Un procedimiento para determinar la capacidad de respuesta de una célula de tumor de mama de mamífero al tratamiento con N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5tiazolcarboxamida o una sal,

solvato o hidrato farmacéuticamente aceptable de la misma, comprendiendo el procedimiento determinar en una muestra biológica el nivel de expresión de al menos un gen seleccionado de moesina, caveolina 1 o proteína 1 asociada a yes en dicha célula tumoral, siendo indicativa la expresión o la expresión elevada de que es probable que la célula responda o sea sensible al tratamiento

CAMPO DE LA INVENCIÓN

La invención descrita en el presente documento se refiere a procedimientos y composiciones útiles en el diagnóstico, tratamiento y gestión de cánceres que expresan genes particulares.

ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN 5

El cáncer es la segunda causa principal de muerte en seres humanos después de la enfermedad coronaria. En todo el mundo, millones de personas mueren de cáncer cada año. Solo en los Estados Unidos, el cáncer produce la muerte de más de medio millón de personas al año, diagnosticándose unos 1,4 millones de casos nuevos al año. Aunque las muertes por enfermedad cardiaca se han ido reduciendo significativamente, las debidas a cáncer en general están aumentando. 10

En todo el mundo, varios cánceres destacan como los principales asesinos. En particular, los carcinomas de mama, pulmón, próstata, colon, páncreas y ovario representan las causas principales de muerte por cáncer. Éstos y prácticamente todos los demás carcinomas comparten una característica letal común. Con muy pocas excepciones, la enfermedad metastásica de un carcinoma es fatal. Además, incluso para los pacientes de cáncer que inicialmente sobreviven a sus cánceres primarios, la experiencia común ha demostrado que sus vidas se alteran radicalmente y 15 muchos pacientes de cáncer experimentan una recurrencia.

El cáncer de mama afecta a más de un millón de mujeres en todo el mundo cada año (véase, por ejemplo, Jemal A y col., 2002. CA Cancer J. Clin. Enero-Febrero 2002; 52(1):23-47; Jensen OM, y col., Eur. J. Cancer. 1990; 26(11-12): 1167-256; y National Cancer Institute of Canada: Canadian Cancer Statistics 1996. Toronto, Canada. 1996; 21-23). El cáncer de mama también es una de las causas principales de muerte entre las mujeres, estando estimado el 20 riesgo acumulativo a lo largo de la vida de una mujer que desarrolla cáncer de mama en 1 de cada 9. La comprensión de los orígenes y subtipos de estas malignidades así como los modelos para la identificación de nuevas modalidades de diagnóstico y terapéuticas tiene un interés significativo para los profesionales sanitarios. La mayoría de las mujeres que mueren por cáncer de mama no sucumben a la enfermedad primaria original, que normalmente es susceptible de tratamiento por diversas terapias, sino más bien a la propagación metastásica del cáncer de mama a sitios distantes. 25 Este hecho recalca la necesidad de desarrollar métodos de diagnóstico adicionales así como nuevos agentes anticancerosos o formas más agresivas de terapia dirigidas específicamente contra subtipos de tumores de mama.

Los avances en la compresión de la biología de esta enfermedad, sin embargo, han llevado a una mejor supervivencia del paciente con la incorporación de nuevos agentes anti-hormonales en el tratamiento de la enfermedad positiva a receptores hormonales y la adición de terapias dirigidas a HER2 para el 25% de las mujeres con amplificación 30 de HER2 (véase, por ejemplo, Fossati R, y col., J. Clin. Oncol. 1998 Oct; 16(10): 3439-60 y Slamon DJ, y col., N Engl J Med. 2001 Mar 15; 344(11): 783-92).

Sin embargo, sigue existiendo una subserie de mujeres para las que estos enfoques no son una opción eficaz y la quimioterapia ofrece sólo efectos beneficiosos limitados. Este grupo se ha descrito como "triple negativo" (es decir, negativo para el receptor de estrógenos (SEC ID Nº: 7), negativo para el receptor de progesterona (SEC ID Nº: 8) y 35 negativo para HER2 (SEC ID Nº: 9)) y representa un subgrupo clínico y molecular distinto de la enfermedad.

Estudios recientes que usan el perfilado de la expresión génica han identificado este grupo como un grupo que expresa citoqueratinas únicas que lo diferencian de otros tipos de cáncer de mama y como un grupo que tiene un mal diagnóstico similar al grupo positivo para HER-2 antes de la introducción de trastuzumab (véase, por ejemplo, Sorlie T y col., Proc Natl Acad Sci USA. 11 Sep 2001; 98: 10869-74; Sotiriou C, y col., Proc Natl Acad. Sci USA. 2 Sep 2003; 40 100(18): 10393-8; y Perou CM, y col., Nature. 17 Agosto 2000; 406(6796): 747-52). Los datos del perfilado han subagrupado la enfermedad en "luminal", que expresa citoqueratinas específicas (CK8, CK18) asociadas con la capa luminal del epitelio de la mama normal, o el grupo "basal" basado en la expresión de citoqueratinas (CK5, CK17) que se encuentran en la capa basal del epitelio de la mama. La enfermedad ER+ y con HER2 amplificado puede aparecer en los dos subtipos, mientras que los cánceres de mama "triple negativos" generalmente son del subtipo basal (véase, por 45 ejemplo, Sorlie T y col., Proc Natl Acad Sci USA. 11 Sep 2001; 98: 10869-74; Sotiriou C, y col., Proc Natl Acad Sci USA. 2 Sep 2003; 100(18): 10393-8; Perou CM, y col., Nature. 17 Agosto 2000; 406(6796): 747-52; y Wilson Ca y col., Breast Cancer Res. 2004; 6(5): 192-200). Además, existe una subserie de cánceres de mama "triple negativos" que también expresan vimentina. Se cree que este grupo representa un grupo de cánceres de mama que ha experimentado una transición de epitelial a mesenquimática (EMT) y se ha asociado con la enfermedad clínica que es más invasiva, tiene 50 un mayor índice mitótico y también tiene peores consecuencias clínicas (véase, por ejemplo, Thomas PA, y col., Clin Cancer Res. Oct 1999; 5(10): 2698-703 y Laakso M, y col., Clin Cancer Res. 15 Jul 2006; 12(14 Pt 1): 4185-91). Considerados conjuntamente, estos datos demuestran que la identificación de nuevas terapias con actividad en el subtipo basal del cáncer de mama es una prioridad clínica.

SUMARIO DE LA INVENCIÓN 55

Los presentes inventores han descubierto que ciertos genes se expresan de forma diferencial en subtipos de cáncer de mama que son sensibles a la terapia con inhibidores de la quinasa src. En particular, los presentes inventores

han descubierto que los genes de moesina, caveolina 1 y proteína 1 asociada a yes se expresan de forma diferencial en subtipos de cáncer de mama que son sensibles a la terapia con N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-(6-(4-(2-hidroxietil)piperazin-1-il)-2-metilpirimidin-4-ilamino)tiazol-5-carboxamida.

Como también se sabe en la técnica, N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida se refiere a un compuesto que tiene la siguiente estructura (1): 5

El compuesto (I) también puede denominarse N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-((6-(4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil)-2-metil-4-pirimidinil)amino)-1,3-tiazol-5-carboxamida de acuerdo con la nomenclatura IUPAC. El uso del término incluye (a menos que se indique otra cosa) solvatos (incluyendo hidratos) y formas polimórficas del compuesto (I) o sus sales (tal como la forma monohidrato de (I) descrita en el documento USSN 11/051.208, presentado el 4 de febrero de 2005. 10

Las composiciones farmacéuticas de N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida incluyen todas las composiciones farmacéuticamente aceptables que comprenden N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida y uno o más diluyentes, vehículos y/o excipientes, tales como las composiciones descritas en el documento USSN 11/402.502, presentado el 12 de abril de 2006. Un ejemplo de una composición farmacéutica que comprende N-(2-cloro-6-metilfenil)-15 2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida es SPRYCEL™ (Bristol-Myers Squibb Company). SPRYCEL™ comprende N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil] amino]-5-tiazolcarboxamida como principio activo, también denominado dasatinib, y como ingredientes inactivos o excipientes lactosa monohidrato, celulosa microcristalina, croscarmelosa sódica, hidroxipropil celulosa y estearato de magnesio en un comprimido que comprende hipromelosa, dióxido de titanio y polietilenglicol. 20

La N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida, también conocida como dasatinib (BMS-354825), es un inhibidor de quinasa multidirigido, oral, muy potente, que se dirige a las quinasas BCR-ABL y SRC con valores de CI50 para las quinasas aisladas de 0,55 y 3,0 nM, respectivamente. El dasatinib es un inhibidor de quinasa de molécula pequeña activo por vía oral, tanto de la proteína src como de la proteína abl. Es un inhibidor de quinasa SFK/Ab1 basado en tiazol y pirimidina... [Seguir leyendo]

1. Un procedimiento para determinar la capacidad de respuesta de una célula de tumor de mama de mamífero al tratamiento con N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida o una sal, solvato o hidrato farmacéuticamente aceptable de la misma, comprendiendo el procedimiento determinar en una muestra biológica el nivel de expresión de al menos un gen seleccionado de moesina, 5 caveolina 1 o proteína 1 asociada a yes en dicha célula tumoral, siendo indicativa la expresión o la expresión elevada de que es probable que la célula responda o sea sensible al tratamiento.

2. El procedimiento de la reivindicación 1, en el que la célula de tumor de mama es una célula basal, una célula luminal, una célula mesenquimática, una célula BRCA-1, una célula que ha experimentado una transición de epitelial a mesenquimática o una célula que tiene expresión reducida de un receptor de estrógenos, progesterona y HER2. 10

3. Un procedimiento in vitro para reducir la capacidad de proliferar de una célula de cáncer de mama triple negativa, que comprende exponer la célula a N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida o una sal, solvato o hidrato farmacéuticamente aceptable de la misma.

4. El procedimiento de la reivindicación 1, en el que la muestra biológica es un material biológico obtenido de un individuo con cáncer de mama y en el que la expresión o la expresión elevada indica capacidad de respuesta del 15 individuo al tratamiento con N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida o una sal, solvato o hidrato farmacéuticamente aceptable de la misma.

5. El procedimiento de la reivindicación 1 ó 4, en el que se determina el nivel de expresión de al menos dos genes seleccionados entre moesina, caveolina 1 o proteína 1 asociada a yes en la muestra biológica.

6. El procedimiento de la reivindicación 1 ó 4, en el que se determina el nivel de expresión del gen de la proteína 20 1 asociada a yes, el gen de la caveolina 1 y el gen de la moesina.

7. N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida o una sal, solvato o hidrato farmacéuticamente aceptable de la misma para su uso en el tratamiento de un individuo que padece un cáncer de mama,

en la que el nivel de expresión de al menos un gen seleccionado de moesina, caveolina 1 o proteína 1 asociada a yes 25 en una muestra biológica obtenida a partir del individuo está aumentado en comparación con una muestra de control.

8. N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida o una sal, solvato o hidrato farmacéuticamente aceptable de la misma para su uso de acuerdo con la reivindicación 7, en la que el nivel de expresión de al menos dos genes seleccionados entre moesina, caveolina 1 o proteína 1 asociada a yes está aumentado en comparación con una muestra de control. 30

9. N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida o una sal, solvato o hidrato farmacéuticamente aceptable de la misma para su uso de acuerdo con la reivindicación 7, en la que el nivel de expresión del gen de la proteína 1 asociada a yes, el gen de caveolina 1 y el gen de moesina está aumentado en comparación con una muestra de control.

10. El procedimiento de la reivindicación 1 ó 4, o N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-35 4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida o una sal, solvato o hidrato farmacéuticamente aceptable de la misma para su uso de acuerdo con la reivindicación 7, en el que el nivel de expresión está determinado por la detección del nivel de ARNm transcrito a partir de dicho al menos un gen.

11. El procedimiento de la reivindicación 1 ó 4, o N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida o una sal, solvato o hidrato farmacéuticamente aceptable de la misma para su 40 uso de acuerdo con la reivindicación 7, en el que el nivel de expresión está determindado por la detección del nivel de ADNc producido por transcripción inversa del ARNm transcrito a partir de dicho al menos un gen.

12. El procedimiento de la reivindicación 1 ó 4, o N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida o una sal, solvato o hidrato farmacéuticamente aceptable de la misma para su uso de acuerdo con la reivindicación 7, en el que el nivel de expresión está determinado por la detección del nivel del 45 polipéptido codificado por dicho al menos un gen.

13. N-(2-cloro-6-metilfenil)-2-[[6-[4-(2-hidroxietil)-1-piperazinil]-2-metil-4-pirimidinil]amino]-5-tiazolcarboxamida o una sal, solvato o hidrato farmacéuticamente aceptable de la misma para su uso en el tratamiento en un individuo que tiene un cáncer de mama que puede ser caracterizado como triple negativo.

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