Genotipado a base de secuencias en base a ensayos de ligación a oligonucleótidos.
Procedimiento para la determinación de una secuencia de nucleótidos diana en una muestra que comprende las etapas de:
(a) proporcionar para cada secuencia de nucleótidos diana (T) una primera sonda (P1) y una segunda sonda (P2), en el que la primera sonda comprende una primera sección específica de diana (TS1) y una primera sección etiqueta (TAG1) que es no complementaria a la secuencia de nucleótidos diana y que comprende opcionalmente una primera secuencia de unión a cebador (PBS1), en el que la primera sección etiqueta comprende una primera secuencia de reconocimiento (RE1) para una primera endonucleasa de restricción;
en el que la segunda sonda comprende una segunda sección específica de diana (TS2) y una segunda sección etiqueta (TAG2) que es no complementaria a la secuencia de nucleótidos diana y que comprende una segunda secuencia de unión a cebador (PBS2) opcional, en el que la segunda sección etiqueta comprende una segunda secuencia de reconocimiento (RE2) para una segunda endonucleasa de restricción;
(b) permitir que la primera y segunda sección específica de diana de la respectiva primera y segunda sonda se hibriden con la secuencia diana;
(c) ligar la primera y segunda sonda cuando las secciones específicas de diana respectivas de las sondas se hibridan con secciones esencialmente adyacentes en la secuencia diana para proporcionar sondas ligadas (LP);
(d) opcionalmente amplificar las sondas ligadas con un primer cebador opcional y/o un segundo cebador opcional para proporcionar amplicones (A);
(e) restringir las sondas ligadas o amplicones con la primera y/o segunda endonucleasa de restricción para proporcionar sondas ligadas restringidas (RLP) o amplicones restringidos (RA), ligar un primer y/o un segundo adaptador que contiene un identificador de base adaptador (AD ID1, AD ID2) a las sondas ligadas restringidas (RLP) o amplicones restringidos (RA);
(f) someter las sondas ligadas restringidas (RLP) ligadas a adaptador o amplicones restringidos (RA) ligados a adaptador a tecnología de secuenciación de alto rendimiento para determinar al menos parte de la secuencia de nucleótidos de las sondas ligadas restringidas o amplicones restringidos
(g) identificar la presencia, ausencia o cantidad de la secuencia de nucleótidos diana en la muestra.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/NL2012/050493.
Solicitante: KEYGENE N.V..
Nacionalidad solicitante: Países Bajos.
Dirección: P.O. BOX 216 6700 AE WAGENINGEN PAISES BAJOS.
Inventor/es: VAN EIJK,MICHAEL,JOSEPHUS,THERESIA, HOGERS,RENE,CORNELIS,JOSEPHUS.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C12Q1/68 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
PDF original: ES-2556580_T3.pdf
Patentes similares o relacionadas:
Método para analizar ácido nucleico molde, método para analizar sustancia objetivo, kit de análisis para ácido nucleico molde o sustancia objetivo y analizador para ácido nucleico molde o sustancia objetivo, del 29 de Julio de 2020, de Kabushiki Kaisha DNAFORM: Un método para analizar un ácido nucleico molde, que comprende las etapas de: fraccionar una muestra que comprende un ácido nucleico molde […]
MÉTODOS PARA EL DIAGNÓSTICO DE ENFERMOS ATÓPICOS SENSIBLES A COMPONENTES ALERGÉNICOS DEL POLEN DE OLEA EUROPAEA (OLIVO), del 23 de Julio de 2020, de SERVICIO ANDALUZ DE SALUD: Biomarcadores y método para el diagnostico, estratificación, seguimiento y pronostico de la evolución de la enfermedad alérgica a polen del olivo, kit […]
Detección de interacciones proteína a proteína, del 15 de Julio de 2020, de THE GOVERNING COUNCIL OF THE UNIVERSITY OF TORONTO: Un método para medir cuantitativamente la fuerza y la afinidad de una interacción entre una primera proteína de membrana o parte de la misma y una […]
Secuenciación dirigida y filtrado de UID, del 15 de Julio de 2020, de F. HOFFMANN-LA ROCHE AG: Un procedimiento para generar una biblioteca de polinucleótidos que comprende: (a) generar una primera secuencia del complemento (CS) de un polinucleótido diana a partir […]
Métodos para la recopilación, estabilización y conservación de muestras, del 8 de Julio de 2020, de Drawbridge Health, Inc: Un método para estabilizar uno o más componentes biológicos de una muestra biológica de un sujeto, comprendiendo el método obtener un […]
Evento de maíz DP-004114-3 y métodos para la detección del mismo, del 1 de Julio de 2020, de PIONEER HI-BRED INTERNATIONAL, INC.: Un amplicón que consiste en la secuencia de ácido nucleico de la SEQ ID NO: 32 o el complemento de longitud completa del mismo.
Aislamiento de ácidos nucleicos, del 24 de Junio de 2020, de REVOLUGEN LIMITED: Un método de aislamiento de ácidos nucleicos que comprenden ADN de material biológico, comprendiendo el método las etapas que consisten en: (i) efectuar un lisado […]
Composiciones para modular la expresión de SOD-1, del 24 de Junio de 2020, de Biogen MA Inc: Un compuesto antisentido según la siguiente fórmula: mCes Aeo Ges Geo Aes Tds Ads mCds Ads Tds Tds Tds mCds Tds Ads mCeo Aes Geo mCes Te (secuencia […]