Procedimiento para la identificación de aptámeros.
Procedimiento para la identificación de aptámeros, que comprende
- La puesta en contacto de una mezcla de oligonucleótidos con una estructura objetivo de aptámero,
y el enlace de al menos una parte de los oligonucleótidos a la estructura objetivo,
- La separación de oligonucleótidos que se han unido a la estructura objetivo de aptámero, de la estructura objetivo de aptámero y de oligonucleótidos no unidos a la estructura objetivo de aptámero,
- La amplificación separada espacialmente de todos los nucleótidos que se han unido a la estructura objetivo de aptámero, y la generación de amplificados separados espacialmente para cada oligonucleótido, conteniendo cada amplificado predominantemente una clase de oligonucleótidos,
- La asignación de una identificación de emplazamiento específica en cada amplificado separado espacialmente, de modo que cada uno de los amplificados caracterizados es identificable claramente por medio de su identificación de emplazamiento específica,
- La secuenciación de oligonucleótidos de los amplificados caracterizados y la asignación de la identificación de emplazamiento específica para el amplificado respecto a la secuencia de la clase de oligonucleótidos en el amplificado,
- Producción de un conjunto de amplificados, aplicándose los oligonucleótidos amplificados al menos en un primer soporte, de modo que el conjunto comprende puntos aislados con secuencias uniformes para cada oligonucleótido seleccionado,
- El análisis de las propiedades de enlace de todas las clases de oligonucleótidos asignados a los amplificados en el ensayo en la estructura objetivo de aptámero, y la asignación de las propiedades de enlace analizadas a las identificaciones de emplazamiento específicas de los amplificados y las secuencias de las correspondientes clases de oligonucleótidos,
- Poniéndose en contacto el conjunto de amplificados con la estructura objetivo de aptámero para el análisis de las propiedades de enlace.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2012/071155.
Solicitante: Albert-Ludwigs-Universität Freiburg.
Nacionalidad solicitante: Alemania.
Dirección: Fahnenbergplatz 79085 Freiburg ALEMANIA.
Inventor/es: ROTH,GÜNTHER, REINEMANN,CHRISTINE, STREHLITZ,BEATE.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C12N15/10 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Procedimientos para el aislamiento, la preparación o la purificación de ADN o ARN (preparación química de ADN o ARN C07H 21/00; preparación de polinucleótidos no estructurales a partir de microorganismos o con la ayuda de enzimas C12P 19/34).
- C12Q1/6811 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › Métodos de selección para la producción o el diseño de oligonucleótidos específicos de diana o moléculas de unión.
PDF original: ES-2691734_T3.pdf
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