Método para identificar patrones de CDR3 asociados a enfermedades en un repertorio inmunitario.

Un método para desarrollar una prueba de diagnóstico para una enfermedad en particular,

comprendiendo el método las etapas de:

en una muestra recogida de cada uno de los múltiples sujetos en un grupo de pacientes y un grupo de control, en donde el grupo de pacientes comprende sujetos que tienen la misma enfermedad y el grupo de control comprende sujetos que están sanos;

amplificar y secuenciar el repertorio inmunitario de cada sujeto en cada uno de los dos grupos para identificar cada secuencia de CDR3 exclusiva presente en las muestras y determinar la frecuencia de aparición de cada secuencia de CDR3 exclusiva;

identificar secuencias de CDR3 que se comparten entre al menos dos sujetos en cada uno de los grupos de control y el grupo de pacientes;

clasificar las secuencias de CDR3 por orden de frecuencia de aparición;

identificar los Linklets de cada grupo; e

identificar los Linklets que están asociados en un grado estadísticamente significativo con el grupo de pacientes para proporcionar una firma de la enfermedad.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2016/021430.

Solicitante: iRepertoire, Inc.

Inventor/es: HAN,JIAN.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/04 QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › Determinación de la presencia o del tipo de microorganismo; Empleo de medios selectivos para la investigación o análisis de antibióticos o bactericidas; Composiciones para este fin que contienen un indicador químico.
  • C12Q1/68 C12Q 1/00 […] › en los que intervienen ácidos nucleicos.
  • C12Q1/6881 C12Q 1/00 […] › para la determinación del tipo de tejido o célula, p. ej. sondas de antígenos de leucocitos humanos [HLA].
  • C12Q1/6883 C12Q 1/00 […] › para enfermedades causadas por alteraciones del material genético.

PDF original: ES-2767696_T3.pdf

 

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