15 patentes, modelos y diseños de IBIS BIOSCIENCES, INC

(19/02/2020) Un sistema para fotoescindir y explorar análogos de nucleótidos que comprende: a) un sustrato que comprende una pluralidad de pocillos que contienen cada uno, o están configurados para contener, una mezcla de reacción que comprende un ácido nucleico plantilla, una polimerasa, un cebador hibridado con dicha plantilla y un primer análogo de nucleótido, en donde dicho cebador comprende un análogo de nucleótido terminal 3' con un grupo de bloqueo fotolábil que termina la extensión de la cadena, y en donde dicho primer análogo de nucleótido comprende: i) una primera fracción detectable, y ii) un grupo de bloqueo fotolábil que termina la extensión de la cadena; y b) un componente de sistema de luz que comprende: i) una fuente de luz en comunicación óptica con…

(16/01/2019) Un método para detectar ácido nucleico humano contaminante en una muestra, de manera que el método comprende: a) secuenciar: i) un ácido nucleico humano diana de la mencionada muestra, de manera que el ácido nucleico diana es un ácido nucleico variable; y ii) un ácido nucleico mitocondrial humano, de manera que el mencionado ácido nucleico mitocondrial humano proviene del mencionado ácido nucleico humano contaminante y de la mencionada muestra; en una muestra de ácido nucleico para obtener un conjunto de datos de secuenciación; b) determinar el número de lecturas de secuenciación atribuibles a los mencionados ácidos nucleicos mitocondriales humanos y el número de lecturas de secuenciación atribuibles al mencionado ácido nucleico diana en el mencionado conjunto de datos de secuenciación; c) comparar el número de lecturas…

(01/10/2018) Un método para secuenciar un ácido nucleico objetivo usando un enfoque de secuenciación por síntesis (SBS), el método comprendiendo: a) proporcionar una primera pluralidad de una primera base de nucleótidos, una segunda pluralidad de una segunda base de nucleótidos, una tercera pluralidad de una tercera base de nucleótidos, y una cuarta pluralidad de una cuarta base de nucleótidos, en donde: una primera proporción de una primera porción de la primera pluralidad marcada con un primer marcador en relación a una segunda porción de la primera pluralidad marcada con un segundo marcador; y una segunda proporción de una tercera porción de la segunda…

(01/10/2018) Un procedimiento para secuenciar un ácido nucleico diana usando un procedimiento de secuenciación por síntesis (SBS), comprendiendo el procedimiento: a) proporcionar una primera pluralidad de una primera base de nucleótidos, una segunda pluralidad de una segunda base de nucleótidos, una tercera pluralidad de una tercera base de nucleótidos, y una cuarta pluralidad de una cuarta base de nucleótidos; en el que una primera fracción de la primera pluralidad de la primera base de nucleótidos está marcada con un marcador, una segunda fracción de la segunda pluralidad de la segunda base de nucleótidos está marcada con dicho marcador, una tercera fracción de la tercera pluralidad de la tercera base de nucleótidos está marcada con un marcador y una cuarta fracción de la cuarta pluralidad de la cuarta base…

(27/09/2018) Un método para identificar un ácido nucleico en una muestra, el método comprendiendo: (a) determinar una secuencia degenerada de dos bases del ácido nucleico objetivo en la muestra, usando un método de secuenciación que determina una secuencia degenerada de dos bases del ácido nucleico objetivo sin determinar una secuencia de cuatro bases del ácido nucleico objetivo, en donde la secuencia degenerada de dos bases del ácido nucleico objetivo se determina sin determinar o conocer de otra manera la secuencia de cuatro bases del ácido nucleico objetivo; y (b) comparar la secuencia degenerada de dos bases del ácido…

(02/08/2017) Un método para determinar la masa molecular de una pluralidad de analitos en una mezcla que comprende: a) hacer una medición de espectrómetro de masas de la mezcla usando un espectrómetro de masas, en donde el espectrómetro de masas comprende: (i) un detector de iones que produce una señal de voltaje analógica; (ii) un digitalizador para convertir una señal de voltaje analógica en una señal de voltaje digital; (iii) un medio de transferencia de señal analógica para transferir una señal analógica desde el detector al digitalizador; y (iv) una pluralidad de filtros de umbral digital para establecer una pluralidad de umbrales de señal digital únicos, cada uno en comunicación de datos digital con el digitalizador, b) especificar una pluralidad de…

(19/04/2017) Un método para generar ácido nucleico circular monocatenario a partir de una muestra del ácido nucleico diana, comprendiendo dicho método: a) formar un complejo que comprende una transposasa y una pluralidad de polinucleótidos en horquilla, teniendo cada uno de dichos polinucleótidos en horquilla una región dúplex que comprende una secuencia de reconocimiento de la transposasa. b) mezclar dicho complejo con dicho ácido nucleico diana, fragmentando de este modo dicho ácido nucleico diana y ligando dichos polinucleótidos en horquilla a dicho ácido nucleico diana, para formar fragmentos de ácido nucleico unidos en horquilla, teniendo cada fragmento de ácido nucleico unido en horquilla una región del fragmento del ácido nucleico diana dúplex y un hueco del segmento de la base nucleotídica entre cada región del fragmento de ácido nucleico diana…

(12/04/2017) Un procedimiento para generar ácido nucleico amplificado a partir de ARN que comprende: a) exponer una secuencia molde de ARN a un conjunto de cebadores en condiciones de transcripción inversa, de tal manera que se genere una población mixta de las primeras cadenas de ADNc, en la que dicho conjunto de cebadores comprende cebadores individuales, comprendiendo cada uno: i) un sitio de secuencia de restricción en 5', (ii) una secuencia hexamérica aleatoria en 3' y (iii) una secuencia de código de barras localizada entre el sitio de secuencia de restricción en 5' y la secuencia hexamérica aleatoria en 3', en la que dicho sitio de secuencia de restricción en cada uno de dichos cebadores…

(18/12/2013) Un procedimiento para identificar un bioagente desconocido que comprende: a) alinear una pluralidad de secuencias de genes de ácidos nucleicos de organismos de identidad conocida; b) analizar dicha pluralidad de secuencias para regiones de conservación y variación; c) identificar una pluralidad de regiones variables que flanquean sitios que enlazan con cebadores para cebar y obtener una o más regiones amplificables dentro de dicha pluralidad de secuencias; d) identificar las composiciones base de dichas una o más regiones amplificables para miembros de dicha pluralidad de organismos conocidos para obtener una pluralidad de composiciones base de regiones amplificables…

(18/12/2013) Un procedimiento para identificar un bioagente desconocido que comprende: a) poner en contacto el ácido nucleico del bioagente con al menos un par de cebadores de oligonucleótidosque hibridizan a las secuencias conservadas del ácido nucleico y flanquean una secuencia de ácidosnucleicos variable; b) amplificar la secuencia de ácidos nucleicos variable usando el mencionado al menos un par de cebadoresde oligonucleótidos para producir un producto de la amplificación; c) determinar la masa molecular del mencionado producto de la amplificación por espectrometría de masas ydeterminar la composición base del mencionado producto de la amplificación; y d) comparar…

(05/02/2013) Un procedimiento para identificar una bacteria desconocida que comprende: a) poner en contacto un ácido nucleico que es una secuencia de un gen de dicha bacteria con al menos un par de cebadores oligonucleotídicos que hibridan con regiones de secuencia conservada de dicho ácido nucleico que muestran entre el 80% y el 100% de identidad entre diferentes especies de bacterias pero que no son específicos para un género de bacteria particular, en el que dichas regiones de secuencia flanquean una secuencia de ácido nucleico variable intermedia de la bacteria, y en el que hay una separación de entre 30 y 250 nucleótidos entre dichas regiones de secuencia; b) amplificar dicha secuencia de ácido nucleico variable usando dicho al menos…

(16/02/2011) Un método forense que comprende los pasos de: (i) determinar una primera masa molecular de un primer producto de amplificación de un Cebador amplicón identificador de ADN mitocondrial por espectrometría de masas; y (ii) comparar la primera masa molecular con una segunda masa molecular de un segundo amplicón identificador de ADN mitocondrial, donde el Cebador y el segundo amplicones identificadores de ADN mitocondrial contienen las mismas secuencias conservadas para la hibridación del mismo par de cebadores, donde el método no comprende la secuenciación de ácido nucleico del primer producto de amplificación, y donde la segunda masa molecular del segundo amplicón…