Predicción de la respuesta a la quimioterapia mediante el uso de marcadores de expresión génica.
Un procedimiento para predecir la probabilidad de una respuesta beneficiosa a la quimioterapia de un ser humano diagnosticado con cáncer de mama,
que comprende
(a) determinar cuantitativamente, en una muestra biológica que comprende células de cáncer de mama obtenidas de dicho sujeto, el valor de una o más de las siguientes variables:
(i) una Puntuación de Recurrencia (RS),
en el que la RS se calcula calculando primero una Puntuación de Recurrencia sin cerrar (RSU):
**(Ver fórmula)**
en el que:
y la Puntuación Umbral del Grupo GRB7 = 8 si la puntuación del grupo GRB7 es <8 e = la puntuación del grupo GRB7 si la puntuación del grupo GRB7 es ≥8;
**(Ver fórmula)**
y la Puntuación Umbral del Grupo de Proliferación = 6,5 si la Puntuación del Grupo de Proliferación es <6,5 e = la Puntuación del Grupo de Proliferación si la Puntuación del Grupo de Proliferación es ≥6,5; y
**(Ver fórmula)**
y posteriormente calculando el RS escalado:
**(Ver fórmula)**
(ii) Puntuación del Grupo ESR1,
en el que la puntuación del Grupo ESR1 = (ESR1 + PGR + BCL2 + SCUBE2)/4;
(iii) Puntuación del Grupo de Invasión,
en el que la puntuación del grupo de invasión = CTSL2 + MMP11)/2;
(iv) Puntuación Umbral del Grupo de Proliferación,
en el que la Puntuación del Grupo de Proliferación = (BIRC5 + MKI67 + MYBL2 + CCNB1 + STK6)/5
y la Puntuación Umbral del Grupo de Proliferación = 6,5 si la Puntuación del Grupo de Proliferación es <6,5 e = la Puntuación del Grupo de Proliferación si la Puntuación del Grupo de Proliferación es ≥6,5; y
(v) el nivel de expresión del transcrito de ARN de al menos uno de MYBL2 y SCUBE2, y (b) determinar la probabilidad de una respuesta beneficiosa a la quimioterapia del sujeto, en el que
(b1) por cada unidad de un aumento en el valor de uno o más de (i), (iii), (iv), o el nivel de expresión del transcrito de ARN de MYBL2, se identifica a dicho sujeto con una probabilidad proporcionalmente mayor de tener una respuesta beneficiosa a dicha quimioterapia; y
(b2) por cada unidad de un aumento en el valor de (ii) o el nivel de expresión del transcrito de ARN de SCUBE2, se identifica a dicho sujeto con una probabilidad proporcionalmente disminuida de tener una respuesta beneficiosa a la quimioterapia;
en el que los símbolos de genes en las ecuaciones representan los niveles de expresión de los transcritos de ARN de los respectivos genes medidos por reacción en cadena cuantitativa de la transcriptasa inversa-polimerasa (qRT PCR) y expresados en unidades de ciclo umbral (CT) normalizadas en relación con los niveles de expresión de uno o más ARNm de referencia.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2005/040238.
Solicitante: GENOMIC HEALTH, INC..
Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.
Dirección: 301 PENOBSCOT DRIVE REDWOOD CITY, CA 94063 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.
Inventor/es: SHAK, STEVEN, BAKER,JOFFRE,B, BRYANT,John L, PAIK,Soonmyung.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C12Q1/6886 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › para el cáncer (ensayos inmunológicos para el cáncer G01N 33/574).
- G06F19/18
- G06F19/20
- G16B20/00 FISICA. › G16 TECNOLOGÍAS DE LA INFORMACIÓN Y DE LA COMUNICACIÓN [TIC] ESPECIALMENTE ADAPTADAS PARA ÁREAS DE APLICACIÓN ESPECÍFICAS. › G16B BIOINFORMATICA, es decir, TECNOLOGIAS DE LA INFORMACION Y DE LA COMUNICACION [TIC] ESPECIALMENTE ADAPTADAS PARA EL PROCESAMIENTO DE DATOS GENETICOS O DATOS RELACIONADOS CON PROTEINAS EN LA BIOLOGÍA MOLECULAR COMPUTACIONAL. › TIC especialmente adaptadas a la genómica o proteómica funcional, p.ej. asociaciones genotipo o fenotipo.
- G16B25/00 G16B […] › TIC especialmente adaptadas a la hibridación; TIC especialmente adaptadas a la expresión de genes o de proteínas.
PDF original: ES-2778851_T3.pdf
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