Método de diseño para proteína de unión a ARN usando motivo de PPR, y uso del mismo.

Método para preparar una proteína que comprende diseñar una proteína que puede unirse a una molécula de ARN de una manera selectiva de base de ARN o específica de secuencia de bases de ARN,



comprendiendo el método:

diseñar una proteína que se une específicamente a ARN que tiene una secuencia específica prestando atención a la combinación de aminoácidos A1, A4 y Lii o la combinación de aminoácidos A4 y Lii, en el que la proteína contiene uno o más motivos de PPR que consisten cada uno en un polipéptido de 30 a 38 aminoácidos de longitud representado por la fórmula 1:

(Hélice A)-X-(Hélice B)-L (Fórmula 1)

(en la que: la hélice A es un resto de 12 aminoácidos de longitud capaz de formar una estructura de hélice α, y está representado por la fórmula 2:

A1-A2-A3-A4-A5-A6-A7-A8-A9-A10-A11-A12 (Fórmula 2)

en el que, en la fórmula 2, de A1 a A12 representan independientemente un aminoácido;

X no existe, o es un resto de 1 a 9 aminoácidos de longitud;

la hélice B es un resto de 11 a 13 aminoácidos de longitud capaz de formar una estructura de hélice α; y

L es un resto de 2 a 7 aminoácidos de longitud representado por la fórmula 3;

Lvii-Lvi-Lv-Liv-Liii-Lii-Li (Fórmula 3)

en el que, en la fórmula 3, los aminoácidos se numeran "i" (-1), "ii" (-2), y así sucesivamente desde el lado del extremo C-terminal,

con la condición de que de Liii a Lvii pueden no existir), y

la combinación de tres aminoácidos A1, A4 y Lii, o la combinación de dos aminoácidos A4 y Lii de un motivo de PPR contenido en la proteína es una combinación correspondiente a una base de ARN diana o una base de ARN específica que constituye una secuencia de bases diana.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/JP2012/077274.

Solicitante: KYUSHU UNIVERSITY, NATIONAL UNIVERSITY CORPORATION.

Inventor/es: NAKAMURA, TAKAHIRO, YAGI,YUSUKE, KOBAYASHI,KEIKO.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07K14/00 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07K PEPTIDOS (péptidos que contienen β -anillos lactamas C07D; ipéptidos cíclicos que no tienen en su molécula ningún otro enlace peptídico más que los que forman su ciclo, p. ej. piperazina diones-2,5, C07D; alcaloides del cornezuelo del centeno de tipo péptido cíclico C07D 519/02;   proteínas monocelulares, enzimas C12N; procedimientos de obtención de péptidos por ingeniería genética C12N 15/00). › Péptidos con más de 20 aminoácidos; Gastrinas; Somatostatinas; Melanotropinas; Sus derivados.
  • C12N15/09 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN (biocidas, productos que repelen o atraen a los animales nocivos, o reguladores del crecimiento de los vegetales, que contienen microorganismos virus, hongos microscópicos, enzimas, productos de fermentación o sustancias obtenidas por o extraídas de microorganismos o sustancias animales A01N 63/00; preparaciones de uso médico A61K; fertilizantes C05F ); PROPAGACION,CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Tecnología del ADN recombinante.
  • C12Q1/68 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2751126_T3.pdf

 

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