(11/12/2019) Un método para determinar el riesgo de recurrencia bajo o alto (ROR) en un sujeto que tiene cáncer de mama que comprende: determinar el tamaño del tumor de cáncer de mama del sujeto; determinar un valor de correlación de un tumor de cáncer de mama para cada uno de al menos cuatro subtipos intrínsecos, que incluyen un tipo Basal, Luminal A, Luminal B o HER-2 enriquecido, midiendo la expresión de ARN de al menos 40 de los genes en la lista de genes intrínsecos NANO46 de la Tabla 1; determinar una puntuación de proliferación midiendo la expresión de ARN de cada uno de los subconjuntos de 18 genes de los genes intrínsecos NANO46 seleccionados de ANLN, CCNE1, CDC20, CDC6, CDCA1, CENPF, CEP55, EXO1, KIF2C, KNTC2, MELK, MKI67, ORC6L, PTTG1, RRM2, TYMS, UBE2C y UBE2T; calcular…

(11/12/2019) Un compuesto representado por la fórmula (I) **(Ver fórmula)** en donde R1 es COOH o COO-; X es un anión orgánico o inorgánico que lleva una o más cargas negativas; Y e Y' son H, o un alquilo; R2 es NH2, NHBoc o H; y Z es S o Se R comprende un grupo que comprende un enlace insaturado en posición β al centro de sulfonio, que es un doble enlace carbonocarbono, doble enlace carbono-oxígeno, doble enlace carbono-azufre, doble enlace carbono-nitrógeno, triple enlace carbono-carbono, triple enlace carbono-nitrógeno, un sistema carbocíclico o heterocíclico aromático, unido a un grupo que comprende al menos un miembro seleccionado de fluoróforos, extintores de fluorescencia, etiquetas…

(04/12/2019) Un oligonucleótido antisentido (ASO) adecuado para uso en un método para inhibir, de manera específica de un gen, en una célula eucariota, la degradación con mediación sin sentido (NMD) de un ARNm, en el que: (a) dicho ARNm está codificado por un ácido nucleico que contiene un codón de terminación prematura (PTC) que causa una enfermedad o un PTC de origen natural; (b) el ASO se hibrida con una región del ARNm que está de alrededor de 1 a alrededor de 50 nucleótidos en dirección 5' de una unión exón-exón que (i) se encuentra en dirección 3' del PTC, y (ii) cuando se marca por el depósito de complejos de la unión de exones (EJC), marca el ARNm para la NMD; y (c) el ASO inhibe…

(04/12/2019) Un método para detectar o cuantificar ácidos nucleicos del virus de la inmunodeficiencia humana-2 (VIH-2) en una muestra biológica, que comprende: a) realizar una reacción en cadena con polimerasa (PCR) a tiempo real o una reacción en cadena con polimerasa y transcriptasa inversa (RT-PCR) a tiempo real sobre los ácidos nucleicos de la muestra biológica con: (i) al menos 4 cebadores que comprenden o que consisten, respectivamente, en: - la secuencia SEQ ID NO:1 o una secuencia que tiene al menos 90% de identidad con SEQ ID NO:1, y - la secuencia SEQ ID NO:2 o una secuencia que tiene al menos 90% de identidad con SEQ ID NO:2, y - la secuencia SEQ ID NO:4 o una secuencia que tiene al menos…

(27/11/2019) Un método para la detección de la presencia o ausencia de al menos una secuencia de ácidos nucleicos específica para el sexo del pollo en una muestra biológica usando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), en donde el método comprende las siguientes etapas de: (a) proporcionar una secuencia de ácidos nucleicos de la muestra biológica, (b) amplificar y detectar al menos una secuencia diana específica para el sexo del pollo usando PCR, en donde se usa un cebador directo y un cebador inverso, el cebador directo y el cebador inverso comprenden cada uno de ellos un oligonucleótido de entre 10 y 30 nucleótidos de longitud y de al menos 10 nucleótidos contiguos de una secuencia de nucleótidos localizada en el intervalo del nucleótido 46 al 446 de SEQ ID NO: 1, en donde el cebador directo se selecciona…

(27/11/2019) Un virus vaccinia modificado de Ankara (MVA) recombinante que comprende: (a) al menos una secuencia de nucleótidos que codifica un determinante antigénico de una glucoproteína de membrana del virus respiratorio sincicial (VRS), en donde la secuencia de nucleótidos codifica una glucoproteína de membrana F del VRS de longitud completa; y (b) al menos una secuencia de nucleótidos que codifica determinantes antigénicos de la nucleocápside del VRS, en donde la secuencia de nucleótidos codifica tanto una proteína de la nucleocápside N del VRS de longitud completa como una proteína de la matriz M2 del VRS de longitud completa, que son codificadas por un único marco de lectura abierto,…

(13/11/2019) Un método para predecir una respuesta de un paciente con cáncer a un régimen de tratamiento contra el cáncer que comprende un agente que daña el ADN, una antraciclina, un inhibidor de topoisomerasa I, radiación, y/o un inhibidor PARP, dicho método comprende: determinar, en una célula de cáncer, el número total de regiones de LOH en al menos un par de cromosomas humanos de dicha célula de cáncer que son más largas que la primera longitud pero más cortas que la longitud del cromosoma completo que contiene la región de LOH, en la que dicho al menos un par de cromosomas humanos no es un par de cromosomas sexuales…

(06/11/2019) Un método para aislar una región genómica específica mientras se mantiene la interacción de la región genómica específica y las moléculas que interactúan con ella, comprendiendo el método los siguientes pasos 1 a 3: Paso 1: poner en contacto el ADN genómico con una molécula exógena capaz de unirse a una secuencia específica de ADN endógeno en el ADN genómico, Paso 2: fragmentar el ADN genómico en un estado en el que se mantiene la interacción del ADN genómico y las moléculas que interactúan con el mismo, y Paso 3: permitir que un fragmento de ADN genómico unido a la molécula exógena forme un complejo con una molécula capaz de unirse específicamente a la molécula exógena, y luego recuperar el complejo, en donde la fragmentación del ADN genómico…

(06/11/2019) Un método para desarrollar una prueba de diagnóstico para una enfermedad en particular, comprendiendo el método las etapas de: en una muestra recogida de cada uno de los múltiples sujetos en un grupo de pacientes y un grupo de control, en donde el grupo de pacientes comprende sujetos que tienen la misma enfermedad y el grupo de control comprende sujetos que están sanos; amplificar y secuenciar el repertorio inmunitario de cada sujeto en cada uno de los dos grupos para identificar cada secuencia de CDR3 exclusiva presente en las muestras y determinar la frecuencia de aparición de cada secuencia de CDR3 exclusiva; identificar secuencias de CDR3 que se comparten entre al menos dos sujetos en cada uno de los grupos de control y el…

(06/11/2019) Un método ex vivo para establecer si un supuesto padre es el padre biológico de un feto que se está gestando en una madre embarazada, el método comprende: realizar mediciones genotípicas de alelos de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP), en una pluralidad de loci polimórficos, en material genético obtenido del supuesto padre, material genético obtenido de la madre embarazada y en una muestra mixta de ADN procedente de una muestra de sangre obtenida de la madre embarazada, donde la muestra mixta de ADN comprende ADN fetal y ADN materno; en donde dichas mediciones genotípicas son mediciones de salida de una plataforma de genotipado que comprende la identidad de la pluralidad de nucleótidos en la pluralidad de loci polimórficos; determinar, en una computadora, la probabilidad de…

(04/11/2019) Un procedimiento de detección e identificación de un micropéptido (miPEP) codificado por una secuencia de nucleótidos contenida en la secuencia de la transcripción primaria de un microARN, que comprende: - a) una etapa de detección de una fase de lectura abierta de 12 a 303 nucleótidos contenida en la secuencia de la transcripción primaria de dicho microARN, después - b) una etapa de comparación entre: • la acumulación de dicho microARN en una célula eucariota determinada que expresa dicho microARN, en presencia de un péptido codificado por una secuencia de nucleótidos idéntica o degenerada con respecto a…

(30/10/2019) Método para identificar de manera exclusiva donaciones de fluido biológico con carga viral positiva, comprendiendo el método las fases que consisten en: - proporcionar una pluralidad de donaciones de fluido biológico; - definir una matriz n-dimensional, donde n es un número entero, comprendiendo también la matriz una pluralidad de elementos internos, estando definido cada elemento por una intersección de n dimensiones de la matriz, siendo identificado cada elemento individual por una notación matricial correspondiente y comprendiendo la notación matricial correspondiente un índice para cada dimensión del conjunto; - tomar una muestra de cada una de las donaciones de fluido biológico; - proyectar cada muestra en un elemento determinado correspondiente de cada elemento de la matriz, siendo cada muestra individual…

(23/10/2019) Una molécula de ácido nucleico que comprende la secuencia de AWCWGGWWC(N)nAWCWGGWWWWWAAG (SEQ ID NO: 15), en donde W es independientemente, por cada aparición, una pirimidina modificada en el C-5, N es cualquier nucleótido no modificado o modificado y n es 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 o 30, en donde la pirimidina modificada en el C-5 se selecciona del grupo que consiste en 5-(N-bencilcarboxiamida)-2'-desoxicitidina (BndC); 5-(N-2-feniletilcarboxiamida)-2'-desoxicitidina (PEdC); 5-(N-3-fenilpropilcarboxiamida)-2'-desoxicitidina (PPdC); 5-(N-1-naftilmetilcarboxiamida)-2'-desoxicitidina (NapdC); 5- (N-2-naftilmetilcarboxiamida)-2'-desoxicitidina…

(23/10/2019) Un método para detectar uno o más ácidos nucleicos diana presentes en una muestra, que comprende las siguientes etapas: agregar un cebador o sonda marcada con fluoróforo y una sonda marcada con un desactivador a la muestra, o agregar la muestra a un cebador o sonda marcada con fluoróforo y una sonda marcada con un desactivador, en donde el cebador o sonda marcada con fluoróforo es un oligonucleótido marcado con fluoróforo que tiene complementariedad con un ácido nucleico diana, y la sonda marcada con desactivador es un oligonucleótido marcado con desactivador que tiene complementariedad con el cebador o sonda marcada con fluoróforo y que tiene una temperatura de fusión (Tf) menor que la del cebador o sonda marcada con fluoróforo; incubar la muestra a una temperatura igual o inferior a la temperatura de fusión (TF)…

(23/10/2019) Método para la secuenciación de ácidos nucleicos, comprendiendo el método: a) proporcionar una molécula de ácido nucleico y un chip que comprende una pluralidad de nanoporos individualmente direccionables, en el que dicha pluralidad de nanoporos individualmente direccionables están a una densidad de al menos 500 nanoporos individualmente direccionables por mm2, en el que dicha pluralidad de nanoporos individualmente direccionables comprende un nanoporo en una bicapa lipídica, teniendo dicho nanoporo una ácido nucleico polimerasa unida al nanoporo adyacente a la entrada de dicho nanoporo, estando dicha bicapa lipídica dispuesta adyacente a al menos un electrodo y separando al menos unas disoluciones de electrolito…

(17/10/2019) Un método para la detección de cepas de Legionella spp. en una muestra ambiental basándose en la amplificación isotérmica mediada por bucle caracterizado por que comprende las etapas de: (a) recogida de la muestra; (b) extracción de material genético de la muestra con un reactivo de extracción que comprende al menos reactivos de lisis celular y una solución de soporte magnetizable; (c) elución del material genético desde el soporte magnetizable y retrotranscripción isotérmica de ARN y amplificación de ADNc con un reactivo de detección que comprende al menos soluciones de elución, retrotranscriptasa, amplificación y lectura, en donde la solución de amplificación comprende un conjunto de cebadores de LAMP para amplificar las regiones específicas del gen de ARNr…

(16/10/2019) Un método para caracterizar la dinámica de la cromatina de las poblaciones celulares obtenidas, comprendiendo el método: (a) obtener al menos dos muestras de poblaciones celulares, comprendiendo cada muestra células de un tipo celular diferente o procedentes de un sujeto concreto; (b) reticular la cromatina celular total de al menos dichas dos muestras; (c) aislar dicha cromatina celular total en un soporte sólido; (d) marcar el ADN de dicha cromatina celular total, en donde dicho marcaje distingue entre dicha cromatina celular total de la primera de al menos dichas dos muestras y dicha cromatina celular total de la segunda de al menos dichas dos muestras; (e) liberar dicha cromatina celular total de dicho soporte sólido; (f) agrupar al menos dichas dos muestras…

(16/10/2019) Un método de secuenciación de un polinucleótido selectivo, que comprende: a) proporcionar una pluralidad de oligonucleótidos de amplificación inmovilizados sobre un soporte sólido; b) hibridar una población de sondas de oligonucleótidos con un subconjunto de los oligonucleótidos de amplificación para producir una población de oligonucleótidos de amplificación hibridados, comprendiendo cada una de las sondas de oligonucleótido una primera porción complementaria a uno o más de los oligonucleótidos de amplificación y una segunda porción que comprende una secuencia de una región seleccionada de un polinucleótido plantilla; c) llevar a cabo la reacción de elongación para elongar los oligonucleótidos de amplificación…

(16/10/2019) Un método para la detección de un ácido nucleico diana en una muestra, comprendiendo dicho método poner en contacto dicha muestra con: un oligonucleótido horquillado que comprende en la dirección 5' a 3', una primera secuencia arbitraria, un sitio de reconocimiento de la endonucleasa, una secuencia complementaria de dicha primera secuencia arbitraria, una secuencia complementaria del extremo 3' de un ácido nucleico diana, una modificación del extremo 3' que evita el inicio de reacciones de extensión no específicas a partir del extremo 3' del oligonucleótido horquillado; una polimerasa; y una endonucleasa para una reacción de mellado; para formar una mezcla de reacción; permitir que la secuencia del extremo 3' del ácido nucleico diana se hibride…

(16/10/2019) Un método para análisis de metilación, comprende a) tratar ADN genómico con uno o más reactivos para convertir bases de citosina no metiladas a sulfonato de uracilo o a otra base que tenga un comportamiento de unión diferente de citosina, mientras que la citosina metilada permanece sin cambio; b) amplificar el ADN tratado por medio de i) al menos un oligonucleótido que comprende o que consiste en una secuencia seleccionada de un grupo que consiste en SEQ ID NO: 6, 48, 62-64 y sus variantes, SEQ ID NO: 6, 44-48 y sus variantes, SEQ ID NO: 1, 12-15 y sus variantes, o SEQ ID NO: 92, en donde dicho al menos un oligonucleótido es adecuado…

(09/10/2019) Un procedimiento para identificar a un individuo con un cáncer que es más probable que responda a un tratamiento con un antagonista de unión a ligando de muerte programada 1 (PD-L1), comprendiendo el procedimiento: (a) determinar en una muestra del individuo la presencia o nivel de PD-L1, en el que la presencia o un incremento en el nivel de PD-L1 en la muestra en relación con el de una muestra de referencia indica que es más probable que el individuo responda al tratamiento con el antagonista de unión a PD-L1; y determinar además en la muestra la presencia o nivel de: (i) PD-1, PD-L2, o ambos PD-1 y PD-L2; (ii) uno o más marcadores relacionados con linfocitos T, en el que el uno o más marcadores relacionados con linfocitos T se selecciona del grupo que consiste en CD8A, IFN-g, EOMES, granzima-A…

(09/10/2019) Un procedimiento para determinar un mecanismo para un fenotipo de sensibilidad antimicrobiana, que comprende: - proporcionar una muestra que comprende al menos un microorganismo que no es sensible a al menos un agente antimicrobiano; - poner en contacto la muestra con el agente antimicrobiano, en el que el agente antimicrobiano puede destruir, inhibir el crecimiento o de otro modo alterar la viabilidad de uno o más microorganismos; - poner en contacto el al menos un microorganismo con al menos un compuesto que comprende una molécula oligonucleotídica que selecciona al menos una secuencia de ácido nucleico…

(09/10/2019) Un método para analizar la presencia de ADN de un alelo mutante de PIK3CA en una muestra de ADN, comprendiendo dicho método las etapas de realizar una reacción en cadena de polimerasa (PCR) asimétrica y específica de alelo de dicho ADN de alelo mutante, y realizar un análisis de fusión del ADN producido en la PCR, en el que dicha PCR se realiza mediante el uso de: - un cebador específico de alelo mutante complementario con un extremo 3' (tres prima) de una primera hebra del ADN del alelo mutante que se va amplificar, y dicho cebador específico de alelo mutante comprende un sitio de mutación y un desapareamiento con el ADN de tipo salvaje correspondiente, y - una sonda de bloqueo no marcada que es un oligonucleótido complementario con una…