CIP-2021 : C12Q 1/6851 : Amplificación cuantitativa.
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Notas[t] desde C01 hasta C14: QUIMICA
C QUIMICA; METALURGIA.
C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.
C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS.
C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones.
C12Q 1/6851 · · · Amplificación cuantitativa.
CIP2021: Invenciones publicadas en esta sección.
Método para analizar ácido nucleico molde, método para analizar sustancia objetivo, kit de análisis para ácido nucleico molde o sustancia objetivo y analizador para ácido nucleico molde o sustancia objetivo.
(29/07/2020) Un método para analizar un ácido nucleico molde, que comprende las etapas de:
fraccionar una muestra que comprende un ácido nucleico molde en una pluralidad de fracciones de ácido nucleico molde;
amplificar una secuencia objetivo y su secuencia complementaria en el ácido nucleico molde con respecto a cada fracción de la pluralidad de fracciones de ácido nucleico molde en presencia de un reactivo de amplificación de ácido nucleico; detectar la generación o interrupción de una señal que muestra una amplificación de la secuencia objetivo o la secuencia complementaria con respecto a cada fracción de la pluralidad de fracciones de ácido nucleico molde después de la etapa de amplificación; y
discriminar una fracción de ácido nucleico molde en la que la generación o interrupción de una señal que muestra la amplificación se ha detectado entre la pluralidad…
Procedimientos y kits para la detección del mildiú pulverulento.
(29/07/2020). Solicitante/s: BAYER S.A.S. Inventor/es: VACHER,SÉBASTIEN, DUBOURNET,PATRICE, CHERRAD,SEMCHEDDINE.
Un cebador oligonucleotídico seleccionado del grupo que consiste en:
(i) oligonucleótidos que tienen la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO: 1;
(ii) oligonucleótidos que tienen una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO: 1;
(iii) oligonucleótidos que tienen una secuencia de nucleótidos de al menos nucleótidos contiguos de los oligonucleótidos SEQ ID NO: 1,2 o sus secuencias de nucleótidos complementarias, con la excepción del oligonucleótido específico que tiene la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO: 2.
PDF original: ES-2821751_T3.pdf
Procedimiento de procesamiento y análisis de datos de expresión génica para identificar genes de referencia endógenos.
(17/06/2020). Solicitante/s: Abion Inc. Inventor/es: SHIN,Young Kee, KOH,Sang-seok, KWON,MI JEONG, OH,EN SEL, IN,YONG-HO.
Un procedimiento para cuantificar el nivel de expresión de un gen diana en una muestra de tejido FFEP (fijado con formalina, embebido en parafina) de tejidos de cáncer de mama humano, que comprende:
1) sintetizar ADNc a partir de ARN de un sujeto;
2) realizar PCR en tiempo real para amplificar el gen diana y el gen de referencia endógeno OAZ1 utilizando un par de cebadores y/o sondas con el ADNc que sirve como molde; y
3) normalizar un nivel de expresión del gen diana al del gen de referencia endógeno de la etapa 2).
PDF original: ES-2814027_T3.pdf
Nuevas composiciones y métodos para mejorar la especificidad de la PCR.
(13/05/2020). Solicitante/s: LIFE TECHNOLOGIES CORPORATION. Inventor/es: DONG,SHOULIAN, LIU,CHUNMEI.
Un cebador oligonucleotidico que comprende una secuencia de etiqueta de Restriccion de amplificacion dirigida a secuencia (STAR) 5' y una secuencia de hibridacion del acido nucleico objetivo, en donde la secuencia de la etiqueta STAR es capaz de formar una estructura de tallo-lazo tras la extension del oligonucleotido a lo largo del acido nucleico objetivo, en donde la secuencia de la etiqueta STAR comprende una secuencia igual a la totalidad o a una parte de una parte de hibridacion del acido nucleico objetivo de un segundo cebador para usarse con el oligonucleotido en una reaccion de amplificacion, o en donde la secuencia de la etiqueta STAR es complementaria a todo o a una parte del sitio de union objetivo de un segundo cebador para usarse con el cebador oligonucleotidico en una reaccion de amplificacion; y
en donde el cebador oligonucleotidico y el segundo cebador son un par de cebadores directo e inverso.
PDF original: ES-2800075_T3.pdf
Método, aparato y producto de programa informático para calibración.
(06/05/2020) Un método para establecer una curva de calibración ajustada para un ensayo cuantitativo realizado utilizando un instrumento local que amplifica un ácido nucleico y monitoriza la síntesis de amplicones a medida que se produce la amplificación, comprendiendo dicho método las etapas de:
(a) obtención de un par de coordenadas para un punto fijo en una curva de calibración específica para el ensayo cuantitativo, en donde la curva de calibración se ha preparado ajustando una ecuación a una recopilación de resultados obtenidos utilizando una pluralidad de instrumentos, distintos del instrumento local, y
en donde el par de coordenadas especifica una cantidad de un polinucleótido analito y un indicio normalizado de valor…
Métodos y dispositivos para compensación de interferencia espectral en la amplificación multiplex de ácidos nucleicos.
(19/02/2020) Método de compensación para interferencia espectral en amplificación multiplex de ácidos nucleicos, que comprende:
un proceso de calibración que comprende:
- realizar al menos una amplificación de ácido nucleico singleplex de una muestra de ácido nucleico usando una sonda de detección, en el que la amplificación de ácido nucleico se produce durante una pluralidad de periodos de interrogación;
- a partir de la amplificación de ácido nucleico, adquirir datos de amplificación que indican una cantidad de ácido nucleico presente para cada uno de la pluralidad de periodos de interrogación; y
- en función de los datos de amplificación, determinar un valor de corrección de la interferencia asociado a un vecino espectral cercano a la sonda de detección para reducir la interferencia espectral del vecino espectral cercano;
comprendiendo…
Procedimientos y dispositivos para determinar una corrección de la interferencia en la amplificación de ácidos nucleicos.
(22/01/2020) Procedimiento de determinación de un valor de corrección de la interferencia en una amplificación multiplex de ácidos nucleicos que comprende:
un proceso de calibración que comprende:
- realizar al menos una serie de amplificación de ácido nucleico singleplex de una muestra de ácido nucleico usando una sonda de detección, en el que la amplificación de ácido nucleico se produce durante una pluralidad de periodos de interrogación;
- a partir de la amplificación de ácido nucleico, adquirir datos de amplificación que indican una cantidad de ácido nucleico presente para cada uno de la pluralidad de periodos de interrogación; y
- en función de los datos de amplificación, determinar un valor de corrección de la interferencia…
Impurezas de ADN en una composición que comprende un virión parvoviral.
(07/08/2019) Método para identificar y cuantificar una impureza de ácido nucleico sobrerrepresentada en una composición que comprende un vector parvoviral y donde el método comprende las etapas de:
a) someter la composición a secuenciación de ácido nucleico para obtener lecturas aleatorias de secuencias de nucleótidos, donde la secuenciación de ácido nucleico comprende la secuenciación de alto rendimiento;
b) comparar las lecturas aleatorias de la etapa a) con una secuencia de nucleótidos de un componente biológico usado en el proceso de producción de la composición por la cual una correspondencia entre una lectura aleatoria y una secuencia de nucleótidos de un componente biológico identifica una impureza…
Captura, detección y cuantificación de ARN pequeño.
(07/08/2019) Un método para detectar un ARN pequeño maduro, comprendiendo el método:
proporcionar una muestra que comprende una molécula de ARN pequeño que comprende aproximadamente 20-30 nucleótidos que se ha procesado a partir de un precursor de ARN más grande (ARN pequeño maduro);
poliadenilar el extremo 3' del ARN pequeño maduro;
realizar la transcripción inversa del ARN pequeño maduro poliadenilado usando un cebador de transcripción inversa universal, de modo que se forma así un ADNc del ARN pequeño maduro, en donde el cebador de transcripción inversa universal comprende una parte de poli(T) y una parte de cola, en donde la parte de cola comprende una parte de cebador universal;
ligar un adaptador de ligadura universal…
Composiciones y procedimientos para cuantificar una secuencia de ácido nucleico en una muestra.
(22/05/2019) Un procedimiento para cuantificar un producto específico en una reacción de amplificación de corte y extensión, comprendiendo el procedimiento:
(a) poner en contacto una molécula de ácido nucleico objetivo en condiciones sustancialmente isotérmicas con una polimerasa deficiente en exonucleasa, dos o más oligonucleótidos cebadores, en el que cada uno de los oligonucleótidos cebadores comprende de 5' a 3':
i. una secuencia de reconocimiento de enzimas de corte;
ii. una secuencia complementaria a la molécula de ácido nucleico objetivo; y
iii. uno o más nucleótidos modificados con 2'-O-metilo colocados en el extremo 3' de la secuencia complementaria a la molécula de ácido nucleico objetivo; y
una enzima de corte que se une…
Prueba genética fetal no invasiva mediante análisis digital.
(08/05/2019) Un método de detección diferencial de secuencias objetivo en una mezcla de material genético materno y fetal, en donde la mezcla de material genético materno y fetal es una mezcla de ADN genómico materno y fetal obtenido a partir de plasma sanguíneo materno, que comprende los pasos de:
a) distribuir el material genético en muestras discretas de tal manera que la medición de una secuencia objetivo pueda cuantificarse como múltiplos binarios o simples;
b) medir la presencia de diferentes secuencias objetivo en muestras discretas usando reactantes específicos de secuencia, en donde una de las diferentes secuencias objetivo está en un cromosoma…
Detección genética fetal no invasiva mediante análisis digital.
(08/05/2019) Un método de detección diferencial de secuencias diana en una mezcla de material genético materno y fetal, en donde la mezcla de material genético materno y fetal es una mezcla de ADN genómico materno y fetal obtenido de plasma sanguíneo materno, que comprende los pasos de:
a) distribuir el material genético en muestras discretas, cada muestra conteniendo de media no más de aproximadamente una secuencia diana por muestra;
b) medir la presencia de diferentes secuencias diana en las muestras discretas, en donde una de las diferentes secuencias diana es diploide en el material genético materno y posiblemente aneuploide en el material genético fetal…
Método de cuantificación para nivel de expresión de ARNm de WT1.
(24/04/2019) Un método para cuantificar el nivel de expresión de ARNm de WT1 humano en una muestra de prueba por medio de PCR-TR de una etapa, el método comprende someter simultáneamente el ARNm de WT1 humano y un ARNm de gen constitutivo a reacciones de transcripción inversa y de extensión llevadas a cabo secuencialmente en la muestra de prueba en el mismo recipiente,
en donde un conjunto de cebadores utilizado para amplificación PCR del gen constitutivo comprende un cebador directo de PCR que consiste en la secuencia de base descrita en el SEQ ID NO: 6 y un cebador inverso de PCR que consiste en la secuencia de base descrita en los SEQ ID NO: 7 o 12;
en donde el gen constitutivo es ARNm de GAPDH; y
en donde un primer conjunto de cebadores utilizado…
Un método de detección de metilación.
(20/03/2019). Solicitante/s: Clinical Genomics Pty Ltd. Inventor/es: MCEVOY,AIDAN, PEDERSEN,SUSANNE, BAKER,ROHAN.
Un método de cribado cuantitativo de la metilación de una región del ADN de interés en una muestra biológica, y dicho método comprende:
(i) poner en contacto ADN de dicha muestra biológica con dos o más endonucleasas de restricción sensibles a la metilación y digerir dicho ADN a 4-6 pg de dicho ADN por unidad de dichas endonucleasas por hora;
(ii) amplificar cuantitativamente la muestra de ADN digerida de la etapa (i) mediante el uso de uno o más cebadores directos y uno o más cebadores inversos, cuyos cebadores se dirigen a las secuencias de ADN que flanquean una o más de las regiones de las secuencias de reconocimiento de endonucleasas de restricción específicas de metilación de las endonucleasas de la etapa (i); y
(iii) cuantificar el nivel de dicha región de ADN metilado de interés, en el que dicha cuantificación no requiere determinar la proporción del ADN amplificado de la etapa (ii) respecto de una muestra sin digerir correspondiente.
PDF original: ES-2720195_T3.pdf
Método para determinar una propiedad de una muestra de partida.
(09/01/2019) Método para determinar la cantidad de un ácido nucleico en una muestra de partida, en la que
- la muestra de partida se amplifica en un sistema en un primer ciclo, y se adquiere una medida de la amplificación como un valor de resultado,
- la amplificación en el sistema en un ciclo respectivo y la adquisición de una medida de la amplificación como un valor de resultado para el ciclo respectivo se repite al menos n veces, y a cada ciclo se le asigna un valor de ciclo para identificación,
- de tal manera que se produzca un conjunto de datos de resultados en el que un valor de resultado se asigna a un valor de ciclo respectivo para una multiplicidad de valores de ciclo,
se produce a partir del conjunto de datos de resultados…
Método para determinar la composición de ácidos nucleicos de una mezcla de ácidos nucleicos.
(15/10/2018) Método para determinar la composición de ácidos nucleicos en una mezcla de ácidos nucleicos totales que comprende un primer ácido nucleico y un segundo ácido nucleico, en el que dicho primer ácido nucleico y dicho segundo ácido nucleico se derivan de fuentes diferentes, comprendiendo dicho método:
1) tratar dicha mezcla de ácidos nucleicos totales con un bisulfito, para convertir citosina no metilada en dicha mezcla de ácidos nucleicos totales en uracilo, y obtener una mezcla de ácidos nucleicos totales convertidos;
2) someter dicha mezcla de ácidos nucleicos totales convertidos a PCR cuantitativa fluorescente multiplexada usando un primer conjunto de cebadores de amplificación y un segundo conjunto de cebadores de amplificación, para capturar y amplificar un fragmento de ácido…