Compensación para interferencia espectral en la amplificación multiplex de ácidos nucleicos.

Método que comprende:

un proceso de calibración que comprende:



- realizar al menos una amplificación de ácido nucleico singleplex de una muestra de ácido nucleico usando una sonda de detección, en el que la amplificación de ácido nucleico se produce durante una pluralidad de periodos de interrogación;

- a partir de la amplificación de ácido nucleico, adquirir datos de amplificación que indican una cantidad de ácido nucleico presente para cada uno de la pluralidad de periodos de interrogación; y

- en función de los datos de amplificación, determinar un valor de corrección de la interferencia asociado a un vecino espectral más cercano a la sonda de detección para reducir la interferencia espectral del vecino espectral más cercano;

comprendiendo además el método un análisis de la amplificación de ácido nucleico que incluye aplicar el valor de corrección de la interferencia obtenido del proceso de calibración a los datos de amplificación recogidos de la amplificación multiplex de ácidos nucleicos de muestras de ácido nucleico,

en el que el valor de corrección de la interferencia determinado es la proporción de una señal detectada para el vecino espectral más cercano con respecto a la señal detectada para los datos de amplificación de la sonda de detección,

en el que el vecino espectral más cercano se determina basándose en una distancia desde un pico de fluorescencia del colorante objetivo de la sonda de detección hasta el pico de fluorescencia de un colorante objetivo vecino,

en el que el pico de fluorescencia del colorante objetivo de la sonda de detección y el pico de fluorescencia del colorante objetivo del vecino espectral más cercano están separados por una distancia menor que una distancia umbral, y

en el que aplicar el valor de corrección de la interferencia a los datos de amplificación comprende:

- sustraer una señal de fondo de la señal detectada para los datos de amplificación para obtener una señal corregida por el fondo; y

- sustraer, de la señal corregida por el fondo, un producto del valor de corrección de la interferencia y la señal detectada por el vecino espectral más cercano.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2010/047265.

Solicitante: DIASORIN S.P.A.

Nacionalidad solicitante: Italia.

Dirección: Via Crescentino snc 13040 Saluggia (Vercelli) ITALIA.

Inventor/es: LUDOWISE,PETER D.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.

PDF original: ES-2680495_T3.pdf

 

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