Ácido nucleico y proteína correspondiente denominados STEAP-1 útiles en el tratamiento y la detección de cáncer.

Una composición que comprende:

(A) un anticuerpo o fragmento del mismo que se unen específicamente a la proteína STEAP-1 (SEC ID Nº:

3) conjugados con un agente citotóxico para formar un conjugado anticuerpo-agente o fragmento-agente, para su uso en un método de suministro de un agente citotóxico a una célula que expresa la proteína STEAP-1 (SEC ID Nº: 3), o

(B) un anticuerpo o fragmento del mismo que se unen específicamente a la proteína STEAP-1 (SEC ID Nº: 3) conjugados con un agente citotóxico para formar un conjugado anticuerpo-agente o fragmento-agente, para su uso en un método de inhibición del crecimiento de una célula cancerosa que expresa la proteína STEAP-1 (SEC ID Nº: 3),

en la que el agente citotóxico es un inhibidor de canales iónicos o un inhibidor de la comunicación celular.

Ã?cido nucleico y proteína correspondiente denominados STEAP-1 útiles en el tratamiento y la detección de cáncer

Campo de la invención La invención descrita en el presente documento se refiere a composiciones útiles en el control de los cánceres que expresan STEAP-1.

Antecedentes de la invención El cáncer es la segunda causa principal de muerte en seres humanos junto con la enfermedad coronaria. En todo el mundo, millones de personas mueren cada año por cáncer. Sólo en los Estados Unidos, según comunica la Sociedad Americana del Cáncer, el cáncer causa la muerte de más de medio millón de personas cada año, siendo diagnosticados más de 1, 2 millones de nuevos casos cada año. Aunque las muertes por problemas cardíacos han estado disminuyendo considerablemente, las que se producen por cáncer generalmente están aumentando. En la primera parte del próximo siglo, se prevé que el cáncer será la causa principal de muerte.

En todo el mundo, son varios cánceres los que destacan como principalmente mortales. En particular, los carcinomas de pulmón, próstata, mama, colon, páncreas y ovario representan las causas principales de muerte por cáncer. Estos y prácticamente todos los otros carcinomas comparten una propiedad mortal común. Con muy pocas excepciones, la enfermedad metastásica de un carcinoma es mortal. Además, hasta para aquellos pacientes con cáncer que sobreviven al principio a sus cánceres primarios, la experiencia común ha mostrado que sus vidas se alteran drásticamente. Muchos pacientes con cáncer experimentan una gran ansiedad producida por la conciencia del posible fracaso del tratamiento o de la recurrencia. Muchos pacientes con cáncer experimentan debilitaciones físicas después del tratamiento. Además, muchos pacientes con cáncer experimentan una recurrencia.

En todo el mundo, el cáncer de próstata es el cuarto cáncer más frecuente en hombres. En Norteamérica y Europa del Norte, es con mucho el cáncer más común en hombres y es el segundo que acaba en un resultado de muerte por cáncer en hombres. Sólo en los Estados Unidos, más de 30.000 hombres mueren cada año por esta enfermedad-sólo segunda después del cáncer de pulmón. A pesar de la magnitud de estas cifras, no hay todavía ningún tratamiento eficaz contra el cáncer de próstata metastásico. La prostatectomía quirúrgica, la radioterapia, la terapia de ablación hormonal, la castración quirúrgica y la quimioterapia siguen siendo las principales modalidades de tratamiento. Lamentablemente, estos tratamientos son ineficaces para muchos y a menudo están asociados a consecuencias indeseables.

Respecto al enfoque diagnóstico, la carencia de un marcador tumoral de próstata que pueda detectar con exactitud tumores localizados en una etapa inicial comporta una limitación significativa en el diagnóstico y el tratamiento médico de esta enfermedad. Aunque el análisis del antígeno prostático específico (PSA, por sus siglas en inglés “Prostate Specific Antigen”) en suero ha sido una herramienta muy útil, sin embargo, su especificidad y su utilidad general están extensamente consideradas como deficientes en varios aspectos importantes.

El progreso en la identificación de marcadores específicos adicionales para el cáncer de próstata ha mejorado por la generación de xenoinjertos de cáncer de próstata que pueden recapitular las diferentes etapas de la enfermedad en ratones. Los xenoinjertos LAPC (por sus siglas en inglés “Los Angeles Prostate Cancer”, en español “Cáncer de Próstata de Los Angeles”) son xenoinjertos de cáncer de próstata que han sobrevivido la transferencia en ratones con inmunodeficiencia combinada severa (SCID, por sus siglas en inglés “Severe Combined Immune Deficient”) y que han exhibido la capacidad de imitar la transición de la dependencia de andrógenos a la independencia de andrógenos (Klein et al., 1997, Nat. Med. 3: 402) . Los marcadores del cáncer de próstata más recientemente identificados incluyen PCTA-1 (Su et al., 1996, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93: 7252) , el antígeno de membrana específico de próstata (PSM, “Prostate-Specific Membrane”) (Pinto et al., Clin Cancer Res, 2 de septiembre de 1996 (9) :1445-51) , STEAP (Hubert, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 7 de diciembre de 1999; 96 (25) : 14523-8) y el antígeno de células madre de próstata (PSCA, “Prostate Stem Cell Antigen”) (Reiter et al., 1998, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95: 1735) .

Aunque los marcadores antes mencionados, tales como PSA, PSM, PCTA y PSCA, han facilitado los esfuerzos para diagnosticar y tratar el cáncer de próstata, continúa existiendo una necesidad de identificación de otros marcadores y dianas terapéuticas para cánceres de próstata y asociados para mejorar posteriormente el diagnóstico y la terapia.

El carcinoma de células renales (RCC, “Renal Cell Carcinoma”) representa aproximadamente un 3 por ciento de malignidades en adultos. Una vez que los adenomas alcanzan un diámetro de 2 a 3 cm, existe potencial maligno. En adultos, los dos principales tumores renales malignos son el adenocarcinoma de células renales y el carcinoma de células de transición de pelvis renal o del uréter. La incidencia del adenocarcinoma de células renales se estima en más de 29.000 casos en los Estados Unidos, y más de 11.600 pacientes muertos por esta enfermedad en 1998. El carcinoma de células de transición es menos frecuente, con una incidencia de aproximadamente 500 casos por año en los Estados Unidos.

La cirugía ha sido la principal terapia para el adenocarcinoma de células renales durante muchas décadas. Hasta hace poco, la enfermedad metastásica ha sido refractaria a cualquier terapia sistémica. Con los desarrollos recientes en terapias sistémicas, particularmente inmunoterapias, se puede tratar agresivamente el carcinoma de células renales metastásico en los pacientes apropiados con posibilidad de tener respuestas duraderas. Sin embargo, hacen falta terapias eficaces para estos pacientes.

De todos los nuevos casos de cáncer en los Estados Unidos, el cáncer de vejiga representa aproximadamente el 5 por ciento en hombres (el neoplasma en quinto lugar más común) y el 3 por ciento en mujeres (el octavo neoplasma más común) . La incidencia aumenta despacio, simultáneamente con una creciente población más anciana. En 1998, había aproximadamente 54.500 casos, incluyendo 39.500 en hombres y 15.000 en mujeres. La incidencia por edades en los Estados Unidos es del 32 por 100.000 para hombres y 8 por 100.000 en mujeres. La relación histórica masculina/femenina de 3:1 puede disminuirse en relación con modelos fumadores en mujeres. Hubo aproximadamente 11.000 muertes por cáncer de vejiga en 1998 (7.800 en hombres y 3.900 en mujeres) . La incidencia del cáncer de vejiga y la mortalidad aumentan fuertemente con la edad y será un problema creciente según la población se vuelva más anciana.

La mayor parte de los cánceres de vejiga reaparecen en la vejiga. El cáncer de vejiga es tratado con una combinación de resección transuretral de la vejiga (TUR, “Transurethral Resection of the Bladder”) y quimioterapia intravesical o inmunoterapia. La naturaleza multifocal y recurrente del cáncer de vejiga destaca las limitaciones de la TUR. La mayoría de los cánceres invasivos musculares no tienen cura solo por TUR. La cistectomía radical y la diversión urinaria son los medios más eficaces para eliminar el cáncer, pero provocan un impacto innegable sobre la función urinaria y sexual. Continúa habiendo una necesidad significativa de modalidades de tratamiento que sean beneficiosas para pacientes con cáncer de vejiga.

Aproximadamente 130.200 casos de cáncer colorrectal aparecieron en 2000 en los Estados Unidos, incluyendo 93.800 casos de cáncer de colon y 36.400 de cáncer rectal. Los cánceres colorrectales son los terceros cánceres más comunes en hombres y mujeres. Las tasas de incidencia disminuyeron considerablemente durante 1992-1996 (-2, 1% por año) . La investigación sugiere que esta disminución se ha debido a un mayor rastreo y eliminación del pólipo, la progresión de la prevención de pólipos frente a cánceres invasivos. Hubo aproximadamente 56.300 muertes (47.700 de cáncer de colon, 8.600 de cáncer rectal) en 2000, lo que representa aproximadamente el 11% de todas las muertes por cáncer en los estados unidos.

Actualmente, la cirugía es la forma más común de terapia para el cáncer colorrectal, y para los cánceres que no se han extendido, es curativa con frecuencia. Se da quimioterapia, o quimioterapia más radiación, antes o después de la cirugía a la mayor parte de pacientes cuyo cáncer ha perforado profundamente la... [Seguir leyendo]

1. Una composición que comprende:

(A) un anticuerpo o fragmento del mismo que se unen específicamente a la proteína STEAP-1 (SEC ID Nº : 3) conjugados con un agente citotóxico para formar un conjugado anticuerpo-agente o fragmento-agente, para su uso en un método de suministro de un agente citotóxico a una célula que expresa la proteína STEAP-1 (SEC ID Nº : 3) , o

(B) un anticuerpo o fragmento del mismo que se unen específicamente a la proteína STEAP-1 (SEC ID Nº : 3) conjugados con un agente citotóxico para formar un conjugado anticuerpo-agente o fragmento-agente, para su uso en un método de inhibición del crecimiento de una célula cancerosa que expresa la proteína STEAP-1 (SEC ID Nº : 3) , en la que el agente citotóxico es un inhibidor de canales iónicos o un inhibidor de la comunicación celular.

2. La composición para su uso de acuerdo con la reivindicación 1, en la que el inhibidor de canales iónicos se selecciona del grupo que consiste en amlodipina, azuleno, dihidropiridinas, tianinas, nefidipina, verapamil, ácido nordihidroguaiarético (NDGA) , y derivados de los mismos.

3. La composición para su uso de acuerdo con la reivindicación 1, en la que el inhibidor de canales iónicos es un inhibidor del canal de calcio.

4. La composición para su uso de acuerdo con la reivindicación 1, en la que el inhibidor de la comunicación celular se selecciona del grupo que consiste en ácido beta-glicirretínico, retinoides y TPA.

5. La composición para su uso de acuerdo con la parte (B) de la reivindicación 1 en donde el cáncer es metastásico.

6. La composición para su uso de acuerdo con la parte (B) de la reivindicación 1 en donde el cáncer es cáncer de próstata, de vejiga, de riñón, de colon, de pulmón, de páncreas, de ovario, de mama, de estómago o rectal, o linfoma de células B.

7. La composición para su uso de acuerdo con la parte (B) de la reivindicación 1 en donde el cáncer es cáncer de próstata.

Figura 1: secuencia HSS de STEAP-1 de 436 nucleótidos. (SEC ID Nº : 1)

Figura 2: Figura 2A. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 2) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 3) de STEAP-1 v.1. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 66 al 1085 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2B. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 4) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 5) de STEAP-1 v.2. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2C. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 6) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 7) de STEAP-1 v.3. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 944 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2D. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 8) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 9) de STEAP-1 v.4 La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2E. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 10) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 11) de STEAP-1 v.5. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2F. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 12) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 13) de STEAP-1 v.6. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2G. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 14) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 15) de STEAP-1 v.7. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2H. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 16) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 17) de STEAP-1 v.8. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2I. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 18) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 19) de STEAP-1 v.9. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2J. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 20) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 21) de STEAP-1 v.10. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2K. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 22) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 23) de STEAP-1 v.11. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2L. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 24) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 25) de STEAP-1 v.12. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2M. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 26) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 27) STEAP-1 v.13. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2N. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 28) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 29) de STEAP-1 v.14. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2 (O) . Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 30) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 31) de STEAP-1 v.15. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2P. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 32) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 33) de STEAP-1 v.16. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 2Q. Secuencia de ADNc (SEC ID Nº : 34) y de aminoácidos (SEC ID Nº : 35) de STEAP-1 v.17. La metionina inicial está subrayada. El marco de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 96 al 872 incluyendo el codón de terminación.

Figura 3.

Figura 3A. Secuencia de aminoácidos de STEAP-1 v.1 (SEC ID Nº : 36) . La proteína STEAP-1 v.1 tiene 339 aminoácidos.

Figura 3B. Secuencia de aminoácidos de STEAP-1 v.2 (SEC ID Nº : 37) . La proteína STEAP-1 v.2 tiene 258 aminoácidos Figura 3C. Secuencia de aminoácidos de STEAP-1 v.3 (SEC ID Nº : 38) . La proteína STEAP-1 v.3 tiene 282 aminoácidos Figura 3D. Secuencia de aminoácidos de STEAP-1 v.4 (SEC ID Nº : 39) . La proteína STEAP-1 v.4 tiene 258 aminoácidos Figura 4A Homología de STEAP-1 v.1 (SEC ID Nº : 40) con la proteína relacionada con adipocitos inducida por TNFα de ratón (gi|16905133|) (SEC ID Nº : 41)

Puntuación = 224 bits (570) , Esperado .

2. 57 Identidades = 110/270 (40 %) , Positivos = 174/270 (63 %)

Figura 4B Homología de STEAP-1 (SEC ID Nº : 42) con la proteína pHy de de rata (gi|21717655|) (SEC ID Nº : 43)

Puntuación = 283 bits (724) , Esperado .

2. 75 Identidades = 127/259 (49 %) , Positivos = 184/259 (71 %)

Figura 4C Homología de STEAP-1 (SEC ID Nº : 99) con el antígeno epitelial de seis dominios transmembrana de la próstata de ratón (gi|20820492|) . (SEC ID Nº : 100)

Puntuación = 488 bits (1256) , Esperado = e-137 Identidades = 255/303 (84 %) , Positivos = 277/303 (91 %)

Figura 5 Perfil de Hidrofilicidad de la variante 1 de 8P1D4

(Hopp T.P., Woods K.R., 1981. Proc. Natl. Acad. Sci. EEUU 78: 3824-3828)

Figura 5a Perfil de Hidrofilicidad de la variante 3 de 8P1D4

(Hopp T.P., Woods K.R., 1981. Proc. Natl. Acad. Sci. EEUU 78: 3824-3828)

Figura 6 Perfil de Hidropaticidad de la variante 1 de 8P1D4

(Kyte J., Doolittle R.F., 1982. J. Mol. Biol. 157.

10. 132)

Figura 6a Perfil de Hidropaticidad de la variante 3 de 8P1D4

(Kyte J., Doolittle R.F., 1982, J. Mol. Biol. 157.

10. 132)

Figura 7 Perfil del % de restos accesibles

de la variante 1 de 8P1D4

(Janin J., 1979. Nature 277.

49. 492)

Figura 7a Perfil del % de restos accesibles

de la variante 3 de 8P1D4

(Janin J., 1979. Nature 277.

49. 492)

Figura 8 Perfil de flexibilidad promedio

de la variante 1 de 8P1D4 (Bhaskaran R, Ponnuswamy P.K., 1988, Int. J. Pept. Protein Res. 32.

24. 255)

Figura 8a Perfil de flexibilidad promedio

de la variante 3 de 8P1D4 (Bhaskaran R, Ponnuswamy P.K., 1988, Int. J. Pept. Protein Res. 32.

24. 255)

Figura 9 Perfil del giro-beta de la variante 1 de 8P1D4

(Deleage G., Roux B. 1987. Protein Engineering 1.

28. 294)

Figura 9a Perfil del giro-beta de la variante 3 de 8P1D4

(Deleage, G., Roux B. 1987. Protein Engineering 1.

28. 294)