PROCEDIMIENTO PARA PRODUCIR L-AMINOACIDOS O ACIDOS NUCLEICOS UTILIZANDO MICROORGANISMOS.

Procedimiento para producir una sustancia diana seleccionada de entre el grupo constituido por L-aminoácidos y ácidos nucleicos utilizando un microorganismo,

que comprende las etapas que consisten en cultivar el microorganismo en un medio para producir y acumular la sustancia diana en el medio y recoger la sustancia diana, en el que el microorganismo se construye a partir de una cepa parental del microorganismo que presenta como rutas de cadena respiratoria una ruta de cadena respiratoria de eficiencia energética elevada y una ruta de cadena respiratoria de eficiencia energética baja, y el microorganismo es una cepa mutante o una cepa recombinante genética que presenta la característica siguiente: la ruta de cadena respiratoria de eficiencia energética elevada se potencia incrementando el número de copias de un gen codificante de una oxidasa de tipo SoxM, la modificación de una secuencia reguladora de la expresión del gen codificante de la oxidasa de tipo SoxM, o una combinación de las mismas

Procedimiento para producir L-aminoácidos o ácidos nucleicos utilizando microorganismos.

Antecedentes de la invención

La presente invención se refiere a un procedimiento para producir sustancias mediante la utilización de microorganismos. En la presente invención, el microorganismo típicamente se selecciona de entre bacterias pertenecientes al género Escherichia o bacterias corineformes, que se utilizan convencionalmente para la producción de sustancias. Las sustancias que deben producirse se seleccionan de entre L-aminoácidos y ácidos nucleicos. La presente invención da a conocer unos medios para mejorar la productividad de las sustancias diana finales en procedimientos para producir sustancias mediante la utilización de microorganismos.

Muchos organismos adquieren energía para las actividades vitales mediante la respiración. En la respiración de los microorganismos, diversos complejos enzimáticos generalmente funcionan según la especie o ambiente de crecimiento, y la eficiencia de captación de la energía también varía significativamente. Los carbohidratos, proteínas y ácidos alifáticos se convierten en acetil-CoA en la glicólisis, en la ß-oxidación y similares, y se descomponen en el ciclo del ácido cítrico. La energía conservada en forma de NADH se utiliza para la excreción de protones de las células microbianas con la ayuda de la NADH deshidrogenasa (NDH) y el posterior sistema de transferencia de electrones constituido por oxidorreductasas, y de esta manera se forma un gradiente de concentración de protones entre el interior y el exterior de la membrana citoplasmática. Este gradiente de concentración de protones se utiliza como fuerza motriz para la síntesis de adenosina trifosfato (ATP). En la actualidad existe una ruta que muestra una capacidad de elevada excreción de protones y una ruta que muestra una capacidad de excreción baja de protones entre las rutas de transferencia de electrones, dependiendo de la combinación de NDH y oxidorreductasas. Se considera que una ruta con capacidad elevada de excreción de proteínas muestra una eficiencia energética elevada y que una ruta de capacidad baja de excreción de protones muestra una eficiencia energética baja. De esta manera, un tipo de microorganismo contiene simultáneamente una pluralidad de rutas respiratorias de cadena de transferencia de electrones en paralelo, y entre estas rutas se incluyen las de eficiencia energética elevada y las de baja eficiencia energética.

Existen dos tipos de NDH y dos tipos de oxidasas terminales en la cadena respiratoria de Escherichia coli para un estado aeróbico. Es decir, respecto a NDH, son conocidos NDH-1 (codificada por el operón nuo) de eficiencia energética elevada, y NDH-II (codificado por ndh) de eficiencia energética baja. Además, respecto a la oxidasa terminal, es conocida la citocromo oxidasa tipo bo (codificada por el operón cyoABCD), clasificada en tipo SoxM (Castresana, J. y Saraste, M., Trends in Biochem. Sci. 20:443-448, 1995) y que muestra eficiencia energética elevada, y la citocromo oxidasa tipo bd (codificada por cydAB), que muestra una eficiencia energética baja. Aunque es conocido que las cantidades de expresión de estos enzimas de cadena respiratoria varían en respuesta al ambiente de crecimiento (Minagawa et al., The Journal of Biological Chemistry 265:11198-11203, 1990; Tseng et al., Journal of Bacteriology 178:1094-1098, 1996; Green et al., Molecular Microbiology 12:433-444, 1994; Bongaerts et al., Molecular Microbiology 16:521-534, 1995), todavía existen muchos aspectos desconocidos sobre el significado fisiológico de los patrones de expresión de los mismos.

Además, en Corynebacterium glutamicum existe un complejo citocromo bc1 y se ha confirmado la presencia de por lo menos dos tipos de oxidasa terminal: la oxidasa de tipo SoxM y la citocromo oxidasa de tipo bd (The Second Symposium Concerning Metabolic Engineering, Lecture Abstracts, 1999). Lo expuesto anteriormente demuestra que la ruta de transferencia de electrones desde el reservorio de quinona hasta la molécula de oxígeno incluye dos tipos de ruta: una ruta que utiliza el complejo citocromo bc1 y la oxidasa de tipo SoxM, y una ruta que utiliza únicamente la citocromo oxidasa de tipo bd. Se considera que la primera es una ruta de transferencia de electrones de eficiencia energética elevada, en la que el valor de transferencia de protones para la transferencia de un electrón es reducido.

Respecto a la oxidasa terminal de E. coli, si se compara el rendimiento de crecimiento en un cultivo aeróbico de una cepa mutante que presenta únicamente la citocromo oxidasa de tipo bo, de una cepa mutante que presenta únicamente la citocromo oxidasa de tipo bd y de una cepa salvaje que presenta ambas, el rendimiento de crecimiento es más bajo en la cepa mutante que presenta únicamente la citocromo oxidasa de tipo bd, y depende del tipo y eficiencia de captación energética de la oxidasa terminal (Annual Meeting of the Society for fermentation and Bioengineering Japón, 1995, Lecture Abstracts, nº 357).

Además, se ha informado de la eficiencia energética de mutantes deficientes en algunos enzimas de la cadena respiratoria (Calhoun et al., Journal of Bacteriology 175:3020-3925, 1993).

Sin embargo, no se ha informado de cambios de la eficiencia energética mediante amplificación de un gen de la cadena respiratoria que proporciona eficiencia elevada, tal como aquellos para la oxidasa de tipo NDH-I y de tipo SoxM, e incluso no se conocen intentos para la utilización del mismo en la producción de sustancias. Además, no se han realizado intentos para utilizar la deleción de un enzima de cadena respiratoria de eficiencia baja, tal como NDH-II y la citocromo oxidasa de tipo bd, en la producción de sustancias.

Sumario de la invención

Se requiere energía para la biosíntesis de sustancias, tales como L-aminoácidos y ácidos nucleicos en seres vivos. La mayor parte de la energía utilizada consta de poder reductor de NDH, NADPH y similares, y de la energía conservada en forma de ATP. Por lo tanto, en el contexto de la presente invención se ha concebido que, si se incrementa el suministro de energía utilizado en la producción de sustancias diana en los procedimientos para producir sustancias diana mediante la utilización de microorganismos, se mejoraría la productividad de las sustancias diana. Basándose en este concepto, un objetivo de la presente invención es concebir un microorganismo que muestre una eficiencia energética mejorada y proporcionar un procedimiento para producir una sustancia diana mediante la utilización del mismo.

En el contexto de la presente invención se ha concebido que podría construirse un microorganismo que muestre un suministro energético incrementado, potenciando una ruta de cadena respiratoria que muestre una eficiencia elevada de captación energética o haciendo deficiente la ruta de cadena respiratoria que muestra una eficiencia baja de captación energética. Específicamente, respecto a E. coli, se prepararon cepas que se considera que presentan una eficiencia energética mejorada, mediante la amplificación de un gen codificante de una citocromo oxidasa de tipo bo a modo de enzima de cadena respiratoria de eficiencia energética elevada, o delecionando un gen codificante de NDH-II a modo de enzima de cadena respiratoria de eficiencia energética baja. A continuación, se llevó a cabo la producción de L-aminoácidos mediante la utilización de dichas cepas y se encontró que la productividad de los L-aminoácidos se encontraba incrementada en las cepas en las que se había mejorado la eficiencia energética. De esta manera se consiguió la presente invención.

Es decir, la presente invención proporciona lo siguiente:

(1) un procedimiento para producir una sustancia diana seleccionada de entre el grupo constituido por L-aminoácidos y ácidos nucleicos, mediante la utilización de un microorganismo, que comprende las etapas que consisten en cultivar el microorganismo en un medio para producir y acumular la sustancia diana en el medio, y recoger la sustancia diana, en el que el microorganismo se construye a partir de una cepa parental del microorganismo que presenta como rutas de cadena respiratoria una ruta de eficiencia energética elevada y una ruta de eficiencia energética baja, y el microorganismo es una cepa mutante o una cepa genética recombinante que presenta la característica siguiente:

la ruta de cadena respiratoria...

1. Procedimiento para producir una sustancia diana seleccionada de entre el grupo constituido por L-aminoácidos y ácidos nucleicos utilizando un microorganismo, que comprende las etapas que consisten en cultivar el microorganismo en un medio para producir y acumular la sustancia diana en el medio y recoger la sustancia diana, en el que el microorganismo se construye a partir de una cepa parental del microorganismo que presenta como rutas de cadena respiratoria una ruta de cadena respiratoria de eficiencia energética elevada y una ruta de cadena respiratoria de eficiencia energética baja, y el microorganismo es una cepa mutante o una cepa recombinante genética que presenta la característica siguiente:

la ruta de cadena respiratoria de eficiencia energética elevada se potencia incrementando el número de copias de un gen codificante de una oxidasa de tipo SoxM, la modificación de una secuencia reguladora de la expresión del gen codificante de la oxidasa de tipo SoxM, o una combinación de las mismas.

2. Procedimiento para producir una sustancia diana según la reivindicación 1, en el que el NDH-II se hace deficiente en el microorganismo.

3. Procedimiento para producir una sustancia diana según la reivindicación 1 ó 2, en el que la oxidasa de tipo SoxM es la citocromo oxidasa de tipo bo.

4. Procedimiento para producir una sustancia diana según la reivindicación 3, en el que dicha citocromo oxidasa de tipo bo se encuentra codificada por el operón cyo.

5. Procedimiento para producir una sustancia diana según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en el que el microorganismo se selecciona de entre el grupo constituido por una bacteria perteneciente al género Escherichia y la bacteria corineforme.

6. Procedimiento para producir una sustancia diana según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en el que el microorganismo es Escherichia coli.