Procedimiento para el subtipado de tipos de linfoma por medio de perfiles de expresión.

Un procedimiento para seleccionar una opción de tratamiento para un sujeto con linfoma difuso de linfocitos B grandes similares a linfocitos B activados (ABC DLBCL),

un sujeto con linfoma difuso de linfocitos B grandes similares a linfocitos B del centro germinal (GCB DLBCL), un sujeto con linfoma primario mediastínico de linfocitos B (PMBL), un sujeto con linfoma de Burkitt (BL) o un sujeto con linfoma de células del manto (MCL), que comprende las etapas de:

(a) aislar un producto de expresión génica de una muestra de biopsia de un sujeto con linfoma;

(b) obtener datos de expresión génica digital a partir del producto de expresión génica aislado, en el que los datos de expresión génica digital comprenden datos para genes en una firma de expresión génica, y en el que la firma de expresión génica comprende al menos uno de los genes enumerados en la tabla 2;

(c) obtener opcionalmente datos de expresión génica digital de un primer y segundo conjunto de sondas de referencia, el segundo conjunto de sondas de referencia conocido para clasificar ABC DLBCL, GCB DLBCL, PMBL, BL o MCL;

(d) generar un promedio ponderado de los niveles de expresión de los genes a partir de la firma de expresión génica para obtener de este modo un valor de firma de expresión génica;

(e) calcular una puntuación predictiva basada en el valor de la firma de expresión génica usando la ecuación: **Fórmula**

en la que yi es una puntuación predictiva, xi son los recuentos para el gen i para el conjunto de sondas i, el conjunto de sondas i es de la muestra que se está sometiendo a análisis, xj es el recuento para el gen j para el conjunto de sondas j, el conjunto de sondas j es el conjunto de genes de normalización de la muestra que se está sometiendo a prueba, hj es el peso de normalización para el conjunto de sondas j como se enumera en la tabla 4, ri es el recuento para el gen i para el conjunto de sondas i en el primer conjunto de sondas de referencia, 30 y gi es el recuento de gen i para el conjunto de sondas i en el segundo conjunto de sondas de referencia, siendo los términos matemáticos con ri y gi igual a cero si no se obtienen datos de expresión génica digital de un primer y segundo conjunto de sondas de referencia;

(f) clasificar el sujeto como perteneciente a uno de los siguientes en base a la puntuación predictiva de (e): (i) ABC DLBCL, (ii) GCB DLBCL, (iii) PMBL, (iv) BL o (v) MCL;

(g) seleccionar una opción de tratamiento para el sujeto basada en la clasificación del sujeto en (f);

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2014/064161.

Solicitante: Hospital Clinic de Barcelona.

Nacionalidad solicitante: España.

Inventor/es: SCOTT, DAVID, WILLIAM, WILLIAMS, PAUL, MICHAEL, CAMPO GUERRI,ELIAS, OTT,GERMAN, ROSENWALD,ANDREAS, STAUDT,LOUIS M, RIMSZA,LISA, WEISENBURGER,DENNIS, DELABIE,JAN, SMELAND,ERLEND B, BRAZIEL,RITA M, JAFFE,ELAINE S, GASCOYNE,RANDY D, CONNORS,JOSEPH M, TUBBS,RAYMOND, WRIGHT,GEORGE W, GREINER,TIMOTHY C, COOK,JAMES ROBERT, FU,KAI, LIH,CHIH-JIAN, CHAN,WING C.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2738289_T3.pdf

 

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