Método de análisis de metilación.

Un método para análisis de metilación, comprende

a) tratar ADN genómico con uno o más reactivos para convertir bases de citosina no metiladas a sulfonato de uracilo o a otra base que tenga un comportamiento de unión diferente de citosina,

mientras que la citosina metilada permanece sin cambio;

b) amplificar el ADN tratado por medio de

i) al menos un oligonucleótido que comprende o que consiste en una secuencia seleccionada de un grupo que consiste en (1) SEQ ID NO: 6, 48, 62-64 y sus variantes, (2) SEQ ID NO: 6, 44-48 y sus variantes, (3) SEQ ID NO: 1, 12-15 y sus variantes, o (4) SEQ ID NO: 92, en donde dicho al menos un oligonucleótido es adecuado para su uso como cebador directo; y

ii)al menos un oligonucleótido que comprende o que consiste en una secuencia seleccionada de un grupo que consiste en (1) SEQ ID NO: 65-72 y sus variantes, (2) SEQ ID NO: 5, 43 y sus variantes, (3) SEQ ID NO: 2, 16-22, o (4) SEQ ID NO: 1, 12-15 y sus variantes, en donde dicho al menos un oligonucleótido es adecuado para su uso como cebador inverso; y

iii) opcionalmente, al menos un oligonucleótido que comprende o que consiste en una secuencia seleccionada del grupo que consiste en (1) SEQ ID NO: 7, 49, 50, 55-57, 73-76 y sus variantes, (2) SEQ ID NO: 7, 49-57 y sus variantes, (3) SEQ ID NO: 3, 9, 23-30 y sus variantes, o (4) SEQ ID NO: 9, 23, 24, 91, sus variantes, y 97-101, en donde dicho al menos un oligonucleótido es adecuado para su uso como bloqueador; y

iv) opcionalmente, al menos un oligonucleótido que comprende o que consiste en una secuencia seleccionada del grupo que consiste en (1) SEQ ID NO: 83, 84 y sus variantes, (2) SEQ ID NO: 8, 58-61 y sus variantes, (3) SEQ ID NO: 4, 31-42, y sus variantes, o (4) SEQ ID NO: 4, 31-42 y sus variantes, en donde dicho al menos un oligonucleótido es adecuado para su uso como sonda; y/o al menos una combinación de oligonucleótidos que comprende o consiste en cualquiera de las secuencias de (1) SEQ ID NO: 77 y 78 o sus variantes, SEQ ID NO: 79 y 80 o sus variantes, o SEQ ID NO: 81 y 82 o sus variantes, o (4) SEQ ID NO: 102 y 103, o SEQ ID NO: 104 y 105, en donde dichas una o más combinaciones de oligonucleótidos son adecuadas para su uso como combinaciones de sondas,

en donde los oligonucleótidos de (i) a (iv) se seleccionan de uno de (1) a (4), y

en donde las variantes tienen una deleción 5'-terminal y/o 3'-terminal de 1, 2, 3, 4 o 5 nucleótidos; y

v) opcionalmente, una polimerasa, preferiblemente una polimerasa termoestable;

c) deducir la presencia o ausencia de metilación de los dinucleótidos CpG amplificados en la etapa b) a partir de los resultados de la etapa b).

Tipo: Patente Europea. Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: E16163841.

Solicitante: EPIGENOMICS AG.

Nacionalidad solicitante: Alemania.

Dirección: Geneststrasse 5 10829 Berlin ALEMANIA.

Inventor/es: DISTLER, JURGEN, DR., SCHUSTER, MATTHIAS, TETZNER,REIMO, MODEL,FABIAN, SLEDZIEWSKI,ANDREW,Z, DEVOS,Theo, LOFTON-DAY,Cathy, KROUSE,MICHAEL, HO,JESSE.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2769841_T3.pdf

 

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