Sondas fluorescentes para la detección de ADN mediante hibridación con una sensibilidad mejorada y baja señal de fondo.
(10/12/2014) Una sonda de oligonucleótidos que comprende una porción de oligonucleótido que tiene un extremo 3' y un extremo 5', una unidad estructural de ligador del surco menor anexada a al menos una de dichas unidades de nucleótidos a través de un grupo enlazante el cual liga covalentemente la unidad estructural ligadora del surco menor al oligonucleótido y un fluoróforo y detenedor, teniendo dicha sonda la fórmula;**Fórmula**
en donde MB es un ligador del surco menor; Q es un detenedor; FI es un fluoróforo; [A-B]n representa un oligómero de ácido nucleico que tienen n unidades, en donde n es un entero de 5 a 50; cada A representa independientemente un componente de esqueleto de ácido nucleico seleccionado del grupo que…
Colorantes fluorescentes de fosfonato y conjugados.
(26/03/2014) Un reactivo colorante fluorescente que tiene la fórmula:**Fórmula**
en donde
FI es un componente colorante fluorescente;
Lf es un grupo enlazante que tiene un miembro unido seleccionado del grupo que consiste en un grupo funcional protegido o no protegido, un grupo reactivo, un resto enlazante polifuncional, un resto de fosforamidita y un soporte sólido;
el subíndice m es un número entero de 0 a 1;
Pz es un grupo fosfonato de ión dipolar protegido que tiene la fórmula (a) o (b):
en donde la línea ondulada indica la unión directa a un carbono sp2 de dicho componente colorante fluorescente;
L es un grupo enlazante;
cada…
Métodos y reactivos para detectar la inhibición de la fluorescencia.
(28/08/2013) Un compuesto de sonda de oligonucleótidos con la fórmula siguiente:
donde
Ar1 y Ar2 son, cada uno de ellos independientemente, un grupo arilo sustituido o no sustituido, y uno de los elementos Ar1 o Ar2 es directa o indirectamente sustituido por un grupo arilo sustituido (Ar3), donde Ar3 amplía la capacidad de resonancia del sistema aromático Ar1-N≥N-Ar2 y, por tanto, aumenta la absorbancia de longitud de onda máxima del compuesto;
MGB es un grupo de unión al surco menor;
FL es un grupo fluorescente que tiene una máxima de emisión en la región de 400 a 900 nm;
K es un grupo de unión cíclico o acíclico que tiene entre 1 y 30 átomos del esqueleto seleccionados entre C, N, O, S y P;
W es un grupo de unión que tiene entre 3 y 100 átomos del esqueleto seleccionados entre C, N, O, S, Si y P, siendo dicho grupo de unión cíclico, acíclico,…
Oligonucleótidos modificados para discriminación de desapareamiento.
(11/07/2012) Un oligonucleótido modificado que comprende al menos una base de la base de pirimidina 5-sustituida y al menos una base de pirazolo[3,4-d]pirimidina no sustituida o 3-sustituida, en el cual dicha al menos una base de pirimidina 5-sustituida tiene una fórmula que consiste en:
en la que al menos un base de pirazolo[3,4-d]pirimidina no sustituida o 3-sustituida está que consiste en en la que cada uno de los grupos X1 , X2 y X3 es un miembro seleccionado independientemente del grupo que consiste en H, OH, NH2 y un grupo amino protegido; y
cada uno de dichos grupos R1 y R4 es un miembro seleccionado independientemente del grupo que consiste en heteroalquilo(C1-C12), heteroalquenilo(C2-C12), heteroalquinilo(C2-C12), -O-(alquilo C1-C12), -O-(alquenilo C2-C12), -O- (alquinilo C2-C12),…
Reactivos y procedimientos para la detección por desactivación de la fluorescencia.
(01/06/2012) Un conjugado de oligonucleótido que tiene la fórmula
FL-ODN-Q
en la que ODN es un oligonucleótido o ácido nucleico;
FL es un resto fluoróforo unido covalentemente al ODN a través de un enlazador que tiene la longitud de 0 a 30 átomos, y
Q es un resto desactivador unido covalentemente al ODN a través de un enlazador que tiene la longitud de 0 a 30 átomos, teniendo el resto desactivador la estructura **Fórmula**
en la que R0, R1, R2, R3 y R4 son independientemente -H, halógeno, -O(CH2)nCH3, -(CH2)nCH3 en la que n= 0 a 5, -NO2, -SO3, -N[(CH2)n'CH3]2 en la que n'= 0 a 5 o -CN, y R5= -H o -(CH2)n''CH3 en la que n"= 0 a 5, y en la que el resto desactivador se une al enlazador a través del enlace de valencia designado a.
MÉTODOS DE AMPLIFICACIÓN.
(10/10/2011) Un método para el control continuo de la amplificación de polinucleótidos, que comprende: (a) combinar una muestra que contiene una secuencia diana, con uno o más cebadores de oligonucleótido complementarios a regiones de la secuencia diana, una enzima de polimerización, sustratos de nucleótido, y un conjugado de oligonucleótido que tiene la formula: en la que MB es un ligando del surco menor, n es 0 o 1, uno de los grupos Fl A y Fl B es un fluoróforo y el otro de los grupos Fl A y Fl B es un apagador, W es un grupo de enlace trivalente, ODN es un oligonucleótido o un oligonucleótido modificado, K es una unión o un grupo de enlace, en donde la secuencia de ODN solapa de 1 a 7 bases con una secuencia de cebador de al menos uno de dichos cebadores y la porción de ODN tiene una secuencia complementaria con una porción…
OLIGONUCLEÓTIDOS MODIFICADOS PARA LA DISCRIMINACIÓN DE DESAPAREAMIENTOS.
(20/01/2011) Un oligonucleótido modificado que comprende al menos una base de pirazolo[3,4 d]pirimidina no sustituida y al menos una base de pirazolo[3,4-d]pirimidina 3-sustituida
OLIGOMEROS NO AGREGANTES Y SIN BLOQUEO DE LA FLUORESCENCIA QUE COMPRENDEN ANALOGOS DE NUCLEOTIDOS; METODOS DE SINTESIS Y USO DE LOS MISMOS.
(25/08/2010) Un conjugado que comprende:
(a) un polímero que comprende una serie de unidades de monómero; y
(b) un fluoróforo unido covalentemente a ellos,
en el que uno o más de las unidades de monómero comprende un análogo de base, en el que el análogo de base se selecciona de entre el grupo que consiste de pirazolopirimidinas, como el análogo de bases retiene la especificidad de emparejamiento de bases de las bases para las que se sustituyen, y conduce a una reducción en el bloqueo de la fluorescencia del fluoróforo y/o auto-asociación del polímero reducida