Códigos de barras de secuencia combinatoria para selección de alto rendimiento.

Método para identificar el origen de muestra de ADN de muestra ligado a un adaptador y/o amplificado comprendiendo las etapas de:



a) proporcionar un primer y un segundo identificador de secuencias de nucleótidos, donde cada identificador de secuencia de nucleótidos es una secuencia de nucleótidos de al menos un nucleótido;

b) proporcionar adaptadores y/o cebadores de amplificación, donde al menos un primer adaptador o cebador de amplificación comprende el primer identificador de secuencia de nucleótidos y un segundo adaptador o cebador de amplificación comprende el segundo identificador de secuencia de nucleótidos, y donde opcionalmente se proporcionan otros adaptadores o cebadores de amplificación que comprenden otro identificador de secuencias de nucleótidos;

c) proporcionar una pluralidad de ADNs de muestra;

d) realizar reacciones de ligamiento y/o de amplificación en los ADNs de muestra utilizando los adaptadores y/o cebadores de amplificación, para proporcionar modelos de ADN amplificado y/o ligado a un adaptador preparados para secuenciación de alto rendimiento, donde un modelo monocatenario preparado de ADN comprende, además de una secuencia capturada y/o amplificada a partir del ADN de muestra, una combinación única del primer y el segundo identificador de secuencia de nucleótidos y un primer y un segundo sitio de unión al cebador de secuenciación, y donde el primer sitio de unión al cebador de secuenciación está localizado 3' del primer identificador de secuencia de nucleótidos y el segundo sitio de unión al cebador de secuenciación está localizado 3' del segundo identificador de secuencia de nucleótidos;

e) determinar al menos la secuencia del primer y el segundo identificador de secuencia de nucleótidos, donde la primera secuencia de identificador de secuencias de nucleótidos se determina en una primera reacción de secuenciación de alto rendimiento utilizando un primer cebador de secuenciación que hibrida con el primer sitio de unión de cebador de secuenciación y la segunda secuencia de identificador de secuencia de nucleótidos se determina en una segunda reacción de secuenciación de alto rendimiento utilizando un segundo cebador de secuenciación que hibrida con el segundo sitio de unión de cebador de secuenciación y

f) determinar, basándose en la combinación única del primer y segundo identificador de secuencia de nucleótidos, el origen de muestra de los ADNs de muestra amplificados y/o ligados a un adaptador.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/NL2011/050411.

Solicitante: KEYGENE N.V..

Nacionalidad solicitante: Países Bajos.

Dirección: P.O. BOX 216 6700 AE WAGENINGEN PAISES BAJOS.

Inventor/es: VAN EIJK,MICHAEL,JOSEPHUS,THERESIA, VAN DER POEL,Henricus,Johannes,Adam.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/6855
  • C12Q1/6869

PDF original: ES-2697974_T3.pdf

 

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