METODO PARA EVALUAR UN ESTADO CANCEROSO.

Un método para evaluar un estado canceroso de un espécimen derivado de mamífero,

que comprende:

(1) una primera etapa de medición de la frecuencia de metilación del gen de la Fibrilina 2 contenido en el espécimen derivado de mamífero o un valor de un índice correlacionado con ella, y

(2) una segunda etapa de determinación del estado canceroso del espécimen basado en la diferencia obtenida comparando la frecuencia de metilación medida o el valor del índice que tiene correlación con la misma, con un control;

donde el valor del índice es la cantidad de un producto de expresión del gen de la Fibrilina

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/JP2004/013871.

Solicitante: SUMITOMO CHEMICAL CO., LTD.
JAPAN AS REPRESENTED BY PRESIDENT OF NATIONAL CANCER CENTER
.

Nacionalidad solicitante: Japón.

Dirección: 27-1, SHINKAWA 2-CHOME, CHUO-KU,TOKYO 104-8260.

Inventor/es: USHIJIMA,TOSHIKAZU, HAGIHARA,ATSUSHI.

Fecha de Publicación: .

Fecha Concesión Europea: 9 de Diciembre de 2009.

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68B6
  • C12Q1/68M6B
  • G01N33/574V6

Clasificación PCT:

  • A61K45/00 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA.A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE.A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › Preparaciones medicinales que contienen ingredientes activos no previstos en los grupos A61K 31/00 - A61K 41/00.
  • A61K48/00 A61K […] › Preparaciones medicinales que contienen material genético que se introduce en las células del cuerpo vivo para tratar enfermedades genéticas; Terapia génica.
  • A61P35/00 A61 […] › A61P ACTIVIDAD TERAPEUTICA ESPECIFICA DE COMPUESTOS QUIMICOS O DE PREPARACIONES MEDICINALES.Agentes antineoplásicos.
  • A61P43/00 A61P […] › Medicamentos para usos específicos, no previstos en los grupos A61P 1/00 - A61P 41/00.
  • C12N15/09 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Tecnología del ADN recombinante.
  • C12Q1/02 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen microorganismos vivos.
  • C12Q1/68 C12Q 1/00 […] › en los que intervienen ácidos nucleicos.
  • G01N33/15 FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › preparaciones medicinales.
  • G01N33/50 G01N 33/00 […] › Análisis químico de material biológico, p. ej. de sangre o de orina; Ensayos mediante métodos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas con grupos coordinadores; Ensayos inmunológicos (procedimientos de medida o ensayos diferentes de los procedimientos inmunológicos en los que intervienen enzimas o microorganismos, composiciones o papeles reactivos a este efecto, procedimientos para preparar estas composiciones, procedimientos de control sensibles a las condiciones del medio en los procedimientos microbiológicos o enzimáticos C12Q).

Clasificación antigua:

  • A61K45/00 A61K […] › Preparaciones medicinales que contienen ingredientes activos no previstos en los grupos A61K 31/00 - A61K 41/00.
  • A61K48/00 A61K […] › Preparaciones medicinales que contienen material genético que se introduce en las células del cuerpo vivo para tratar enfermedades genéticas; Terapia génica.
  • A61P35/00 A61P […] › Agentes antineoplásicos.
  • A61P43/00 A61P […] › Medicamentos para usos específicos, no previstos en los grupos A61P 1/00 - A61P 41/00.
  • C12N15/09 C12N 15/00 […] › Tecnología del ADN recombinante.
  • C12Q1/02 C12Q 1/00 […] › en los que intervienen microorganismos vivos.
  • C12Q1/68 C12Q 1/00 […] › en los que intervienen ácidos nucleicos.
  • G01N33/15 G01N 33/00 […] › preparaciones medicinales.
  • G01N33/50 G01N 33/00 […] › Análisis químico de material biológico, p. ej. de sangre o de orina; Ensayos mediante métodos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas con grupos coordinadores; Ensayos inmunológicos (procedimientos de medida o ensayos diferentes de los procedimientos inmunológicos en los que intervienen enzimas o microorganismos, composiciones o papeles reactivos a este efecto, procedimientos para preparar estas composiciones, procedimientos de control sensibles a las condiciones del medio en los procedimientos microbiológicos o enzimáticos C12Q).

Fragmento de la descripción:

Método para evaluar un estado canceroso.

Campo técnico

La presente invención se refiere a un método para evaluar un estado canceroso de un espécimen derivado de mamífero, y similares.

Antecedentes de la invención

Aunque se ha revelado gradualmente que un cáncer es una enfermedad, cuya causa es una anomalía génica, la mortalidad de los pacientes con cáncer todavía es elevada, demostrando que los métodos de diagnóstico y los métodos tratamiento que se encuentran disponibles en la actualidad no son necesariamente completamente satisfactorios. Es clínicamente significativo detectar temprano el cáncer y elegir un tratamiento eficaz para el cáncer detectado y adicionalmente proporcionar una recuperación para verificar la recurrencia del cáncer y similares después del tratamiento.

Se desea, en ese caso, el desarrollo de un método para evaluar un estado canceroso de un espécimen derivado de mamífero basándose en la detección de una anomalía génica, que es adecuado para un método de diagnóstico para detectar temprano un cáncer, una valoración de la eficacia del tratamiento del cáncer y una verificación de la recurrencia del cáncer y similares.

Descripción de la invención

En tales circunstancias, los autores de la presente invención estudiaron intensamente y, como resultado, han descubierto que el gen de la Fibrilina 2 (en adelante, referido como gen FBN2 en algunos casos) está metilado en una línea celular de cáncer y un espécimen de un tejido canceroso con una frecuencia significativamente mayor en comparación con una linea celular normal inmortalizada y un espécimen de un tejido normal y, en esta línea de células cancerosas, el nivel de expresión del gen de la Fibrilina 2 en una línea de células cancerosas es significativamente menor en comparación con una línea celular normal inmortalizada, y adicionalmente, han descubierto que el nivel de expresión de semejante gen puede ser incrementado mediante la acción de un inhibidor de la metilación del ADN sobre la línea de células cancerosas, lo que dio como resultado la conclusión de la presente invención.

Esto es, la presente invención proporciona:

1. un método para evaluar un estado canceroso de un espécimen derivado de mamífero, que comprende: (1) una primera etapa de medición de la frecuencia de metilación del gen de la Fibrilina 2 contenido en un espécimen derivado de mamífero o un valor de un índice que tenga correlación con la misma, y (2) una segunda etapa de determinación de un estado canceroso del espécimen basado en la diferencia obtenida comparando la frecuencia de metilación medida o el valor del índice que tiene correlación con la misma, con un control en el que el valor del índice es la cantidad de producto de expresión del gen de la fibrilina 2 (en adelante, referido como presente método de evaluación en algunos casos); 2. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 1 anterior, donde el espécimen derivado de mamífero son células; 3. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 1 anterior, donde el espécimen derivado de mamífero es un tejido; 4. un método de evaluación de un estado canceroso de un espécimen derivado de mamífero, que comprende: (1) una primera etapa de medición de la frecuencia de metilación del gen de la Fibrilina 2 contenido en el espécimen derivado de mamífero, y (2) una segunda etapa de determinación de un estado canceroso del espécimen basado en la diferencia obtenida comparando la frecuencia de metilación medida con un control; 5. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 1 anterior, donde el espécimen derivado de mamífero son células, y el estado canceroso del espécimen es una malignidad de las células derivadas de mamífero; 6. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 4 anterior, donde el espécimen derivado de mamífero son células, y el estado canceroso del espécimen es una malignidad de una célula derivada de mamífero; 7. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 1 anterior, donde el espécimen derivado de mamífero es un tejido, y el estado canceroso del espécimen es una cantidad de células cancerosas existente en un tejido derivado de mamífero; 8. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 4 anterior, donde el espécimen derivado de mamífero es un tejido, y el estado canceroso del espécimen es una cantidad de células cancerosas existente en un tejido derivado de mamífero; 9. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 8 anterior, donde el tejido es un tejido pancreático, y el cáncer es cáncer pancreático; 10. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 1 o 4 anteriores, donde la frecuencia de metilación de un gen es la frecuencia de metilación de la citosina en una o más secuencias de nucleótidos representadas por 5'-CG-3' presente en una secuencia de nucleótidos de una región promotora, una región no traducida o una región traducida del gen; 11. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 12 anterior, donde el tejido es un tejido pancreático, y el cáncer es cáncer pancreático; 12. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 1 o 4 anteriores, donde la frecuencia de metilación de un gen es la frecuencia de metilación de la citosina en una o más secuencias de nucleótidos representada por 5'-CG-3' presente en una secuencia de nucleótidos de una región promotora del gen; 13. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 1 o 4 anteriores, donde la frecuencia de metilación de un gen es la frecuencia de metilación de la citosina en una o más secuencias de nucleótidos representada por 5'-CG-3' presente en una secuencia de nucleótidos de una región no traducida o una región traducida del gen; 14. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 1 anterior, donde la frecuencia de metilación de un gen es la frecuencia de metilación de la citosina en una o más secuencias de nucleótidos representada por 5'-CG-3' presente en la secuencia de nucleótidos representada por el SEQ ID No: 1; 15. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 16 anterior, donde el tejido es una tejido pancreático, y el cáncer es cáncer pancreático; 16. un método de evaluación de un estado canceroso de un espécimen derivado de mamífero, que comprende: (1) una primera etapa de medición de la cantidad de producto de expresión del gen de la Fibrilina 2 contenido en el espécimen derivado de mamífero, y (2) una segunda etapa para determinar un estado canceroso del espécimen basándose en una diferencia obtenida comparando la cantidad medida de producto de expresión con un control; 17. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 16 anterior, donde la cantidad de un producto de expresión del gen de la Fibrilina 2 es una cantidad de un producto de transcripción del gen; 18. el método de evaluación de acuerdo con el apartado 16 anterior, donde la cantidad de producto de expresión del gen de la Fibrilina 2 es una cantidad de producto de la traducción del gen; 19. un método de identificación de una sustancia que tiene la capacidad de reducir la frecuencia de metilación del gen de la Fibrilina...

 


Reivindicaciones:

1. Un método para evaluar un estado canceroso de un espécimen derivado de mamífero, que comprende:

(1) una primera etapa de medición de la frecuencia de metilación del gen de la Fibrilina 2 contenido en el espécimen derivado de mamífero o un valor de un índice correlacionado con ella, y (2) una segunda etapa de determinación del estado canceroso del espécimen basado en la diferencia obtenida comparando la frecuencia de metilación medida o el valor del índice que tiene correlación con la misma, con un control;

donde el valor del índice es la cantidad de un producto de expresión del gen de la Fibrilina 2.

2. Un método de acuerdo con la reivindicación 1, donde el espécimen derivado de mamífero es un espécimen celular.

3. Un método de acuerdo con la reivindicación 2, donde el estado canceroso del espécimen es una malignidad de una célula derivada de mamífero.

4. Un método de acuerdo con la reivindicación 1, donde el espécimen derivado de mamífero es un espécimen de tejido.

5. Un método de acuerdo con la reivindicación 4, donde el estado canceroso del espécimen es una cantidad de células cancerosas existente en un tejido derivado de mamífero.

6. Un método de acuerdo con la reivindicación 4 o 5, donde el tejido es un tejido pancreático, y el cáncer es cáncer pancreático.

7. Un método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, donde la primera etapa comprende la medición de la frecuencia de metilación del gen de la Fibrilina 2 y la segunda etapa comprende la determinación de un estado canceroso del espécimen basado en la diferencia obtenida comparando la frecuencia de metilación medida con un control.

8. Un método de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones anteriores, donde la frecuencia de metilación de un gen es la frecuencia de metilación de la citosina en una o más secuencias de nucleótidos representadas por 5'-CG-3' presente en una secuencia de nucleótidos de una región promotora, una región no traducida o una región traducida del gen.

9. Un método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, donde la frecuencia de metilación de un gen es la frecuencia de metilación de la citosina en una o más secuencias de nucleótidos representadas por 5'-CG-3' presente en la secuencia de nucleótidos representada por el SEQ ID NO. 1.

10. Un método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, que comprende:

(1) una primera etapa de medición de la cantidad de un producto de expresión del gen de la Fibrilina 2 contenido en el espécimen derivado de mamífero, y (2) una segunda etapa de determinación de un estado canceroso del espécimen basada en la diferencia obtenida comparando la cantidad medida del producto de expresión con un control.

11. Un método de acuerdo con la reivindicación 10, donde la cantidad de producto de expresión del gen de la Fibrilina 2 es la cantidad de producto de la transcripción del gen.

12. Un método de acuerdo con la reivindicación 10, donde la cantidad de producto de expresión del gen de la Fibrilina 2 es la cantidad de producto de la traducción del gen.

13. Un método in vitro para identificar una sustancia que tiene la capacidad de reducir la frecuencia de metilación del gen de la Fibrilina 2 y promover la expresión del gen, que comprende:

(1) una primera etapa para poner en contacto una sustancia de ensayo con células cancerosas, (2) una segunda etapa para medir la cantidad de producto de expresión del gen de la Fibrilina 2 contenido en las células cancerosas después de la primera etapa (1), y (3) una tercera etapa para determinar la capacidad de la sustancia de ensayo para promover la expresión del gen de la Fibrilina 2 basada en la diferencia obtenida comparando la cantidad de producto de expresión medida con un control.

14. Un método de acuerdo con la reivindicación 13, donde las células cancerosas son células de cáncer pancreático.

15. Una composición para su uso en el tratamiento del cáncer, que comprende un ácido nucleico que comprende una secuencia de nucleótidos que codifica una secuencia de aminoácidos de la Fibrilina 2 como ingrediente activo, donde el ingrediente activo se formula en un portador farmacéuticamente aceptable.

16. El uso, ex vivo, del gen metilado de la Fibrilina 2 como marcador del cáncer.

17. El uso de acuerdo con la reivindicación 16, donde el marcador del cáncer es un marcador del cáncer pancreático.


 

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