Métodos para analizar la contaminación en la secuenciación del ADN.

Un método para detectar ácido nucleico humano contaminante en una muestra,

de manera que el método comprende:

a) secuenciar:

i) un ácido nucleico humano diana de la mencionada muestra, de manera que el ácido nucleico diana es un ácido nucleico variable; y

ii) un ácido nucleico mitocondrial humano, de manera que el mencionado ácido nucleico mitocondrial humano proviene del mencionado ácido nucleico humano contaminante y de la mencionada muestra; en una muestra de ácido nucleico para obtener un conjunto de datos de secuenciación;

b) determinar el número de lecturas de secuenciación atribuibles a los mencionados ácidos nucleicos mitocondriales humanos y el número de lecturas de secuenciación atribuibles al mencionado ácido nucleico diana en el mencionado conjunto de datos de secuenciación;

c) comparar el número de lecturas de secuenciación atribuibles a los mencionados ácidos nucleicos mitocondriales humanos respecto al número de lecturas de secuenciación atribuibles al mencionado ácido nucleico diana; y

d) determinar la presencia de ácido nucleico humano contaminante en la mencionada muestra basándose en la mencionada comparación cuando se identifica un número mayor de lecturas de secuenciación atribuibles a los ácidos nucleicos mitocondriales humanos en relación con el ácido nucleico diana.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2014/024516.

Solicitante: IBIS BIOSCIENCES, INC.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 2251 Faraday Avenue Suite 150 Carlsbad, CA 92008 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: ESHOO,MARK,W, MOTLEY,STANLEY.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/6869
  • C12Q1/689

PDF original: ES-2716094_T3.pdf

 

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