22 patentes, modelos y diseños de ILLUMINA, INC

Composiciones y métodos para secuenciar polinucleótidos.

Sección de la CIP Química y metalurgia

(01/05/2019). Inventor/es: GUNDLACH,JENS H, GUNDERSON,KEVIN L, MANDELL,JEFFREY G, STAVA,ERIC, DERRINGTON,IAN M, MOHIMANI,HOSEIN. Clasificación: C12Q1/6869.

Un método de caracterización de un polinucleótido diana, comprendiendo el método: (a) aplicar una diferencia de potencial a través de un poro en contacto con una helicasa Hel308 y el polinucleótido diana; (b) medir al menos dos señales de diferentes magnitudes por nucleótido del polinucleótido diana que se mueve a través del poro durante un ciclo de translocación completo de la helicasa Hel308; y (c) caracterizar el polinucleótido diana utilizando al menos dos señales de diferentes magnitudes por nucleótido medido en (b).

PDF original: ES-2735015_T3.pdf

Amplificación de polinucleótidos empleando sistemas CRISPR-Cas.

Sección de la CIP Química y metalurgia

(29/03/2019). Inventor/es: MANDELL,JEFFREY G. Clasificación: C12Q1/68, C12N15/63, C12N15/10, C12N15/90.

Un método para amplificar un ácido nucleico bicatenario diana que comprende: a) proporcionar un sistema que tiene: un ARN (ARNcr) con repeticiones palindrómicas cortas agrupadas y regularmente interespaciadas (CRISPR), y una proteína asociada a CRISPR (Cas), en donde el ARNcr contiene una región de nucleótidos específica de la diana complementaria praa una región de una primera cadena de ácido nucleico bicatenario diana; b) poner en contacto el ácido nucleico bicatenario diana con el sistema para formar un complejo; c) hibridar un cebador a una segunda cadena del ácido nucleico bicatenario diana, el cebador contiene una secuencia complementaria para una región de la segunda cadena del ácido nucleico bicatenario diana, y d) prolongar un ácido nucleico complementario a la segunda cadena de ácido nucleico bicatenario diana a partir del cebador empleando una polimerasa.

PDF original: ES-2706531_T3.pdf

Análisis de expresión génica en células individuales.

(27/03/2019) Un método para preparar una biblioteca de ADNc a partir de una pluralidad de células individuales, comprendiendo el método las etapas de: (i) liberar ARNm de cada célula individual para proporcionar una pluralidad de muestras de ARNm individuales, en las que el ARNm en cada muestra de ARNm individual es de una única célula; (ii) sintetizar una primera cadena de ADNc a partir del ARNm en cada muestra de ARNm individual con un cebador de síntesis de una primera cadena de ADNc (CDS) que comprende una secuencia de un cebador de amplificación (APS) en 5' y una secuencia complementaria de ARN (RCS) que es al menos parcialmente complementaria a uno o más ARNm en una muestra de ARNm individual, en donde el RCS comprende oligo (dT), hexámeros aleatorios o una secuencia semi-aleatoria no auto-complementaria, e incorporar…

Métodos y sistemas para alinear elementos de ADN repetitivos.

(15/03/2019) Un método para determinar la longitud y/o secuencia de un elemento de ADN repetitivo polimórfico que tiene una región de repetición situada entre una primera región flanqueante conservada y una segunda región flanqueante conservada, comprendiendo dicho método: (a) proporcionar un conjunto de datos que comprende al menos una lectura de secuencia del elemento de ADN repetitivo polimórfico; (b) proporcionar una secuencia de referencia que comprende la primera región flanqueante conservada y la segunda región flanqueante conservada; (c) alinear una porción de la primera región flanqueante de la secuencia de referencia con la lectura de secuencia; (d) alinear una porción de la segunda…

Métodos para la secuenciación de ácidos nucleicos.

(20/02/2019) Un método de preparación de una biblioteca de ácidos nucleicos molde para obtener información de secuencia a partir de un ácido nucleico diana, comprendiendo dicho método: (a) compartimentar el ácido nucleico diana en una pluralidad de primeros recipientes proporcionando a cada primer recipiente una cantidad de ácido nucleico diana mayor que aproximadamente uno o más equivalentes haploides del ácido nucleico diana; (b) proporcionar un primer índice al ácido nucleico diana de cada primer recipiente, en donde el primer índice proporcionado al ácido nucleico diana de cada primer recipiente es distinto, en donde la etapa comprende poner…

Sistema para secuenciación por síntesis ortogonal.

(20/02/2019) Un sistema para secuenciar moldes de ácidos nucleicos, que comprende: (a) una matriz de sitios, en el que cada sitio incluye un primer molde de ácido nucleico y un segundo molde de ácido nucleico, en el que el primer molde de ácido nucleico tiene una secuencia que es diferente de la secuencia del segundo molde de ácido nucleico; (b) un primer cebador unido al primer molde; (c) una primera especie de polimerasa adecuada para extender el primer cebador unido al primer molde; (d) un primer conjunto de análogos de nucleótidos adecuados para producir un primer producto de extensión de cebador que se extiende desde el primer cebador, en el que el primer producto…

Funcionalización de superficie sin catalizador e injerto de polímero.

Secciones de la CIP Química y metalurgia Técnicas industriales diversas y transportes

(18/02/2019). Inventor/es: BERTI,LORENZO, BROWN,ANDREW A, GEORGE,WAYNE N. Clasificación: C07H21/00, C12Q1/68, B01J19/00, C09D133/26.

Un sustrato que comprende una primera superficie que comprende silano o un derivado de silano unido covalentemente a una molécula funcionalizada a través de la reacción de la molécula funcionalizada con una primera pluralidad de restos insaturados seleccionados de cicloalquenos, heteronorbornenos, o variantes opcionalmente sustituidas o combinaciones de ellos unidas covalentemente a dicho silano o derivado de silano.

PDF original: ES-2700529_T3.pdf

Conjunto de cartucho.

(30/01/2019) Un conjunto de cartucho que comprende: un alojamiento que incluye una cámara de celda de flujo para recibir una celda de flujo; una placa de pocillos con pocillos de líquidos para recibir cantidades deseadas de líquidos, en donde la placa de pocillos incluye una estación de válvula , una estación de bomba y una estación de análisis de fluidos , en donde la placa de pocillos incluye canales asociados a los pocillos, la estación de válvula , la estación de bomba y la estación de análisis de fluidos ; un conjunto de bomba proporcionado sobre la placa de pocillos en la estación de bomba , en donde el conjunto de bomba ha de controlar el flujo de fluido a través de los canales…

Dispositivo electrónico activado bioquímicamente.

(23/01/2019) Un método para conectar componentes de reacción a sensores de carga, que comprende (a) aportar un soporte sólido que comprende numerosos sensores de carga, en donde cada uno de los sensores de carga tiene una capacidad para conectarse a numerosos componentes de reacción; (b) aportar un fluido que comprende numerosos componentes de reacción de un tipo concreto, en donde cada uno de los componentes de reacción del tipo concreto está fijado a un resto repelente; y (c) poner en contacto el soporte sólido con el fluido en las condiciones en las que (i) los numerosos componentes de reacción del tipo concreto están en comunicación fluida con los numerosos sensores de carga, (ii) en el fluido hay un mayor número de componentes de reacción del tipo concreto que el número de sensores…

Sistemas para análisis de secuencia mediante síntesis.

(25/04/2018) Sistema configurado para secuenciar uno o más polinucleótidos que comprende: a) plataforma configurada para contener un sustrato sólido que tiene uno o más polinucleótidos unidos a este; b) sistema de dirección de fluido para poner, de manera que se pueda controlar, uno o más reactivos que tengan etiquetas fluorescentes en contacto con los polinucleótidos; c) sistema de control de temperatura para regular una temperatura de al menos uno del sustrato sólido o de los reactivos; d) sistema de iluminación para excitar las etiquetas fluorescentes a través de reflexión interna total (TIR) que comprende al menos un láser de excitación acoplado a través de una fibra óptica multimodal con un índice de refracción que cambia de forma dinámica para obtener una…

Polimerasas modificadas para una mejor incorporación de análogos de nucleótidos.

(25/04/2018) Una ADN polimerasa tipo de la familia B que comprende aminoácidos que tienen una mutación de sustitución de aminoácidos para la posición equivalente para Thr514 y/o Ile521, dichos aminoácidos se seleccionan de: (i) el aminoácido de cualquiera de SEQ ID NOS:6-8, 10-12, 14-16, 18-20, 22-24 y 26-34; (ii) un aminoácido que tiene una mutación de sustitución en el dominio semi-conservado en el bolsillo de unión de bloqueo 3', comprendiendo dicho dominio semi-conservado la secuencia de aminoácidos de cualquiera de SEQ ID NOS: 1-3 en donde la mutación de sustitución comprende una mutación seleccionada a partir de una sustitución en posición 3 de cualquier otro resto distinto a Thr o una sustitución en posición 10 para cualquier resto…

Amplificación de exclusión cinética de bibliotecas de ácidos nucleicos.

(10/01/2018) Un método para amplificar los ácidos nucleicos, que comprende (a) proporcionar (i) una matriz de sitios de amplificación que tiene uno o más agentes de captura y (ii) un agente de amplificación que comprende una solución que comprende una pluralidad de ácidos nucleicos diana diferentes, en donde el número de los ácidos nucleicos diana diferentes en la solución excede el número de sitios de amplificación en la matriz, en donde los ácidos nucleicos diana diferentes tienen un acceso fluídico a la pluralidad de sitios de amplificación, y en donde cada uno de los sitios de amplificación es capaz de estar ocupado por varios ácidos nucleicos diana de la pluralidad…

Métodos y composiciones para la secuenciación de ácidos nucleicos.

(12/07/2017) Un método de secuenciación por síntesis (SBS) basado en fluorescencia para determinar la secuencia de un polinucleótido que comprende detectar en una reacción de secuenciación la incorporación de tres tipos diferentes de conjugados de nucleótidos detectables en un polinucleótido y determinar la incorporación de un cuarto tipo de nucleótido basado en el patrón de detección de los tres tipos diferentes de nucleótidos detectables en el polinucleótido determinando con ello la secuencia de un polinucleótido, en el que la incorporación de tres tipos diferentes de conjugados de nucleótidos detectables se detecta a partir de un estado de señal; y en el que se detecta un primer nucleótido conjugado, unido a un primer fluoróforo, en un primer canal; se detecta un segundo…

Procedimientos y aparatos para la formación confocal de imágenes.

(10/05/2017) Un aparato de formación de imágenes, que comprende: (a) una fuente de radiación , situada para enviar radiación de excitación a al menos una porción de una región de muestra; (b) un conjunto de detectores rectangular , que tiene elementos que convierten la energía de los fotones en contacto en una respuesta eléctrica, estando dichos elementos en una disposición ortogonal bidimensional en la que una primera dimensión es más larga que una segunda dimensión; (c) un generador de línea colocado para recibir radiación de excitación procedente de dicha fuente de radiación y para enviar una línea de radiación a dicha región de muestra; (d) una óptica de formación de imágenes colocada para dirigir una imagen rectangular…

Métodos para reducir el daño en ácidos nucleicos.

Secciones de la CIP Química y metalurgia Física

(08/03/2017). Inventor/es: MOORE,JOHN, RIGATTI,ROBERTO, GORMLEY,NIALL ANTHONY, SHEN,MIN-JUI RICHARD, HALL,KEVIN, KLAUSING,KAY, SMITH,VINCENT, IOANNOU,AVGOUSTA, FRITZILAS,EPAMEINONDAS. Clasificación: C12Q1/68, G01N33/53, C12Q1/48.

Un método para inhibir la degradación de ácidos nucleicos durante una etapa de procesamiento de detección de ácidos nucleicos, que comprende introducir mediante un sistema de flujo fluido uno o más nucleótidos etiquetados con fluorescencia de manera diferente y una polimerasa en una célula de flujo, comprendiendo dicha célula de flujo una matriz de ácidos nucleicos unida a un soporte; reemplazar dicho uno o más nucleótidos etiquetados con fluorescencia de manera diferente y una polimerasa con una solución de detección que comprende ácido gálico, un éster alquílico inferior del mismo, o mezclas de los mismos, e irradiar una porción de dichos ácidos nucleicos en presencia de dicha solución de detección para inducir fluorescencia, en donde dicha solución de detección reduce la cantidad de degradación inducida por la luz de los ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2627851_T3.pdf

Procedimientos de enfoque y sistemas y conjuntos ópticos que usan los mismos.

Sección de la CIP Física

(03/08/2016). Inventor/es: BUERMANN,DALE, KINDWALL,ALEXANDER P. Clasificación: G02B21/24.

Un procedimiento para controlar un enfoque de un sistema óptico, en el que el procedimiento comprende: proporcionar un par de haces (130A, 132A) de luz incidentes a una lente conjugada, en el que los haces de luz incidentes son dirigidos por la lente para converger hacia una región focal; reflejar los haces de luz incidentes con un objeto posicionado cerca de la región focal, en el que los haces (130B, 132B) de luz reflejados vuelven a, y se propagan a través de, la lente; determinar la separación relativa entre los haces de luz reflejados; y determinar un grado de enfoque del sistema óptico con respecto al objeto en base a la separación relativa, caracterizado por que los haces de luz incidentes se propagan en paralelos entre sí cuando son recibidos por la lente y por que el objeto está en foco cuando los haces de luz reflejados salen de la lente en paralelo entre sí.

PDF original: ES-2596655_T3.pdf

Métodos para seleccionar y amplificar polinucleótidos.

(20/07/2016) Un procedimiento de selección y amplificación de polinucleótidos en un soporte sólido, que comprende: a) proporcionar una pluralidad de oligonucleótidos de amplificación inmovilizados en un soporte sólido; b) hibridar una población de sondas oligonucleotídicas con un subconjunto de dichos oligonucleótidos de amplificación, comprendiendo cada una de dichas sondas oligonucleotídicas una primera porción que es complementaria a los oligonucleótidos de amplificación y una segunda porción que comprende la secuencia de una región seleccionada de un polinucleótido plantilla; c) realizar una reacción de extensión para extender los oligonucleótidos de amplificación hibridados para producir una población de oligonucleótidos…

Secuenciación mediante síntesis ortogonal.

(11/05/2016) Un método para secuenciar moldes de ácido nucleico, que comprende: (a) proporcionar un conjunto de sitios, en el que cada sitio comprende un primer molde de ácido nucleico y un segundo molde de ácido nucleico, en el que el primer molde de ácido nucleico tiene una secuencia que es diferente de la secuencia del segundo molde de ácido nucleico; (b) extender un primer cebador unido al primer molde utilizando una primera especie de polimerasa y un primer conjunto de análogos de nucleótidos, produciendo de este modo un primer producto de extensión del cebador que comprende un primer análogo de nucleótido en cada uno de los sitios; (c) extender un segundo cebador unido al…

Reemplazo de oligonucleótidos para bibliotecas etiquetadas en dos extremos y direccionadas.

Sección de la CIP Química y metalurgia

(06/04/2016). Ver ilustración. Inventor/es: GORYSHIN,IGOR, BAAS,BRADLEY, VAIDYANATHAN,RAMESH, MAFFITT,MARK. Clasificación: C12Q1/68, C12N15/10.

Un método para adicionar una etiqueta al producto bicatenario de una reacción de tagmentación que comprende los pasos de: (a) proporcionar un ácido nucleico bicatenario diana y un transposoma que tiene una transposasa con dos secuencias extremo de transposón: una hebra transferida y una hebra no transferida; (b) permitir que el transposoma fragmente el ácido nucleico diana, por lo cual la hebra transferida se transfiere de modo covalente a una primera hebra de un primer fragmento y la hebra no transferida permanece hibridada a la hebra transferida; (c) retirar la hebra no transferida de la hebra transferida; (d) proporcionar un oligonucleótido de reemplazo que comprende una secuencia de etiqueta para hibridar a la hebra transferida; y (e) ligar el oligonucleótido de reemplazo a la segunda hebra del primer fragmento; generando de esta manera un producto de tagmentación que tiene una hebra transferida y un oligonucleótido de reemplazo.

PDF original: ES-2568910_T3.pdf

Análisis de expresión génica en células individuales.

Sección de la CIP Química y metalurgia

(30/12/2015). Ver ilustración. Inventor/es: LINNARSSON,STEN. Clasificación: C12Q1/68, C12N15/11.

Un método para preparar una biblioteca de ADNc a partir de una pluralidad de células individuales, comprendiendo el método las etapas de: (i) liberar ARNm de cada célula individual para proporcionar una pluralidad de muestras de ARNm individuales, en las que el ARNm en cada muestra de ARNm individual es de una única célula; (ii) sintetizar una primera cadena de ADNc a partir del ARNm en cada muestra de ARNm individual e incorporar un marcador definido o una combinación de marcadores definida en cada muestra de ADNc individual para proporcionar una pluralidad de muestras de ADNc marcadas, en la que cada muestra de ADNc tiene un marcador o una combinación de marcadores definido, en la que el ADNc en cada muestra de ADNc marcada es complementario al ARNm de una única célula; (iii) agrupar las muestras de ADNc marcadas; y (iv) amplificar las muestras de ADNc agrupadas para generar una biblioteca de ADNc que comprende ADNc bicatenario.

PDF original: ES-2555389_T3.pdf

Métodos y composiciones para la amplificación y genotificación de genomas completos.

(11/12/2013) Un método para indicar la presencia de un polimorfismo de nucleótido único (SNP) de interés en los loci tipablesde un genoma, que comprende las etapas de: (a) amplificar representativamente un genoma nativo para obtener una población representativa defragmentos de genoma que comprende loci tipables, teniendo cada uno una posición de interrogación quecorresponde a un SNP; (b) poner en contacto dichos fragmentos con una matriz de diferentes sondas de ácidos nucleicosinmovilizados en condiciones en las que se forman los híbridos sonda-fragmentos,donde dichos fragmentos tienen una concentración de al menos 1 μg/μl de ADN y donde dichas sondas deácidos nucleicos inmovilizados comprenden…

Procedimientos y aparatos para la formación confocal de imágenes.

(17/06/2013) Aparato para la formación de imágenes que comprende: (a) una fuente de radiación dispuesta para enviar radiación de excitación, como mínimo, a una parte de una regiónde muestra; (b) un conjunto detector rectangular que tiene elementos que convierten la energía de los fotones contactados enuna repuesta eléctrica, encontrándose dichos elementos en una disposición bidimensional, ortogonal, en la queuna primera dimensión es más larga que una segunda dimensión; (c) una óptica de formación de imágenes dispuesta para dirigir una imagen rectangular de dicha parte a dichoconjunto detector rectangular; y (d) un dispositivo de escaneado configurado para escanear dicha región de muestra…

 

Patentes más consultadas

 

Clasificación Internacional de Patentes 2015