CIP-2021 : C40B 40/08 : Bibliotecas que contienen ARN o ADN que codifican proteínas, p. ej. genotecas.

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Notas[n] desde C40B 40/06 hasta C40B 40/16:
  • Las bibliotecas que contienen sales de compuestos orgánicos se clasifican en los grupos para las bibliotecas que contienen los compuestos madre

C QUIMICA; METALURGIA.

C40 TECNOLOGIA COMBINATORIA.

C40B QUIMICA COMBINATORIA; BIBLIOTECAS, p. ej. QUIMIOTECAS (bibliotecas combinatorias in silico de ácidos nucleicos, proteínas o péptidos G16B 35/00; química combinatoria in silico G16C 20/60).

C40B 40/00 Bibliotecas per se , p. ej. arrays, mezclas.

C40B 40/08 · · · Bibliotecas que contienen ARN o ADN que codifican proteínas, p. ej. genotecas.

CIP2021: Invenciones publicadas en esta sección.

Biblioteca de péptidos y su uso.

(08/07/2020). Solicitante/s: DAIICHI SANKYO COMPANY, LIMITED. Inventor/es: NISHIMIYA,DAISUKE, HASHIMOTO,RYUJI.

Una biblioteca de péptidos que comprende una pluralidad de péptidos diferentes en la que los péptidos comprenden cada uno una secuencia de aminoácidos codificada por una secuencia de nucleótidos que consiste en la secuencia representada por la SEQ ID NO: 14 en el Listado de Secuencias en la que la secuencia de nucleótidos ha sido modificada reemplazando un secuencia de nucleótidos que consiste en la 43a base timina a la 93a base timina con una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos representada por la SEQ ID NO: 1 en el Listado de Secuencias, en la que la biblioteca de péptidos tiene una diversidad de al menos 1 × 105.

PDF original: ES-2813867_T3.pdf

Ingeniería del genoma multiplex mediante CRISPR.

(08/04/2020). Solicitante/s: The Regents of the University of Colorado, a body corporate. Inventor/es: GILL,RYAN T, GARST,ANDREW.

Un casete sintetizado que comprende: (i) al menos un casete de edición que comprende (a) una región homóloga a una región objetivo de un ácido nucleico en una célula, (b) una mutación de al menos un nucleótido con relación a dicha región objetivo, y (c) un motivo adyacente protoespaciador mutado (PAM) que no se reconoce por un sistema CRISPR; y (ii) un ácido nucleico que codifica un ARN guía (ARNg) que comprende (a) una región complementaria a una porción de la región objetivo, y (b) una región que recluta una endonucleasa.

PDF original: ES-2802984_T3.pdf

Adaptador vesicular y sus usos en la construcción y secuenciación de una biblioteca de ácidos nucleicos.

(10/07/2019) Uso de un adaptador vesicular del oligonucleótido para la construcción de una biblioteca de ácidos nucleicos monocatenarios cíclicos en donde dicho adaptador comprende una región bicatenaria emparejada en 5' en un primer terminal del adaptador; una región bicatenaria emparejada en 3' en un segundo terminal del adaptador, que comprende una primera cadena y una segunda cadena complementarias entre sí, en la que la primera cadena comprende un saliente en el extremo 3' de la misma y la segunda cadena comprende una base fosforilada en su extremo 5' para proporcionar un terminal adherente y una región vesicular…

Composiciones del dominio de fibronectina estabilizados, métodos y usos.

(17/04/2019). Solicitante/s: Janssen Biotech, Inc. Inventor/es: JACOBS,STEVEN.

Un polipéptido que comprende una molécula de base de armazón que comprende dominios en giro topológicamente similares a dominios del tercer dominio de fibronectina, el polipéptido tiene una secuencia de aminoácidos basada en una secuencia de consenso del tercer dominio de fibronectina que tiene: (i) la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO:16, en donde los residuos específicos de la SEQ ID NO:16 se reemplazan y mejoran la estabilidad térmica de la molécula basada en armazón, en donde la molécula basada en armazón comprende una sustitución E11N; o (ii) la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO:144.

PDF original: ES-2730693_T3.pdf

Diseño de transcriptoma completo de moléculas pequeñas bioactivas, selectivas que seleccionan como diana ARN.

(27/03/2019). Solicitante/s: THE SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE. Inventor/es: DISNEY,MATTHEW D, VELAGAPUDI,SAI.

Compuesto para su uso en el tratamiento de cáncer en un sujeto, en el que dicho compuesto es cualquiera de**Fórmula** o cualquier combinación de los mismos; en las que n es un número entero desde 1 hasta 10.

PDF original: ES-2733030_T3.pdf

Anticuerpos anti-receptor P2X7 y fragmentos de los mismos.

(19/03/2019). Solicitante/s: Biosceptre (Aust) Pty Ltd. Inventor/es: JONES, PHILIP, GRANT,STEVEN, BARDEN,JULIAN,ALEXANDER, BREWIS,NEIL.

Un anticuerpo de dominio único para unión a un receptor P2X7, definiéndose el anticuerpo de dominio único por la fórmula general: FR1 - CDR1 - FR2 - CDR2 - FR3 - CDR3 - FR4 en la que: FR1, FR2, FR3 y FR4 son cada una regiones marco conservadas; CDR1, CDR2 y CDR3 son cada una regiones determinantes de complementariedad; y en las que: CDR1 tiene una secuencia:PMKDMG; CDR2 tiene una secuencia: AISGSGGGTYYADSVKG; y CDR3 tiene una secuencia: EPKPMDTEFDY.

PDF original: ES-2704711_T3.pdf

Adaptador vesicular y usos de este en la construcción y secuenciación de bibliotecas de ácidos nucleicos.

(09/01/2019) Un adaptador vesicular de oligonucleótido para construir una biblioteca de ácidos nucleicos, que comprende: una región bicatenaria emparejada en 5' en un primer extremo terminal del adaptador; una región bicatenaria emparejada en 3' en un segundo extremo terminal del adaptador, que comprende una primera cadena y una segunda cadena complementarias entre sí, en donde la primera cadena comprende un saliente en el extremo 3' de esta y la segunda cadena comprende una base fosforilada en el extremo 5' de esta para proporcionar un extremo terminal adhesivo; y una región vesicular no emparejada entre la región bicatenaria emparejada en 5' y la región bicatenaria emparejada en 3', en donde la región vesicular no emparejada…

Polipéptidos solubles.

(19/09/2018) Una biblioteca de polipéptidos que comprende una pluralidad de polipéptidos diferentes, que comprenden: i) una región variable de cadena pesada de anticuerpo (VH) que comprende una región de armazón que es al menos el 95 % idéntica a la región de armazón de IGHV3-23 tal como se establece en la SEQ ID NO: 3; y i) una región variable de cadena ligera de anticuerpo (VL) que comprende una región de armazón que es al menos el 95 % idéntica a la región de armazón de uno cualquiera de IGLV1-40 (tal como se establece en la SEQ ID NO: 18), IGLV1-44 (tal como se establece en la SEQ ID NO: 21), IGLV1-47 (tal como se establece en la SEQ ID NO: 24), IGLV3-1…

Método para construir una biblioteca de secuenciación con base en una muestra de sangre y uso de la misma para determinar una anormalidad genética fetal.

(18/09/2018) Un método para preparar una biblioteca para la secuenciación usando una muestra de ADN de una muestra de sangre, que comprende: (a) aislar una muestra de ADN de la muestra de sangre, (b) desfosforilación de la muestra de ADN para obtener un producto de fragmentación desfosforilado, y (c) someter los fragmentos de ADN desfosforilados de dicho producto de fragmentación a las siguientes etapas para obtener una biblioteca de ADN cíclicos para secuenciación: (i) reparación final para obtener un fragmento de ADN de cadena doble que tiene dos extremos romos con cuatro nucleótidos terminales que carecen cada uno de un grupo fosfato; (ii) ligar un primer adaptador y un segundo adaptador que son diferentes entre sí con el fragmento de ADN de cadena doble respectivamente en los dos extremos…

MÉTODO EX VIVO DE PRONÓSTICO DE METÁSTASIS EN CÁNCER DE PRÓSTATA.

(05/07/2018). Solicitante/s: PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE. Inventor/es: MONTECINOS ACUÑA,Viviana.

Método ex vivo de pronóstico de metástasis en cáncer de próstata que comprende determinar el nivel de expresión de al menos uno de los siguientes genes: NRP-1, MFAP4, NRIP3, THBS2, TNF, EDN1, EBF1 y GALNT16, en una muestra biológica que contenga células de estroma de tumor primario de cáncer de próstata; y establecer si la expresión de los genes NRP-1, MFAP4, NRIP3, THBS2, TNF, EDN1, EBF1 está aumentada o si la expresión del gen GALNT16 está disminuida, lo que se correlaciona con el pronóstico de metástasis en cáncer de próstata. Y kit para pronosticar metástasis en cáncer de próstata que comprende medios para cuantificar los productos de los genes NRP-1, MFAP4, NRIP3, THBS2, TNF, EDN1, EBF1 y GALNT16, en una muestra que comprende células de estroma prostático.

Composiciones y métodos para identificar mutaciones de manera precisa.

(17/01/2018) Un método para detectar una mutación verdadera en una molécula de ácido nucleico, que comprende: amplificar un banco de ácidos nucleicos de doble cadena, en donde el banco de ácidos nucleicos de doble cadena comprende una pluralidad de moléculas de ácidos nucleicos diana y una pluralidad de códigos de doble cadena, en donde el banco de ácidos nucleicos comprende moléculas que tienen una fórmula de Xa-Y-Xb (en orden 5' a 3'), en donde: (a) Xa comprende un primer código; (b) Y comprende una molécula de ácido nucleico diana, y (c) Xb comprende un segundo código, en donde cada una de la pluralidad de moléculas de ácidos nucleicos diana está asociada con un par único de primero y segundo códigos de doble cadena, en donde cada uno de la pluralidad de códigos comprende una…

Métodos de codificación enzimática para la síntesis eficiente de grandes bibliotecas.

(19/07/2017). Solicitante/s: NUEVOLUTION A/S. Inventor/es: SAMS, CHRISTIAN, FELDING, JAKOB, PEDERSEN, HENRIK, N RREGAARD-MADSEN,MADS, THISTED,Thomas, FRANCH,Thomas, GOULIAEV,Alex,Haahr, LUNDORF,Mikkel,Dybro, OLSEN,Eva,Kampmann, HOLTMANN,Anette, JAKOBSEN,Soren,Nyboe, SØRENSEN,ANDERS MALLING, GLAD,SANNE SCHRØDER, JENSEN,KIM BIRKEBÆK, NEVE,SØREN, FRESKGÅRD,PER-OLA, GODSKESEN,MICHAEL ANDERS, ANDERSEN,ANNE LEE, HANSEN,ANDERS HOLM, GOLDBECH,ANNE, DE LEON,DAEN, KALDOR,DITTE KIVSMOSE, SLØK,FRANK ABILDGAARD, HUSEMOEN,BIRGITTE NYSTRUP, DOLBERG,JOHANNES, PETERSEN,LENE, KRONBERG,TINE TITILOLA AKINLEMINU.

Un complejo bifuncional que comprende una molécula y un oligonucleótido identificador bicatenario que comprende una pluralidad de etiquetas de oligonucleótidos que identifican entidades químicas que han participado en la síntesis de la molécula, donde una extensión del cebador mediada por polimerasa da como resultado la formación de dicho oligonucleótido identificador bicatenario que comprende secuencia de diversificación capaz de diversificar combinaciones de etiquetas que de otro modo serían distinguibles.

PDF original: ES-2651450_T3.pdf

Métodos de creación y examen de bibliotecas codificadas por ADN.

(03/05/2017). Solicitante/s: X-Chem, Inc. Inventor/es: WAGNER,RICHARD,W.

Método de etiquetado de bibliotecas químicas codificadas por ADN, comprendiendo dicho método: (a) unir un primer grupo funcional de un ligador bifuncional a una parte anterior que comprende un oligonucleótido iniciador, en el que dicho oligonucleótido iniciador comprende una estructura de horquilla; (b) unir un segundo grupo funcional del ligador bifuncional a un primer elemento estructural; (c) hacer reaccionar un segundo elemento estructural con dicho primer elemento estructural; y (d) unir una región identificadora en el extremo 3' de dicha parte anterior, en el que la región identificadora codifica para dicho segundo elemento estructural; en el que la etapa (c) se realiza en disolvente orgánico.

PDF original: ES-2638324_T3.pdf

Producción de ácido nucleico circular monocatenario.

(19/04/2017) Un método para generar ácido nucleico circular monocatenario a partir de una muestra del ácido nucleico diana, comprendiendo dicho método: a) formar un complejo que comprende una transposasa y una pluralidad de polinucleótidos en horquilla, teniendo cada uno de dichos polinucleótidos en horquilla una región dúplex que comprende una secuencia de reconocimiento de la transposasa. b) mezclar dicho complejo con dicho ácido nucleico diana, fragmentando de este modo dicho ácido nucleico diana y ligando dichos polinucleótidos en horquilla a dicho ácido nucleico diana, para formar fragmentos de ácido nucleico unidos en horquilla, teniendo cada fragmento de ácido nucleico unido en horquilla una región del fragmento del ácido nucleico diana dúplex y un hueco del segmento de la base nucleotídica entre cada región del fragmento de ácido nucleico diana…

Composiciones del dominio de fibronectina estabilizados, métodos y usos.

(22/06/2016). Solicitante/s: Janssen Biotech, Inc. Inventor/es: JACOBS,STEVEN.

Un polipéptido que comprende una molécula de base de armazón que comprende dominios en bucle topológicamente similares a dominios del dominio del tercer fibronectino, el polipéptido tiene una secuencia de amino ácido basada en una secuencia de consenso del demonio del tercer fibronectino poseyendo: i. La secuencia de amino ácido de SEQ ID NO: 16, en la cual residuos específicos de SEQ ID NO: 16 son reemplazados y mejorada la estabilidad térmica y la estabilidad química de la molécula de base de armazón, en la cual la molécula con base de armazón comprende uno o más sustituciones selectas de un grupo consistente en N46V, E14P, L17A y E86I; o ii. La secuencia de amino ácido seleccionada de un grupo que consiste en SEQ ID NOs: 142, 143 y 147-151.

PDF original: ES-2592511_T3.pdf

Un biomarcador transcriptómico de miocarditis.

(20/04/2016) Uso de una composición molecular que comprende moléculas de ácido nucleico que consisten en las secuencias de ácido nucleico de: 1553145_at (proteína hipotética FLJ39653), 1553575_at, 1557236_at (apolipoproteína L, 6), 1558142_at (repetición de trinucleótidos que contiene 6B), 1560752_at (proteína 2 de los dominios caja F y WD-40), 1565614_at (proteína en dedo de zinc 337), 1567100_at (homólogo de Dachshund 1 (Drosophila)), 200068_s_at (calnexina /// calnexina), 201031_s_at (ribonucleoproteína nuclear heterogénea H1 (H)), 202646_s_at (dominio de choque frío que contiene E1, que se enlaza a ARN), 205758_at (molécula CD8a /// molécula CD8a), 206188_at (dedo de zinc de la proteína 623), 212637_s_at (dominio WW que contiene la proteína ubiquitina E3 ligasa 1), 212920_at, 213317_at (canal intracelular…

Marcadores genéticos para la gestión del peso y métodos de uso de los mismos.

(30/03/2016). Ver ilustración. Solicitante/s: INTERLEUKIN GENETICS, INC.. Inventor/es: RAMAKRISHNAN, SHYAM, WILKINS,Leon, DRAPER,COLLEEN, BRETON,GARY, PERUSSE,LOUIS, DEBUSK,RUTH, KREMPIN,DAVID.

Un método para seleccionar un régimen dietético apropiado para la pérdida y/o mantenimiento del peso para un sujeto que comprende: a) determinar el genotipo del sujeto con respecto a los loci polimórficos FABP2 rs1799883; G/A; PPARG rs1801282; C/G; y ADRB2 rs1042714; C/G; y b) clasificar al sujeto basándose en la determinación de tres loci polimórficos en la etapa (a) en una categoría nutricional, en la que es predecible que el sujeto con un genotipo combinado de FABP2 rs1799883 1.1 G/G, PPARG rs1801282 1.1 C/C, y ADRB2 rs1042714 1.1 C/C responda a una dieta equilibrada.

PDF original: ES-2586685_T3.pdf

Anticuerpos anti-receptor P2X7 y fragmentos de los mismos.

(26/01/2016). Solicitante/s: Biosceptre (Aust) Pty Ltd. Inventor/es: JONES, PHILIP, GRANT,STEVEN, BARDEN,JULIAN,ALEXANDER, BREWIS,NEIL.

Un anticuerpo de un único dominio para unión a un receptor P2X7, definiéndose el anticuerpo de un único dominio por la fórmula general: FR1 - CDR1 - FR2 - CDR2 - FR3 - CDR3 - FR4 en la que: FR1, FR2, FR3 y FR4 son cada una regiones marco conservadas; CDR1, CDR2 y CDR3 son cada una regiones determinantes de complementariedad; y en las que: CDR1 tiene una secuencia: RNHDMG; CDR2 tiene una secuencia: AISGSGGSTYYANSVKG; y CDR3 tiene una secuencia: EPKPMDTEFDY.

PDF original: ES-2557456_T3.pdf

Reacciones de amplificación de ácido nucleico de múltiples estadios en sistema cerrado.

(03/09/2014) Un método para realizar una reacción de amplificación anidada, comprendiendo el método las etapas de: a) realizar una reacción de amplificación de primer estadio en una cámara de reacción de un sistema cerrado de forma fluida, comprendiendo la reacción de amplificación de primer estadio uno o más polinucleótidos diana de una muestra usando reactivos de amplificación de primer estadio en una primera mezcla de reacción para formar uno o más primeros amplicones, incluyendo los reactivos de amplificación de primer estadio cebadores iniciales para cada polinucleótido diana, en donde el o los primeros amplicones se amplifican…

Colección de anticuerpos sintéticos para tratar enfermedades.

(02/07/2014) Una colección de anticuerpos sintéticos o de fragmentos funcionales de los mismos, que comprende regiones estructurales de la cadena pesada variable y la cadena ligera variable, en donde dichas regiones estructurales de la cadena pesada variable y dichas regiones estructurales de la cadena ligera variable comprenden secuencias de proteínas de la línea germinal de una pareja de proteínas de la línea germinal, en donde dicha pareja de proteínas de la línea germinal comprende las siguientes propiedades: i) una tasa de presentación relativa en formato Fab que comprende un valor dentro del 75% superior de los Fabs sometidos a ensayo; ii) un nivel de expresión en formato Fab de al menos 0,4 en comparación con Fab VH1-69 VLA_VI1-40 AYA cuyas secuencias…

Polinucleótidos y polipéptidos implicados en el cáncer.

(27/11/2013) Un método in vitro para identificar una célula de cáncer ovárico, comprendiendo el método poner en contacto unacélula de ensayo, una muestra celular de ensayo, un fluido corporal de ensayo o un tejido de ensayo con un reactivocapaz de unirse específicamente a al menos una secuencia polinucleotídica seleccionada del grupo que consiste en: a) un polinucleótido que comprende SEQ ID NO.:24; y b) un polinucleótido que tiene al menos 80% de identidad de secuencia con un polinucleótido de a) y detectar un complejo formado por el reactivo y el polinucleótido, con lo que la presencia de un complejo esindicativa de una célula de cáncer ovárico

Polímeros recombinantes no estructurados y usos de los mismos.

(06/08/2013) Un procedimiento de aumento de la semivida en suero de una proteina, que comprende: fusionar dicha proteina con uno o mas polimeros recombinantes no estructurados (URP), en el que el URP comprende al menos aproximadamente 200 aminoacidos contiguos, y en el que (a) la suma de los residuos de glicina (G), aspartato (D), alanina (A), serina (S), treonina (T), glutamato (E) y prolina (P) contenidos en el URP constituye mas de aproximadamente el 80% de los aminoacidos totales del URP; y (b) al menos el 50% de los aminoacidos del URP no estan presentes en la estructura secundaria como se ha determinado por el algoritmo de Chou-Fasman; y en el que dicho URP es sustancialmente incapaz de…

Sistemas de despliegue de levaduras.

(02/07/2013) Una biblioteca de células huésped, en donde cada célula huésped comprende: (a) una molécula de la superficie de la célula unida a la superficie de la célula, (b) una molécula adaptadora que comprende un primer sitio de enlazamiento y un segundo sitio de enlazamiento, y (c) una molécula de despliegue que comprende un polipéptido modificado; en donde el primer sitio de enlazamiento se enlaza específicamente con la molécula de la superficie de la célula y no puede enlazarse con la molécula de despliegue y el segundo sitio de enlazamiento se enlaza específicamente con la molécula de despliegue y no puede enlazarse con la molécula…

Métodos para la formación de enlaces disulfuro.

(22/05/2013) Un método para formar un enlace disulfuro entre un primer residuo cisteína comprendido en un primer(poli)péptido/proteína y un segundo residuo cisteína comprendido en un segundo (poli)péptido/proteína,comprendiendo el método: (a) introducir artificialmente un aminoácido con un pI mayor que 8 en dicho primer (poli)péptido/proteína osegundo (poli)péptido/proteína, en donde dicho aminoácido afecta positivamente a la reactividad de al menos uno de dichos residuoscisteína, y (b) causar o permitir la fijación de dicho primer (poli)péptido/proteína a dicho segundo (poli)péptido/proteína,en donde dicha fijación…

Métodos y composiciones.

(25/04/2012) Complejo que comprende una partícula de fago, comprendiendo dicha partícula de fago (i) un ácido nucleico que codifica un polipéptido; (ii) el polipéptido expresado por el ácido nucleico de (i) y expuesto en la superficie del fago; (iii) un compuesto conector unido a dicho polipéptido en el que dicho compuesto conector está unido al polipéptido mediante al menos tres enlaces covalentes independientes.

PROCEDIMIENTO PARA UNIR SECUENCIAS DE INTERÉS.

(01/03/2012) Una biblioteca de pares análogos que comprende secuencias de ácido nucleico unidas que codifican la región variable, en la que cada par análogo es un par original de secuencias de ácido nucleico no contiguas amplificadas a partir de un único linfocito, estando presente la biblioteca en una pluralidad de recipientes en la que cada recipiente contiene un único par análogo.

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