21 patentes, modelos y diseños de GENOMIC HEALTH, INC.

Predicción de la probabilidad de recidiva de cáncer.

(19/11/2018) Un método de predicción de la probabilidad de supervivencia a largo plazo de un paciente con cáncer de mama ductal con ganglios negativos, ER positivo, sin recidiva del cáncer, que consiste en determinar el nivel de expresión del transcrito de ARN de CDC20, o su producto de expresión, en una muestra de célula o tejido de cáncer de mama obtenida del paciente, normalizado frente al nivel de expresión de un conjunto de referencia de transcritos de ARN, o sus productos de expresión, comparando el nivel de expresión normalizado de CDC20 del paciente con un nivel de expresión normalizado de CDC20 en un grupo de referencia de tejido de cáncer de mama…

Obtención de perfil de expresión génica en tejidos tumorales biopsiados.

Secciones de la CIP Química y metalurgia Física

(10/10/2018). Inventor/es: BAKER, JOFFRE, KIEFER, MICHAEL, C., SHAK,STEVE, CRONIN,MAUREEN,T, Walker,Michael G. Clasificación: C12N15/09, G01N33/574, C12N15/10, C12M1/00, C12Q1/6886.

Un método para predecir la probabilidad de supervivencia a largo plazo de un paciente con cáncer de mama sin recidiva de cáncer de mama, después de la escisión quirúrgica del tumor primario, que comprende: determinar el nivel del transcrito de ARN de GSTM1 en una muestra de tejido de cáncer de mama obtenida del paciente, normalizada frente al nivel de expresión de todos los transcritos de ARN ensayados en la muestra, o frente a un conjunto de referencia de transcritos de ARN, en el que el nivel normalizado aumentado del transcrito de ARN de GSTM1 comparado con el nivel normalizado del transcrito de ARN de GSTM1 en un conjunto de referencia de tejido de cáncer de mama indica una mayor probabilidad de supervivencia a largo plazo sin recidiva de cáncer de mama.

PDF original: ES-2685702_T3.pdf

Algoritmo del perfil de expresión y test para el pronóstico del cáncer.

(06/12/2017) Un método para determinar la probabilidad de recidiva del cáncer de mama en un paciente humano con cáncer de mama positivo en receptores de estrógenos y negativo en nódulo linfático, tratado con tamoxifeno, donde el método consiste en lo siguiente: a) determinar los niveles de expresión de las transcripciones de ARN de GRB7, HER2, ER, PR, Bcl2, CEGP1, SURV, Ki.67, MYBL2, CCNB1, STK15, CTSL2, STMY3, CD68, GSTM1, y BAG1, o sus productos de expresión, en una muestra biológica que contiene células tumorales obtenidas del paciente; b) crear los siguientes subconjuntos de genes: (a) subconjunto del factor…

Marcadores de expresión génica para predecir la respuesta a la quimioterapia.

Sección de la CIP Química y metalurgia

(12/07/2017). Inventor/es: BAKER, JOFFRE, SHAK, STEVEN, GIANNI, LUCA. Clasificación: C12Q1/68.

Un método para predecir la probabilidad de respuesta a la quimioterapia de un paciente humano diagnosticado de cáncer de mama, comprendiendo; medir el nivel de expresión de un transcrito de ARN de GBP1 en una muestra comprendiendo células cancerosas obtenidas de dicho paciente antes de la quimioterapia, y normalizar el nivel del transcrito de ARN de GBP1 para obtener un nivel de expresión de GBP1 normalizado, donde el nivel de expresión de GBP1 normalizado del paciente va asociado a una mayor probabilidad de respuesta a la quimioterapia, si el nivel de expresión de GBP1 normalizado del paciente es mayor 10 comparado con el nivel de expresión de GBP1 normalizado en pacientes con cáncer de mama, de muestras sin posterior respuesta patológica a la quimioterapia.

PDF original: ES-2636470_T3.pdf

Obtención de perfil de expresión génica en tejidos tumorales biopsiados.

Secciones de la CIP Química y metalurgia Física

(22/02/2017). Inventor/es: BAKER, JOFFRE, KIEFER, MICHAEL, C., SHAK,STEVE, CRONIN,MAUREEN,T, Walker,Michael G. Clasificación: C12N15/09, C12Q1/68, G01N33/574, C12N15/10, C12M1/00.

Un método de predicción de la probabilidad de supervivencia a largo plazo de una paciente de cáncer de mama sin recidiva de cáncer de mama, tras la extirpación quirúrgica del tumor primario, que comprende: determinar el nivel de expresión del transcrito de ARN de GSTM3 en una muestra de tejido de cáncer de mama obtenida de la paciente, normalizado contra el nivel de expresión de un conjunto de referencia de transcritos de ARN, en el que un aumento de la expresión de GSTM3 indica un aumento de la probabilidad de supervivencia a largo plazo sin recidiva de cáncer de mama.

PDF original: ES-2616800_T3.pdf

Predicción de la probabilidad de recidiva de cáncer.

(09/11/2016) Un método de predicción de la probabilidad de supervivencia libre de enfermedad de un paciente con cáncer de mama ductal invasivo, de ganglios negativos, positivo para ER, que comprende determinar el nivel de expresión del transcrito de ARN de STMY3 en una muestra de célula o tejido de cáncer de mama obtenida del paciente, normalizado frente al nivel de expresión de un conjunto de referencia de transcritos de ARN comparando el nivel de expresión normalizado de STMY3 del paciente con un nivel de expresión normalizado de STMY3 en un conjunto de referencia de tejido de cáncer de mama que comprende pacientes que (a) estaban vivos sin recidiva de cáncer…

Método para usar la expresión génica para determinar el pronóstico de cáncer de próstata.

Secciones de la CIP Química y metalurgia Física

(09/11/2016). Inventor/es: GODDARD, AUDREY, BAKER, JOFFRE, KIEFER, MICHAEL, C., SHAK,STEVE, MADDALA,TARA, COWENS,WAYNE, BAEHNER,FREDERICK L, LEE,MARK, PELHAM,ROBERT J, CHERBAVAZ,DIANA, CRAGER,MICHAEL. Clasificación: C12Q1/68, G01N33/574.

Un método para determinar una probabilidad de recidiva de cáncer en un paciente con cáncer de próstata, que comprende: medir un nivel de expresión de KLK2 en una muestra biológica que comprende tejido prostático obtenido del paciente, predecir una probabilidad de recidiva de cáncer para el paciente; en el que un nivel de expresión aumentado de LKL2 se asocia negativamente a un aumento del riesgo de recidiva.

PDF original: ES-2611000_T3.pdf

Marcadores de expresión génica para prognosis del cáncer de mama.

Secciones de la CIP Química y metalurgia Técnicas industriales diversas y transportes

(24/02/2016). Inventor/es: SHAK, STEVEN, BAKER,JOFFRE,B, COBLEIGH,MELODY,A, CRONIN,MAUREEN,T. Clasificación: C12Q1/68, B60K17/04, B60G9/02.

Un método de predicción de la probabilidad de supervivencia a largo plazo de un paciente de cáncer de mama sin recurrencia del cáncer de mama, que comprende determinar el nivel de expresión del transcrito de RNA de MYBL2 en una muestra de tejido de cáncer de mama obtenida de dicho paciente; normalizar dicho nivel del transcrito de RNA para obtener un nivel de expresión normalizado de MYBL2; en donde un mayor nivel de expresión normalizado de MYBL2 en comparación con el nivel normalizado del transcrito de RNA de MYBL2 en la serie de referencia de tejidos de cáncer de mama indica una probabilidad reducida de supervivencia a largo plazo sin recurrencia de cáncer de mama.

PDF original: ES-2561179_T3.pdf

Marcadores de expresión génica para predecir la respuesta a la quimioterapia.

(11/11/2015) Un método para determinar si un nivel de un transcrito de ARN está asociado con una respuesta beneficiosa a un tratamiento de quimioterapia que comprende una antraciclina y un taxano, comprendiendo el método: determinar el nivel de un transcrito de ARN en una muestra biológica que comprende células de cáncer de mama obtenidas antes de la quimioterapia de un sujeto humano al que se le ha diagnosticado cáncer de mama, donde el transcrito de ARN es el transcrito de ARN de BAG1; normalizar el nivel del transcrito de ARN de BAG1 frente a un nivel de al menos un ARN de referencia para obtener un nivel de expresión normalizado de BAG1; comparar el nivel de expresión normalizado de BAG1 del sujeto con un nivel de expresión normalizado de BAG1 en muestras de pacientes…

Método para usar la expresión génica para determinar el pronóstico de cáncer de próstata.

(11/03/2015) Método para determinar una probabilidad de recidiva de cáncer en un paciente con cáncer de próstata, que comprende: medir un nivel de expresión de GSTM2 en una muestra biológica que comprende tejido prostático obtenido del paciente, predecir una probabilidad de recidiva de cáncer para el paciente; en el que un nivel aumentado de expresión de GSTM2 se asocia negativamente con un riesgo aumentado de recidiva.

Marcadores de expresión génica para el pronóstico de cáncer colorrectal.

(11/06/2014) Método de predicción del desenlace clínico para un sujeto humano al que se le ha diagnosticado cáncer colorrectal tras la resección quirúrgica del cáncer, que comprende: determinar un nivel de expresión normalizada de un transcrito de ARN de BGN, o un producto de expresión del mismo, en una muestra biológica que comprende células de cáncer colorrectal obtenidas del sujeto humano; y predecir la probabilidad de un desenlace clínico positivo para el sujeto humano basándose en dicho nivel de expresión normalizada, en el que un aumento de la expresión normalizada de un transcrito de ARN de BGN, o un producto de expresión del mismo, se correlaciona negativamente con una probabilidad aumentada de…

Obtención de perfil de expresión génica en tejidos tumorales biopsiados.

(14/05/2014) Método de predicción de la probabilidad de supervivencia a largo plazo de un paciente con cáncer de mama sin la recidiva de cáncer de mama, tras la extirpación quirúrgica del tumor primario, que comprende determinar mediante RT-PCR el nivel del transcrito de ARN de SURV en una muestra de tejido de cáncer de mama incrustado en cera, fijado obtenida de dicho paciente, normalizado frente al nivel de todos los transcritos de ARN sometidos a ensayo en dicha muestra, o un conjunto de referencia de transcritos de ARN, en el que un aumento del nivel normalizado del transcrito de ARN de SURV en comparación con…

Predicción de la probabilidad de recidiva de cáncer.

(14/05/2014) Método de predicción de la probabilidad de supervivencia libre de enfermedad de un paciente con cáncer de mama ductal invasivo, de ganglios negativos, positivo para ER, que comprende determinar el nivel de expresión del transcrito de ARN de STMY3 en una muestra de célula o tejido de cáncer de mama obtenida del paciente, normalizado frente al nivel de expresión de un conjunto de referencia de transcritos de ARN, comparar el nivel de expresión normalizado de STMY3 del paciente con un nivel de expresión normalizado de STMY3 en un conjunto de referencia de tejido de cáncer de mama que comprende pacientes que (a) estaban vivos sin recidiva de cáncer de mama local, regional o distante, (b)…

Pruebas para predecir la receptividad de pacientes con cáncer a opciones de tratamiento con quimioterapia.

(16/04/2014) Método de predicción de si un paciente con cáncer de mama presentará una respuesta beneficiosa a la quimioterapia, que comprende: medir un nivel de expresión de DDR1, o su producto de expresión, en una muestra de tumor obtenida del paciente; usar el nivel de expresión para determinar una probabilidad de una respuesta beneficiosa a un tratamiento que incluye un taxano, en el que la expresión de DDR1 se correlaciona positivamente con un aumento de la probabilidad de una respuesta beneficiosa a un tratamiento que incluye un taxano, y generar un informe que incluye información basada en la probabilidad de una respuesta beneficiosa…

Predictores de la respuesta de pacientes al tratamiento con inhibidores del receptor del EGF.

(21/11/2013) Un procedimiento para predecir una probabilidad de que un paciente humano con un cáncer colorrectal queexpresa EGFR presente una respuesta beneficiosa a un inhibidor del EGFR usando un modelo de 4 genes basadoen niveles de expresión de AREG, EREG, DUSP6 y SLC26A3, que comprende: medir, en una muestra tumoral obtenida del paciente, niveles de transcritos de ARN, o sus productos deexpresión, de AREG, EREG, DUSP6 y SLC26A3, normalizar los niveles de los transcritos de ARN, o sus productos de expresión, de AREG, EREG, DUSP6 ySLC26A3, para obtener niveles de expresión normalizados de AREG, EREG, DUSP6 y SLC26A3; y usar los niveles…

Obtención de perfil de expresión génica en tejidos tumorales biopsiados.

(14/08/2013) Método de predicción de la probabilidad de supervivencia a largo plazo de un paciente con cáncer de mamasin la recidiva de cáncer de mama, tras la extirpación quirúrgica del tumor primario, que comprende determinar el nivel del transcrito de ARN de BAG1 en una muestra de tejido de cáncer de mama obtenidade dicho paciente, normalizado frente al nivel de expresión de todos los transcritos de ARN sometidos aensayo en dicha muestra, o un conjunto de referencia de transcritos de ARN, en el que un aumento del nivel normalizado del transcrito de ARN de BAG1 en comparación con el nivelnormalizado del transcrito de ARN de BAG1 en un conjunto de referencia de tejidos de cáncer de mamaindica un aumento de la probabilidad de supervivencia a largo plazo sin recidiva de cáncer de mama.

Pruebas para predecir la receptividad de pacientes con cáncer a opciones de tratamiento con quimioterapia.

(16/05/2013) Método de predicción de si un paciente con cáncer de mama presentará una respuesta beneficiosa a laquimioterapia, que comprende: medir un nivel de expresión de BAK1, o su producto de expresión, en una muestra de tumor obtenida del paciente; usar el nivel de expresión para determinar una probabilidad de una respuesta beneficiosa a un tratamiento queincluye un taxano, en el que la expresión de BAK1 se correlaciona positivamente con un aumento de la probabilidadde una respuesta beneficiosa a un tratamiento que incluye un taxano; y generar un informe que incluye información basada en la probabilidad de una respuesta beneficiosa a unaquimioterapia que incluye un taxano.

Indicadores moleculares de pronóstico de cáncer de mama y predicción de la respuesta al tratamiento.

(21/03/2012) Un método para la determinación cuantitativa de la probabilidad de una respuesta beneficiosa en un paciente con cáncer de mama positivo para receptor de estrógenos 1 (ESR1) al tratamiento con un fármaco antiestrógeno, que comprende determinar cuantitativamente, en una muestra biológica que comprende células de cáncer de mama obtenidas de dicho paciente, una puntuación del grupo de ESR1 que se basa en los niveles de expresión de ESR1, PGR, BCL2 y SCUBE2, o productos de expresión de los mismos, en el que dicha puntuación del grupo de ESR1 se representa como una variable continua o como intervalos de expresión y en el que se usan aumentos en dichos niveles de expresión como una indicación cuantitativa de que dicho…

OBTENCIÓN DE PERFIL DE EXPRESIÓN GÉNICA EN TEJIDOS TUMORALES BIOPSIADOS.

(15/02/2012) Método de predicción de la probabilidad de supervivencia a largo plazo de un paciente con cáncer de mama sin la recidiva de cáncer de mama, tras la extirpación quirúrgica del tumor primario, que comprende determinar el nivel de expresión del transcrito de ARN de CCNB1, en una muestra de tejido de cáncer de mama obtenida de dicho paciente, normalizado frente al nivel de expresión de un conjunto de referencia de transcritos de ARN, en el que la sobreexpresión de dicho CCNB1 indica una disminución de la probabilidad de supervivencia a largo plazo sin recidiva de cáncer de mama

AMPLIFICACIÓN UNIVERSAL DE RNA FRAGMENTADO.

(01/06/2011) Un método de procesamiento de RNA fragmentado que comprende una multiplicidad de especies de RNA obtenidas de una muestra de tejido fijada e incrustada en parafina para análisis de la expresión génica, que comprende los pasos de: (a) poliadenilación del RNA fragmentado, y (b) conversión del RNA poliadenilado fragmentado obtenido en el paso (a) en cDNA

USO DE ARN INTRONICO PARA MEDIR LA EXPRESION GENICA.

Sección de la CIP Química y metalurgia

(16/03/2009). Ver ilustración. Inventor/es: KIEFER, MICHAEL, C., SCOTT, RANDAL W., BAKER,JOFFRE,B. Clasificación: C12Q1/68.

Un método para controlar la expresión génica en una muestra biológica, que comprende: (a) proporcionar un polinucleótido complementario a una secuencia de ARN intrónica dentro de un gen diana, donde la expresión de dicha secuencia de ARN intrónica se correlaciona con la expresión de una secuencia de ARNm exónica dentro de dicho gen; (b) hibridar dicho polinucleótido con dicha secuencia de ARN intrónica para formar un complejo de polinucleótido- ARN intrónico; y (c) detectar el complejo de polinucleótido-ARN intrónico.