IDENTIFICACION DE AMINOACIDOS MEDIANTE ESPECTROMETRIA DE MASAS.

SE SUMINISTRA UN METODO PARA CORRELACIONAR UN FRAGMENTO PEPTIDO DE ESPECTRO DE MASA CON SECUENCIAS DE AMINOACIDOS DERIVADAS DE UNA BASE DE DATOS.

UN PEPTIDO SE ANALIZA POR UN DOBLE ESPECTROMETRO DE MASA PARA PRODUCIR UN FRAGMENTO PEPTIDO DE ESPECTRO DE MASA. UNA BASE DE DATOS DE SECUENCIA DE PROTEINAS O UNA BASE DE DATOS DE SECUENCIA DE NUCLEOTIDOS SE USA PARA PREDECIR UNO O MAS FRAGMENTOS DE ESPECTROS PARA SU COMPARACION CON EL FRAGMENTO DE ESPECTRO DERIVADO DEL EXPERIMENTO. EN UNA VERSION, SUB-SECUENCIAS DE LAS SECUENCIAS ENCONTRADAS EN LA BASE DE DATOS QUE DEFINE UN PEPTIDO CON UNA MASA SUBSTANCIALMENTE IGUAL A LA MASA DEL PEPTIDO ANALIZADO POR EL DOBLE ESPECTROMETRO DE MASA SE IDENTIFICAN COMO SECUENCIAS CANDIDATAS. PARA CADA SECUENCIA CANDIDATA, UNA VARIEDAD DE FRAGMENTOS DE LA SECUENCIA SON IDENTIFICADOS Y LAS MASAS Y LOS INDICES M/Z DE LOS FRAGMENTOS SE PREDICEN Y SON UTILIZADOS PARA FORMAR UN ESPECTRO DE MASA PREDECIDO. LOS VARIOS ESPECTROS DE MASA PREDECIDOS SON COMPARADOS A LOS FRAGMENTOS DE ESPECTROS DERIVADOS DEL EXPERIMENTO USANDO UNA MEDIDA DE CIERRE DE AJUSTE, PREFERIBLEMENTE CALCULADA MEDIANTE UN PROCESO DE DOS PASOS, INCLUYENDO UN CALCULO DE PUNTUACION PRELIMINAR FINAL, PARA LOS ESPECTROS DE MAYOR PUNTUACION, CALCULO DE UNA FUNCION DE CORRELACION.

Tipo: Resumen de patente/invención.

Solicitante: UNIVERSITY OF WASHINGTON.

Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.

Dirección: 1107 N.E. 45TH STREET, SUITE 200,SEATTLE, WA 98105.

Inventor/es: YATES, JOHN, R., III., ENG, JAMES, K., LINK, ANDREW, J.

Fecha de Publicación: .

Fecha Solicitud PCT: 14 de Marzo de 1995.

Fecha Concesión Europea: 28 de Mayo de 2003.

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C12Q1/68 SECCION C — QUIMICA; METALURGIA.C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
  • G01N33/68 SECCION G — FISICA.G01 METROLOGIA; ENSAYOS.G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › en los que intervienen proteínas, péptidos o aminoácidos.

Países PCT: Austria, Bélgica, Suiza, Alemania, Dinamarca, España, Francia, Reino Unido, Grecia, Italia, Liechtensein, Luxemburgo, Países Bajos, Mónaco, Irlanda, Oficina Europea de Patentes.

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