Composiciones y métodos para tratar cánceres hematológicos dirigiéndose a la interacción SIRPalfa - CD47.

Un compuesto para uso en un método para tratar células cancerosas que son CD47+,

compuesto que comprende un polipéptido capaz de unirse al dominio extracelular de CD47 humano para interrumpir la señalización entre Sirpα humano y CD47 humano, en donde el polipéptido comprende Sirpα humano soluble o un fragmento del mismo que se une a CD47.

Composiciones y métodos para tratar cánceres hematológicos dirigiéndose a la interacción SIRPa - CD47 Solicitudes relacionadas

Esta solicitud reivindica el beneficio de prioridad de la Solicitud Provisional de EE.UU. n° 61/178.553.

Campo de la invención

La invención se refiere a la focalización en la interacción SIRPa - CD47 con objeto de tratar un cáncer hematológico, particularmente la leucemia mieloide aguda (AML; del inglés, acute myeloid leukemia) humana, y a compuestos para la misma.

Antecedentes de la invención

Se produce fallo del injerto en el trasplante de células madre hematopoyéticas a pesar de la identidad genética donante-huésped de los antígenos leucocitarios humanos, lo que sugiere que factores adicionales modulan la enjertación. Con el modelo de xenotrasplante en ratón diabético no obeso (NOD; del inglés, non-obese diabetic) con inmunodeficiencia combinada grave (SCID; del inglés, severe combined immunodeficiency) se ha hallado recientemente que el fondo NOD permite una mejor enjertación hematopoyética que con otras razas con mutaciones equivalentes relacionadas con una inmunodeficiencia [K. Takenaka et al., "Polymorphism in Sirpa modulates engraftment of human hematopoietic stem cells", Nat. Immunol. 8, 1313-1323 (27)]. Se identificaron polimorfismos en el alelo Sirpa y se mostró que eran responsables de las diferencias en la enjertación entre las razas de ratón analizadas. Aunque el fondo NOD confería el mejor soporte para la enjertación humana, no se pudo realizar la enjertación en ratones con otros polimorfismos de Sirpa (es decir, NOD.NOR-ldd13.SCID). En el ratón y el ser humano, Sirpa codifica la proteína SIRPa, que interacciona con su ligando CD47. En el sistema hematopoyético, SIRPa se encuentra principalmente en macrófagos, células dendríticas y granulocitos, mientras que CD47 está presente en la mayoría de las células hematopoyéticas [T. Matozaki, Y. Murata, H. Okazawa y H. Ohnishi, "Functions and molecular mechanisms of the CD47-SIRPalpha signalling pathway", Trends Cell Biol. 19, 72-8 (29)]. Se ha mostrado que el alelo Sirpa murino es muy polimórfico en el dominio extracelular de tipo V inmunoglobulínico que interacciona con CD47. Se secuenciaron treinta y siete (37) testigos humanos normales no relacionados y se identificaron 4 polimorfismos, lo que sugiere que el alelo Sirpa es polimórfico en seres humanos como lo es en ratones (Takenaka et al., supra).

Una gran cantidad de trabajo ha mostrado que clones de leucemia mieloide aguda (AML) humanos están jerárquicamente organizados y mantenidos por células que inician la leucemia (AML-LSC) [J. C. Wang y J. E. Dick, "Cáncer stem cells: lessons from leukemia", Trends Cell Biol. 15, 494-51 (25)]. Sin embargo, poco se sabe acerca de los reguladores moleculares que gobiernan el destino de las AML-LSC. Se expresa CD47 en la mayoría de las muestras de AML humanas, pero el nivel de expresión en blastos leucémicos varía. La expresión de CD47 es mayor en AML LSCs humanas que en HSCs normales [R. Majeti et al., "CD47 is an adverse prognostic factor and therapeutic antibody target on human acute myeloid leukemia stem cells", Cell 138, 286 (29)]. Se ha mostrado que una mayor expresión de CD47 es un factor independiente de mal pronóstico en AML (Majeti et al., supra). El tratamiento de ratones inmunodeficientes, a los que se ha injertado AML humana, con un anticuerpo monoclonal dirigido contra CD47 da lugar a una reducción de la enjertación leucémica en la médula ósea murina (Majeti et al., supra). Sin embargo, no está claro si este efecto es específicamente mediado a través de la alteración de interacciones CD47-SIRPa ya que CD47 también se une a SIRPy y a la subunidad integrínica (33 (Matozaki et al., supra).

Sumario de la invención

De acuerdo con un aspecto, se proporciona un método para tratar un cáncer hematológico, que comprende modular la interacción entre Sirpa humano y CD47 humano. Preferiblemente, la interacción entre Sirpa humano y CD47 humano se modula administrando una cantidad terapéuticamente eficaz de un polipéptido capaz de unirse al dominio extracelular de CD47 humano.

De acuerdo con otro aspecto, se proporciona un uso de un compuesto para tratar un cáncer hematológico, compuesto que comprende un polipéptido capaz de modular la interacción entre Sirpa humano y CD47 humano al unirse al dominio extracelular de CD47 humano.

De acuerdo con otro aspecto, se proporciona un uso de un compuesto en la preparación de un medicamento para tratar un cáncer hematológico, compuesto que comprende un polipéptido capaz de modular la interacción entre Sirpa humano y CD47 humano al unirse al dominio extracelular de CD47 humano.

En aspectos preferibles, el polipéptido comprende Sirpa humano soluble, o un fragmento del mismo que se une a

CD47. En algunas realizaciones, el polipéptido es el dominio extracelular de SIRPa humano.

En una realización, el polipéptido es una proteína de fusión Sirpa-Fcy es preferiblemente la ID. SEC. n° 13.

De acuerdo con otro aspecto, se proporciona un método para determinar polimorfismos genéticos en seres humanos que afectan a la supervivencia a un cáncer hematológico, que comprende:

a) secuenciar el gen Sirpa de una pluralidad de seres humanos que tienen cáncer hematológico;

b) determinar diferencias de nucleótidos en el gen Sirpa dentro de la pluralidad de seres humanos; y

c) correlacionar las diferencias de nucleótidos con la supervivencia para determinar polimorfismos relevantes.

En otro aspecto, se proporciona un método para pronosticar la probabilidad de supervivencia a un cáncer hematológico, que comprende:

a) secuenciar el gen Sirpa del receptor; y

b) determinar si existen los polimorfismos relevantes descritos en esta memoria.

De acuerdo con ciertas realizaciones, el polipéptido capaz de modular la interacción entre Sirpa humano y CD47 humano es seleccionado del grupo que consiste en:

a) un polipéptido que consiste en la secuencia de aminoácidos de ID. SEC. n° 1;

b) un polipéptido que consiste en un fragmento, ligante de CD47, de la secuencia de aminoácidos de ID. SEC.

n° 1, en donde el fragmento comprende al menos uno de los restos 31, 32, 34, 37, 74, 77, 83, 84, 86, 87, 9, 91, 96, 1, 12, 114, 118 y 126 de la ID. SEC. n° 1; y

c) una variante, ligante de CD47, de uno de los polipéptidos de a) y b) con hasta 1 inserción, supresión o sustitución de aminoácido por cada tramo de 7 aminoácidos del polipéptido, en donde el polipéptido comprende al menos uno de los restos 31, 32, 34, 37, 74, 77, 83, 84, 86, 87, 9, 91, 96, 1, 12, 114, 118 y 126 de la ID. SEC. n° 1.

De acuerdo con otra realización, el polipéptido capaz de modular la interacción entre Sirpa humano y CD47 humano es seleccionado del grupo que consiste en:

a) un polipéptido que consiste en la secuencia de aminoácidos de ID. SEC. n° 2;

b) un polipéptido que consiste en un fragmento, ligante de CD47, de la secuencia de aminoácidos de ID. SEC.

n° 2; y

c) una variante, ligante de CD47, de uno de los polipéptidos de a) y b) con hasta 1 inserción, supresión o sustitución de aminoácido por cada tramo de 7 aminoácidos del polipéptido;

en donde:

i. al menos uno de los restos de las posiciones 31, 32, 34, 37, 74, 77, 83, 84, 86, 87, 9, 91, 96, 1, 12, 114, 118 y 126 de la ID. SEC. n° 2 del polipéptido está sustituido por el correspondiente resto 31, 32, 34, 37, 74, 77, 83, 84, 86, 87, 9, 91, 96, 1, 12, 114, 118 o 126 de la ID. SEC. n° 1; o

¡i. al menos uno de los restos 129 y 13 de la ID. SEC. n° 2 del polipéptido está suprimido.

De acuerdo con otra realización, el polipéptido capaz de modular la interacción entre Sirpa humano y CD47 humano es seleccionado del grupo que consiste en:

a) un polipéptido que consiste en una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en las ID. SEC. números 4-7;

b) un polipéptido que consiste en un fragmento, ligante de CD47, de una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en las ID. SEC. números 4-7; y

c) una variante, ligante de CD47, de uno de los polipéptidos de a) y b) con hasta 1 Inserción, supresión o sustitución de aminoácido por cada tramo de 7 aminoácidos del polipéptido.

De acuerdo con otro aspecto, se proporciona una composición farmacéutica para tratar un cáncer hematológico, preferiblemente leucemia, y más preferiblemente leucemia mlelolde aguda (AML) humana, que comprende una cantidad eficaz de un polipéptido descrito en esta memoria y un vehículo farmacéuticamente aceptable.

En aspectos preferibles, el cáncer hematológico comprende... [Seguir leyendo]

1. Un compuesto para uso en un método para tratar células cancerosas que son CD47+, compuesto que comprende un pollpéptldo capaz de unirse al dominio extracelular de CD47 humano para Interrumpir la señalización entre Sirpa humano y CD47 humano, en donde el pollpéptido comprende Sirpa humano soluble o un fragmento del mismo que se une a CD47.

2. Un compuesto para uso según la Reivindicación 1, en donde dichas células están asociadas con un cáncer hematológlco.

3. El compuesto para uso según la Reivindicación 1 o 2, en donde el pollpéptldo comprende el dominio extracelular de Sirpa humano, un fragmento ligante de CD47 del dominio extracelular de Sirpa humano, el dominio IgV de Sirpa humano, el dominio IgV de la variante 1 de Sirpa humano, o el dominio IgV de la variante 2 de Sirpa humano.

4. El compuesto para uso según la Reivindicación 2 o 3, en donde el pollpéptldo está fusionado con una segunda proteína.

5. El compuesto para uso según la Reivindicación 4, en donde la segunda proteína es la porción Fe de una IgG.

6. El compuesto para uso según la Reivindicación 5, en donde la segunda proteína es la porción Fe de una lgG1.

7. El compuesto para uso según la Reivindicación 5, en donde la segunda proteína es la porción Fe de una lgG4.

8. El compuesto para uso según la Reivindicación 4, en donde la proteína de fusión resultante es la ID. SEC. n° 13,

Sirpa humano-Fc, Sirpa humano (dominio extracelular)-Fc, el dominio IgV de Sirpa humano-Fc, el dominio IgV de Sirpa humano (variante 1)-Fc, o el dominio IgV de Sirpa humano (variante 2)-Fc.

9. El compuesto para uso según la Reivindicación 8, en donde la proteína de fusión resultante es el dominio IgV de Sirpa humano-Fc.

1. El compuesto para uso según la Reivindicación 8, en donde la proteína de fusión resultante es el dominio IgV de Sirpa humano (variante 1)-Fc.

11. El compuesto para uso según la Reivindicación 8, en donde la proteína de fusión resultante es el dominio IgV de Sirpa humano (variante 2)-Fc.

12. El compuesto para uso según cualquiera de las Reivindicaciones 1-11, en donde la interrupción da lugar a desrepresión de macrófagos.

13. El compuesto para uso según cualquiera de las Reivindicaciones 1-12, en donde el cánceres una leucemia.

14. El compuesto para uso según la Reivindicación 13, en donde la leucemia es seleccionada de entre leucemia linfocítica aguda, leucemia linfocítica crónica, leucemia mielógena crónica, trastorno/neoplasia mieloproliferativo y síndrome mielodisplásico.

15. El compuesto para uso según la Reivindicación 13, en donde la leucemia es leucemia mieloide aguda humana.

16. El compuesto para uso según cualquiera de las Reivindicaciones 1-12, en donde el cáncer es un linfoma o mieloma seleccionado de entre linfoma de Hodgkin, linfomas no hodgkinianos tanto indolentes como agresivos, linfoma de Burkitt, linfoma folicular (célula pequeña y célula grande), mieloma múltiple (MM), mieloma de células gigantes, mieloma de cadenas pesadas, y mieloma de cadenas ligeras o de Bence-Jones.

17. El compuesto para uso según cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 16, en donde el polipéptido es seleccionado del grupo que consiste en:

a) un polipéptido que consiste en una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en las ID. SEC. números 4-7;

b) un polipéptido que consiste en un fragmento, ligante de CD47, de una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en las ID. SEC. números 4-7; y

c) una variante, ligante de CD47, de uno de los polipéptidos de a) y b) con hasta 1 inserción, supresión o sustitución de aminoácido por cada tramo de 7 aminoácidos del polipéptido.

18. Una composición farmacéutica para uso en el tratamiento de un cáncer con células cancerosas que son CD47+, que comprende una cantidad eficaz de un compuesto como el definido en cualquiera de las Reivindicaciones 1-12 y 17 y un vehículo farmacéuticamente aceptable.

19. La composición farmacéutica para uso según la Reivindicación 18, en donde el cáncer es un cáncer hematológico.

2. La composición farmacéutica para uso según la Reivindicación 19, en donde el cáncer es una leucemia.

21. La composición farmacéutica para uso según la Reivindicación 2, en donde la leucemia es seleccionada de 5 entre leucemia linfocítica aguda, leucemia linfocítica crónica, leucemia mielógena crónica, trastorno/neoplasia

mieloproliferativo y síndrome mielodisplásico.

22. La composición farmacéutica para uso según la Reivindicación 2, en donde la leucemia es leucemia mieloide aguda humana.

23. La composición farmacéutica para uso según la Reivindicación 19, en donde el cáncer es un linfoma o mieloma 1 seleccionado de entre linfoma de Hodgkin, linfomas no hodgkinianos tanto indolentes como agresivos, linfoma de

Burkitt, linfoma folicular (célula pequeña y célula grande), mieloma múltiple (MM), mieloma de células gigantes, mieloma de cadenas pesadas, y mieloma de cadenas ligeras o de Bence-Jones.