Etiquetado múltiple de fragmentos largos de ADN.

Un método para preparar ADN genómico para el análisis de secuencias,

por reacción homogénea sin el uso de compartimentación física tal como nanogotas, comprendiendo el método:

(a) combinar una pluralidad de fragmentos largos que comprenden secuencias de ADN genómico en una sola mezcla con una población de perlas, en las que (i) los fragmentos largos son de 5 kilobases a 750 kilobases de longitud, (ii) cada perla comprende al menos 1000 copias del mismo oligonucleótido inmovilizado sobre la misma, comprendiendo dicho oligonucleótido una secuencia que contiene una etiqueta, (iii) cada secuencia que contiene una etiqueta comprende una secuencia de etiqueta, y (iv) la población de perlas comprende, en conjunto, al menos 10.000 secuencias de etiquetas diferentes;

(b) producir fragmentos largos etiquetados incorporando en cada uno de una pluralidad de fragmentos largos individuales múltiples copias de una secuencia de etiqueta, en los que en una pluralidad de dichos fragmentos largos individuales dichas copias múltiples son de una sola perla;

(c) producir subfragmentos de los fragmentos largos etiquetados, en los que una pluralidad de subfragmentos del mismo fragmento largo etiquetado comprende secuencias de etiquetas de la misma perla;

en el que la etapa (b) se lleva a cabo bajo condiciones que promueven la interacción de solo una secuencia de etiqueta por fragmento largo

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2014/030649.

Solicitante: Complete Genomics, Inc.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 2904 Orchard Parkway San Jose, CA 95134 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: DRMANAC,RADOJE, PETERS,BROCK A, ALEXEEV,ANDREI.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12N15/10 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN (biocidas, productos que repelen o atraen a los animales nocivos, o reguladores del crecimiento de los vegetales, que contienen microorganismos virus, hongos microscópicos, enzimas, productos de fermentación o sustancias obtenidas por o extraídas de microorganismos o sustancias animales A01N 63/00; preparaciones de uso médico A61K; fertilizantes C05F ); PROPAGACION,CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Procedimientos para el aislamiento, la preparación o la purificación de ADN o ARN (preparación química de ADN o ARN C07H 21/00; preparación de polinucleótidos no estructurales a partir de microorganismos o con la ayuda de enzimas C12P 19/34).
  • C12Q1/6806
  • C12Q1/6869

PDF original: ES-2794021_T3.pdf

 

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