos la sección identificadora específica de…

(16/12/2015) Procedimiento para genotipificación de marcadores genéticos en una muestra, que comprende las etapas consistentes en: (a) suministro de una muestra de ADN; (b) reducción de la complejidad de la muestra de ácido nucleico que usa AFLP para producir un subconjunto reproducible de fragmentos de restricción ligados a un adaptador amplificados; (c) secuenciación del subconjunto reproducible de fragmentos de restricción ligados a un adaptador amplificados que usa secuenciación de alto rendimiento; (d) alineación de las secuencias del subconjunto reproducible de fragmentos de restricción ligados a un adaptador amplificados; (e) selección de fragmentos de restricción ligados a un adaptador amplificados…

(10/06/2015) Método para identificar la presencia o ausencia de fragmentos de restricción en una muestra, que comprende las etapas de: (a) proporcionar dos o más muestras de ácidos nucleicos; (b) digerir cada muestra de ácido nucleico con al menos una endonucleasa de restricción para obtener un conjunto de fragmentos de restricción; (c) proporcionar adaptadores sintéticos bicatenarios que comprenden - una secuencia complementaria del cebador 5', - una sección identificadora específica de la muestra, - al menos un extremo que se puede ligar al extremo romo o que sobresale de un fragmento de restricción; (d) ligar los adaptadores sintéticos bicatenarios a los fragmentos de restricción en el conjunto, para proporcionar un conjunto de…

(18/12/2013) Procedimiento para la detección rápida de por lo menos 100 secuencias de nucleótidos elegidas como objetivo en una pluralidad de muestras, comprendiendo el procedimiento las etapas de: (a) proporcionar para cada secuencia de nucleótidos elegida como objetivo en cada una de las muestras: I. una primera sonda y una segunda sonda, comprendiendo la primera sonda una sección específica elegida como objetivo en su extremo 3' y una primera sección etiquetada que no es complementaria a la secuencia de nucleótidos elegida como objetivo y que comprende una primera secuencia de enlace con un cebador, comprendiendo la segunda sonda una segunda sección específica elegida como objetivo…

(10/09/2013) Método para la identificación de una inserción asociada a un gen o fenotipo de interés en un miembro deuna población de transposones, que comprende las etapas de: (a) aislar, individualmente o en mezclas, el ADN genómico de miembros de la población detransposones; (b) realizar la restricción del ADN utilizando una o más endonucleasas de restricción, realizar laligación de los adaptadores con los fragmentos de restricción para preparar de este modo losfragmentos de restricción ligados a adaptadores; (c) realizar la amplificación de los fragmentos de restricción ligados a adaptadores con un par decebadores, con lo que uno de los cebadores comprende una sección que es complementaria a partede…

(17/05/2013) Procedimiento para determinar la secuencia genómica que comprende las etapas de: - proporcionar un mapa físico de una muestra de genoma por secuenciación de los extremos de fragmentos defragmentos de clones de cromosomas artificiales mezclados; - proporcionar un conjunto de lecturas de secuencia de la muestra de genoma; - generar un cóntigo del mapa físico y las lecturas de secuencia para construir una secuencia genómica.

(04/02/2013) Procedimiento para determinar niveles de transcripción relativos de una secuencia de nucleótidos en muestrasde ADNc que comprende las etapas de: (a) Proporcionar una primera muestra de ADNc; (b) Realizar una reducción de la complejidad reproducible de la primera muestra de ADNc 5 para obtener unaprimera colección que comprende las etapas de: - digerir el ADNc con al menos una endonucleasa de restricción para fragmentarlo en fragmentos derestricción; - ligar los fragmentos de restricción con al menos un adaptador oligonucleotídico sintético bicatenario quetenga un extremo compatible con uno o ambos extremos de los fragmentos de restricción para producirfragmentos de restricción ligados a adaptador; - poner en contacto dichos fragmentos…

(25/07/2012) Método para el descubrimiento, la detección y el genotipado de alto rendimiento de uno o más marcadoresgenéticos en una o más muestras, que comprende las etapas de: (a) proporcionar ADN de una o más muestras; (b) cortar el ADN con al menos una endonucleasa de restricción para producir fragmentos de restricción; (c) ligar adaptadores a los fragmentos de restricción para producir fragmentos de restricción ligados a adaptador; (d) amplificar los fragmentos de restricción ligados a adaptador con un par de cebadores que es complementario alos adaptadores para producir fragmentos de restricción ligados a adaptador preamplificados; (e) amplificar los fragmentos de restricción ligados a adaptador preamplificados con un par de cebadores,conteniendo al menos uno de los cebadores desde uno hasta…

(09/05/2012) Método para identificar uno o más polimorfismos en muestras de ácido nucleico, comprendiendo dichométodo las etapas de: a) proporcionar una pluralidad de muestras de ácido nucleico de interés; b) realizar una reducción de la complejidad en cada una de las muestras para proporcionar una pluralidadde bibliotecas de muestras de ácido nucleico, c) ligar adaptadores a las muestras de ácido nucleico de complejidad reducida en las bibliotecas, usando undaptador que porta una proyección 3'-T; d) secuenciar al menos una parte de las bibliotecas; e) alinear las secuencias de cada muestra obtenida en la etapa d); f) determinar uno o más polimorfismos entre la pluralidad de muestras de ácido nucleico en la alineación dela etapa e); g) opcionalmente, examinar…

(27/04/2011) Método para identificar uno o más polimorfismos, comprendiendo dicho método las etapas de: a) proporcionar una primera muestra de ácidos nucleicos de interés; b) llevar a cabo una reducción de complejidad de la primera muestra de ácidos nucleicos de interés, proporcionando una primera biblioteca de la primera muestra de ácidos nucleicos; c) llevar a cabo consecutiva o simultáneamente las etapas a) y b) con una segunda o posterior muestra de ácidos nucleicos de interés, obteniendo una segunda o posterior biblioteca de la segunda o posterior muestra de ácidos nucleicos de interés; d) secuenciar por lo menos una parte de la…

(24/02/2011) Procedimiento para la generación de un mapa físico de por lo menos una parte de un genoma que comprende las etapas de: (a) proporcionar una muestra ADN; (b) generar un banco de clones de un cromosoma artificial (BAC, YAC) en el que cada clon de un cromosoma artificial; (c) combinar los clones de cromosomas artificiales en uno o más agrupaciones, en los que cada clon se encuentra presente en más de una agrupación, para crear una genoteca; (d) digerir el ADN de una o más agrupaciones con una o más endonucleasas de restricción para proporcionar un conjunto de fragmentos de restricción para cada agrupación; (e) ligar los adaptadores a uno o ambos lados de los fragmentos de restricción, en los…

(07/09/2010) Procedimiento para determinar una secuencia genómica que comprende las etapas de: (a) proporcionar un primer subconjunto del genoma mediante la digestión del genoma con por lo menos una primera endonucleasa de restricción para proporcionar fragmentos de restricción; (b) realizar la ligación de por lo menos un adaptador con los fragmentos de restricción del primer subconjunto para proporcionar un primer conjunto de fragmentos de restricción ligados al adaptador; (c) amplificar selectivamente el primer conjunto de fragmentos de restricción ligados al adaptador utilizando una primera combinación de cebador en la que por lo menos un primer cebador contiene una sección complementaria al adaptador y a una parte de la secuencia de reconocimiento de la endonucleasa de restricción y que contiene además una primera secuencia…

(07/05/2010) Método para la detección de una mutación en una secuencia diana en un miembro de una población mutagenizada, que comprende las etapas de: (a) aislar ADN genómico de cada miembro de la población mutagenizada para proporcionar muestras de ADN de cada miembro de la población; (b) reunir el ADN obtenido en la etapa (a); (c) amplificar la secuencia diana con un par de cebadores (opcionalmente marcados) a partir de los conjuntos de ADN; (d) reunir los productos de amplificación de la etapa (c) para crear una biblioteca de productos de amplificación; (e) opcionalmente, fragmentar los productos de amplificación de la biblioteca; (f) determinar la secuencia de nucleótidos de los fragmentos o productos amplificados usando secuenciación de alto…

(01/07/2009) Un par de sondas oligonucleotídicas (K) que comprende: #a) una primera sonda oligonucleotídica (P1) que comprende una primera sección de pinza (C1), que es capaz de hibridar con una segunda sección de pinza (C2) de una segunda sonda oligonucleotídica (P2), y una primera sección diana (T1) en su extremo 3'' que es capaz de hibridar con una primera sección (S1) de una secuencia de ADN diana (D) a detectar; #b) una segunda sonda oligonucleotídica (P2) que comprende una segunda sección de pinza (C2), que es capaz de hibridar con la primera sección de pinza (C1) de la primera sonda oligonucleotídica (P1), y una segunda sección diana (T2) en su extremo 5'' que es capaz de hibridar con un segunda sección (S2) de la secuencia…

(16/11/2007) Un método para determinar la presencia o ausencia de una secuencia diana en una muestra de ácido nucleico, comprendiendo el método las etapas de:# (a) proporcionar a una muestra de ácido nucleico al menos una sonda circularizable para cada secuencia diana a detectar en la muestra, por lo que la sonda tiene una primera sección específica de diana en su extremo 5'' que es complementaria a una primera parte de una secuencia diana y una segunda sección específica de diana en su extremo 3'' que es complementaria a una segunda parte de la secuencia diana, por lo que la primera y segunda partes de las secuencias diana están localizadas adyacentes entre sí, y por lo…