UTILIZACIÓN DE FRAGMENTOS DEL FACTOR DE CRECIMIENTO DE FIBROBLASTOS.

Utilización de fragmentos del factor de crecimiento de fibroblastos Campo de la invención La invención se relaciona en general con el análisis in vivo de la eficacia de un compuesto o composición, y particularmente con él análisis y funcionalización biológica de moléculas clásicas pequeñas, productos naturales, genes, péptidos y proteínas por medio de actividad in vivo. La invención se relaciona además con los usos médicos del factor 23 de crecimiento de fibroblastos (FGF-23), fragmentos del FGF-23, polipéptidos del terminal C del FGF-23, homólogos del FGF-23 y/o variantes del FGF-23, en particular para la fabricación de un medicamento para el tratamiento de enfermedades asociadas con angiogénesis desregulada o trastornos de proliferación de células. Antecedentes de la invención Las compañías farmacéuticas están interesadas en evaluar y comprender la función y regulación de genes y productos génicos recientemente descubiertos (proteínas), especialmente genes y proteínas recientemente descubiertos, que podría ayudar en la comprensión de los mecanismos vinculados con enfermedades o con la acción de los compuestos. Además, los genes y los productos génicos pueden convertirse en fármacos o en biomarcadores potenciales. Grenet O, Pharmacogenomics J. 1(1): 11 - 2 (2001). Sin embargo, una sola secuencia de genes no proporciona información acerca de la función real de la proteína en la fisiología de la célula o del organismo. Además, aunque el genoma tiene un número de genes relativamente bien definido, no se conoce un límite para el número posible de variantes de proteínas. El número potencial de proteínas codificadas por estos genes se estima que es de dos hasta al menos cien veces mayor que el número de genes, ya que se ha encontrado recientemente que se pueden producir proteínas también por medio de empalme a nivel de proteínas y no solamente a nivel del ARN. El proceso actual de descubrimiento de fármacos procede desde un solo objetivo hasta un solo fármaco. El proceso actual es un proceso largo, frecuentemente con un desgaste tardío por falta de eficacia, un diseño equivocado o un indicio erróneo. Por lo tanto, existe la necesidad en el arte de un método más eficiente para el descubrimiento de identificación de candidatos a fármacos, objetivos génicos y biomarcadores. Resumen de la invención ES 2 365 852 T3 La invención suministra un proceso de descubrimiento para funcionalización biológica de péptidos, proteínas, genes, moléculas pequeñas y productos naturales utilizando perfiles de expresión génica de todo el organismo. El proceso de descubrimiento de la invención procede desde un solo principio o fármaco hasta objetivos e indicaciones múltiples (como se indica por medio de un impacto sobre cualquier objetivo en la cadena en cascada de una ruta), y productos farmacéuticos múltiples, suministrando así una guía rápida para un concepto correcto de prueba en humanos. El proceso de descubrimiento de la invención se inicia con la administración de sustancias de prueba a animales, seguido por la selección de la expresión génica resultante en muchos órganos obtenidos del animal de prueba. La invención puede ser utilizada para funcionalizar biológicamente el genoma completo de cualquier organismo donde se encuentran disponibles chips de microarreglos. La invención no está restringida al tipo de compuesto que va a ser funcionalizado. Pequeñas moléculas, proteínas, productos naturales, ADNc (para funcionalizar cualquier gen de interés), etc., son todos susceptibles a la estrategia de la invención. Ya que el proceso de descubrimiento de la invención se basa en una hipótesis no preconcebida y en análisis multiorgánico de todo el organismo, se pueden seleccionar polipéptidos para análisis en ausencia de cualquier criterio biológico de selección diferente de la secuencia del péptido. El patrón resultante de todo el organismo de los cambios de expresión génica en el transcriptoma proporciona un resumen de las actividades a nivel molecular y de todo el organismo. Por lo tanto, el enfoque imparcial de la invención con relación a la administración de un compuesto puede proporcionar información acerca de las relaciones fisiológicas a través de todo el organismo que son provocadas por la administración de compuesto. El proceso de descubrimiento de la invención integra entonces el perfil in vivo con bases de datos genómicas internas y externas para dilucidar la función de proteínas desconocidas, típicamente en pocos meses. El enfoque 2 ES 2 365 852 T3 imparcial de la invención en lo que respecta a la administración de un compuesto proporciona convenientemente firmas genómicas de múltiples órganos. Los datos resultantes pueden ser analizados ya sea por medio del uso de herramientas conocidas por aquellos capacitados en el arte o por medio del uso de moles que comparan las firmas del compuesto producidas por la administración del compuesto entre los diferentes órganos. Este análisis multiorgánico se diferencia de los enfoques estándar, que, ya que no utilizan un enfoque imparcial de la administración del compuesto, no dan como resultado una identificación multiorgánica de la función del compuesto. En vez de eso, el enfoque estándar permite el análisis caso por caso, lo que puede hacer difícil las comparaciones experimentales cruzadas. En contraste con los enfoques estándar, la identificación de la función del compuesto utilizando el método de la invención permite la identificación de la función del compuesto en muchas rutas reguladoras y metabólicas. Además, la identificación de la función del compuesto utilizando el método de la invención resulta conveniente en la comprensión de la estabilidad del compuesto activo en el organismo, una propiedad del compuesto administrado que no sería previsible de otra manera a priori utilizando enfoques estándar. La identificación de la función del compuesto utilizando el método de la invención puede ser en múltiples etapas, ya que una etapa o parte de la identificación conduce a otra etapa o parte de la identificación, para proporcionar una comprensión completa de la actividad del compuesto administrado in vivo. Por ejemplo, la identificación de la función del compuesto en un órgano (tal como el bazo) puede conducir a una comprensión de la función del compuesto en otros órganos. Por el contrario, los enfoques estándar, que se basan en el acceso inmediato a los ensayos en un número limitado de órganos, dependen de la evidencia anecdótica a partir de otros experimentos para etapas adicionales en la identificación de la función del compuesto. La invención es adecuada para diferentes etapas del descubrimiento de fármacos, identificando tanto objetivos como biomarcadores de los fármacos. El proceso de descubrimiento de la invención suministra convenientemente un mayor número de candidatos validados para fármacos y de objetivos y biomarcadores identificados para fármacos junto con ahorro de tiempo, de recursos y de animales. El proceso de descubrimiento de la invención integra convenientemente en un proceso herramientas estándar de exploración con nuevos enfoques genómicos. El proceso de descubrimiento de la invención puede ser utilizado también para perfilar nuevamente compuestos seguros detenidos después de las etapas iniciales de aprobación del fármaco (por ejemplo, la Fase I) para una nueva indicación. La invención puede ser utilizada para ajustar la mejor opción para terapias de combinación, por medio de una adecuación óptima de las firmas de expresión génica entre los compuestos, cancelando los efectos secundarios y la potenciación de la eficacia. El proceso de descubrimiento de la invención puede ser utilizado para perfilar la cartera más avanzada de desarrollo para guiar las etapas posteriores del proceso de aprobación del fármaco (por ejemplo, la Fase II y la Fase III). En diferentes modalidades, el proceso puede ser utilizado para analizar tejidos o fluidos corporales (tales como enfermedad coronaria, cáncer de seno y otras indicaciones; cada uno comparado con controles sanos). Las proteínas del plasma que se expresan en forma diferencial entre individuos normales y pacientes con arterias coronarias enfermas, con una función conocida o desconocida, se analizan para una identificación/validación potencial del objetivo, e identificación del biomarcador. En una modalidad, el proceso de descubrimiento de la invención se inicia con una selección in vivo de proteínas, péptidos y compuestos de referencia en ratones. Con base en los resultados de la selección de los ratones, se lleva a cabo entonces una verificación in vivo de proteínas, péptidos o compuestos de referencia seleccionados en primates no humanos o en modelos animales de una patología o enfermedad humana. La comparación de la información... [Seguir leyendo]

b) es una variante funcional del polipéptido de la SEQ ID NO. 2, que tiene al menos 90% de identidad de secuencia 5 con la SEQ ID NO 2, derivada por medio de sustitución conservadora de aminoácidos de la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO 2. 2. Un polipéptido de acuerdo con la reivindicación 1 para uso como un medicamento. 3. Un polipéptido de acuerdo con la reivindicación 1 para el tratamiento de una enfermedad asociada con una mayor angiogénesis. 10 4. Un polipéptido de acuerdo con la reivindicación 3, en donde la enfermedad asociada con una mayor angiogénesis se selecciona del grupo que consiste de retinopatías, degeneración macular relacionada con la edad, hemangioblastoma, hemangioma, tumores y cáncer. 5. Un polipéptido de acuerdo con la reivindicación 4, en donde la enfermedad asociada con una mayor angiogénesis es retinopatía. 15 6. Un polipéptido de acuerdo con la reivindicación 5, en donde la enfermedad asociada con angiogénesis mejora es cáncer. 7. El uso de un polipéptido de acuerdo con la reivindicación 1 para la fabricación de un medicamento para el tratamiento de una enfermedad seleccionada del grupo que consiste de retinopatías, degeneración macular relacionada con la edad, hemangioblastoma, hemangioma, tumores y cáncer. 20 8. Una composición farmacéutica que contiene un polipéptido de acuerdo con la reivindicación 1 y un portador farmacéuticamente aceptable. ES 2 365 852 T3 216 ES 2 365 852 T3 217 REFERENCIAS CITADAS EN LA DESCRIPCIÓN Este listado de referencias citado por el solicitante es únicamente para conveniencia del lector. No forma parte del documento europeo de la patente. Aunque se ha tenido gran cuidado en la recopilación, no se pueden excluir los 5 errores o las omisiones y la OEP rechaza toda responsabilidad en este sentido. Documentos de patente citados en la descripción US 6165754 A [0048] WO 0210192 A [0186] US 6309370 B [0048] US 5733569 A [0215] US 6566342 B [0048] US 5759565 A [0215] US 6620617 B [0048] US 5719122 A [0215] US 6651655 B [0048] US 5175146 A [0215] US 5202232 A [0052] US 56986721 B [0215] US 5445934 A [0052] US 003015815 A [0215] US 5525464 A [0052] EP 0672057 A [0216] US 5695940 A [0052] WO 9402510 A [0216] US 5744305 A [0052] WO 9631206 A [0271] US 5795716 A [0052] WO 0039120 A [0271] US 5800992 A [0052] WO 0149673 A [0271] WO 02088358 A [0158] 10 Literatura citada en la descripción que no es de patente: ES 2 365 852 T3 Grenet O. Pharmacogenomics J., 2001, vol. 1 (1), 11 - 2 [0003] Shimada T. et al. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2001, vol. 98, 6500 - 6505 [0020] White K. E. et al. J. Clin. Endocrinol. Metab., 2001, vol. 86, 497 - 500 [0021] 15 The ADHR Consortium. Nat. Genet., 2000, vol. 26, 345 - 348 [0022] The HYP Consortium. Nat. Genet., 1995, vol. 11, 130 - 136 [0023] Quarles L. D. ; Drezner M. K. J. Clin. Endocrino/. Metab., 2001, vol. 86, 494 - 496 [0024] Shimada T. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2001, vol. 98, 6500 - 6505 [0025] 218 Quarles L. D. Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab., 2003, vol. 285, E1 - 9 [0025] Kim J-M et al. Gene Ther., August 2003, vol. 10 (15), 1216 - 24 [0047] Gene Ther., September 2003, vol. 10 (19), 1672 - 9 [0047] Sambrook J et al. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Press, 2000 [0052] Johnston, M. Curr Biol, 1998, vol. 8, K171 - 174 [0052] Iyer V R et al. Science, 1999, vol. 283, 83 - 8T [0052] ES 2 365 852 T3 Elias P. New human genome chip is a revolution in the offing, 03 October 2003 [0052] Needleman; Wunsch. GAP program of Wisconsin Sequence Analysis Package, Genetics Computer Group. J. Mol. Biol., 1970, vol. 48, 443 - 453 [0075] Wisconsin Sequence Analysis Package, Genetics Computer Group, Madison. BestFit program, based on the algorithm of Smith and Waterman, Advances in Applied Mathematics, 1981, vol. 2, 482 - 489 [0075] Altschul et al. Methods in Enzymology, 1996, vol. 266, 460 - 480 [0075] Ausubel et al. Protocols in Molecular Biology, 1995 [0084] Ausubel et al. Current Protocols in Molecular Biology. John Wiley Sons, 1990 [0086] Sambrook et al. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989 [0087] Creighton T. E. Proteins, Structures and Molecular Properties. W H Freeman, 1984 [0103] Annes J P et al. Cell Sci., 2003, vol. 116 (2), 217 - 24 [0157] Chen S et al. Nucl. Acids Res., 2003, vol. 31 (4), 1302 - 10 [0157] Vehivilainen P et al. J. Biol. Chem., 2003, vol. 278 (27), 24705 - 13 [0157] Brown T L et al. J. Biol. Chem., 1999, vol. 274 (33), 23256 - 23262 [0157] Tang Y et al. Science, 2003, vol. 299 (5606), 574 - 7 [0157] Ludbrook S B et al. Biochem. J., 2003, vol. 369 (2), 311 - 8 [0157] Ota T et al. J. Cell Physiol., 2002, vol. 193 (3), 299 - 318 [0157] Hu MC et al. Development, 2002, vol. 130 (12), 2753 - 2766 [0157] Letamendia A et al. J. Bone Joint Surg. Am., 2001, vol. 83 - A (1), S31 - 9 [0157] Perlman R et al. Nature Cell Biology, 2001, vol. 3 (8), 708 - 14 [0157] Zhou Y et al. Genomics, 2002, vol. 80 (5), 465 - 72 [0157] Chen W B et al. J. Biol. Chem, 2002, vol. 277 (39), 36118 - 28 [0157] Lesne S et al. J. Biol. Chem., 2003, vol. 278 (20), 18408 - 18 [0157] Yang L et al. J. Cell Physiol., 2001, vol. 188 (3), 383 - 93 [0157] Aschenbrenner J K et al. T. Surg. Res., 2001, vol. 100 (2), 171 - 5 [0157] 219 Yamashita T et al. Biochem. Biophys. Res. Commu., 2000, vol. 277, 494 - 8 [0158] Saito H et al. Am. J. Pathol., 2002, vol. 156, 697 - 707 [0158] White K E et al. Kidney Int., 2001, vol. 60, 2079 - 86 [0158] Shimada T et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2001, vol. 98, 6500 - 5 [0158] Hoi Sang U et al. J. Neurosurg., 1995, vol. 82, 841 - 846 [0173] Wu C J et al. Oncogene, 2000, vol. 19, 3999 - 4010 [0173] [0181] Streffer JR et al. J. Neurooncol., 2002, vol. 56, 43 - 49 [0173] Martin S et al. J. Neurooncol., 2001, vol. 52, 129 - 139 [0173] Huang R et al. Cancer Res., 2002, vol. 62, 2806 - 2812 [0173] Soroceanu L et al. Glia, 2001, vol. 33, 107 - 117 [0173] Shir A; Levitzki A. Nature Biotechnology, 2002, vol. 20, 895 - 900 [0173] [0181] Cichowski K; Jacks T. Cell, 2001, vol. 104, 593 - 604 [0173] [0181] Gutmann, D H et al. Hum. Mol. Genet., 2001, vol. 10, 3009 - 3016 [0173] Aiello F P et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1995, vol. 92, 10457 - 61 [0180] Ozaki H et al. Am. J. Pathol., 2000, vol. 156, 697 - 707 [0180] Hoi Sang U et al. J. Neurosurg., 1995, vol. 82, 841 - 6 [0181] Streffer J R et al. J. Neurooncol., 2002, vol. 56, 43 - 9 [0181] Huang R et al. Cancer Res., 2002, vol. 62, 2806 - 12 [0181] Soroceanu L et al. Glia, 2001, vol. 33, 107 - 17 [0181] Gutmann D H et al. Hum. Mol. Genet., 2001, vol. 10, 3009 - 16 [0181] Lewis I et al. J. Med. Chem., 05 June 2003, vol. 46 (12), 2334 - 44 [0186] Weckbecker G et al. Endocrinology, 2002, vol. 143 (10), 4123 - 4130 [0186] Kneissel M et al. Bone, 2001, vol. 28, 237 - 250 [0186] ES 2 365 852 T3 Thomsen J S et al. Bone, 1999, vol. 25, 561 - 569 [0186] Lewis I et al. J Med Chem, 05 June 2003, vol. 46 (12), 2334 - 44 [0187] Weckbecker G et al. Endocrinology, October 2002, vol. 143 (10), 4123 - 30 [0187] Bruns C et al. Eur J Endocrinol, 2000, vol. 143 (1), S3 7 [0187] Bruns C et al. Eur J Endocrinol., May 2002, vol. 146 (5), 707 - 16 [0187] Macaulay V M. Br J Cancer, 1992, vol. 65, 311 - 20 [0211] Pollak M N ; Schally AV. Proc Soc Exp Biol Med, 1998, vol. 217, 143 - 52 [0211] Woltering E A et al. New Drugs, 1997, vol. 1.5, 77 - 86 [0212] van Hagen PM et al. Eur J Clin Invest, 1994, vol. 24, 91 - 9 [0212] Aguilera G et al. Nature, 1981, vol. 292, 262 - 3 [0212] Aguilera G et al. Endocrinology, 1982, vol. 111, 1376 - 84 [0212] Ray C et al. Clin Sci (Lond), 1993, vol. 84, 455 - 60 [0212] Cheng H et al. Biochem J, 2002, vol. 364, 33 - 9 [0212] Bachman E et al. Science, 2002, vol. 297, 843 - 45 [0212] Kneissel M et al. Bone, March 2001, vol. 28, 237 - 50 [0216] Stewart A F et al. J. Bone. Miner. Res., August 2000, vol. 15 (8), 1517 - 25 [0216] Thomsen J S et al. Bone, November 1999, vol. 25 (5), 561 - 9 [0216] Stewart A F et al. J Bone Miner Res, August 2000, vol. 15 (8), 1517 - 25 [0216] Eiden S et al. J. Physiol., 2002, vol. 541 (3), 1041 - 1048 [0226] Lutz T A et al. Peptides, 2000, vol. 21 (2), 233 - 8 [0226] Pondel M. Intl. J. Exp. Pathol., 2000, vol. 81 (6), 405 - 22 [0256] Tondravi M M et al. Nature, 1997, vol. 386 (6620), 81 - 4 [0257] Teitelbaum S L. Science, 2000, vol. 289 (5484), 1504 - 1508 [0257] Reddy S et al. J. Cell Physiol., 1998, vol. 177 (4), 636 - 45 [0259] Blair H C et al. Biochem., 2002 [0260] Zaidi M et al. Bone, 2002, vol. 30 (5), 655 - 63 [0260] ES 2 365 852 T3 Jaffer Z M ; Chernoff J. Intl. J. Biochem. Cell Biol., 2002, vol. 34 (7), 713 - 7 [0260] McCarthy T L et al. Crit. Rev. Oral Biol. Med., 2000, vol. 11 (4), 409 - 22 [0262] Szweras M et al. J. Biol. Chem., 2002, vol. 277 (22), 19991 - 19997 [0262] Wang D S et al. Endocrinology, 1997, vol. 138 (7), 2953 - 62 [0263] Mayr-Wohlfahrt U et al. Bone, 2002, vol. 30 (3), 472 - 7 [0263] Swarthout J T et al. Gene, 2002, vol. 282 (1 - 2), 1 - 17 [0264] Greenfield E M et al. Life Sci., 1999, vol. 65, 1087 - 102 [0264] Sun W et al. Matrix Biol., 2001, vol. 20 (8), 527 - 41 [0268] van de Rijn M ; Gilks C B. Histopathology, 2004, vol. 44, 97 - 108 [0274] Heller M J. Annual Review of Biomedical Engineering., 2002, vol. 4, 129 - 153 [0275] Kiang D T ; Kennedy B J. Ann Intern Med., 1997, vol. 87, 687 - 690 [0276] 221 Jordan V C ; Allen K E. Eur. J. Cancer, 1980, vol. 16, 239 - 251 [0276] Jordan V C et al. Breast Cancer Res Treat., 1987, vol. 10, 31 - 35 [0276] Gottardis M M et al. Cancer Res., 1998, vol. 48, 812 - 815 [0276] Fornander T et al. Lancet, 1989, vol. 1, 117 - 120 [0276] Cohen F J et al. Obstet. Gynecol., 2000, vol. 95, 104 - 110 [0276] Ring J et al. (The Desloratadine Study Group) Int J Dermatol., 2001, vol. 40, 1 - 5 [0276] Fugere P et al. Am J Obstet Gynecol., 2000, vol. 182, 568 - 574 [0276] Ace C I ; Okulicz W C. Reprod Biol Endocrinol., 2004, vol. 2, 54 [0277] Marvanova M et al. FASEB J., 2003, vol. 17, 929 - 931 [0277] Zou J et al. Genome Biol., 2002 [0277] Cline J M et al. Toxicol Pathol., 2001, vol. 29, 84 - 90 [0280] [0310] [0311] [0315] Chomczynski P ; Sacchi N. Anal Biochem., 1987, vol. 162, 156 - 159 [0284] Lockhart D J ; Dong H ; Byrne M C et al. Nat Biotechnol., 1996, vol. 14, 1675 - 1680 [0284] Hacia J G et al. Nat Genet, 1998, vol. 18, 155 - 158 [0285] Massart D L et al. Handbook for Chemometrics and Qualimetrics, Part a. Elsevier, 1997 [0290] Jolliffe I T. Principal Component Analysis. Springer, 2002 [0290] Barker M ; Rayens W. Journal of Chemometrics, 2004, vol. 17, 166 - 173 [0290] Massart D L et al. Handbook of Chemometrics and Qualimetrics, Part b. Elsevier, 1997 [0290] Hunter W G ; Hunter J S. Statistics for Experimenters: an Introduction to Design, Data Analysis, and Model Building. Wiley, 1978 [0290] Eriksson L et al. Multi- and Megavariate Data Analysis - Principles and Applications. Umetrics Academy, 2001 [0291] Eriksson L et al. J Comput Aided Mol Des., 2002, vol. 16, 711 - 726 [0291] Sachs L. Angewandte Statistik. Springer, 2002 [0293] ES 2 365 852 T3 Zar J H. Biostatistical Analysis. Prentice Hall, 1998 [0293] Gottardis M M et al. Cancer Res., 1988, vol. 48, 812 - 815 [0311] Cohen F J et al. Obstet Gynecol., 2000, vol. 95, 104 - 110 [0311] Norstedt G et al. Acta Endocrinologica (Copenh), 1989, vol. 120, 466 - 472 [0312] Stygar D et al. Reproductive Biology and Endocrinology, 2003, vol. 1, 40 [0312] Sampath D et al. Endocrinology, 2001, vol. 142, 2540 - 2548 [0312] Takahashi T et al. Cell Growth Differ., 1994, vol. 5, 919 - 935 [0312] 222 Sartor B M et al. Reprod Toxicol., 1995, vol. 9, 225 - 231 [0312] Tulac S et al. J Clin Endocrinol Metab., 2003, vol. 88, 3860 - 3866 [0313] Katoh M. Int J Mol Med., 2001, vol. 8, 657 - 660 [0313] ES 2 365 852 T3 Ricken A et al. Endocrinology, 2002, vol. 143, 2741 - 2749 [0313] 5 Fujita M et al. J Mol Endocrinol., 2002, vol. 28, 213 - 223 [0313] Fukuhara K et al. J Clin Endocrinol Metab., 2002, vol. 87, 1729 - 1736 [0313] Wang H et al. Reprod Biol Endocrinol., 2003, vol. 1, 7 [0314] Higgins, R. D. et al. J. AAPOS, 1999, vol. 3, 114 - 116 [0324] 223