Polipéptidos de Pseudomonas aeruginosa.
Una composición farmacéutica que comprende un vehículo o diluyente farmacéuticamente aceptable y unpolipéptido aislado seleccionado de:
(a) un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácidos idéntica al menos en un 90 % a lasecuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:4;
(b) un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácidos idéntica al menos en un 95 % a lasecuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:4;
(c) un polipéptido aislado que comprende la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº: 4;
(d) un polipéptido aislado que comprende un fragmento de polipéptido, comprendiendo el fragmento al menos20 aminoácidos contiguos de la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:4;
(e) el polipéptido aislado de (c) del que está eliminada la secuencia de aminoácidos secretora; y
(f) un polipéptido aislado del que está eliminada la secuencia de aminoácidos secretora que comprende unasecuencia de aminoácidos idéntica al menos en un 90 % a la secuencia de aminoácidos de la porción nosubrayada de la secuencia de la Figura 4;
en la que el polipéptido aislado es capaz de producir anticuerpos que se unen específicamente a un polipéptidoconstituido por la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:4 y es capaz de provocar una respuestainmunitaria a Pseudomonas aeruginosa.
Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E06022429.
Solicitante: ID BIOMEDICAL CORPORATION.
Nacionalidad solicitante: Canadá.
Dirección: 525 CARTIER BOULEVARD WEST LAVAL, QC H7V 3S8 CANADA.
Inventor/es: BRODEUR,BERNARD,R, CHARLEBOIS,ISABELLE, HAMEL,JOSEE, MARTIN,DENIS, CHARLAND,NATHALIE, BUSSIERE,DIANE.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- A61K38/00 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA. › A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE. › A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › Preparaciones medicinales que contienen péptidos (péptidos que contienen ciclos beta-lactama A61K 31/00; dipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina 2,5-dionas, A61K 31/00; péptidos basados en la ergolina A61K 31/48; que contienen compuestos macromoleculares que tienen unidades aminoácido repartidas estadísticamente A61K 31/74; preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos A61K 39/00; preparaciones medicinales caracterizadas por los ingredientes no activos, p. ej. péptidos como soportes de fármacos, A61K 47/00).
- A61K39/00 A61K […] › Preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos (materiales para ensayos inmunológicos G01N 33/53).
- A61K39/104 A61K […] › A61K 39/00 Preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos (materiales para ensayos inmunológicos G01N 33/53). › Pseudomonas.
- A61K39/395 A61K 39/00 […] › Anticuerpos (aglutininas A61K 38/36 ); Inmunoglobulinas; Inmunosuero, p. ej. suero antilinfocitario.
- A61K9/127 A61K […] › A61K 9/00 Preparaciones medicinales caracterizadas por un aspecto particular. › Liposomas.
- A61P11/00 A61 […] › A61P ACTIVIDAD TERAPEUTICA ESPECIFICA DE COMPUESTOS QUIMICOS O DE PREPARACIONES MEDICINALES. › Medicamentos para el tratamiento de trastornos del aparato respiratorio.
- A61P31/04 A61P […] › A61P 31/00 Antiinfecciosos, es decir antibióticos, antisépticos, quimioterápicos. › Agentes antibacterianos.
- C07K14/21 QUIMICA; METALURGIA. › C07 QUIMICA ORGANICA. › C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 14/00 Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados. › de Pseudomonadaceae (F).
- C07K19/00 C07K […] › Péptidos híbridos (Inmoglobulinas híbridas compuestas solamente de inmoglobulinas C07K 16/46).
- C12N1/15 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 1/00 Microorganismos, p.ej. protozoos; Composiciones que los contienen (preparaciones de uso médico que contienen material de protozoos, bacterias o virus A61K 35/66, de algas A61K 36/02, de hongos A61K 36/06; preparación de composiciones de uso médico que contienen antígenos o anticuerpos bacterianos, p. ej. vacunas bacterianas, A61K 39/00 ); Procesos de cultivo o conservación de microorganismos, o de composiciones que los contienen; Procesos de preparación o aislamiento de una composición que contiene un microorganismo; Sus medios de cultivo. › modificados por la introducción de material genético extraño.
- C12N1/19 C12N 1/00 […] › modificados por la introducción de material genético extraño.
- C12N1/21 C12N 1/00 […] › modificados por la introducción de material genético extraño.
- C12N15/09 C12N […] › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Tecnología del ADN recombinante.
- C12N15/62 C12N 15/00 […] › Secuencias de ADN que codifican proteínas de fusión.
- C12N5/10 C12N […] › C12N 5/00 Células no diferenciadas humanas, animales o vegetales, p. ej. líneas celulares; Tejidos; Su cultivo o conservación; Medios de cultivo para este fin (reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00). › Células modificadas por introducción de material genético extraño, p. ej. células transformadas por virus.
- C12P21/02 C12 […] › C12P PROCESOS DE FERMENTACION O PROCESOS QUE UTILIZAN ENZIMAS PARA LA SINTESIS DE UN COMPUESTO QUIMICO DADO O DE UNA COMPOSICION DADA, O PARA LA SEPARACION DE ISOMEROS OPTICOS A PARTIR DE UNA MEZCLA RACEMICA. › C12P 21/00 Preparación de péptidos o de proteínas (proteína monocelular C12N 1/00). › que tienen una secuencia conocida de varios aminoácidos, p. ej. glutation.
- G01N33/53 FISICA. › G01 METROLOGIA; ENSAYOS. › G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Ensayos inmunológicos; Ensayos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas; Materiales a este efecto.
- G01N33/569 G01N 33/00 […] › para microorganismos, p. ej. protozoarios, bacterias, virus.
PDF original: ES-2431318_T3.pdf
Fragmento de la descripción:
Polipéptidos de Pseudomonas aeruginosa
CAMPO DE LA INVENCIÓN
La presente invención se refiere a polipéptidos, más particularmente polipéptidos SPA-2 de Pseudomonas aeruginosa que pueden usarse para prevenir, diagnosticar y/o tratar una infección por Pseudomonas aeruginosa.
ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN
La Pseudomonas aeruginosa es un patógeno bacteriano oportunista prevalente en seres humanos y animales. La P. aeruginosa es la bacteria gram negativa más común encontrada en infecciones nosocomiales, especialmente en individuos inmunodeprimidos. Se relaciona frecuentemente con neumonía asociada a ventilador en pacientes entubados. La infección por Pseudomonas es común entre pacientes con fibrosis quística, heridas por quemaduras, transplantes de órganos y drogadicción por vía intravenosa. Los pacientes con fibrosis quística se infectan a menudo de forma crónica por P. aeruginosa, que es responsable del aumento de la enfermedad y de la muerte en esta población particular. La bacteremia por P. aeruginosa es responsable de altas tasas de muerte en unidades de quemados. Las Pseudomonas pueden causar afecciones graves tales como endoftalmitis, endocarditis, meningitis, neumonía y septicemia. La septicemia provocada por P. aeruginosa está asociada con las tasas de muerte más altas de todas las infecciones gram negativas.
Debido a que la P. aeruginosa es resistente de forma natural a muchos antibióticos, existe la necesidad de desarrollar una vacuna que proteja individuos contra la infección por P. aeruginosa. Una infección por P. aeruginosa induce una respuesta inmunitaria contra antígenos encontrados en la superficie de las células bacterianas. No obstante, muchas de estas proteínas de superficie no están aún caracterizadas, ni se ha determinado la respuesta inmunitaria que tiene como consecuencia la protección contra la infección por diferentes cepas.
Para desarrollar una vacuna que proteja individuos de la infección por P. aeruginosa, se han concentrado los esfuerzos principalmente en lipopolisacáridos (LPS) . No obstante, incluso aunque un número limitado de serotipos de LPS están asociados con casos clínicos, la producción de una vacuna basada en LPS polivalente es compleja y puede inducir el reemplazo de serotipos en individuos vacunados. También se evalúan vacunas antiflagelos y antipili, pero la regulación de la expresión de flagelos/pili en diferentes estados de infección por P. aeruginosa puede evitar la protección eficaz. También se están analizado proteínas de membranas exteriores (OMP) . Existe actualmente una preparación de OMP de 4 serotipos diferentes de P. aeruginosa en ensayos clínicos, pero la especificidad de la protección conferida por esta preparación permanece sin evaluar. Una proteína de fusión recombinante en base a las proteínas OprF y OprI de la membrana exterior se considera una vacuna experimental prometedora. No obstante, se ha demostrado que la proteína OprF estaba ausente en algunas cepas clínicas de P. aeruginosa y la protección conferida por la proteína OprI sola no se ha evaluado aún.
Una recapitulación de la tecnología existente se ha descrito por Stanislavsky ES y Lam JS. (1997) FEMS Microbiol. Rev. 21 (3) : 243-77 y Holder IA. (2001) J. Burn Care Rehabil. 22 (5) : 311-20.
La secuencia del genoma de la cepa de P. aeruginosa PAO1 se determinó en una colaboración entre la Cystic Fibrosis Foundation (Fundación de fibrosis quística) , la Universidad de Washington y la Pathogenesis Corporation (Corporación de patogénesis) y está disponible en http://www.pseudomonas.com/, http://www.tigr.org/tigrscripts/CMR2/GenomePage3.spl?database=n tpa03, http://pseudomonas.bit.uq.edu.au/ y en Nature, Stover y col. 406:959-964 (2000) .
Los documentos WO 99/57142, EP0717106, EP0297291 y WO 01/40473 divulgan polipéptidos de P. aeruginosa.
Por lo tanto, existe aún la necesidad no satisfecha de polipéptidos de P. aeruginosa que se puedan usar para prevenir, diagnosticar y/o tratar una infección por P. aeruginosa.
SUMARIO DE LA INVENCIÓN
Según un aspecto, la presente invención se refiere a la reivindicación 1
BREVE DESCRIPCIÓN DE LAS FIGURAS
La figura 1 representa la secuencia de ADN del gen SPA-1 de la cepa de P. aeruginosa PAO1; SEC ID Nº: 1. La porción subrayada de la secuencia representa la región codificante del péptido líder.
La figura 2 representa la secuencia de aminoácidos del polipéptido SPA-1 de la cepa de P. aeruginosa PAO1; SEC ID Nº: 2. La secuencia subrayada representa el péptido líder de 32 restos de aminoácidos.
La figura 3 representa la secuencia de ADN del gen SPA-2 de la cepa de P. aeruginosa PAO1; SEC ID Nº: 3. La porción subrayada de la secuencia representa la región codificante del péptido líder.
La figura 4 representa la secuencia de aminoácidos del polipéptido SPA-2 de la cepa de P. aeruginosa PAO1; SEC ID Nº: 4. La secuencia subrayada representa el péptido líder de 19 restos de aminoácidos.
La figura 5 representa la secuencia de ADN del gen SPA-3 de la cepa de P. aeruginosa PAO1; SEC ID Nº: 5. La porción subrayada de la secuencia representa la región codificante del péptido líder.
La figura 6 representa la secuencia de aminoácidos del polipéptido SPA-3 de la cepa de P. aeruginosa PAO1; SEC ID Nº: 6. La secuencia subrayada representa el péptido líder de 21 restos de aminoácidos.
La figura 7 representa la secuencia de ADN del gen SHB-PA104 de la cepa de P. aeruginosa PAO1; SEC ID Nº: 19. La porción subrayada de la secuencia representa la región codificante del péptido líder.
La figura 8 representa la secuencia de aminoácidos de la proteína SHB-PA104 de la cepa de P. aeruginosa PAO1. SEC ID Nº: 20. La secuencia subrayada representa el péptido líder de 16 restos de aminoácidos.
La figura 9 representa la secuencia de ADN del gen SHB-PA105 de la cepa de P. aeruginosa PAO1; SEC ID Nº: 21. La porción subrayada de la secuencia representa la región codificante del péptido líder.
La figura 10 representa la secuencia de aminoácidos de la proteína SHB-PA105 de la cepa de P. aeruginosa PAO1; SEC ID Nº: 22. La secuencia subrayada representa el péptido líder de 33 restos de aminoácidos.
La figura 11 representa la secuencia de ADN del gen SHB-PA106 de la cepa de P. aeruginosa PAO1; SEC ID Nº:
23. La porción subrayada de la secuencia representa la región codificante del péptido líder.
La figura 12 representa la secuencia de aminoácidos de la proteína SHB-PA106 de la cepa de P. aeruginosa PAO1; SEC ID Nº: 24. La secuencia subrayada representa el péptido líder de 16 restos de aminoácidos.
La figura 13 representa el alineamiento de secuencia de proteína de la proteína SPA-1 con SHB-PA104 (sin péptidos líder) de la cepa PAO1. |, aminoácidos idénticos; :, aminoácidos conservados.
La figura 14 representa el alineamiento de secuencia de proteína de la proteína SPA-1 con SHB-PA105 (sin péptidos líder) de la cepa PAO1. |, aminoácidos idénticos; :, aminoácidos conservados.
La figura 15 representa el alineamiento de secuencia de proteína de la proteína SPA-1 con SHB-PA106 (sin péptidos líder) de la cepa PAO1. |, aminoácidos idénticos; :, aminoácidos conservados.
DESCRIPCIÓN DETALLADA DE LA INVENCIÓN
La presente invención proporciona polinucleótidos purificados y aislados que codifican polipéptidos de Pseudomonas que pueden usarse para prevenir, diagnosticar y/o tratar una infección por Pseudomonas.
Según un aspecto, la presente invención proporciona un polinucleótido aislado que codifica un polipéptido que tiene una identidad de al menos el 90 % con un segundo polipéptido que comprende una secuencia seleccionada de la SEC ID Nº: 4 o fragmentos o análogos del mismo.
Según un aspecto, la presente invención proporciona un polinucleótido aislado que codifica un polipéptido que tiene una identidad de al menos el 95 % con un segundo polipéptido que comprende una secuencia seleccionada de la SEC ID Nº: 4 o fragmentos o análogos del mismo.
Según un aspecto, la presente invención proporciona un polinucleótido aislado que codifica un polipéptido que tiene una identidad de al menos el 98 % con un segundo polipéptido que comprende una secuencia seleccionada de la SEC ID Nº: 4 o fragmentos o análogos del mismo.
Según un aspecto, la presente invención proporciona un polinucleótido aislado que codifica un polipéptido que tiene una identidad de al menos el 90 % con un segundo polipéptido que comprende la SEC ID Nº: 4.
Según un aspecto, la presente invención proporciona un polinucleótido aislado que codifica un polipéptido que tiene... [Seguir leyendo]
Reivindicaciones:
1. Una composición farmacéutica que comprende un vehículo o diluyente farmacéuticamente aceptable y un polipéptido aislado seleccionado de:
(a) un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácidos idéntica al menos en un 90 % a la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:4;
(b) un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácidos idéntica al menos en un 95 % a la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:4;
(c) un polipéptido aislado que comprende la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº: 4;
(d) un polipéptido aislado que comprende un fragmento de polipéptido, comprendiendo el fragmento al menos 20 aminoácidos contiguos de la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:4;
(e) el polipéptido aislado de (c) del que está eliminada la secuencia de aminoácidos secretora; y
(f) un polipéptido aislado del que está eliminada la secuencia de aminoácidos secretora que comprende una secuencia de aminoácidos idéntica al menos en un 90 % a la secuencia de aminoácidos de la porción no subrayada de la secuencia de la Figura 4;
en la que el polipéptido aislado es capaz de producir anticuerpos que se unen específicamente a un polipéptido constituido por la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:4 y es capaz de provocar una respuesta inmunitaria a Pseudomonas aeruginosa.
2. La composición farmacéutica según la reivindicación 1, en la que el polipéptido aislado está conjugado con, o acoplado a, una proteína portadora.
3. La composición farmacéutica según la reivindicación 1 o la reivindicación 2 que además comprende un coadyuvante farmacéuticamente aceptable.
4. La composición farmacéutica según la reivindicación 1 o la reivindicación 2 en la que el polipéptido aislado está asociado con un liposoma.
5. La composición farmacéutica según la reivindicación 1 o la reivindicación 2 en la que el polipéptido aislado está producido recombinantemente mediante un procedimiento que comprende cultivar una célula huésped transfectada con un vector que comprende un polinucleótido que codifica el polipéptido aislado, estando el polipéptido unido operativamente a una región de control de la expresión.
6. La composición farmacéutica según la reivindicación 1, en la que el polipéptido aislado de (a) , (b) , (c) , (d) , (e) o (f) está unido a uno o más polipéptidos antigénicos adicionales formando un polipéptido quimérico que comprende dos o más polipéptidos antigénicos que tienen una secuencia seleccionada de las SEC ID Nº: 2, 4, 6, 8, 10 o 12 o fragmentos de los mismos, comprendiendo cada uno de los dos o más fragmentos de polipéptidos antigénicos al menos 20 aminoácidos contiguos de la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:2, 4, 6, 8, 10 o 12.
7. La composición farmacéutica de la reivindicación 6 que comprende un vehículo, diluyente, coadyuvante o liposoma farmacéuticamente aceptable.
8. Kit para la detección o diagnosis de una infección por Pseudomonas aeruginosa, comprendiendo dicho kit:
(a) el polipéptido quimérico según la reivindicación 6;
(b) un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácidos idéntica al menos en un 90 % a la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:4;
(c) un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácidos idéntica al menos en un 95 % a la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:4;
(d) un polipéptido aislado que comprende la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:4
(e) un polipéptido aislado que comprende un fragmento de polipéptido, comprendiendo el fragmento al menos 20 aminoácidos contiguos de la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:4; y
(g) el polipéptido aislado de (b) , (c) o (d) , del que se ha eliminado el péptido de señalización,
en el que el polipéptido aislado es capaz de producir anticuerpos que se unen específicamente a un polipéptido constituido por la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:4.
9. La composición farmacéutica según una cualquiera de las reivindicaciones 1-7 para usar en el tratamiento
profiláctico o terapéutico de una infección por Pseudomonas aeruginosa.
10. Uso de la composición farmacéutica según una cualquiera de las reivindicaciones 1-7 para la fabricación de una vacuna para el tratamiento profiláctico o terapéutico de una infección por Pseudomonas aeruginosa.
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