Método para la evaluación no invasiva de variaciones genéticas.
Un método para estimar una fracción de ácido nucleico fetal en una muestra de ensayo de una hembra gestante,
que comprende:
(a) obtener recuentos de lecturas de secuencias mapeadas a porciones de un genoma de referencia, cuyas lecturas de secuencias son lecturas de ácido nucleico circulante libre de células de una muestra de ensayo de una hembra gestante, y cuyas porciones se eligen de ventanas genómicas discretas, ventanas genómicas que tienen secuencias secuenciales de longitud predeterminada, ventanas de tamaño variable, atenuado de la señal de cobertura basado en puntos y una combinación de los mismos;
(b) convertir, utilizando un microprocesador, los recuentos de las lecturas de secuencias mapeadas a cada porción en una fracción de ácido nucleico fetal específica de porción de acuerdo con un factor de ponderación asociado independientemente con cada porción, proporcionando, de este modo, estimaciones de la fracción fetal específica de porción para la muestra de ensayo de acuerdo con los factores de ponderación, en donde cada uno de los factores de ponderación se ha determinado a partir de una relación ajustada para cada porción entre (1) una fracción de ácido nucleico fetal para cada una de unas múltiples muestras en un conjunto de prueba, y (2) los recuentos de lecturas de secuencias mapeadas a cada porción para las múltiples muestras; y
(c) estimar una fracción de ácido nucleico fetal para la muestra de ensayo basándose en las estimaciones de la fracción fetal específica de porción.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2014/043497.
Solicitante: SEQUENOM, INC..
Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.
Dirección: 3595 John Hopkins Court San Diego ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.
Inventor/es: DECIU,COSMIN, KIM,SUNG K, HANNUM,GREGORY, GEIS,JENNIFER.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C12Q1/6869 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › Métodos de secuenciación.
- C12Q1/6872 C12Q 1/00 […] › implicando espectrometría de masas.
PDF original: ES-2721051_T3.pdf
Patentes similares o relacionadas:
Secuenciado pirofosforolítico usando nanoporos, del 15 de Julio de 2020, de ILLUMINA CAMBRIDGE LIMITED: Un método para determinar la secuencia de un ácido nucleico diana, que comprende (a) proporcionar un ácido nucleico diana; (b) poner en […]
Métodos y sistemas para detectar variantes genéticas, del 15 de Julio de 2020, de Guardant Health, Inc: Un método para determinar una medida cuantitativa indicativa de una serie de moléculas de ácido desoxirribonucleico (ADN) de cadena doble individuales en una muestra, […]
Métodos y sistemas para analizar datos de imagen, del 3 de Junio de 2020, de ILLUMINA, INC: Un método que comprende: (a) realizar una pluralidad de ciclos de una secuenciación por reacción de síntesis, de tal forma que, en cada ciclo, se genera una […]
Métodos de secuenciación, del 3 de Junio de 2020, de DNAE GROUP HOLDINGS LIMITED: Un método para secuenciar una cadena de polinucleótidos mediante secuenciación por síntesis, comprendiendo el método las etapas de: a) proporcionar […]
Análisis de polinucleótidos basado en nanoporos con marcadores fluorescentes que se inactivan mutuamente, del 29 de Abril de 2020, de Quantapore Inc: Un método para determinar una secuencia de nucleótidos de al menos un polinucleótido, comprendiendo el método las etapas de: translocar al menos un polinucleótido […]
Etiquetado múltiple de fragmentos largos de ADN, del 22 de Abril de 2020, de Complete Genomics, Inc: Un método para preparar ADN genómico para el análisis de secuencias, por reacción homogénea sin el uso de compartimentación física tal como nanogotas, comprendiendo el método: […]
Secuenciación de ácidos nucleicos usando marcas, del 8 de Abril de 2020, de Roche Sequencing Solutions, Inc: Un procedimiento para secuenciar una muestra de ácido nucleico con la ayuda de un nanoporo en una membrana contigua a un electrodo sensor, comprendiendo el procedimiento: […]
Método para evaluar un inmunorrepertorio, del 1 de Abril de 2020, de iRepertoire, Inc: Un método implementado por ordenador para analizar informaciones de secuencia semicuantitativas para identificar y caracterizar el inmunoperfil de un ser humano o animal […]