Método para evaluar un inmunorrepertorio.

Un método implementado por ordenador para analizar informaciones de secuencia semicuantitativas para identificar y caracterizar el inmunoperfil de un ser humano o animal como normal o como que es probable que indique la presencia de una enfermedad,

comprendiendo el método las etapas de:

(a) identificar una o más secuencias distintas de la región determinante de complementariedad 3 (CDR3) que se comparten entre el inmunoperfil del sujeto y un inmunoperfil acumulativo de una biblioteca de enfermedades que representa una enfermedad específica almacenada en una base de datos;

(b) sumar un número total de las secuencias detectadas del sujeto que corresponden a esas secuencias distintas de CDR3 compartidas;

(c) calcular el porcentaje del número total de secuencias detectadas en el inmunoperfil del sujeto que son representativas de esas CDR3 distintas compartidas entre el inmunoperfil del sujeto y la biblioteca de enfermedades para crear uno o más índices de compartición originales;

(d) seleccionar al azar secuencias de una biblioteca pública almacenada en una base de datos para formar una sub-biblioteca, comprendiendo la sub-biblioteca un número de secuencias de CDR3 distintas que es aproximadamente igual al número de secuencias de CDR3 distintas en la biblioteca de enfermedades;

(e) identificar una o más secuencias de CDR3 distintas que se comparten entre el inmunoperfil del sujeto y la subbiblioteca;

(f) sumar un número total de secuencias detectadas que corresponden a esas secuencias de CDR3 compartidas y calcular un porcentaje del número total de secuencias detectadas en el inmunoperfil del sujeto que se comparten entre el inmunoperfil del sujeto y la sub-biblioteca, para crear un índice de compartición de muestreo;

(g) repetir las etapas (d) - (f) durante una cantidad de veces suficiente para producir un resultado que sea estadísticamente significativo para identificar y caracterizar el inmunoperfil de dicho sujeto como normal o como que es probable que indique la presencia de una enfermedad;

(h) estimar el valor de P como la fracción de veces que los índices de compartición de muestras son mayores que o iguales al índice de compartición original entre el inmunoperfil de dicho sujeto y la biblioteca de enfermedades; e

(i) caracterizar el inmunoperfil del sujeto como normal si el valor de P estimado es superior a 0,01, o caracterizar el inmunoperfil del sujeto como que es probable que indique la presencia de la enfermedad representada por la biblioteca de enfermedades, si el valor de P estimado es inferior a 0,01.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2014/015841.

Solicitante: iRepertoire, Inc.

Inventor/es: HAN,JIAN, WANG,CHUNLIN.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/6869
  • C12Q1/6883

PDF original: ES-2798119_T3.pdf

 

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