Procedimiento implementado por ordenador y sistema informático para la identificación de organismos.

Un procedimiento implementado por ordenador para identificar tipos de organismos a partir de una secuencia genética diana,

que comprende:

recibir la secuencia genética diana;

seleccionar automáticamente en una base de datos (4) a partir de una pluralidad de perfiles (42) de secuencias específicas de tipos de organismos, en el que cada perfil (42) de secuencias define regiones de secuencias informativas para la diferenciación de los tipos de organismos individuales e incluye información específica de la posición relacionada con más de una secuencia (41) de referencia asociada de un tipo de organismo específico, en el que un perfil (42) de secuencias seleccionado tiene una correlación más alta con la secuencia genética diana en base a dicha información específica de la posición del perfil específico del tipo de organismo relacionado;

recuperar automáticamente desde la base de datos (4) secuencias (41) de referencia asociadas con el perfil (42) de secuencias seleccionado;

comparar automáticamente la secuencia genética diana con las secuencias (41) de referencia y ponderar automáticamente los resultados de comparación relacionados con las regiones de secuencias informativas usando factores de ponderación asociados con las regiones de secuencias informativas definidas en el perfil de secuencias seleccionado;

determinar a partir de las secuencias (41) de referencia una secuencia (41) de referencia específica del tipo de organismo que tiene una mejor coincidencia con la secuencia genética diana, en el que la mejor coincidencia se determina en base a los resultados de comparación ponderados para las regiones de secuencias informativas; y

asignar a la secuencia genética diana un tipo de organismo en base a la secuencia de referencia específica del tipo de organismo con la mejor coincidencia.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/CH2005/000664.

Solicitante: SMARTGENE GMBH.

Nacionalidad solicitante: Suiza.

Dirección: INDUSTRIESTRASSE 16 6300 ZUG SUIZA.

Inventor/es: EMLER,STEFAN.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • G06F19/22 SECCION G — FISICA.G06 COMPUTO; CALCULO; CONTEO.G06F TRATAMIENTO DE DATOS DIGITALES ELECTRICOS (computadores en los que una parte del cálculo se efectúa hidráulica o neumáticamente G06D, ópticamente G06E; sistemas de computadores basados en modelos de cálculo específicos G06N). › G06F 19/00 Métodos o equipos para computación digital o procesamiento de datos, especialmente adaptados para aplicaciones específicas (G06F 17/00  tiene preferencia; sistema o métodos de procesamiento de datos especialmente adaptados para propósitos administrativos, comerciales, financieros, de gestión, supervisión o predicción G06Q). › para comparación de secuencias de nucleótidos o aminoácidos, p.ej. búsqueda de homología, descubrimiento de motivos o SNP [Polimorfismos de un único nucleótido, en inglés Single-Nucleotide Polymorphism] o alineamiento de secuencias.
  • G06F19/28 G06F 19/00 […] › para herramientas de programación o sistemas de bases de datos, p.ej. ontologías, integración de datos heterogéneos, almacenamiento de datos o arquitecturas de ordenador.

PDF original: ES-2609479_T3.pdf

 

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