REACCIONES ALDOLICAS ENANTIO- Y DIASTEREOSELECTIVAS CATALIZADAS POR ANTICUERPOS.
Un hapteno representado por la siguiente estructura:
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US00/27777.
Solicitante: THE SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE.
Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.
Dirección: 10550 NORTH TORREY PINES ROAD,LA JOLLA, CA 92037.
Inventor/es: BARBAS, CARLOS, F., LERNER, RICHARD, A., ZHONG,GUOFU.
Fecha de Publicación: .
Fecha Concesión Europea: 9 de Junio de 2010.
Clasificación Internacional de Patentes:
- C07D277/24 QUIMICA; METALURGIA. › C07 QUIMICA ORGANICA. › C07D COMPUESTOS HETEROCICLICOS (Compuestos macromoleculares C08). › C07D 277/00 Compuestos heterocíclicos que contienen ciclos de tiazol-1,3 o tiazol-1,3 hidrogenado. › Radicales sustituidos por átomos de oxígeno.
- C07D277/34 C07D 277/00 […] › Atomos de oxígeno.
- C07D277/36 C07D 277/00 […] › Atomos de azufre.
- C07D417/06 C07D […] › C07D 417/00 Compuestos heterocíclicos que contienen dos o más heterociclos, teniendo al menos un ciclo átomos de nitrógeno y azufre como únicos heteroátomos del ciclo, no previstos por el C07D 415/00. › unidos por una cadena de carbono que contiene solamente átomos de carbono alifáticos.
- C07D493/04 C07D […] › C07D 493/00 Compuestos heterocíclicos que contienen átomos de oxígeno como únicos heteroátomos del ciclo en el sistema condensado. › Sistemas orto-condensados.
- C12N9/00B
- C12P17/16 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12P PROCESOS DE FERMENTACION O PROCESOS QUE UTILIZAN ENZIMAS PARA LA SINTESIS DE UN COMPUESTO QUIMICO DADO O DE UNA COMPOSICION DADA, O PARA LA SEPARACION DE ISOMEROS OPTICOS A PARTIR DE UNA MEZCLA RACEMICA. › C12P 17/00 Preparación de compuestos heterocíclicos que contienen O, N, S, Se o Te como únicos heteroátomos del ciclo (C12P 13/04 - C12P 13/24 tienen prioridad). › que contienen varios heterociclos.
- C12P17/18 C12P 17/00 […] › que contienen varios heterociclos condensados entre ellos o condensados con un sistema carbocíclico común, p. ej. rifamicina.
- C12P41/00B
- C12P7/26 C12P […] › C12P 7/00 Preparación de compuestos orgánicos que contienen oxígeno. › Cetonas.
Clasificación PCT:
- A61K31/427 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA. › A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE. › A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › A61K 31/00 Preparaciones medicinales que contienen ingredientes orgánicos activos. › no condensados y conteniendo otros heterociclos.
- A61P35/00 A61 […] › A61P ACTIVIDAD TERAPEUTICA ESPECIFICA DE COMPUESTOS QUIMICOS O DE PREPARACIONES MEDICINALES. › Agentes antineoplásicos.
- C07D277/24 C07D 277/00 […] › Radicales sustituidos por átomos de oxígeno.
- C07D277/34 C07D 277/00 […] › Atomos de oxígeno.
- C07D277/36 C07D 277/00 […] › Atomos de azufre.
- C07D417/06 C07D 417/00 […] › unidos por una cadena de carbono que contiene solamente átomos de carbono alifáticos.
- C07D493/04 C07D 493/00 […] › Sistemas orto-condensados.
- C07K16/44 C07 […] › C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02; proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › C07K 16/00 Inmunoglobulinas, p. ej. anticuerpos mono o policlonales. › contra material no previsto.
- C12N9/00 C12 […] › C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › Enzimas, p. ej. ligasas (6.); Proenzimas; Composiciones que las contienen (preparaciones para la limpieza de los dientes que contienen enzimas A61K 8/66, A61Q 11/00; preparaciones de uso médico que contienen enzimas A61K 38/43; composiciones detergentes que contienen enzimas C11D ); Procesos para preparar, activar, inhibir, separar o purificar enzimas.
- C12P17/16 C12P 17/00 […] › que contienen varios heterociclos.
- C12P17/18 C12P 17/00 […] › que contienen varios heterociclos condensados entre ellos o condensados con un sistema carbocíclico común, p. ej. rifamicina.
- C12P41/00 C12P […] › Procesos que utilizan enzimas o microorganismos para la separación de isómeros ópticos a partir de una mezcla racémica.
Clasificación antigua:
- C07K14/00 C07K […] › Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados.
- C07K69/66
Fragmento de la descripción:
Reacciones aldólicas enantio- y diastereoselectivas catalizadas por anticuerpos.
Campo de la invención
La invención se refiere a reacciones aldólicas catalizadas por anticuerpos. Más particularmente la invención se refiere a reacciones aldólicas enantio- y diastereoselectivas y a anticuerpos que catalizan estas reacciones.
Declaración de derechos gubernamentales
Esta invención se realizó con el apoyo del gobierno con la subvención del Instituto Nacional del Cáncer Nº CA 27489. El gobierno de Estados Unidos tiene ciertos derechos sobre la invención.
Antecedentes
La reacción aldólica es una reacción formadora de enlaces C-C que es clave para la práctica de la química orgánica sintética. Para las revisiones de las reacciones aldólicas, véase: a) S. Masamune, et al., Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1985, 24,1-30; b) C.H. Heathcock, Aldrichim. Acta 1990, 23, 99-111; c) D.A. Evans, Science 1988, 140, 420-426; d) C.H. Heathcock, et al., en Comprehensive Organic Synthesis, Vol. 2 (Eds. B.M. Trost, I. Fleming, C.H. Heathcock), Pergamon, Oxford, 1991, pág. 133-319; e) C.J. Cowden, et al., Org. React. 1997, 51, 1; f) A.S. Franklin, et al., Contemp. Org. Synth. 1994, 1, 317. Como resultado de su utilidad, se ha aplicado un esfuerzo intensivo para el desarrollo de variantes enantioselectivas catalíticas de esta reacción. Las reacciones aldólicas enantioselectivas catalíticas se consiguen típicamente con enolatos preformados y catálisis metálica de transición quiral (S.G. Nelson, Tetrahedron: Asymmetric 1998, 9, 357-389; A. Yanagisawa, et al., J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 9319-9320; E.M. Carreira, et al., J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 3649-3650; D.A. Evans, et al., J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 10859-10860; y D.J. Ager, et al., Asymmetric Synthetic Methodology (CRC Press, Inc.: Florida. 1996). Como alternativa, las reacciones aldólicas enantioselectivas catalíticas pueden conseguirse con catalizadores de enzimas aldolasas naturales (C.-H. Wong, et al., Enzymes en Synthetic Organic Chemistry (Pergamon, Oxford, 1994); C.-H. Wong, et al., Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1995, 34, 412-432; y W.-D. Fessner, Current Opinion en Chemical Biology 1998, 2, 85-89). Con las reacciones aldólicas catalizadas por metales de transición, la enantioselectividad se invierte fácilmente mediante el intercambio del ligando quiral que dirige el curso estereoquímico de la reacción. Con enzimas, sin embargo, no está disponible un procedimiento de estudio general para la inversión de la enantiose- lectividad.
Para dirigir el problema de la generación de novo de enzimas aldolasa, se desarrolló una estrategia de inmunización reactiva usando haptenos ß-dicetona para programar un mecanismo químico análogo al usado por las enzimas aldolasas de Clase I naturales en anticuerpos. La química de esta clase de enzimas está basada en un único resto de lisina químicamente reactivo que es esencial para el mecanismo covalente de estos catalizadores. La Figura 1 ilustra un hapteno de la técnica previa, es decir, el compuesto 1, que tiene una funcionalidad de ß-dicetona empleable como inmunogen activo capaz de atrapar un resto de lisina químicamente reactivo en el sitio activo del anticuerpo. El atrapamiento covalente se facilitó por enlazamiento de hidrógenos intramoleculares que actúan para estabilizar una enaminona en el sitio activo del anticuerpo. El mecanismo químico que conduce a la enaminona estabilizada debería corresponder a aquel de las aldeolasas de Clase I sobre esta porción del coordinado de la reacción. Dada la simetría mecánica alrededor del estado de transición de formación de enlaces C-C, este enfoque permitió la programación de este mecanismo de reacción multietapa en anticuerpos (C.F. Barbas III, et al., Science 1997, 278, 2085-2092). Los catalizadores de anticuerpos eficaces resultantes, ab38C2 (reactivo de Aldrich) y ab33F12 han mostrado que catalizan una amplia serie de reacciones enantioselectivas aldólicas y retroaldólicas (R. Björnestedt, et al., J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11720-11724; G. Zhong, et al., J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 8131-8132; T. Hoffmann, et al., J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 2768-2779; y S.C. Sinha, et al., J. Am. Chem. Soc. 1999, presentados). Para una estrategia alternativa de anticuerpos de aldolasa véase J.L Reymond, Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1995, 34, 2285-2287 o J.L. Reymond, et al., J. Org. Chem. 1995, 60, 6979.
Lo que se necesita es un método para aumentar el repertorio de catalizadores para esta reacción. En particular, se necesitan los anticuerpos con reactividad antipodal. Lo que se necesita es un nuevo concepto de diseño de hapteno para proporcionar una programación de reacción eficaz.
Sumario
En el presente documento se describe que una limitación del diseño de haptenos 1 de la técnica previa es que no dirige la geometría tetraédrica del estado de transición determinante de la tasa de la etapa de formación de enlaces C-C (J. Wagner, et al., Science 1995, 270, 1797-1880). Para el análisis de la geometría del estado de transición de la reacción aldólica, véase a) H.E. Zimmerman, et al., J. Am. Chem. Soc. 1957, 79, 1920; b) S.E. Dinamarca, et al., J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 2177-2194 y las referencias en este; c) C. Gennari, et al., Tetrahedron 1992, 48, 4439-4458.
En la Figura 1 se ilustra un nuevo hapteno de sulfona ß-dicetona, es decir, el compuesto 2, que supera esta limitación al contener características estructurales comunes al enfoque análogo del estado de transición que han sido exitosas para tantas reacciones (P.G. Schultz y R.A. Lerner, Science 1995, 269, 1835-1842; y N.R. Thomas, Nat. Prod. Rep. 1996, 13, 479-511). El hapteno 2 de sulfona ß-dicetona también incluye la funcionalidad ß-dicetona, que es clave en la estrategia de inmunización reactiva. La geometría tetraédrica del resto de sulfona en el hapteno 2 imita al estado de transición tetraédrico de la etapa de formación de enlaces C-C y por lo tanto facilita el ataque nucleófilo del intermedio enantiómero del aldehído aceptor (Figura 2).
En el presente documento se describe que la combinación del diseño de la inmunización reactiva y la analogía del estado de transición en un único hapteno da como resultado un aumento con respecto a tanto el rendimiento de los catalizadores del sistema inmune así como a su eficacia como catalizadores. Esta estrategia dio como resultado la caracterización de los catalizadores de anticuerpo más competentes preparados hasta la fecha. Los anticuerpos 93F3 y 84G3 catalizan una amplia serie de reacciones aldólicas con ee en la mayoría de casos estudiados excediendo el 95%. Con acetona como el sustrato donador de aldol un nuevo centro estereogénico se forma por ataque en la otra cara del aldehído, lo que proporciona el complemento antipodal de ab38C2 en las reacciones aldólicas. A través de las reacciones aldólicas y retroaldólicas se puede acceder a ambos enantíomeros del aldol. Se muestra que estos catalizadores proporcionan acceso a una amplia variedad de sintones con aplicación a síntesis de productos naturales.
Un aspecto de la invención se dirige a un hapteno que combina una estructura que imita un estado de transición de una reacción aldólica como se encuentra en las aldolasas de Clase I junto con una estructura empleable en una inmunización reactiva. El hapteno se presenta con la siguiente estructura:
En la estructura anterior, n es 3.
Otro aspecto de la invención se dirige a moléculas de anticuerpo o moléculas que contienen porciones de sitio de combinación de anticuerpos que catalizan una reacción de adición aldólica. Las moléculas de anticuerpo o las moléculas que contienen porciones de sitios de combinación de anticuerpos se producen por hibridoma 93F3, teniendo un número de acceso ATCC PTA-823; hibridoma 84G3, teniendo un número de acceso ATCC PTA-824 o hibridoma 85H6, teniendo un número de acceso ATCC PTA-825.
Otro aspecto de la invención está dirigido a una célula productora de anticuerpos que segrega moléculas de anticuerpo o moléculas que contienen porciones de sitio de combinación de anticuerpos que catalizan una reacción de adición aldólica. La célula productora de anticuerpos es el hibridoma 93F3, teniendo un número de acceso ATCC PTA-823; el hibridoma 84G3, teniendo un número de acceso ATCC PTA-824 o el hibridoma 85H6, teniendo...
Reivindicaciones:
1. Un hapteno representado por la siguiente estructura:
2. Un hapteno de acuerdo con la reivindicación 1 que imita el estado de transición de una reacción aldólica como se encuentra en las aldolasas de Clase I.
3. Moléculas de anticuerpo o moléculas que contienen porciones de sitio de combinación de anticuerpos producidas por el hibridoma 93F3, que tiene un número de acceso ATTC PTA-823.
4. Moléculas de anticuerpo o moléculas que contienen porciones de sitio de combinación de anticuerpos producidas por el hibridoma 84G3, que tiene un número de acceso ATTC PTA-824.
5. Moléculas de anticuerpo o moléculas que contienen porciones de sitio de combinación de anticuerpos producidas por el hibridoma 85H6, que tiene un número de acceso ATTC PTA-825.
6. Un hibridoma que tiene un número de acceso ATTC PTA-823 que es capaz de expresar el anticuerpo 93F3.
7. Un hibridoma que tiene un número de acceso ATTC PTA-824 que es capaz de expresar el anticuerpo 84G3.
8. Un hibridoma que tiene un número de acceso ATTC PTA-825 que es capaz de expresar el anticuerpo 85H6.
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