Un procedimiento para diagnosticar cáncer que comprende:

(a) poner en contacto una muestra de prueba de un sujeto humano del que se sospecha que tiene cáncer conuna sonda que puede unirse específicamente a un ARNm de 191P4D12(b) que tiene la secuencia expuestaen SEC ID Nº:

2, en el que la muestra de prueba es de un tejido seleccionado del grupo que consiste enriñón, cuello uterino y ovario;

(b) determinar el nivel de expresión del ARNm de 191P4D12(b) en la muestra de prueba; y

(c) comparar el nivel así determinado con el nivel de expresión del ARNm de 191P4D12(b) en una muestrade tejido normal del mismo tipo de tejido que la muestra de prueba, por lo que la presencia de expresión deARNm de 191P4D12(b) elevada en la muestra de prueba con respecto a la muestra de tejido normal indica lapresencia o estado de un cáncer seleccionado del grupo que consiste en riñón, cuello uterino y ovario.

Ácidos nucleicos y proteínas correspondientes tituladas 191P4D12 (b) útiles en el tratamiento y la detección de cáncer

Campo de la invención

La invención descrita en el presente documento se refiere a genes y a sus proteínas codificadas, llamadas 191P4D12 (b) , expresadas en ciertos cánceres, y a procedimientos de diagnóstico útiles en el tratamiento de cánceres que expresan 191P4D12 (b) .

Antecedentes de la invención

El cáncer es la segunda causa frecuente de muerte humana junto a la enfermedad coronaria. En el mundo, millones de personas mueren de cáncer cada año. En Estados Unidos solo, como se informa por la Sociedad americana del cáncer, el cáncer produce la muerte de más de medio millón de personas anualmente, con más de 1, 2 millones de casos nuevos diagnosticados por año. Aunque las muertes de enfermedad cardíaca han ido disminuyendo significativamente, aquellas resultantes de cáncer generalmente están en aumento. Se predice que a principios del próximo siglo el cáncer sea la causa principal de muerte.

En el mundo, varios cánceres destacan como las causas principales de mortalidad. En particular, los carcinomas de pulmón, próstata, mama, colon, páncreas y ovario representan la causa primaria de muerte por cáncer. Estos y prácticamente todos los otros carcinomas comparten una característica mortal común. Con muy pocas excepciones, la enfermedad metastásica de un carcinoma es mortal. Además, incluso para aquellos pacientes con cáncer que inicialmente sobreviven a sus cánceres primarios, la experiencia común ha mostrado que sus vidas están espectacularmente alteradas. Muchos pacientes con cáncer experimentan fuertes ansiedades accionadas por la conciencia de las posibilidades de reaparición o fracaso del tratamiento. Muchos pacientes con cáncer experimentan debilitaciones físicas tras el tratamiento. Además, muchos pacientes con cáncer experimentan una reaparición.

En el mundo, el cáncer de próstata es el cuarto cáncer más prevalente en el hombre. En América del norte y Europa del norte, es con mucho el cáncer más común en hombres y es la segunda causa principal de muerte por cáncer en el hombre. En Estados Unidos solo, más de 30.000 hombres mueren anualmente de esta enfermedad – en segundo lugar tras el cáncer de pulmón. A pesar de la magnitud de estas cifras, todavía no hay tratamiento eficaz para el cáncer de próstata metastásico. La prostatectomía quirúrgica, radioterapia, terapia de ablación de hormonas, castración quirúrgica y quimioterapia continúan siendo las principales modalidades de tratamiento. Desafortunadamente, estos tratamientos son ineficaces para muchos y frecuentemente están asociados a consecuencias no deseables.

En el frente del diagnóstico, la falta de un marcador de tumor de próstata que pueda detectar con exactitud tumores localizados en el estado temprano sigue siendo una limitación significativa en el diagnóstico y el tratamiento de esta enfermedad. Aunque el ensayo de antígeno prostático específico (PSA) en suero ha sido una herramienta muy útil, sin embargo se considera ampliamente que su especificidad y utilidad general carecen de varios aspectos importantes.

El progreso en identificar marcadores específicos adicionales para cáncer de próstata ha mejorado por la generación de xenoinjertos de cáncer de próstata que pueden recapitular diferentes estados de la enfermedad en ratones. Los xenoinjertos de LAPC (cáncer de próstata de Los Ángeles) son xenoinjertos de cáncer de próstata que han sobrevivido a pase por ratones inmunodeficientes combinados graves (SCID) y han presentado la capacidad de imitar la transición de dependencia de andrógenos a independencia de andrógenos (Klein y col., 1997, Nat. Med. 3:402) . Marcadores de cáncer de próstata más recientemente identificados incluyen PCTA-1 (Su y col., 1996, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93: 7252) , antígeno prostático específico de membrana (PSM) (Pinto y col., Clin Cancer Res 1996 Sep 2 (9) : 1445-51) , STEAP (Hubert y col., Proc Natl Acad Sci USA. 1999 Dec 7; 96 (25) : 14523-8) y antígeno de citoblasto de próstata (PSCA) (Reiter y col., 1998, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95: 1735) .

Aunque los marcadores previamente identificados tales como PSA, PSM, PCTA y PSCA han facilitado esfuerzos para diagnosticar y tratar cáncer de próstata, existe la necesidad de la identificación de marcadores y dianas terapéuticas adicionales para cánceres de próstata y relacionados con el fin de mejorar adicionalmente el diagnóstico y la terapia.

El carcinoma de células renales (CCR) representa aproximadamente el 3 por ciento de los tumores malignos en adultos. Una vez los adenomas alcanzan un diámetro de 2 a 3 cm, existe potencial maligno. En el adulto, los dos tumores renales malignos principales son adenocarcinoma de células renales y carcinoma de células transicionales de la pelvis renal o uréter. La incidencia de adenocarcinoma de células renales se estima en más de 29.000 casos en Estados Unidos, y más de 11.600 pacientes murieron de esta enfermedad en 1998. El carcinoma de células transicionales es menos frecuente, con una incidencia de aproximadamente 500 casos por año en Estados Unidos.

La cirugía ha sido la terapia primaria para adenocarcinoma de células renales durante muchas décadas. Hasta recientemente, la enfermedad metastásica ha sido resistente a cualquier terapia sistémica. Con los recientes desarrollos en terapias sistémicas, particularmente inmunoterapias, el carcinoma de células renales metastásico puede abordarse agresivamente en pacientes apropiados con una posibilidad de respuestas duraderas. Sin embargo, hay una necesidad continua de terapias eficaces para estos pacientes.

De todos los nuevos casos de cáncer en Estados Unidos, el cáncer de vejiga representa aproximadamente el 5 por ciento en hombres (quinta neoplasia más común) y el 3 por ciento en mujeres (octava neoplasia más común) . La incidencia está aumentando lentamente, simultáneamente a una población cada vez más vieja. En 1998 hubo un cálculo aproximado de 54.500 casos, que incluyeron 39.500 en hombres y 15.000 en mujeres. La incidencia ajustada a la edad en Estados Unidos es 32 por cada 100.000 para hombres y ocho por cada 100.000 en mujeres. La relación histórica hombre/mujer de 3:1 puede estar disminuyendo relacionado con los patrones de tabaquismo en las mujeres. Hay un cálculo aproximado de 11.000 muertes de cáncer de vejiga en 1998 (7.800 en hombres y 3.900 en mujeres) . La incidencia y mortalidad del cáncer de vejiga aumentan considerablemente con la edad y serán un problema cada vez mayor a medida que la población se vuelve cada vez más vieja.

La mayoría de los cánceres de vejiga se producen en la vejiga. El cáncer de vejiga se trata con una combinación de resección transuretral (RTU) de la vejiga y quimioterapia intravesical o inmunoterapia. La naturaleza multifocal y recurrente del cáncer de vejiga señala las limitaciones de la RTU. La mayoría de los cánceres invasivos de músculo no son curados por RTU sola. La cistectomía radical y la diversión urinaria son el medio más eficaz para eliminar el cáncer, pero lleva un impacto innegable sobre la función urinaria y sexual. Continúa habiendo una necesidad significativa para las modalidades de tratamiento que son beneficiosas para pacientes con cáncer de vejiga.

Un cálculo estimado de 130.200 casos de cáncer colorrectal se produjeron en el año 2000 en Estados Unidos, que incluyeron 93.800 casos de cáncer de colon y 36.400 de cáncer rectal. Los cánceres colorrectales son el tercer cáncer más común en hombres y mujeres. Las tasas de incidencia disminuyeron significativamente durante 19921996 (-2, 1% por año) . La investigación sugiere que estas diminuciones han sido debidas a un aumento en la detección y extirpación de pólipos, prevención de la evolución de pólipos a cánceres invasivos. Hubo un cálculo estimado de 56.300 muertes (47.700 de cáncer de colon, 8.600 de cáncer rectal) en el año 2000, representando aproximadamente el 11% de todas las muertes por cáncer en EE.UU.

Actualmente, la cirugía es la forma más común de terapia para el cáncer colorrectal, y para cánceres que no se han extendido es frecuentemente curativa. La quimioterapia, o quimioterapia más radiación, se da antes o después de la cirugía a la mayoría de los pacientes cuyo cáncer ha perforado profundamente la pared del intestino o se ha extendido a los ganglios linfáticos. Ocasionalmente se necesita una colostomía permanente (creación de una abertura... [Seguir leyendo]

1. Un procedimiento para diagnosticar cáncer que comprende:

(a) poner en contacto una muestra de prueba de un sujeto humano del que se sospecha que tiene cáncer con una sonda que puede unirse específicamente a un ARNm de 191P4D12 (b) que tiene la secuencia expuesta en SEC ID Nº: 2, en el que la muestra de prueba es de un tejido seleccionado del grupo que consiste en riñón, cuello uterino y ovario;

(b) determinar el nivel de expresión del ARNm de 191P4D12 (b) en la muestra de prueba; y

(c) comparar el nivel así determinado con el nivel de expresión del ARNm de 191P4D12 (b) en una muestra de tejido normal del mismo tipo de tejido que la muestra de prueba, por lo que la presencia de expresión de ARNm de 191P4D12 (b) elevada en la muestra de prueba con respecto a la muestra de tejido normal indica la presencia o estado de un cáncer seleccionado del grupo que consiste en riñón, cuello uterino y ovario.

2. El procedimiento de la reivindicación 1, en el que la sonda está marcada con un marcador detectable.

3. El procedimiento de la reivindicación 2, en el que el marcador detectable es un isótopo radiactivo que está seleccionado del grupo que consiste en 131I, 125I, 90Y, 186Re, 188Re, 153Sm, 212 Bi, 32P y 177Lu.

4. El procedimiento de la reivindicación 1, en el que determinar el nivel de expresión del ARNm en la muestra de prueba comprende

producir ADNc a partir del ARNm por transcripción inversa usando al menos un cebador; amplificar el ADNc obtenido usando polinucleótidos 191P4D12 (b) como cebadores de sentido directo y de sentido contrario, en el que los polinucleótidos 191P4D12 (b) usados como cebadores de sentido directo y de sentido contrario son eficaces para amplificar un ADNc de 191P4D12 (b) ; y detectar la presencia del ADNc de 191P4D12 (b) amplificado.

5. El procedimiento de la reivindicación 1 ó 4, en el que la sonda es un cebador que puede unirse específicamente al ARNm o ADNc.

6. El procedimiento de la reivindicación 1 ó 4, en el que un aumento en la expresión de ARNm de 191P4D12 (b) en la muestra de prueba con respecto a la muestra normal es una indicación de que la muestra muestra crecimiento celular desregulado.

7. Un procedimiento para determinar la susceptibilidad a desarrollar cáncer que comprende:

(a) poner en contacto una muestra de prueba de un sujeto humano con una sonda que puede unirse específicamente a un ARNm de 191P4D12 (b) que tiene la secuencia expuesta en SEC ID Nº: 2, en el que la muestra de prueba es de un tejido seleccionado del grupo que consiste en riñón, cuello uterino y ovario; y

(b) determinar el nivel de expresión del ARNm de 191P4D12 (b) en la muestra de prueba, en el que la presencia de ARNm de 191P4D12 (b) indica la susceptibilidad a cáncer y en el que el nivel de expresión de ARNm de 191P4D12 (b) en la muestra de prueba guarda relación con el grado de susceptibilidad a cáncer del riñón, cuello uterino u ovario.