Análisis automatizado de patrones de interacción sonda-diana multiplexados: coincidencia de patrones e identificación de alelos.

Método para asignaciones de alelos donde las asignaciones se realizan basándose en someter una muestra que incluye ácido nucleico diana a un ensayo de hibridación o ensayo de elongación mediado por captura,

o ambos, y donde se analizan varios marcadores polimórficos, presentes en alelos del ácido nucleico diana, comprendiendo el método:

determinar un patrón de intensidad de señales de ensayo generado por interacciones sonda-diana para generar un patrón de reacción designando como positivas aquellas intensidades de señal que superan un umbral predeterminado y designando como negativas aquellas intensidades de señal que no superan el umbral predeterminado, binarizando de ese modo dicho patrón de intensidad de señales de ensayo generado por interacciones sonda-diana donde cada una de dicha intensidad corresponde al número de acontecimientos de hibridación o elongación correspondientes, según sea aplicable;

realizar asignaciones de alelos basándose en comparar y hacer coincidir dicho patrón de reacción con un patrón de reacción de referencia similar que representa combinaciones de dos o más alelos de referencia, tal como se enumera en una colección de referencia de alelos para el ácido nucleico diana en construcción; y designar, como nuevos alelos, los que tienen patrones de reacción que difieren de patrones de reacción de referencia que representan combinaciones de dos o más alelos de referencia mediante una disparidad mínima predeterminada.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2005/027359.

Solicitante: BIOARRAY SOLUTIONS LTD.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 35 TECHNOLOGY DRIVE, SUITE 100 WARREN, NJ 07059 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.

Inventor/es: SEUL, MICHAEL, XIONGWU,XIA.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • G01N33/48 FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Material biológico, p. ej. sangre, orina (G01N 33/02, G01N 33/26, G01N 33/44, G01N 33/46 tienen prioridad ); Hemocitómetros (cómputo de glóbulos repartidos sobre una superficie por barrido óptico de la superficie G06M 11/02).
  • G01N33/50 G01N 33/00 […] › Análisis químico de material biológico, p. ej. de sangre o de orina; Ensayos mediante métodos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas con grupos coordinadores; Ensayos inmunológicos (procedimientos de medida o ensayos diferentes de los procedimientos inmunológicos en los que intervienen enzimas o microorganismos, composiciones o papeles reactivos a este efecto, procedimientos para preparar estas composiciones, procedimientos de control sensibles a las condiciones del medio en los procedimientos microbiológicos o enzimáticos C12Q).
  • G06F19/00

PDF original: ES-2573484_T3.pdf

 

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