Métodos y dispositivos para compensación de interferencia espectral en la amplificación multiplex de ácidos nucleicos.
Método de compensación para interferencia espectral en amplificación multiplex de ácidos nucleicos,
que comprende:
un proceso de calibración que comprende:
- realizar al menos una amplificación de ácido nucleico singleplex de una muestra de ácido nucleico usando una sonda de detección, en el que la amplificación de ácido nucleico se produce durante una pluralidad de periodos de interrogación;
- a partir de la amplificación de ácido nucleico, adquirir datos de amplificación que indican una cantidad de ácido nucleico presente para cada uno de la pluralidad de periodos de interrogación; y
- en función de los datos de amplificación, determinar un valor de corrección de la interferencia asociado a un vecino espectral cercano a la sonda de detección para reducir la interferencia espectral del vecino espectral cercano;
comprendiendo además el método un análisis de la amplificación de ácido nucleico que incluye aplicar el valor de corrección de la interferencia obtenido del proceso de calibración a los datos de amplificación recogidos de la amplificación multiplex de ácidos nucleicos de muestras de ácido nucleico, en el que el valor de corrección de la interferencia determinado es la proporción de una señal detectada para el vecino espectral cercano con respecto a la señal detectada para los datos de amplificación de la sonda de detección,
en el que el vecino espectral cercano se determina basándose en una distancia desde un pico de fluorescencia del colorante objetivo de la sonda de detección hasta el pico de fluorescencia de un colorante objetivo vecino,
en el que el pico de fluorescencia del colorante objetivo de la sonda de detección y el pico de fluorescencia del colorante objetivo del vecino espectral cercano están separados por una distancia menor que una distancia umbral, y
en el que aplicar el valor de corrección de la interferencia a los datos de amplificación comprende:
- sustraer una señal de fondo de la señal detectada para los datos de amplificación para obtener una señal corregida por el fondo; y
- sustraer, de la señal corregida por el fondo, un producto del valor de corrección de la interferencia y la señal detectada por el vecino espectral cercano.
Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E18169040.
Solicitante: DIASORIN S.P.A.
Nacionalidad solicitante: Italia.
Dirección: Via Crescentino snc 13040 Saluggia (Vercelli) ITALIA.
Inventor/es: LUDOWISE,PETER D.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- C12Q1/6851 QUIMICA; METALURGIA. › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › Amplificación cuantitativa.
- G16B20/00 FISICA. › G16 TECNOLOGÍAS DE LA INFORMACIÓN Y DE LA COMUNICACIÓN [TIC] ESPECIALMENTE ADAPTADAS PARA ÁREAS DE APLICACIÓN ESPECÍFICAS. › G16B BIOINFORMATICA, es decir, TECNOLOGIAS DE LA INFORMACION Y DE LA COMUNICACION [TIC] ESPECIALMENTE ADAPTADAS PARA EL PROCESAMIENTO DE DATOS GENETICOS O DATOS RELACIONADOS CON PROTEINAS EN LA BIOLOGÍA MOLECULAR COMPUTACIONAL. › TIC especialmente adaptadas a la genómica o proteómica funcional, p.ej. asociaciones genotipo o fenotipo.
- G16B25/00 G16B […] › TIC especialmente adaptadas a la hibridación; TIC especialmente adaptadas a la expresión de genes o de proteínas.
PDF original: ES-2791369_T3.pdf
Patentes similares o relacionadas:
Método para analizar ácido nucleico molde, método para analizar sustancia objetivo, kit de análisis para ácido nucleico molde o sustancia objetivo y analizador para ácido nucleico molde o sustancia objetivo, del 29 de Julio de 2020, de Kabushiki Kaisha DNAFORM: Un método para analizar un ácido nucleico molde, que comprende las etapas de: fraccionar una muestra que comprende un ácido nucleico molde […]
Procedimientos y kits para la detección del mildiú pulverulento, del 29 de Julio de 2020, de BAYER S.A.S: Un cebador oligonucleotídico seleccionado del grupo que consiste en: (i) oligonucleótidos que tienen la secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO: 1; […]
Procedimiento de procesamiento y análisis de datos de expresión génica para identificar genes de referencia endógenos, del 17 de Junio de 2020, de Abion Inc: Un procedimiento para cuantificar el nivel de expresión de un gen diana en una muestra de tejido FFEP (fijado con formalina, embebido en parafina) […]
Nuevas composiciones y métodos para mejorar la especificidad de la PCR, del 13 de Mayo de 2020, de LIFE TECHNOLOGIES CORPORATION: Un cebador oligonucleotidico que comprende una secuencia de etiqueta de Restriccion de amplificacion dirigida a secuencia (STAR) 5' y una secuencia de hibridacion […]
Método, aparato y producto de programa informático para calibración, del 6 de Mayo de 2020, de GEN-PROBE INCORPORATED: Un método para establecer una curva de calibración ajustada para un ensayo cuantitativo realizado utilizando un instrumento local que amplifica un ácido […]
Procedimientos y dispositivos para determinar una corrección de la interferencia en la amplificación de ácidos nucleicos, del 22 de Enero de 2020, de DIASORIN S.P.A: Procedimiento de determinación de un valor de corrección de la interferencia en una amplificación multiplex de ácidos nucleicos que comprende: un proceso de […]
Impurezas de ADN en una composición que comprende un virión parvoviral, del 7 de Agosto de 2019, de UniQure IP B.V: Método para identificar y cuantificar una impureza de ácido nucleico sobrerrepresentada en una composición que comprende un vector parvoviral y donde el método comprende […]
Predicción de la respuesta a la quimioterapia mediante el uso de marcadores de expresión génica, del 4 de Marzo de 2020, de GENOMIC HEALTH, INC.: Un procedimiento para predecir la probabilidad de una respuesta beneficiosa a la quimioterapia de un ser humano diagnosticado con cáncer de mama, que comprende (a) […]