ANTICUERPOS QUE SE UNEN AL ANTÍGENO TAT10772 ASOCIADO A TUMORES PARA EL DIAGNÓSTICO Y TRATAMIENTO DE UN TUMOR.

Anticuerpos que se unen al antígeno TAT10772 asociado a tumores para el diagnóstico y tratamiento de un tumor CAMPO DE LA INVENCIÓN [0001] La presente memoria se refiere a composiciones de materia útil para el diagnóstico y tratamiento de un tumor en mamíferos y a métodos de utilización de estas composiciones de materia para los mismos. ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN [0002] Los tumores malignos (cáncer) son la segunda causa de muerte en los Estados Unidos, después de las enfermedades del corazón (Boring et al., CA Cancer J Clin., 43:7 [(1993]). El cáncer se caracteriza por el incremento en el número de células anormales, o neoplásicas, derivadas de un tejido normal que proliferan para formar una masa tumoral, la invasión de tejidos adyacentes por estas células tumorales neoplásicas, y la generación de células malignas que finalmente se extienden a través de la sangre o el sistema linfático hasta nódulos linfáticos regionales y hasta puntos distantes a través de un proceso llamado metástasis. En un estado canceroso, una célula prolifera bajo condiciones en las que no crecerían células normales. El cáncer se manifiesta en una gran variedad de formas, caracterizadas por diferentes grados de invasión y agresividad. [0003] En los intentos por descubrir dianas celulares eficaces para el diagnostico y la terapia contra el cáncer, los investigadores han buscado identificar polipéptidos transmembrana u otros polipéptidos asociados a membranas que se expresan específicamente en la superficie de uno o más tipos particulares de células cancerosas en comparación con una o más células no cancerosas normales. A menudo, dichos polipéptidos asociados a membrana se expresan de manera más abundante en la superficie de las células cancerosas en comparación con la superficie de las células no cancerosas. La identificación de dichos polipéptidos antígenos de la superficie celular asociados a tumores ha proporcionado la capacidad de reconocer específicamente células cancerosas para la destrucción a través de terapias basadas en anticuerpos. En este aspecto, cabe indicar que la terapia basada en anticuerpos se ha demostrado muy eficaz en el tratamiento de ciertos cánceres. Por ejemplo, HERCEPTIN® y RITUXAN® (ambas de Genentech Inc, South San Francisco, California) son anticuerpos que se han utilizado satisfactoriamente para tratar el cáncer de mama y el linfoma de no Hodgkin, respectivamente. Más específicamente, HERCEPTIN® es un anticuerpo monoclonal humanizado derivado de ADN recombinante que se une selectivamente al dominio extracelular del protooncogén del receptor 2 del factor de crecimiento epidérmico humano (HER2). Se observa la sobreexpresión de la proteína HER2 en el 25-30% de cánceres de mama primarios. RITUXAN® es un anticuerpo monoclonal murino/humano quimérico modificado genéticamente dirigido contra el antígeno CD20 hallado en la superficie de linfocitos B normales y malignos. Estos anticuerpos se producen recombinantemente en células CHO. [0004] A pesar de los avances identificados anteriormente en la terapia del cáncer de mamífero, existe una gran necesidad para agentes de diagnóstico y terapéuticos adicionales capaces de detectar la presencia de un tumor en un mamífero y para inhibir de manera eficaz el crecimiento de células neoplásicas, respectivamente. Por consiguiente, un objetivo de la presente invención es identificar: (1) polipéptidos asociados a la membrana celular que se expresan de manera más abundante en uno o más tipos de células cancerosas en comparación con células normales o en otras células cancerosas diferentes, y utilizar estos polipéptidos, y sus ácido nucleicos codificantes, para producir composiciones de materia útiles en el tratamiento terapéutico y la detección diagnóstica de cáncer en mamíferos [0005] WO 2004/035537 describe secuencias completas y parciales de CA125 (TAT 10772) y anticuerpos par alas mismas. [0006] Sweet et al., Gynecologic Oncology 34, 305-311(1989) describe un anticuerpo monoclonal anti-CA125 de ratón OC125 conjugado con daunorubicina que elimina células de cáncer de ovario humano. DESCRIPCIÓN RESUMIDA DE LA INVENCIÓN A.   [0007] Se describe aquí polipéptidos celulares (y sus ácidos nucleicos codificantes o fragmentos de los mismos) que son expresados en mayor grado en la superficie de o por uno o más tipos de células cancerosas en comparación con la superficie de o por uno o más tipos de células no cancerosas normales. Estos polipéptidos se refieren aquí como polipéptidos antigénicos diana asociados a tumores (polipéptidos TAT) y se espera que sirvan como dianas eficaces para la terapia y el diagnóstico contra el cáncer en mamíferos; una molécula de ácido nucleico aislada que tiene una secuencia de nucleótidos que codifica un polipéptido antigénico diana asociado a tumores o fragmento del mismo (un polipéptido TAT); una secuencia de nucleótidos que tiene por lo menos aproximadamente un 80% de identidad en la secuencia de ácidos nucleicos, alternativamente por lo menos aproximadamente un 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 2   89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ó 100% de identidad de la secuencia de ácidos nucleicos con (a) una molécula de ADN que codifica un polipéptido TAT de longitud completa que tiene una secuencia de aminoácidos tal como se describe aquí, una secuencia de aminoácidos del polipéptido TAT que carece del péptido señal tal como se describe aquí, un dominio extracelular de un polipéptido TAT transmembrana, con o sin el péptido señal, tal como se describe aquí o cualquier otro fragmento específicamente definido de una secuencia de aminoácidos de polipéptido TAT de longitud completa tal como se describe aquí, o (b) el complemento de la molécula de ADN de (a); una secuencia de nucleótidos que tiene por lo menos aproximadamente un 80% de identidad en la secuencia de ácidos nucleicos, alternativamente por lo menos aproximadamente un 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ó 100% de identidad en la secuencia de ácidos nucleicos, con (a) una molécula de ADN que comprende la secuencia codificante de un ADNc del polipéptido TAT de longitud completa tal como se describe aquí, la secuencia codificante de un polipéptido TAT que carece del péptido señal tal como se describe aquí, la secuencia codificante de un dominio extracelular de un polipéptido TAT transmembrana, con o sin el péptido señal, tal como se describe aquí o la secuencia codificante de cualquier otro fragmento específicamente definido de la secuencia de aminoácidos del polipéptido TAT de longitud completa tal como se describe aquí o (b) el complemento de la molécula de ADN de (a) una molécula de ácido nucleico aislada que comprende una secuencia de nucleótidos que tiene por lo menos aproximadamente un 80% de identidad en la secuencia de ácidos nucleicos, alternativamente por lo menos aproximadamente un 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ó 100% de identidad en la secuencia de ácidos nucleicos con (a) una molécula de ADN que codifica el mismo polipéptido maduro codificado por la región codificante de longitud completa de cualquiera de los ADNcs de proteína humana depositados con la ATCC tal como se describe aquí, o (b) el complemento de la molécula de ADN de (a) una molécula de ácido nucleico aislada que comprende una secuencia de nucleótidos que codifica un polipéptido TAT que presenta el dominio transmembrana eliminado o inactivado, o es complementaria a dicha secuencia de nucleótidos codificante, donde el dominio o dominios transmembrana de dicho polipéptido o polipéptidos se describen aquí. Por lo tanto, se contemplan los dominios extracelulares solubles de los polipéptidos TAT descritos aquí: moléculas de ácido nucleico aisladas que se hibridan a (a) una secuencia de nucleótidos que codifica un polipéptido TAT que tiene una secuencia de aminoácidos de longitud completa tal como se describe aquí, una secuencia de aminoácidos del polipéptido TAT que carece del péptido señal tal como se describe aquí, un dominio extracelular de un polipéptido TAT transmembrana, con o sin el péptido señal, tal como se describe aquí, o cualquier otro fragmento específicamente definido de una secuencia de aminoácidos del polipéptido TAT de longitud completa tal como se describe aquí, o (b) el complemento de la secuencia de nucleótidos de (a). En este aspecto, una realización de la presente invención se refiere a fragmentos de una secuencia codificante del polipéptido TAT de longitud completa, o el complemento de la misma, tal como se describe aquí, que pueden ser útiles como, por ejemplo, sondas de hibridación útiles como, por ejemplo, sondas de diagnóstico, cebadores PCR, sondas de oligonucleótidos... [Seguir leyendo]

1. Anticuerpo aislado que comprende tres regiones hipervariables de cadena ligera (HVR-L1, HVR-L2 y HVR-L3) y tres regiones hipervariables de cadena pesada (HVR-H1, HVR-H2 y HVR-H3), en el que: (a) HVR-L1 comprende la secuencia de aminoácidos de SEC ID NO:119; (b) HVR-L2 comprende la secuencia de aminoácidos de cualquiera de las SEC ID NOS:120-121; (c) HVR-L3 comprende la secuencia de aminoácidos de SEC ID NO:122; (d) HVR-H1 comprende la secuencia de aminoácidos de SEC ID NO:123; (e) HVR-H2 comprende la secuencia de aminoácidos de cualquiera de las SEC ID NOS:124-127; y (f) HVR-H3 comprende la secuencia de aminoácidos de cualquiera de las SEC ID NOS:128-183, cuyo anticuerpo se une a un epítopo que tiene los aminoácidos 3765-6397 del polipéptido que tiene la secuencia mostrada como SEC ID NO:2. 2. Anticuerpo aislado según la reivindicación 1, donde HVR-H3 comprende la secuencia de aminoácidos de cualquiera de las SEC ID NOS: 129-183. 3. Anticuerpo aislado según la reivindicación 1, donde HVR-H3 comprende la secuencia de aminoácidos de cualquiera de las SEC ID NOS: 131, 142, 144, 152, 155, 174, 180 y 183. 4. Anticuerpo aislado según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, que comprende además una o ambas de (i) una secuencia de armazón de consenso humana aceptora de VH de cualquiera de las SEC ID NOS:184-193, y (ii) una secuencia de armazón de consenso humana aceptora de VL de cualquiera de las SEC ID NOS:194-197. 5. Anticuerpo aislado según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, que comprende además una o más de (i) una secuencia de armazón de consenso humana aceptora de VH de SEC ID NOS: 192 o 193, y (ii) una secuencia de armazón de consenso humana aceptora de VL de SEC ID NO:194. 6. Anticuerpo aislado según la reivindicación 5, que comprende además ambas de (i) una secuencia de armazón de consenso humana aceptora de VH de SEC ID NOS: 192 o 193, y (ii) una secuencia de armazón de consenso humana aceptora de VL de SEC ID NO:194. 7. Anticuerpo según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, que comprende una o ambas de (i) la secuencia de VH mostrada tal como se muestra en cualquiera de SEC ID NOS:198-209 y (ii) la secuencia de VL mostrada como SEC ID NO:211. 8. Anticuerpo según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, que comprende una o ambas de (i) la secuencia de VH mostrada como SEC ID NO: 208 y (ii) la secuencia de VL mostrada como SEC ID NO:211. 9. Anticuerpo según la reivindicación 1 que es un fragmento de anticuerpo, un anticuerpo quimérico o un anticuerpo humanizado. 10. Anticuerpo según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, que está conjugado a un agente inhibidor del crecimiento o un agente citotóxico; un agente citotóxico que es una toxina, un antibiótico, un isótopo radioactivo o una enzima nucleolítica; o una toxina que es un maitansinoide o una caliqueamicina. 11. Anticuerpo según la reivindicación 10, que induce la muerte de una célula a la que se une, donde dicha célula es opcionalmente una célula de cáncer de ovario. 12. Anticuerpo según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 11, que se marca para su detección. 13. Método de diagnóstico de la presencia de un tumor en un mamífero, comprendiendo dicho método poner en contacto una muestra de prueba de células de tejido obtenidas de dicho mamífero con un anticuerpo según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 12 y detectar la formación de un complejo entre dicho anticuerpo y un polipéptido TAT10772 que tiene la secuencia de aminoácidos mostrada en SEC ID NO:2 en la muestra de prueba, donde la formación de un complejo es indicativo de la presencia de un tumor en dicho mamífero, donde dicho tumor es opcionalmente un tumor de ovario, mama o páncreas. 14. Anticuerpo según la reivindicación 10 para utilizar en un método de inhibición del crecimiento de una célula cancerosa que expresa un polipéptido TAT10772 que tiene la secuencia de aminoácidos mostrada en SEC ID NO: 2, comprendiendo dicho método poner en contacto dicha célula con dicho anticuerpo, donde la unición de dicho anticuerpo a dicho polipéptido provoca la inhibición del crecimiento de dicha célula. 15. Anticuerpo según la reivindicación 10 para utilizar en un método de tratamiento terapéutico de un mamífero que   tiene un tumor canceroso que comprende células que expresan un polipéptido TAT10772 que tiene la secuencia de aminoácidos mostrada en la SEC ID No. 2, comprendiendo dicho método administrar a dicho mamífero una cantidad terapéuticamente eficaz de dicho anticuerpo. 16. Anticuerpo para utilizar según la reivindicación 14 ó 15, donde dicha célula es una célula de cáncer de ovario, o dicho tumor canceroso es un tumor de ovario. 17. Conjugado de anticuerpo y fármaco que comprende un anticuerpo unido covalentemente por un enlazador a uno o más grupos farmacológicos, teniendo el compuesto la fórmula: donde: Ab-(L-D)p Ab es un anticuerpo según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9; L es un enlazador: D es un grupo farmacólogico; y p es 1 a 20. 18. Conjugado de anticuerpo y fármaco según la reivindicación 17, donde D es un maitansinoide, una auristatina; un maitansinoide que es DM1, o una auristatina que es MMAE o MMAF; y/o L es MC-val-cit-PAB, MC, SMCC, SPP, o BMPEO; y/o que tiene la fórmula Ab-MC-val-cit-PAB-MMAE, Ab-MC-val-cit-PAB-MMAF, Ab-MC-MMAE, Ab-MC- MMAF, Ab-SPPDM1 o Ab-SMCC-DM1. 19. Conjugado de anticuerpo y fármaco según la reivindicación 18, donde el anticuerpo comprende una HVR-L1 que comprende la secuencia de aminoácidos SEC ID NO:119, una HVR-L2 que comprende la secuencia de aminoácidos de SEC ID NO:120 o 121, una HVRL3 que comprende la secuencia de aminoácidos de SEC ID NO:122, una HVR- H1 que comprende la secuencia de aminoácidos de SEC ID NO:123, una HVR-H2 que comprende la secuencia de aminoácidos de cualquiera de las SEC ID NOS:124-127, y una HVR-H3 que comprende la secuencia de aminoácidos de SEC ID NO:128; o tanto la secuencia VH mostrada como SEC ID NO:11 como la secuencia VL mostrada como SEC ID NO:9. 20. Compuesto de conjugado de anticuerpo y fármaco según cualquiera de las reivindicaciones 17 a 19, donde el anticuerpo se une al enlazador a través de un tiol de cisteína del anticuerpo. 21. Formulación farmacéutica que comprende el conjugado de anticuerpo y fármaco según cualquiera de las reivindicaciones 17 a 20, y (i) un diluyente, portador o excipiente farmcéuticamente aceptable; o (ii) un diluyente, portador o excipiente farmacéuticamente aceptable y una cantidad terapéuticamente eficaz de un agente quimioterapéutico seleccionado entre letrozol, oxaliplatino, doxetaxel, 5-FU, leucovorina, lapatinib, y gemcitabina. 22. Método de inhibición de la proliferación celular que comprende tratar células tumorales de mamífero que expresan un polipéptido TAT10772 que tiene la secuencia de aminoácidos mostrada en la SEC ID NO: 2 en un medio de cultivo celular con un compuesto conjugado de anticuerpo-fármaco según cualquiera de las reivindicaciones 17 a 20, mediante lo cual se inhibe la proliferación de las células tumorales; donde las células tumorales de mamífero son opcionalmente células tumorales de ovario. 23. Formulación farmacéutica según la reivindicación 21 para utilizar en un método de tratamiento de un cáncer que expresa el polipéptido TAT10772, donde el polipéptido TAT10772 tiene la secuencia de aminoácidos mostrada en SEC ID NO: 2; donde el cáncer es opcionalmente cáncer de próstata, cáncer del tracto urinario, cáncer de páncreas, cáncer de pulmón, cáncer de mama, cáncer de colon o cáncer de ovario. 24. Formulación farmacéutica para utilizar según la reivindicación 23, donde el cáncer es cáncer de ovario, mama o páncreas. 25. Formulación farmacéutica para utilizar según la reivindicación 23 ó 24, donde dicho método comprende además la administración de un agente quimioterapéutico, donde el agente quimioterapéutico se selecciona entre letrozol, oxaliplatino, doxetaxel, 5-FU, leucovorina, lapatinib, y gemcitabina. 26. Método in vitro para determinar la presencia de un polipéptido TAT10772 que tiene la secuencia de aminoácidos mostrada en SEC ID NO. 2 en una muestra que comprende una célula cancerosa sospechosa de expresar dicho polipéptido, comprendiendo dicho método exponer dicha muestra a un anticuerpo según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 12 y determinar la unión de dicho anticuerpo a dicho polipéptido en dicha muestra, donde la unión del anticuerpo a dicho polipéptido es indicativo de la presencia de dicho polipéptido en dicha muestra. 27. Método según la reivindicación 26, donde dicha célula cancerosa es una célula de cáncer de páncreas, mama u ovario. 116   Figura 1A 117   Figura 1B 118   Figura 1C 119   Figura 1D   Figura 1E 121   Figura 2A 122   Figura 2B Secuencia de repetición de mucina: Aminoácidos 3765-6397 123   Figura 3 124   Figura 4   Figura 5 126   Figura 6A 127   Figura 6B 128   Figura 7 129   Figura 8   Figura 9 131   Figura 10 132   Figura 11 133   Figura 12 134   Figura 13   Figura 14 136   Figura 15 137   Figura 16 138   Figura 17 139   Figura 18A   Figura 18B 141   Figura 19 142   Figura 20 143   Figura 21A 144   Figura 21B   Figura 22 146   Figura 23 147   Figura 24 148   Figura 25 DO a 450/620 nm 149   Figura 26 Proliferación de OVCAR-3   Figura 27 Proliferación de OVCAR-3 151   Figura 28 Proliferación de OVCAR-3 152   Figura 29 Proliferación celular 153   Figura 30 Proliferación celular 154   Figura 31 Proliferación celular   Figura 32 156   Figura 33 157   Figura 34 158   Figura 35 159   Figura 36   Figura 37 161