Antagonista de TASK110 para utilizar en un método de inhibición del crecimiento de una célula de cáncer pancreático que expresa un polipéptido que tiene por lo menos un 80% de identidad en la secuencia de aminoácidos con:

(a) la secuencia de aminoácidos mostrada en la figura 2 (SEC ID No.2 ); o (b) una secuencia de aminoácidos codificada por una secuencia de nucleótidos que comprende la secuencia de nucleótidos mostrada en la figura 1 (SEC ID No. 1) comprendiendo dicho método poner en contacto dicha célula cancerosa con dicho antagonista de TASK110, donde dicho antagonista de TASK110 es un anticuerpo que se une a dicho polipéptido, un oligonucleótido no codificante o un siARN

CAMPO DE LA INVENCIÓN

La presente invención se refiere a composiciones de materia útiles para el diagnóstico y el tratamiento de tumores en mamíferos y a métodos de utilización de las composiciones de materia para los mismos.

ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN

Los tumores malignos (cánceres) son la segunda causa de muerte en los Estados Unidos, después de las enfermedades del corazón (Boring et al., CA Cancer J Clin., 43:7 [(1993]). El cáncer se caracteriza por el incremento en el número de células anormales, o neoplásicas, derivadas de un tejido normal que proliferan para formar una masa tumoral, la invasión de tejidos adyacentes por estas células tumorales neoplásicas, y la generación de células malignas que finalmente se extienden a través de la sangre o el sistema linfático hasta nódulos linfáticos regionales y hasta puntos distantes a través de un proceso denominado metástasis. En un estado canceroso, una célula prolifera bajo condiciones en las que no crecerían células normales. El cáncer se manifiesta en una gran variedad de formas, caracterizadas por diferentes grados de invasión y agresividad.

En los intentos por descubrir dianas celulares eficaces para el diagnóstico y la terapia contra el cáncer, los investigadores han buscado identificar polipéptidos que se sobreexpresan específicamente en un tipos particular de célula cancerosa en comparación con una o más células no cancerosas normales. La identificación de dichos polipéptidos de células asociadas a tumores ha proporcionado la capacidad de reconocer específicamente células cancerosas para la destrucción a través de terapias basadas en anticuerpos. En este aspecto, cabe indicar que la terapia basada en anticuerpos se ha demostrado muy eficaz en el tratamiento de ciertos cánceres. Por ejemplo, HERCEPTIN® y RITUXAN® (ambas de Genentech Inc, South San Francisco, California) son anticuerpos que se han utilizado satisfactoriamente para tratar el cáncer de mama y el linfoma de no Hodgkin, respectivamente. Más específicamente, HERCEPTIN® es un anticuerpo monoclonal humanizado derivado de ADN recombinante que se une selectivamente al dominio extracelular del protooncogén del receptor 2 del factor de crecimiento epidérmico humano (HER2). Se observa la sobreexpresión de la proteína HER2 en el 25-30% de cánceres de mama primarios. RITUXAN® es un anticuerpo monoclonal murino/humano quimérico modificado genéticamente dirigido contra el antígeno CD20 hallado en la superficie de linfocitos B normales y malignos.

En otros intentos por descubrir dianas celulares eficaces para la terapia contra el cáncer, los investigadores han buscado identificar polipéptidos que son sobreexpresados por un tipo particular de célula cancerosa en relación a la expresión normal de polipéptidos en una o más células no cancerosas normales. Se esperaría que la identificación de antagonistas de dichos polipéptidos sobreexpresados sirvieran como agentes terapéuticos eficaces para el tratamiento de dichos cánceres. Además, la identificación de la sobreexpresión de dichos polipéptidos sería útil para el diagnóstico de cánceres particulares en mamíferos.

Las quinasas que controlan los mecanismos de transducción de señales, el ciclo celular y la muerte celular programada son críticas para la regulación celular. La sobreexpresión o activación de mutaciones de estas quinasas críticas pueden alterar la regulación celular y conducir a la formación de tumores. El veinte por ciento de todos los oncogenes conocidos son proteínas quinasas. La identificación del mecanismo de transducción de señales apropiado y el desarrollo de fármacos para inhibir específicamente estas quinasas oncogénicas ha sido un objetivo principal de la investigación contra el cáncer durante un tiempo. El cribado de alto rendimiento ha conducido a la identificación de moléculas pequeñas con diferentes modos de inhibición, tales como la competición con el sitio de unión a adenosin trifosfato catalítico, la inhibición de la unión a sustrato o la modificación del propio sustrato. Ciertos compuestos son altamente específicos para una única quinasa, mientras que otros pueden inhibir varias quinasas con estructuras de unión similares (Busse et al., Semin Oncol 2001, 28:47-55). Por ejemplo, la tirosina quinasa Bcr-Abl ha sido identificada como factor causante en la leucemia mieloide crónica (CML). La molécula pequeña imatinib mesilato (Novartis Pharmaceuticals Corp, East Hanover, NJ) fue aprobada recientemente para el tratamiento de CML, demostrando que el tratamiento del componente quinasa de un mecanismo de transducción de señales es eficaz en el tratamiento de cáncer. (Griffin J. Semin Oncol 2001, 28:3-8).

El documento US 2002049180 describe la implicación de TASK110 en ciertos tipos de cáncer, pero no menciona el cáncer pancreático. El documento US 5,885,803 describe la implicación especulativa de proteínas DAPK que incluyen DAPK-5 (sinónimo de TASK120), otra quinasa asociada a tumores o polipéptido "TASK", en una serie de cánceres que incluyen cáncer pancreático.

A pesar de los avances identificados anteriormente en la terapia del cáncer de mamífero, existe una gran necesidad para agentes de diagnóstico y terapéuticos adicionales capaces de detectar la presencia de un tumor en un mamífero y para inhibir de manera eficaz el crecimiento de células neoplásicas, respectivamente. Por consiguiente, un objetivo de la presente invención es identificar polipéptidos que se sobreexpresen en ciertas células cancerosas en comparación con células normales u otras células cancerosas diferentes y utilizar estos polipéptidos y sus ácidos nucleicos codificantes para producir composiciones de materia útiles en el tratamiento terapéutico y la detección diagnóstica del cáncer en mamíferos.

DESCRIPCIÓN RESUMIDA DE LA INVENCIÓN

A. Realizaciones

En la presente memoria, los solicitantes describen por primera vez la identificación de varios polipéptidos celulares (y sus ácidos nucleicos codificantes o fragmentos de los mismos) que son expresados en mayor grado por uno o más tipos de células cancerosas en comparación con uno o más tipos de células no cancerosas normales. Dichos polipéptidos se refieren aquí como polipéptidos quinasa asociados a tumor (TUMOR-ASSOCIATED KINASE) (polipéptidos “TASK”) y se espera que sirvan como dianas eficaces para la terapia y el diagnóstico contra el cáncer en mamíferos.

Por consiguiente, en una realización de la presente invención, la presente invención se refiere a una molécula de ácido nucleico aislada que comprende una secuencia de nucleótidos que codifica un polipéptido antigénico diana asociado a tumores o fragmento del mismo (un polipéptido “TASK”).

En ciertos aspectos, la molécula de ácido nucleico aislada comprende una secuencia de nucleótidos que tiene por lo menos aproximadamente un 80% de identidad en la secuencia de ácidos nucleicos, alternativamente por lo menos aproximadamente un 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% ó 99% de identidad de la secuencia de ácidos nucleicos con (a) una molécula de ADN que codifica un polipéptido TASK de longitud completa que tiene una secuencia de aminoácidos tal como se describe aquí o cualquier otro fragmento específicamente definido de una secuencia de aminoácidos de polipéptido TASK de longitud completa tal como se describe aquí, o (b) el complemento de la molécula de ADN de (a).

En otros aspectos, la molécula de ácido nucleico aislada comprende una secuencia de nucleótidos que tiene por lo menos aproximadamente un 80% de identidad en la secuencia de ácidos nucleicos, alternativamente por lo menos aproximadamente un 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% ó 99% de identidad en la secuencia de ácidos nucleicos, con (a) una molécula de ADN que comprende la secuencia codificante de un ADNc del polipéptido TASK de longitud completa tal como se describe aquí o la secuencia codificante de cualquier otro fragmento específicamente definido de la secuencia de aminoácidos del polipéptido TASK de longitud completa tal como se describe aquí o (b) el complemento de la molécula de ADN de (a).

En un aspecto adicional, la presente invención se refiere a una molécula de ácido nucleico aislada que comprende una secuencia de nucleótidos que tiene por lo menos aproximadamente un 80% de identidad en la secuencia de ácidos nucleicos, alternativamente... [Seguir leyendo]

1. Antagonista de TASK110 para utilizar en un método de inhibición del crecimiento de una célula de cáncer pancreático que expresa un polipéptido que tiene por lo menos un 80% de identidad en la secuencia de aminoácidos con:

(a) la secuencia de aminoácidos mostrada en la figura 2 (SEC ID No.2 ); o

(b) una secuencia de aminoácidos codificada por una secuencia de nucleótidos que comprende la secuencia de nucleótidos mostrada en la figura 1 (SEC ID No. 1) comprendiendo dicho método poner en contacto dicha célula cancerosa con dicho antagonista de TASK110, donde dicho antagonista de TASK110 es un anticuerpo que se une a dicho polipéptido, un oligonucleótido no codificante o un siARN.

2. Antagonista de TASK110 para utilizar en un método de tratamiento de un mamífero que tiene un tumor pancreático que comprende células que expresan un polipéptido que tiene por lo menos un 80% de identidad en la secuencia de aminoácidos con:

(a) la secuencia de aminoácidos mostrada en la figura 2 (SEC ID No.2 );

(b) una secuencia de aminoácidos codificada por una secuencia de nucleótidos que comprende la secuencia de nucleótidos mostrada en la figura 1 (SEC ID No. 1); comprendiendo dicho método administrar a dicho mamífero una cantidad terapéuticamente eficaz de dicho antagonista de TASK110, donde dicho antagonista de TASK110 es un anticuerpo que se une a dicho polipéptido, un oligonucleótido no codificante o un siARN.

3. Antagonista según la reivindicación 1 o la reivindicación 2, en el que dicho anticuerpo se conjuga a un agente inhibidor del crecimiento.

4. Antagonista según la reivindicación 1 o la reivindicación 2, en el que dicho anticuerpo se conjuga a un agente citotóxico.

5. Antagonista según la reivindicación 4, en el que dicho agente citotóxico se selecciona del grupo que consiste en toxinas, antibióticos, isótopos radioactivos y enzimas nucleolíticas.

6. Antagonista según la reivindicación 5, en el que el agente citotóxico es una toxina.

7. Antagonista según la reivindicación 6, en el que la toxina se selecciona del grupo que consiste en maitansinoide y caliqueamicina.

8. Antagonista según la reivindicación 6, en el que la toxina es un maitansinoide.

9. Antagonista según la reivindicación 1 o la reivindicación 2, en el que dicha célula cancerosa se expone además a un tratamiento con radiación o un agente quimioterapéutico.

10. Antagonista según la reivindicación 1, en el que dicha célula cancerosa sobreexpresa dicho polipéptido en comparación con una célula normal del mismo origen de tejido.

11. Método de determinación de la presencia de un polipéptido en una muestra sospechosa de contener dicho polipéptido, en el que dicho polipéptido tiene por lo menos un 80% de identidad en la secuencia de aminoácidos con:

(a) la secuencia de aminoácidos mostrada en la figura 2 (SEC ID No.2 ); o

(b) una secuencia de aminoácidos codificada por una secuencia de nucleótidos que comprende la secuencia de nucleótidos mostrada en la figura 1 (SEC ID No. 1); comprendiendo dicho método exponer dicha muestra a un anticuerpo que se une a dicho polipéptido y determinar la unión de dicho anticuerpo a dicho polipéptido en dicha muestra, en el que dicha muestra comprende una célula pancreática sospechosa de expresar dicho polipéptido.

12. Método según la reivindicación 11, en el que dicha célula es una célula cancerosa.

13. Método según la reivindicación 11, en el que dicho anticuerpo está marcado de manera detectable.

14. Método de diagnóstico de la presencia de un tumor pancreático en un mamífero, comprendiendo dicho método detectar el nivel de expresión de un gen que codifica un polipéptido que tiene por lo menos un 80% de identidad en la secuencia de aminoácidos con:

(a) la secuencia de aminoácidos mostrada en la figura 2 (SEC ID No.2 ); o

(b) una secuencia de aminoácidos codificada por una secuencia de nucleótidos que comprende la secuencia de nucleótidos mostrada en la figura 1 (SEC ID No. 1), en una muestra de prueba de células de tejido pancreático obtenidas de dicho mamífero y en una muestra de control de células normales conocidas del mismo origen de tejido, en el que un nivel más elevado de la expresión de un gen que codifica dicho polipéptido en la muestra de prueba, en comparación con la muestra de control, es indicativo de la presencia de tumor en el mamífero del cual se obtuvo la muestra de prueba.

15. Método según la reivindicación 14, en el que la etapa de detectar el nivel de expresión de un gen que codifica dicho polipéptido comprende utilizar un oligonucleótido en una hibridación in situ o análisis RT-PCR.

16. Método de diagnóstico de la presencia de un tumor pancreático en un mamífero, comprendiendo dicho método poner en contacto un anticuerpo que se une a un polipéptido que tiene por lo menos un 80% de identidad en la secuencia de aminoácidos con:

(a) la secuencia de aminoácidos mostrada en la figura 2 (SEC ID No.2 ); o

(b) una secuencia de aminoácidos codificada por una secuencia de nucleótidos que comprende la secuencia de nucleótidos mostrada en la figura 1 (SEC ID No. 1), con una muestra de prueba de células de tejido pancreático obtenidas de dicho mamífero y con una muestra de control de células normales conocidas del mismo origen de tejido; y detectar la formación de un complejo entre dicho anticuerpo y dicho polipéptido en la muestra de prueba y en la muestra de control, en el que la formación de una mayor cantidad de complejo en la muestra de prueba en comparación con la muestra de control es indicativa de la presencia de un tumor en dicho mamífero.

17. Método según la reivindicación 16, que comprende utilizar dicho anticuerpo en un análisis inmunohistoquímico.

18. Método según la reivindicación 16, en el que dicho anticuerpo está marcado de forma detectable.

19. Método según la reivindicación 16, en el que dicha muestra de prueba de células de tejido se obtiene de un individuo sospechoso de tener un tumor canceroso.