Productos de glucoproteínas definidas y métodos relacionados.

Un método para obtener un producto de glucoproteína que tiene una propiedad de glucano diana,

comprendiendoel método:

en un sistema de ordenador (400, 450) que tiene una base de datos, almacenar el sistema de ordenador unapluralidad de propiedades de glucano y correlacionar, en la base de datos, cada una de la pluralidad de propiedadesde glucano con uno o más parámetros de producción o combinaciones de parámetros de producción,

i) introducir en el sistema de ordenador una propiedad de glucano diana seleccionada de galactosilación,fucosilación, manosa elevada, estructuras híbridas, y sus combinaciones;

ii) seleccionar, mediante el sistema de ordenador a partir de la base de datos, una pluralidad de parámetros deproducción o combinaciones de parámetros de producción que se correlaciona con la propiedad de glucano diana,en el que al menos una combinación seleccionada de parámetros de producción y la propiedad de glucano dianaestán correlacionados en dicha base de datos mediante una función correlativa no lineal o una función correlativaconstreñida, y en el que dicha al menos una combinación seleccionada de parámetros de producción incluye unprimer parámetro de producción y un segundo parámetro de producción, en el que dicho primer parámetro deproducción es el contenido de glucosamina de un medio de cultivo celular, y dicho segundo parámetro de producciónes el contenido de uridina de un medio de cultivo celular;

iii) extraer del sistema de ordenador los parámetros de producción seleccionados o las combinaciones deparámetros de producción; y

iv) aplicar los parámetros de producción seleccionados o las combinaciones de parámetros de producción en unprocedimiento para obtener el producto de glucoproteína, etapa de aplicación la cual comprende incorporar losparámetros de producción seleccionados o las combinaciones de parámetros de producción en un sistema deproducción y mantener dicho sistema en condiciones que permitan la producción del producto de glucoproteína,obteniendo de ese modo el producto de glucoproteína;

en el que:

la función correlativa no lineal representa una relación en la que el efecto de dicho primer parámetro de producción ydicho segundo parámetro de producción que actúan juntos sobre dicha propiedad de glucano diana no es la mismaque la combinación de dicho primer parámetro de producción que actúa solo sobre dicha propiedad de glucanodiana junto con el efecto de dicho segundo parámetro de producción que actúa solo sobre dicha propiedad deglucano diana; y

la función correlativa constreñida se refiere a un valor para dicho primer parámetro de producción a un valor paradicha propiedad de glucano diana seleccionada de galactosilación y manosa elevada, y también identifica uno oambos de: una segunda propiedad de glucano que es alterada por dicho primer parámetro de producción; y quedicho segundo parámetro de producción se puede usar junto con el primer parámetro de producción para modular elefecto global de dicho primer parámetro de producción en una segunda propiedad de glucano.

Productos de glucoproteínas definidas y métodos relacionados

La presente descripción se refiere a productos de glucoproteínas y a métodos relacionados, por ejemplo métodos para obtener productos de glucoproteínas de referencia y a métodos para diseñar procedimientos para obtener productos de glucoproteínas que tienen propiedades físicas y funcionales definidas.

ANTECEDENTES

Muchos fármacos en uso hoy en día son “fármacos de pequeñas moléculas”. Estos fármacos existen como estructuras químicas simples que se obtienen sintéticamente. El ingrediente activo existe generalmente como un producto homogéneo. Estos fármacos de pequeñas moléculas y sus preparaciones se pueden caracterizar químicamente y generalmente se fabrican fácilmente mediante síntesis química comparativamente simple.

Un producto de glucoproteína típico difiere sustancialmente en términos de complejidad de un fármaco de pequeña molécula típico. Las estructuras de azúcar unidas a la cadena principal de aminoácido de una glucoproteína pueden variar estructuralmente de muchas maneras, incluyendo secuencia, ramificación, contenido de azúcar, y heterogeneidad. De este modo, los productos de glucoproteínas pueden ser mezclas heterogéneas complejas de muchas moléculas estructuralmente diversas que tienen ellas mismas estructuras de glucano complejas. La glucosilación no sólo se añade a la complejidad estructural de la molécula, sino afecta a muchos de los atributos biológicos clínicos de la glucoproteínas.

Hasta la fecha, la creación de fármacos de glucoproteínas que tienen propiedades definidas, ya sea en un intento para producir una versión genérica de un fármaco existente o para producir una segunda generación u otra glucoproteína que tiene propiedades mejoradas o deseables, ha sido científicamente desafiante debido a la dificultad para comprender y sintetizar estas estructuras químicas complejas y las mezclas que las contienen.

La situación con respecto a la producción de productos genéricos es indicativa de los problemas encarados a la hora de obtener fármacos de glucoproteínas que tienen propiedades definidas. Aunque se han implementado procedimientos reguladores abreviados para versiones genéricas de productos farmacéuticos, muchos en la industria biotecnológica y farmacéutica han aceptado el punto de vista de que la complejidad de los productos biológicos los hacen inadecuados para enfoques similares.

Métodos para obtener glucoproteínas

Los métodos descritos aquí permiten la producción de glucoproteínas que tienen estructuras de glucano definidas y/o propiedades funcionales definidas mediadas por glucanos. Algunos métodos se basan en el uso de bases de datos que incluyen correlaciones entre parámetros de producción y propiedades deseadas de glucanos. La base de datos puede proporcionar parámetros de producción para la incorporación en un protocolo de producción. Los métodos permiten la producción de glucoproteínas diseñadas o glucoproteínas en general que tienen propiedades de glucanos definidas.

Según un primer aspecto de la presente invención, se proporciona un método para obtener un producto de glucoproteína que tiene una propiedad de glucano diana, comprendiendo el método:

en un sistema de ordenador que tiene una base de datos, almacenar el sistema de ordenador una pluralidad de propiedades de glucano y correlacionar, en la base de datos, cada una de la pluralidad de propiedades de glucano con uno o más parámetros de producción o combinaciones de parámetros de producción,

i) introducir en el sistema de ordenador una propiedad de glucano diana seleccionada de galactosilación, fucosilación, manosa elevada, estructuras híbridas, y sus combinaciones;

ii) seleccionar, mediante el sistema de ordenador a partir de la base de datos, una pluralidad de parámetros de producción o combinaciones de parámetros de producción que se correlaciona con la propiedad de glucano diana, en el que al menos una combinación seleccionada de parámetros de producción y la propiedad de glucano diana están correlacionados en dicha base de datos mediante una función correlativa no lineal o una función correlativa constreñida, y en el que dicha al menos una combinación seleccionada de parámetros de producción incluye un primer parámetro de producción y un segundo parámetro de producción, en el que dicho primer parámetro de producción es el contenido de glucosamina de un medio de cultivo celular, y dicho segundo parámetro de producción es el contenido de uridina de un medio de cultivo celular;

iii) extraer del sistema de ordenador los parámetros de producción seleccionados o las combinaciones de parámetros de producción; y

iv) aplicar los parámetros de producción seleccionados o las combinaciones de parámetros de producción en un procedimiento para obtener el producto de glucoproteína, etapa de aplicación la cual comprende incorporar los parámetros de producción seleccionados o las combinaciones de parámetros de producción en un sistema de producción y mantener dicho sistema en condiciones que permitan la producción del producto de glucoproteína,

obteniendo de ese modo el producto de glucoproteína;

en el que:

la función correlativa no lineal representa una relación en la que el efecto de dicho primer parámetro de producción y dicho segundo parámetro de producción que actúan juntos sobre dicha propiedad de glucano diana no es la misma que la combinación de dicho primer parámetro de producción que actúa solo sobre dicha propiedad de glucano diana junto con el efecto de dicho segundo parámetro de producción que actúa solo sobre dicha propiedad de glucano diana; y

la función correlativa constreñida se refiere a un valor para dicho primer parámetro de producción a un valor para dicha propiedad de glucano diana seleccionada de galactosilación y manosa elevada, y también identifica uno o ambos de: una segunda propiedad de glucano que es alterada por dicho primer parámetro de producción; y que dicho segundo parámetro de producción se puede usar junto con el primer parámetro de producción para modular el efecto global de dicho primer parámetro de producción en una segunda propiedad de glucano.

En otro aspecto, la presente invención proporciona un medio legible por el ordenador que comprende un código que, cuando se ejecuta en un sistema de procesamiento de datos, lleva a cabo las etapas i) , ii) y iii) del método anterior.

En un aspecto adicional, la presente invención proporciona un sistema de ordenador que comprende medios para llevar a cabo las etapas i) , ii) y iii) del método anterior.

Más generalmente, la presente descripción se refiere a un método para obtener un producto de glucoproteína, que incluye las etapas de:

i) proporcionar una base de datos que correlaciona, define, identifica, se refiere, o proporciona cada una de una pluralidad de propiedades de glucano como una función correlativa de uno o más parámetros de producción o combinaciones de parámetros de producción;

ii) identificar una propiedad de glucano diana, por ejemplo una propiedad de glucano de un producto de glucoproteína primario;

iii) seleccionar de una base de datos uno o más parámetros de producción o combinaciones de parámetros de producción que se correlaciona con la propiedad de glucano diana; y

iv) aplicar el parámetro de producción seleccionado o las combinaciones de parámetros de producción en un procedimiento para obtener el producto de glucoproteína,

obteniendo de ese modo un producto de glucoproteína.

Como se discute con detalle en otra parte aquí, los métodos, bases de datos y sistemas descritos aquí pueden incluir o usar diversos tipos de correlaciones entre los parámetros de producción y las propiedades de los glucanos que condicionan. Estas se denominan como funciones correlativas. La producción de glucoproteínas es un proceso complejo, y las correlaciones proporcionadas en las bases de datos pueden reflejar esto mismo. Las funciones correlativas ejemplares incluyen funciones correlativas no lineales. Una correlación no lineal puede reflejar una relación entre parámetros de producción y propiedades de glucano, en la que el efecto de dos (o más) parámetros de producción que actúan... [Seguir leyendo]

1. Un método para obtener un producto de glucoproteína que tiene una propiedad de glucano diana, comprendiendo el método:

en un sistema de ordenador (400, 450) que tiene una base de datos, almacenar el sistema de ordenador una pluralidad de propiedades de glucano y correlacionar, en la base de datos, cada una de la pluralidad de propiedades de glucano con uno o más parámetros de producción o combinaciones de parámetros de producción,

i) introducir en el sistema de ordenador una propiedad de glucano diana seleccionada de galactosilación, fucosilación, manosa elevada, estructuras híbridas, y sus combinaciones;

ii) seleccionar, mediante el sistema de ordenador a partir de la base de datos, una pluralidad de parámetros de producción o combinaciones de parámetros de producción que se correlaciona con la propiedad de glucano diana, en el que al menos una combinación seleccionada de parámetros de producción y la propiedad de glucano diana están correlacionados en dicha base de datos mediante una función correlativa no lineal o una función correlativa constreñida, y en el que dicha al menos una combinación seleccionada de parámetros de producción incluye un primer parámetro de producción y un segundo parámetro de producción, en el que dicho primer parámetro de producción es el contenido de glucosamina de un medio de cultivo celular, y dicho segundo parámetro de producción es el contenido de uridina de un medio de cultivo celular;

iii) extraer del sistema de ordenador los parámetros de producción seleccionados o las combinaciones de parámetros de producción; y

iv) aplicar los parámetros de producción seleccionados o las combinaciones de parámetros de producción en un procedimiento para obtener el producto de glucoproteína, etapa de aplicación la cual comprende incorporar los parámetros de producción seleccionados o las combinaciones de parámetros de producción en un sistema de producción y mantener dicho sistema en condiciones que permitan la producción del producto de glucoproteína,

obteniendo de ese modo el producto de glucoproteína;

en el que:

la función correlativa no lineal representa una relación en la que el efecto de dicho primer parámetro de producción y dicho segundo parámetro de producción que actúan juntos sobre dicha propiedad de glucano diana no es la misma que la combinación de dicho primer parámetro de producción que actúa solo sobre dicha propiedad de glucano diana junto con el efecto de dicho segundo parámetro de producción que actúa solo sobre dicha propiedad de glucano diana; y

la función correlativa constreñida se refiere a un valor para dicho primer parámetro de producción a un valor para dicha propiedad de glucano diana seleccionada de galactosilación y manosa elevada, y también identifica uno o ambos de: una segunda propiedad de glucano que es alterada por dicho primer parámetro de producción; y que dicho segundo parámetro de producción se puede usar junto con el primer parámetro de producción para modular el efecto global de dicho primer parámetro de producción en una segunda propiedad de glucano.

2. El método de la reivindicación 1, que comprende además:

recibir, como entrada al sistema de ordenador (400, 450) , un valor alterado de un parámetro de producción seleccionado o combinación de parámetros de producción, y seleccionar, mediante el sistema de ordenador a partir de la base de datos, el efecto correlacionado del valor alterado en la propiedad de glucano.

3. El método de la reivindicación 1, que comprende además:

estudiar la glucoproteína, o su cultivo celular, para determinar cualquiera de contenido de endotoxina, esterilidad, contenido de micoplasma, lixiviados, contaminantes de ADN de células hospedantes (por ejemplo CHO) o de proteína; y

registrar los contaminantes del proceso de la glucoproteína, o su cultivo celular.

4. El método de la reivindicación 1, en el que se seleccionan 2, 3, 4 ó 5 parámetros de producción.

5. Un medio legible por ordenador que comprende un código que, cuando se ejecuta en un sistema de procesamiento de datos, lleva a cabo las etapas (i) , (ii) y (iii) del método de la reivindicación 1.

6. Un sistema de ordenador (400, 450) que comprende medios para llevar a cabo las etapas (i) , (ii) y (iii) del método de la reivindicación 1.