Detección de alelos basada en consenso.

Un método para genotipar alelos en al menos un conjunto de loci genéticos homólogos,

que comprende:

(i) proporcionar una muestra que contiene ADN que incluye dicho al menos un conjunto de loci genéticos homólogos, en donde dicho conjunto de loci genéticos homólogos comprende:

(a) el gen RHD y el gen RHCE que codifican el antígeno eritrocitario; o

(b) dos o más genes del sistema del antígeno leucocitario humano (HLA); o

(c) dos de más de los genes que codifican la glucoforina seleccionados del gen GYPA, el gen GYPB y el gen GYPE;

(ii) realizar la amplificación por PCR de regiones de dicho conjunto de loci genéticos homólogos usando cebadores específicos de secuencia consenso, en donde dichos cebadores específicos de secuencia consenso se unen a secuencias consenso que son comunes a dichos genes de conjunto de loci genéticos homólogos (a),

(b) o (c);

generando así un conjunto de productos de amplificación;

(iii) secuenciar una pluralidad de dichos productos de amplificación para determinar la proporción relativa de cada nucleótido en cada posición en una lectura de secuenciación;

(iv) realizar una alineación de secuencia entre los resultados de lectura de secuencia de (iii) y al menos una secuencia de referencia, correspondiéndose dicha secuencia de referencia con uno de los genes en dicho conjunto de loci genéticos homólogos; y

(v) realizar una identificación de genotipo del alelo o alelos en dicha muestra basada en la proporción relativa de cada nucleótido en cada una de una pluralidad de posiciones discriminantes en dicha alineación.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/EP2015/068601.

Solicitante: PROGENIKA BIOPHARMA, S.A..

Nacionalidad solicitante: España.

Provincia: VIZCAYA.

Inventor/es: MARTINEZ, ANTONIO, OCHOA,JORGE, LOPEZ,MONICA, TEJEDOR,DIEGO, ARTETA,DAVID, ILLESCAS,MARÍA JOSÉ, STEF,MARIANNE.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/6827
  • C12Q1/6881

PDF original: ES-2761567_T3.pdf

 

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