Secuenciación por síntesis usando óptica de lectura por pulsos.
Un sistema para fotoescindir y explorar análogos de nucleótidos que comprende:
a) un sustrato que comprende una pluralidad de pocillos que contienen cada uno, o están configurados para contener, una mezcla de reacción que comprende un ácido nucleico plantilla, una polimerasa, un cebador hibridado con dicha plantilla y un primer análogo de nucleótido,
en donde dicho cebador comprende un análogo de nucleótido terminal 3' con un grupo de bloqueo fotolábil que termina la extensión de la cadena, y
en donde dicho primer análogo de nucleótido comprende: i) una primera fracción detectable, y ii) un grupo de bloqueo fotolábil que termina la extensión de la cadena;
y
b) un componente de sistema de luz que comprende:
i) una fuente de luz en comunicación óptica con dicha pluralidad de pocillos que proporciona: A) entrada de luz de fotoescisión que escinde dicho grupo de bloqueo fotolábil cuando es parte de dicho cebador; y B) luz de entrada de exploración que produce una señal óptica de dicha primera fracción detectable después de que dicho primer análogo de nucleótido sea añadido a dicho cebador por dicha polimerasa; y
ii) un componente de control de luz que activa dicha fuente de luz de tal manera que se genera una pluralidad de ciclos de desbloqueo-exploración, en donde cada uno de dichos ciclos de desbloqueoexploración comprende un período de tiempo de desbloqueo inicial en el que por lo menos una parte de dicha entrada de luz de fotoescisión se pasa a dicha pluralidad de pocillos, y un período de tiempo de exploración siguiente en el que por lo menos parte de dicha entrada de luz de exploración se pasa a dicha pluralidad de pocillos, y
en donde dicho período de tiempo de desbloqueo está entre 25 y 150 ms y dicho tiempo de exploración es de por lo menos 200 ms.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2015/050376.
Solicitante: IBIS BIOSCIENCES, INC.
Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.
Dirección: 2251 Faraday Avenue Suite 150 Carlsbad, CA 92008 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.
Inventor/es: CLEMENS, JOHN M., ESHOO,MARK,W, HAYDEN,MARK A.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C07K1/04 QUIMICA; METALURGIA. › C07 QUIMICA ORGANICA. › C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 1/00 Procedimientos generales de preparación de péptidos. › sobre soportes.
- C12Q1/6869 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › Métodos de secuenciación.
- C40B60/14 C […] › C40 TECNOLOGIA COMBINATORIA. › C40B QUIMICA COMBINATORIA; BIBLIOTECAS, p. ej. QUIMIOTECAS (bibliotecas combinatorias in silico de ácidos nucleicos, proteínas o péptidos G16B 35/00; química combinatoria in silico G16C 20/60). › C40B 60/00 Aparatos especialmente adaptados para su empleo en química combinatoria o con bibliotecas. › para la creación de bibliotecas.
PDF original: ES-2788692_T3.pdf
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