(24/07/2019) Un método para corregir el sesgo de amplificación en una reacción de PCR de una muestra, el método comprende: A) amplificar por PCR múltiple, secuenciar, y cuantificar las lecturas de salida de: (i) moléculas plantilla biológicas que comprenden secuencias oligonucleotídicas de CDR3 reordenadas de loci de receptor de células T (TCR) de células T o loci de inmunoglobulina (Ig) de células B, cada secuencia comprende un segmento V de TCR o IG y un segmento J de TCR o IG, para obtener un número total de lecturas de secuencias biológicas de salida; y (ii) moléculas plantilla sintéticas que comprenden cada una un segmento V de TCR o Ig y un segmento J de TCR o IG, secuencias adaptadoras universales de cebadores directos y/o inversos, uno o más códigos de barras que identifican las moléculas plantilla…

(24/07/2019) Un kit de ensayo para uso en un método para la detección de la actividad de la polimerasa como un indicador de la presencia de un microrganismo en una muestra que comprende: (a) un sustrato de ADN no ligable que consta de una hebra de oligonucleótido en sentido y una hebra de oligonucleótido antisentido, en la que las dos hebras se sobreponen para formar una región de doble hebra y una porción de hebra sencilla del oligonucleótido antisentido que actúa como una plantilla son la hebra de oligonucleótido en sentido de la región de doble hebra funcionando como un cebador para crear un producto de extensión en presencia de la actividad de la polimerasa; (b) un cebador reverso que hibrida específicamente con el producto de la extensión…

(17/07/2019) Un método para probar un efecto terapéutico de una terapia contra el cáncer con al menos un fármaco antineoplásico seleccionado entre fármacos antineoplásicos que comprenden como principio activo un anticuerpo anti-CD4, fármacos antineoplásicos que comprenden como principio activo un antagonista de una molécula inhibidora del punto de control inmunitario y fármacos antineoplásicos que comprenden como principio activo un agonista de una molécula coestimuladora de punto de control inmunitario, comprendiendo dicho método investigar la expresión de: al menos un receptor de punto de control inmunitario seleccionado entre el grupo que consiste en PD-1, CD137 y TIM-3; CD8; y al menos una molécula de superficie celular seleccionada…

(17/07/2019) Uso de una composición para predecir la susceptibilidad al cetuximab en el cáncer de colon, comprendiendo la composición un agente que mide un nivel de expresión del gen de RON (recepteur d'origine nantais, N.º de acceso de Gene Bank NM_002447.1); o un nivel de expresión o actividad de una proteína del mismo, y un agente que mide un nivel de expresión de uno o más genes seleccionados entre el grupo que consiste en los genes KRAS (homólogo de oncogén vírico de sarcoma de rata Kirsten V-Ki-ras2, N.º de acceso de Gene Bank NM_033360.2), NRAS (homólogo de oncogén vírico de neuroblastoma RAS (v-ras), N.º de acceso de Gene Bank NP_002515.1), BRAF (homólogo de…

(17/07/2019) Un método para detectar un cáncer (o cánceres), que se aplica a una muestra separada de un cuerpo vivo y que comprende medir una expresión de calmegina; en donde el cáncer es al menos uno seleccionado del grupo que consiste en tumor cerebral; carcinomas de células escamosas de cabeza, cuello, pulmón, útero y esófago; melanoma; adenocarcinomas de pulmón y útero; cáncer renal; tumor mixto maligno; carcinoma hepatocelular; carcinoma de células basales; epulis acantomatoso; tumor intraoral; adenocarcinoma perianal; tumor de la glándula anal; carcinoma apocrino de la glándula anal; tumor de células de Sertoli; cáncer de vulva; adenocarcinoma sebáceo;…

(10/07/2019) Procedimiento de extracción de componentes contenidos en una muestra biológica en forma líquida, siendo dichos componentes aptos a fijarse sobre unas partículas magnéticas, comprendiendo el procedimiento: - una fase de mezcla de la muestra con las partículas magnéticas; - una fase de aspiración de la mezcla desde un pocillo en un cono de pipeta tubular que comprende una punta destinada al pipeteo de líquido; - una fase de captura de las partículas magnéticas sobre una pared interna del cono de pipeta ; * aplicando un primer campo magnético al cono de pipeta , siendo dicho campo apto para atraer y mantener las partículas magnéticas en una zona predeterminada del cono de pipeta , denominada de "captura" por encima de la punta de esta; * y aplicando al menos un ciclo de aspiración y de expulsión de…

(10/07/2019) Uso de un adaptador vesicular del oligonucleótido para la construcción de una biblioteca de ácidos nucleicos monocatenarios cíclicos en donde dicho adaptador comprende una región bicatenaria emparejada en 5' en un primer terminal del adaptador; una región bicatenaria emparejada en 3' en un segundo terminal del adaptador, que comprende una primera cadena y una segunda cadena complementarias entre sí, en la que la primera cadena comprende un saliente en el extremo 3' de la misma y la segunda cadena comprende una base fosforilada en su extremo 5' para proporcionar un terminal adherente y una región vesicular…

(10/07/2019) Método para procesar una muestra biológica que contiene células de un sujeto para el análisis de ácido nucleico de células microbianas en la muestra biológica que comprende, o que consiste esencialmente en: i) poner la muestra biológica obtenida de un sujeto directamente en contacto con un pequeño volumen menor de 1 ml de una disolución de lisis celular diferencial que consiste esencialmente en SDS en agua o solución salina para obtener una concentración final del 0,1 al 1% de SDS en dicha muestra y opcionalmente un agente antiespumante y/o un anticoagulante, en el que el volumen inicial de muestra biológica es mayor de 3 ml; ii)…

(03/07/2019) Un método para determinar el nivel de expresión de una molécula de ácido nucleico específica en una muestra biológica, el método que comprende las etapas de: (i) proporcionar un lote A que comprende ADN o ADNc aislado/obtenido de la muestra biológica; (ii) proporcionar tres o más alícuotas del lote A proporcionado en la etapa (i) y realizar unan reacción en cadena de la polimerasa independiente (PCR) con cada una de las tres o más alícuotas para amplificar la molécula de ácido nucleico específica, de esta manera proporcionando tres o más lotes B que comprenden la molécula de ácido nucleico específica amplificada; y (iii) mezclar cantidades iguales de los tres o más lotes B, de esta manera proporcionando un lote C,…

(03/07/2019) Un método de enriquecimiento que comprende: a) proporcionar i) una emulsión que comprende uno o más compartimentos acuosos en aceite, comprendiendo al menos algunos de dichos compartimentos reactivos de PCR, un primer cebador de PCR inmovilizado en una perla de emulsión, un segundo cebador de PCR biotinilado en solución y plantilla de secuencia de nucleótidos; y ii) perlas de enriquecimiento, en donde dichas perlas de enriquecimiento son diferentes de dichas perlas de emulsión en dichos compartimientos; b) exponer dicha emulsión a condiciones para amplificar al menos parte de dicha plantilla en al menos parte de dichas perlas de emulsión para producir una plantilla amplificada en al menos parte de dichos compartimentos, en donde un cordón…

(03/07/2019) Composición que comprende un par aislado de cebadores polinucleotídicos que comprenden, como mínimo, 10 pero menos de 600, residuos de nucleótidos contiguos de una secuencia codificante de una proteína IDH1 o IDH2 humana, que se encuentra en un tumor humano o su complemento, en la que en uno de dicho par de cebadores polinucleotídicos dichos, como mínimo, 10 residuos de ácido nucleico contiguos comprenden: los nucleótidos 394 y/o 395 de la secuencia codificante de IDH1, en la que dichos nucleótidos no son C o T en el nucleótido 394 y/o no son G en el nucleótido 395, respectivamente; el nucleótido 515 de la secuencia codificante de IDH2, en la que dicho nucleótido 515 no es una G; el complemento de los nucleótidos 394 y/o 395 de la secuencia codificante de IDH1, en la que dichos…

(03/07/2019) Un método para detectar un analito mediante el movimiento de partículas ancladas, comprendiendo el método: poner una matriz que contiene el analito en contacto con un dispositivo de sensor que tiene una superficie y una molécula de anclaje unida en un primer extremo a la superficie y unida en un segundo extremo a una partícula funcionalizada, donde la partícula funcionalizada está funcionalizada con un primer resto y la superficie está funcionalizada con un segundo resto, de manera que la partícula funcionalizada tiene un primer estado en el que la partícula funcionalizada está unida a la superficie a través del primer resto y el segundo resto, y un segundo…

(03/07/2019) Un método de evaluación de si un sujeto sufre síndromes mielodisplásicos o un tumor mielógeno, comprendiendo el método la etapa de detección de una mutación genética en al menos un gen entre el gen U2AF35, el gen ZRSR2, el gen SRSF2 y el gen SF3B1 usando una muestra que contiene genes humanos del sujeto, en el que se evalúan síndromes mielodisplásicos o un tumor mielógeno en el sujeto, en un caso en el que se detecta al menos una de las siguientes: una mutación del gen U2AF35 resultando en una sustitución de S con F o Y en un residuo aminoácido en posición 34 de una proteína traducida del gen U2AF35, comparándose la secuencia de aminoácidos de la proteína con la secuencia de aminoácidos de una proteína traducida del ARNm con…

(27/06/2019) Método de ensayo único para la detección de la presencia o ausencia de variación en el número de copias (VNC) de una región genómica y presencia o ausencia de uno o más polimorfismos en una muestra mixta usando un ensayo único, en el que la muestra mixta comprende ácidos nucleicos libres de células tanto fetales como maternas y en el que la muestra mixta es plasma materno o suero materno; comprendiendo el método de ensayo las etapas de: introducir un primer conjunto de oligonucleótidos de secuencia fija a la muestra mixta en condiciones que permiten que los oligonucleótidos de secuencia fija se hibriden específicamente con regiones complementarias…

(26/06/2019) Un método para remover especies de alta abundancia de una pluralidad de moléculas de ácido nucleico, que comprende: hibridar una pluralidad de primeros oligonucleótidos que comprenden un resto de unión con una primera pluralidad de moléculas de ácido nucleico, en donde la primera pluralidad de moléculas de ácido nucleico comprende al menos una especie de alta abundancia; extender la pluralidad de primeros oligonucleótidos para generar una pluralidad de cadenas complementarias de la primera pluralidad de moléculas de ácido nucleico que comprenden el resto de unión; desnaturalizar una pluralidad de moléculas de ácido nucleico de doble cadena que comprenden la pluralidad…

(26/06/2019) Un procedimiento para modificar genéticamente un locus génico endógeno de la región variable de cadena pesada de inmunoglobulina en una célula madre embrionaria (ES) de ratón, en donde la modificación genética comprende la inserción de los segmentos génicos V, D y J de cadena pesada de inmunoglobulina humana, comprendiendo dicho procedimiento: (a) obtener un fragmento genómico clonado que contiene los segmentos génicos humanos V, D y J; (b) usar la recombinación homóloga bacteriana para modificar genéticamente el fragmento genómico clonado de (a) para crear un vector dirigido para su uso en la célula ES; (c) introducir el vector dirigido de (b) en la célula ES para modificar genéticamente el locus génico endógeno de la región variable de cadena pesada de la…

(24/06/2019) Un método implementado por ordenador para predecir un resultado clínico relacionado con un paciente que padece cáncer colorrectal, que comprende: (a) determinar un valor predictivo mediante el uso de valores de muestra de pacientes para al menos un marcador seleccionado del grupo que consiste en marcadores tumorales, marcadores inmunes, marcadores de fase aguda, y al menos un marcador que (i) se selecciona del grupo que consiste en un marcador de matriz extracelular (ECM), un marcador que es indicativo de la síntesis de matriz extracelular (fibrogénesis), y marcador que es indicativo de la degradación de…

(20/06/2019) Método para el diagnóstico de cánceres de próstata, que comprende las etapas de: a. determinar una pluralidad de valores de expresión de cada uno de un grupo de genes predictivos, en una muestra de tejido prostático aislada, b. proporcionar a un algoritmo predictivo entrenado, que funciona en espacios vectoriales, un vector de entrada que contiene en elementos vectoriales respectivos cada valor de expresión de dicha pluralidad de valores de expresión en dicha muestra de tejido prostático que va a analizarse; c. procesar el vector de entrada, mediante el algoritmo predictivo entrenado; d. generar un resultado representativo de dicho diagnóstico para dicha muestra de tejido prostático; en el que: …